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Schistosoma mansoni
cluster # 10101 cluster # 10101       Sequences # 13       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10101#0 length = 834 sequences # 13  

consensusID : consensus_10101#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 13
consensus length = 834
fasta sequence
                              [AGACTACGCCGAAGGTTGTCTGCAGTAGTGTGTGTATTCTCAATGAATAATATCTAAGTAAATTCCCTCCAGATAACTACTTCACACCCGAAATTGAAGGAGCTGAGTACTTACTAATTTCTTTTCAGAAAATTATGAAGGATAACAATTGTTCATCTCGCTGTCGTTGTATATGCCAATCCGATTCTGATGTAAACAATAAGAATGGTATAGTTACCAATGGTAAAACGCTACTAGCTACAAACCACACGTCTTCTAAACTGAAACCAAATACTATAACAGATA-TCTACATAAATTGTATGTTATTAGC-ATGTATTTTAATAACTATCTTTGTATTTTCTCGACCATTCAC-AGAACATTTTATAATACGTTTA-ATATTTGGTGAATCTTTAAATTATTGTAATTATACATATGTACCTTC-AAAAAATAACTATCGTCGACCATATAAAATCTACAATTAACGCTAATATGATAAATTTTTTTTCTAATTAGCAAGAATATCGTTGTTATTTTTTGTTTTTG-TTTTTTTCATTTCGATGCCTTTCTTCCTAAACCGATTCACATCTTCCTATTTATAACAAATTGTATTTGGTAATATAGTGAAGCAATAATATAATTGAAGAGTGATATATGCA-TATTTTTGTATTTTCCTTTAACACCATACTCAACATAGTAACAAATACATACCCATCTCATATCTACCTGTTATTTTTTAC-AAAAAACTNTATTATTTACCTAAACTTATGT-ATGATTNTGATNTGATATGATGNTAATCTTATTTACGAAATGAANTATTNTGNANNTTATTGAATGGTATTCTTTGTCATAAAGTAA]

[+] EMBL CD082339             [AGACTACGCCGAAGGTTGTCTGCAGTAGTGTGTGTTTTCTCAATGAATAATACCTAAGTAAATTCCCTCCAGATAACTACTTCACACCCGAAATTGAAGGAGCTGAGTACTTACTAATTTCTTTTCAGAAAATTATGAAGGATAACAATTGTTCATCTCGCTGTCGTTGTATATGCCAATCCGATTCTGATGTAAACAATAAGAATGGTATAGTTACCAATGGTAAAACGCTACTAGCTACAAACCACACGTCTTCTAAACTGAAACCAAATACTATAACAGATA TCTACATAAATTGTATGTTATTAGC ATGTATTTTAATAACTATCTTTGTATTTTCTCGACCATTCAC AGAACATTTTATAATACGTTTA ATATTTGGTGAATCTTTAAATTATTGTAATTATACATATGTACCTTC AAAAAATAACTATCGTCGACCATATAAAATCTACAATTAACGCTAATATGATAAATTTTTTTTCTAATTAGCAAGAATATCGTTGTTATTTTTTGTTTTTG TTTTTTTCATTTCGATGCCTTTCTTCCTAAACCGATTCACATCTTCCTATTTATAACANATTGTATTTGGTAATATAGTGAAGCAATAATATAATTGAAGAGTGATATATGCA TATTTTTGTATTTTCCTTTAACACCATACTCAACATAGTAACCAATACA                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD080038             [                  TCTGCAGTAGTGTGTGTATTCTCAATGAATAATATCTAAGTAAATTCCCTCCAGATAACTACTTCACACCCGAAATTGAAGGAGCTGAGTACTTACTAATTTCTTTTCAGAAAATTATGAAGGATAACAATTGTTCATCTCGCTGTCGTTGTATATGCCAATCCGATTCTGATGTAAACAATAAGAATGGTATAGTTACCAATGGTAAAACGCTACTAGCTACAAACCACACGTCTTCTAAACTGAAACCAAATACTATAACAGATA TCTACATAAATTGTATGTTATTAGC ATGTATTTTAATAACTATCTTTGTATTTTCTCGACCATTCAC AGAACATTTTATAATACGTTTA ATATTTGGTGAATCTTTAAATTATTGTAATTATACATATGTACCTTC AAAAAATAACTATCGTCGACCATATAAAATCTACAATTAACGCTAATATGATAAATTTTTTTTCTAATTAGCAAGATNATCGTTGTTATTTTTTGTTTTTG TTTTTTTCATTTCGATGCCTTTCTTCCTAAACCGATTCACATCTTCCTATTTATAACAAATTGTATTTGGTAATATAGTGAAGCAATAATATAATTGAAGAGTGATATATGCANTATTNTTGTATTTTCCTTTAACACCATACTCAACATAGTAACAAATACATACCCATCTCATATCTACCTGTTATTTTTTAC AAAAAACTNTATTATTTACCTAAACTTATGT ATGATTNTGATNTGATATGATGNTAATCTTATTTACGAAATGAANTATTNTGNANNTTATTGAATGGTATTCTTTGTCATAAAGTAA]
[+] EMBL AI975915             [                         TAGTGTGTGTATTCTCAATGAATAATATCTAAGTAAATTCCCTCCAGATAACTACTTCACACCCGAAATTGAAGGAGCTGAGTACTTACTAATTTCTTTTCAGAAAATTATGAAGGATAACAATTGTTCATCTCGCTGTCGTTGTATATGCCAATCCGATTCTGATGTAAACAATAAGAATGGTATAGTTACCAATGGTAAAACGCTACTAGCTACAAACCACACGTTTTCTAAACTGAAACCAAATACTATAACACATA TCTACATAAATTGTATGTTATTAGC ATGTATTTTAATAACTATCTTTGTATTTTCTCGACCATTCAC AGAACATTTTATAATACGTTTA ATATTTGGTGAATCTTTAAATTATTGTAATTATACATATGTACCTTC AAAAAATAACTATTGTCGACCATATAAAATCTACAATTAACGCTAATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD179005             [                               GTGTATTCTCAATGAATAATATCTAAGTAAATTCCCTCCAGATAACTACTTCACACCCGAAATTGAAGGAGCTGAGTACTTACTAATTTCTTTTCAGAAAATTATGAAGGATAACAATTGTTCATCTCGCTGTCGTTGTATATGCCAATCCGATTCTGATGTAAACAATAAGAATGGTATAGTTACCAATGGTAAAACGCTACTAGCTACAAACCACACGTCTTCTAAACTGAAACCAAATACTATAACAGATA TCTACATAAATTGTATGTTATTAGC ATGTATTTTAATAACTATCTTTGTATTTTCTCGACCATTCAC AGAACATTTTATAATACGTTTA ATATTTGGTGAATCTTTAAATTATTGTAATTATACATATGTACCTTC AAAAAATAACTATCGTCGACCATATAAAATCTACAATTAACGCTAATATGATAAATTTTTTTTCTAATTAGCAAGAATATCGTTGTTATTTTTTGTTTTTG TTTTTTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD186940             [                                                                                                                                                                                                              GGAATAGTAACCAATGGTAAAACGCTACTAGCTACAAACCACACGTCTTCTAAACTGAAACCAAATACTATAACAGATA TCTACATAAATTGTATGTTATTAGC ATGTATTTTAATAACTATCTTTGTATTTTCTCGACCATTCAC AGAACATTTTATAATACGTTTA ATATTTGGTGAATCTTTAAATTATTGTAATTATACATATGTACCTTCAAAAAAATAACTATCGTCGACCATATAAAATCTACAATTAACGCTAATATGATAAATTTTTTTTCTAATTAGCAAGAATATCGTTGTTATTTTTTGTTCTTG TTTTTTTCATTTCGATGCCTTTCTTCCTAAACCGATTCACATCTTCCTATTTATAACAAATTGTAT                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL AI067545             [                                                                                                                                                                                                                              GTAAAACGCTACTAGCTACAAACCACACGTCTTCTAAACTGAAACCAAATACTATAACAGATA TCTACATAAATTGTATGTTATTAGC ATGTATTTTAATAACTATCTTTGTATTTTCTCGACCATTCAC AGAACATTTTATAATACGTTTA ATATTTGGTGAATCTTTAAATTATTGTAATTATACATATGTACCTTC AAAAAATAACTATCGTCGACCATATAAAATCTACAATTAACGCTAATATGATAAATTTTTTTTCTAATTAGCAAGAATATCGTTGTTATCTCTTGTTTATG TTTTTTTCATTTCGATGCCTTTCTTCCTAAACCGATTCACATCTTCCTATTTATAACAAATTGTATTTGGT                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD126262             [                                                                                                                                                                                                                                                             TTCTAAACTGAAACCAAATACTATAACAGATAGTTTACATTAATTGTATGTTATTAGCTATGTATTTTAATAACTATCTTTGTATTTTCTCGACCATTCACGAGAACATTTTATAATACGTTTAGATATTTGGTGAATCTTTAAATTATTGTAATTATACATATGTACCTTC AAAAAATAACTATCGTCGACCATATAAAATCTACAATTAACGCTAATATGATAAATTTTTTTTCTAATTAGCAAGAATATCGTTGTTATTTTTTGTTTTTGTTTTTTTTCATTTCGATGCCTTTCTTCCTAAACCGATTCACATCTTCCTATTTATAACAAATTGTATTTGGTAATATAGTGAAGCAATAATATAATTGAAGAGTGATATATGCA TATTTTTGTATTTTCCTTTAACACCATACTCAACATAGTAACAAAT                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD075938             [                                                                                                                                                                                                                                                                TAAACTGAAACCAAATACTATAACAGATA TCTACATAAATTGTATGTTATTAGC ATGTATTTTAATAACTATCTTTGTATTTTCTCGACCATTCAC AGAACATTTTATAATACGTTTA ATATTTGGTGAATCTTTAAATTATTGTAATTATACATATGTACCTTC AAAAAATAACTATCGTCGACCATATAAAATCTACAATTAACGCTAATATGATAAATTTTTTTTCTAATTAGCAAGAATATCGTTGTTATTTTTTGTTTTTG TTTTTTTCATTTCGATGCCTTTCTTCCTAAACCGATTCACATCTTCCTATTTATAACAAATTGTATTTGGTAATATAGTGAAGCAATAATATAATTGAAGAGTGATATATGCA TATTTTTGTATTTTCCTTTAACACCATACTCAACATAGTAACAAATACATACCCATCTCATATCTACCTGTTATTTTTTACAAAAAAACTTTATTATTTACCTAACTTTATGTAATGATTTTGATTTGATATGATGTTAATCTTAATTACGAAATGAA TAT                                       ]
[-] EMBL CD084459             [                                                                                                                                                                                                                                                                                   ccAACAGATA TCTACATAAATTGTATGTTATTAGC ATGTATTTTAATAACAATCTTTGTATTTTCTCGACCATTCAC AGAACATTTTATAATACGTTTA ATATTTGGTGAATCTTTAAATTATTGTAATTATACATATGTACCTTC AAAAAATAACTATCGTCGACCATATAAAATCTACAATTAACGCTAATATGATAAATTATTTTTCTAATTAGCAAGAATATCGTTGTTATTTTTTGTTTTTG TTTTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD084451             [                                                                                                                                                                                                                                                                                   ccAACAGATA TCTACATAAATTGTATGTTATTAGC ATGTATTTTAATAACAATCTTTGTATTTTCTCGACCATTCAC AGAACATTTTATAATACGTTTA ATATTTGGTGAATCTTTAAATTATTGTAATTATACATATGTACCTTC AAAAAATAACTATCGTCGACCATATAAAATCTACAATTAACGCTAATATGATAAATTATTTTTCTAATTAGCAAGAACATCGTTGTTATTTTTTGTTTTTG TTTTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD084458             [                                                                                                                                                                                                                                                                                   ccAACAGATA TCTACATAAATTGTATGTTATTAGC ATGTATTTTAATAACAATCTTTGTATTTTCTCGACCATTCAC AGAACATTTTATAATACGTTTA ATATTTGGTGAATCTTTAAATTATTGTAATTATACATATGTACCTTC AAAAAATAACTATCGTCGACCATATAAAATCTACAATTAACGCTAATATGATAAATTATTTTTCTAATTAGCAACAACCCCGTTGTTATTTTTTGTTTTTG TTTata                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD084470             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                TACATAAATTGTATGTTATTAGC ATGTATTTTAATAACTATCTTTGTATTTTCTCGACCATTCAC AGAACATTTTATAATACGTTTA ATATTTGGTGAATCTTTAAATTATTGTAATTATACATATGTCCCTTC AAAAAATAACTATCGTCGACCATATAACATCTACAATTAACGCTAATATGATAAATTTTTTTTCTAATTAGCAAGAATATCGTTGTTATTTTTTGTTTTTG TTTTTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD084464             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AGC ATGGGTGGGGATAACTATCTTTGTATTTTCTCGACCATTCAC AGAACATTTTATAATACGTTTA ATATTTGGTGAAACTTTAAATTATTGTAATTATACATATGTACCTTC AAAAAATAACTATCGTCGACCATATAAAATCTACAATTAACGCTAATATGATAAATTTTTTTTCTAATTAGCAAGAATATCCGTGGTATTTTTTGTTTTTG GTTTTTAAATTTCGAGGCCTTcga                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]


>consensus_10101#0 AGACTACGCCGAAGGTTGTCTGCAGTAGTGTGTGTATTCTCAATGAATAATATCTAAGTA AATTCCCTCCAGATAACTACTTCACACCCGAAATTGAAGGAGCTGAGTACTTACTAATTT CTTTTCAGAAAATTATGAAGGATAACAATTGTTCATCTCGCTGTCGTTGTATATGCCAAT CCGATTCTGATGTAAACAATAAGAATGGTATAGTTACCAATGGTAAAACGCTACTAGCTA CAAACCACACGTCTTCTAAACTGAAACCAAATACTATAACAGATATCTACATAAATTGTA TGTTATTAGCATGTATTTTAATAACTATCTTTGTATTTTCTCGACCATTCACAGAACATT TTATAATACGTTTAATATTTGGTGAATCTTTAAATTATTGTAATTATACATATGTACCTT CAAAAAATAACTATCGTCGACCATATAAAATCTACAATTAACGCTAATATGATAAATTTT TTTTCTAATTAGCAAGAATATCGTTGTTATTTTTTGTTTTTGTTTTTTTCATTTCGATGC CTTTCTTCCTAAACCGATTCACATCTTCCTATTTATAACAAATTGTATTTGGTAATATAG TGAAGCAATAATATAATTGAAGAGTGATATATGCATATTTTTGTATTTTCCTTTAACACC ATACTCAACATAGTAACAAATACATACCCATCTCATATCTACCTGTTATTTTTTACAAAA AACTNTATTATTTACCTAAACTTATGTATGATTNTGATNTGATATGATGNTAATCTTATT TACGAAATGAANTATTNTGNANNTTATTGAATGGTATTCTTTGTCATAAAGTAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)