cluster # 10110

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Schistosoma mansoni
cluster # 10110 cluster # 10110 Sequences # 13 consensus # 3

see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_10110#0 length = 1448 sequences # 10

consensus_10110#1 length = 536 sequences # 2
consensus_10110#2 length = 395 sequences # 1

consensusID : consensus_10110#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 1448
fasta sequence

                              [TGGGCATGTACTCTTGATGGCCGGACAGGTTGCCGCTCTGGGTGGTTCTTGTATTTGGCTCTTGGTTGCTACATTCTTCCGTCTTCCAGTCTCTGGTACACATAGTATTGTAGGTGCAACGATGGGTTTTAGTCTTGTTATCTTTGGACTCAATGCTATTCAATGGAAAGGACTAATTAAAATTGTTGGATCATGGTTTCTCTCACCTCTTCTGAGCGGTTTGGCATCTATTGGAGTATTTTTCCTAATGCGTTTTATGGTGCTCAGAAAGGAAGATCCTCTTGAACCTGCACTTAAACTTATCCCAGGTTTTTTCGGTACGGTGGTGCTAGTCAATAGTTTTTCCATATTTTACGAAGGACCTTCAATGCTAAAATTCGATAGAATACCTCTTTATGGAATATTTATAATTAGTTGTGGTCTAGGCATTATCACTGTTCTACTTGTGAAGTTTATTGGGTACCTTTGGTTCGTCGACGTATTTTAACGGGAGAATCGAGTAGACATATTTTGAAAGGCTATTTTTCCCGTAAGAGCAAAAAGAAATTATCTGTCGCTGTAGACGATAAGTATCAGTCTATTGAGGATAATAAATCTTCCAAACGTTCAAGCAGTAATCATGAAACAATTGACATGGATACGTATGTACCTCATACAGATGAAGAGGCTGTGGTTGGATTTCGAAATAATGTTGCTAGAGGAAATACGGATAATAAAGACAAACTTGAACGATTTACAAGTGAAAATAATGGTGTAATACAAGGATTAGAAAATCAGAATAAAGTTTCAAGTCATTTTGAAGTGAAACCAAGTAATCCAGATGAAACAGGTCATAAAAGAAATCAGTTAAATTGGGTTTTGGATTATTCCTCAAGTGATCAAAATGCCATCACGGATGGTAGTCATAATTTAACCAATGGTAAAATGAATGTATCACTTCCTCCTAACCTATCTACAATTGGTGAAGAACCAGATCCTATGGACTCTGTTAAAGATCGTCCTGCTGAAGCTCAGGT-TTTCTCTTCTTTACAAATTTTAACAGCTGTTTTTGGGTCATTTGCTCATGGTGGTAATGACGTAAGTAATGCTATCGGACCGTTGATCGGTTTATGGCTTATCGCCACCACACAATCAGTTGATTCATCGAAAACTACAGATATTTGGATTTTAGTTTATGGTGGTGTTGGTATATCGGTTGGTCTTTGGATATGGGGTAGACGAGTTATTCAAACATTAGGTGAAGATCTGACGAAAATATCACCCTCTAGTGGTGTTTGTATTGAGATTGGTTCAGCCCTAACTGTATTAATTGCTAGTAAAATTGGTCTACC-ATATCAACTACACATTGTAAAGTTGGTTCAGTTGTATTTGTTGGACGTGCACGTTCTAAAGACAATGTTAATTAGGGTATACTTCGTAATATTCTAATTGCATGGTTAGTAACCTTA]

[+] EMBL CD168622             [TGGGCATGTACTCTTGATGGCCGGACAGGTTGCCGCTCTGGGTGGTTCTTGTATTTGGCTCTTGGTTGCTACATTCTTCCGTCTTCCAGTCTCTGGTACACATAGTATTGTAGGTGCAACGATGGGTTTTAGTCTTGTTATCTTTGGACTCAATGCTATTCAATGGAAAGGACTAATTAAAATTGTTGGATCATGGTTTCTCTCACCTCTTCTGAGCGGTTTGGCATCTATTGGAGTATTTTTCCTAATGCGTTTTATGGTGCTCAGAAAGGAAGATCCTCTTGAACCTGCACTTAAACTTATCCCAGGTTTTTTCGGTACGGTGGTGCTAGTCAATAGTTTTTCCATATTTTACGAAGGACCTTCAATGCTAAAATTCGATAGAATACCTCTTTATGGAATATTTATAATTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD195838             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CGGTACGGTGGCGCTAGTCAATAGTTNTTCCATATTTTACGAAGGACCTTCAATGCTAAAATTCGATAGAATACCTCTTTATGGAATATTTATAATTAGTTGTGGTCTAGGCATTATCACTGTTCTACTTGTGAAGTTTATTGGGTACCTTTGGTTCGTCGACGTATTTTAACGGGAGAATCGAGTAGACATATTTTGAAAGGCTATTTTTCCCGTAAGAGCAAAAAGAAATTATCTGTCGCTGTAGACGATAAGTATCAGTCTATTGAGGATAATAAATCTTCCAAACGTTCAAGCAGTAATCATGAAACAATTGACATGGATACGTATGTACCTCATACAGATGAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD116613             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AGGATAATAAATCTTCCAAACGTTCAAGCAGTAATCATGAAACAATTGACATGGATACGTATGTACCTCATACAGATGAAGAGGCTGTGGTTGGATTTCGAAATAATGTTGCTAGAGGAAATACGGATAATAAAGACAAACTTGAACGATTTACAAGTGAAAATAATGGTGTAATACAAGGATTAGAAAATCAGAATAAAGTTTCAAGTTATTTTGAAGTGAAACCAAGTAATCCAGATGAAACAGGTCATAAAAGAAATCAGTTAAATTGGGTTTTGGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD168820             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CCTCATACAGATGAAGAGGCTGTGGTTGGATTTCGAAATAATGTTGCTAGAGGAAATACGGATAATAAAGACAAACTTGAACGATTTACAAGTGAAAATAATGGTGTAATACAAGGATTAGAAAATCAGAATAAAGTTTCAAGTCATTTTGAAGTGAAACCAAGTAATCCAGATGAAACAGGTCATAAAAGAAATCAGTTAAATTGGGTTTTGGATTATTCCTCAAGTGATCAAAATGCCATCACGGATGGTAGTCATAATTTAACCAATGGTAAAATGAATGTATCACTTCCTCCTAACCTATCTACAATTGGTGAAGAACCAGATCCTATGGACTCTGTTAAAGATCGTCCTGCTGAAGCTCAGGT TTTCTCTTCTTTACAAATTTTAACAGCTGTTTTTGGGTCATTTGCTCATGGTGGTAATGACGTAAGTAATGCTATCGGACCGTTGATCGGTTTATGGCTTATCGCCACCACACAATCAGTTGATTCATCGAAAACTACAGATATTTGGATT                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD168825             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CCTCATACAGATGAAGAGGCTGTGGTTGGATTTCGAAATAATGTTGCTAGAGGAAATACGGATAATAAAGACAAACTTGAACGATTTACAAGTGAAAATAATGGTGTAATACAAGGATTAGAAAATCAGAATAAAGTTTCAAGTCATTTTGAAGTGAAACCAAGTAATCCAGATGAAACAGGTCATAAAAGAAATCAGTTAAATTGGGTTTTGGATTATTCCTCAAGTGATCAAAATGCCATCACGGATGGTAGTCATAATTTAACCAATGGTAAAATGAATGTATCACTTCCTCCTAACCTATCTACAATTGGTGAAGAACCAGATCCTATGGACTCTGTTAAAGATCGTCCTGCTCAAGCTCAGGTAAAAATATTCTTTACAAATTTTAACAGCTGTTTTTGGGTCATTTGCTCATGGTGGTAATGACGTAAGTAATGCTATCGGACCGTTGATCGGTTTATGGCTTATCGCCACCACACAATCAGTTGATTCATCGAAAACTACAGATA TGGGATT                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD168844             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CCTCATACAGATGAAGAGGCTGTGGTTGGATTTCGAAATAATGTTGCTAGAGGAAATACGGATAATAAAGACAAACTTGAACGATTTACAAGTGAAAATAATGGTGTAATACAAGGATTAGAAAATCAGAATAAAGTTTCAAGTCATTTTGAAGTGAAACCAAGTAATCCAGATGAAACAGGTCATAAAAGAAATCAGTTAAATTGGGTTTTGGATTATTCCTCAAGTGATCAAAATGCCATCACGGATGGTAGTCATAATTTAACCAATGGTAAAATGAATGTATCACTTCCTCCTAACCTATCTACAATTGGTGAAGAACCAGATCCTATGGACTCTGTTAAAGATCGTCCTGCTGAAGCTCAGGT TTTCTCTTCTTTACAAATTTTAACAGCTGTTTTTGGGTCATTTGCTCATGGTGGTAATGACGTAAGTAATGCTATCGGACCGTTGATCGGTTTATGGCTTATCGCCACCACACAATCAGTTGATTCATCGAAAACTACAGATATTTGGATT                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD080308             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTGTGGTTGGATTTCGAAATAATGTTGCTAGAGGAAATACGGATAATAAAGACAAACTTGAACGATTTACAAGTGAAAATAATGGTGTAATACAAGGATTAGAAAATCAGAATAAAGTTTCAAGTCATTTTGAAGTGAAACCAAGTAATCCAGATGAAACAGGTCATAAAAGAAATCAGTTAAATTGGGTTTTGGATTATTCCTCAAGTGATCAAAATGCCATCACGGATGGTAGTCATAATTTAACTAATGGTAAAATGAATGTATCACTTCCTCCTAACCTATCTACAATTGGTGAAGAACCAGATCCTATGGACTCTGTTAAAGATCGT  TGCTGAAGCTCAGGT TTTCTCTTCTTTACAAATTTTAACAGCTGTTTTTGGGTCATTTGCTCATGGTGGTAATGATGTAAGTAATGCTATCGGACCGTTGATCGGTTTATGGCTTATCGCCACCACACAATCAGTTGATTCATCGAAAACTACAGATATTTGGATTTTAGTTTATGGTGGTGTTGGTATATCGGTTGGTCTTTGGATATGGGGTAGACGAGTTATTCAAACATTAGGTGAAGATCTGACGAAAATATCACCCTCTAGTGGTGTTTGTATTGAGATTGGTTCAGCCCTAACTGTATTAATTGCTAGTAAAATTGGTCTACC ATATCAACTA                                                                                                           ]
[+] EMBL CD083556             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTCAAGTCATTTTGAAGTGAAACCAAGTAATCCAGATGAAACAGGTCATAAAAGAAATCAGTTAAATTGGGTTTTGGATTATTCCTCAAGTGATCAAAATGCCATCACGGATGGTAGTCATAATTTAACCAATGGTAAAATGAATGTATCACTTCCTCCTAACCTATCTACAATTGGTGAAGAACCAGATCCTATGGACTCTGTTAAAGATCGTCCTGCTGAAGCTCAGGT TTTCTCTTCTTTACAAATTTTAACAGCTGTTTTTGGGTCATTTGCTCATGGTGGTAATGACGTAAGTAATGCTATCGGACCGTTGATCGGTTTATGGCTTATCGCCACCACACAATCAGTTGATTCATCGAAAACTACAGATATCTGGATTTTAGTTTATGGTGGTGTTGGTATATCGGTTGGTCTTTGGATATGGGGTAGACGAGTTATTCAAACATTAGGTGAAGATCTGACGAAAATATCACCCTCTAGTGGTGTTTGTATTGAGATTGGTTCAGCCCTAA                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD164430             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gtgggcaCTATCTACAATTGGTGAAGAACCAGATCCTATGGACTCTGTTAAAGATCGTCCTGCTGAAGCTCAGGT TTTCTCTTCTTTACAAATTTTAACAGCTGTTTTTGGGTCATTTGCTCATGGTGGTAATGACGTAAGTAATGCTATCGGACCGTTGATCGGTTTATGGCTTATCGCCACCACACAATCAGTTGATTCATCGAAAACTACAGATATTTGGATTTTAGTTTATGGTGGTGTTGGTATATCGGTTGGTCTTTGGATATGGGGTAGACGAGTTATTCAGACATTAGGTGAAGATCTGACGAAAATATCACCCTCTAGTGGTGTTTGTATTGAGATTGGTTCAGCCCTAACTGTATTAATTGCTAGTAAAATTGGTCTACCAATATCAACTACACATTGTAAAGTTGGTTCAGTTGTATTTGTTGGACGTGCACGTTCTAAAGACAATGTTAATTAGGGTATACTTCGTAATATTCTAATTGCATGGTTAGTAACCTTA]
[-] EMBL CD146845             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTGGTGAAGAACCAGATCCTATGGACTCTGTTAAAGATCGTCCTGCTGAAGCTCAGGT TTTCTCTTCTTTACAAATTTTAACAGCTGTTTTTGGGTCATTTGCTCATGGTGGTAATGACGTAAGTAATGCTATCGGACCGTTGATCGGTTTATGGCTTATCGCCACCACACAATCAGTTGATTCATCGAAAACTACAGATATTTGGATTTTAGTTTATGGTGGTGTTGGTATATCGGTTGGTCTTTGGATATGGGGTAGACGAGTTATTCAAACATTAGGTGAAGATCTGACGAAAATATCACCCTCTAGTGGTGTTTGTATTGAGATTGGTTCAGCCCTAACTGTATTAATTGCTAGTAAAATTGGTCTACCAATATCAACTACACATTGTAAAGTTGGTTCAGTTGTATTTGTTGGACGTGCACGTTCTAAAGACAATGTTAATTGGGGTATATTTCGTAATATTCTAATTGCATGGTTAGTAACC   ]




>consensus_10110#0
TGGGCATGTACTCTTGATGGCCGGACAGGTTGCCGCTCTGGGTGGTTCTTGTATTTGGCT
CTTGGTTGCTACATTCTTCCGTCTTCCAGTCTCTGGTACACATAGTATTGTAGGTGCAAC
GATGGGTTTTAGTCTTGTTATCTTTGGACTCAATGCTATTCAATGGAAAGGACTAATTAA
AATTGTTGGATCATGGTTTCTCTCACCTCTTCTGAGCGGTTTGGCATCTATTGGAGTATT
TTTCCTAATGCGTTTTATGGTGCTCAGAAAGGAAGATCCTCTTGAACCTGCACTTAAACT
TATCCCAGGTTTTTTCGGTACGGTGGTGCTAGTCAATAGTTTTTCCATATTTTACGAAGG
ACCTTCAATGCTAAAATTCGATAGAATACCTCTTTATGGAATATTTATAATTAGTTGTGG
TCTAGGCATTATCACTGTTCTACTTGTGAAGTTTATTGGGTACCTTTGGTTCGTCGACGT
ATTTTAACGGGAGAATCGAGTAGACATATTTTGAAAGGCTATTTTTCCCGTAAGAGCAAA
AAGAAATTATCTGTCGCTGTAGACGATAAGTATCAGTCTATTGAGGATAATAAATCTTCC
AAACGTTCAAGCAGTAATCATGAAACAATTGACATGGATACGTATGTACCTCATACAGAT
GAAGAGGCTGTGGTTGGATTTCGAAATAATGTTGCTAGAGGAAATACGGATAATAAAGAC
AAACTTGAACGATTTACAAGTGAAAATAATGGTGTAATACAAGGATTAGAAAATCAGAAT
AAAGTTTCAAGTCATTTTGAAGTGAAACCAAGTAATCCAGATGAAACAGGTCATAAAAGA
AATCAGTTAAATTGGGTTTTGGATTATTCCTCAAGTGATCAAAATGCCATCACGGATGGT
AGTCATAATTTAACCAATGGTAAAATGAATGTATCACTTCCTCCTAACCTATCTACAATT
GGTGAAGAACCAGATCCTATGGACTCTGTTAAAGATCGTCCTGCTGAAGCTCAGGTTTTC
TCTTCTTTACAAATTTTAACAGCTGTTTTTGGGTCATTTGCTCATGGTGGTAATGACGTA
AGTAATGCTATCGGACCGTTGATCGGTTTATGGCTTATCGCCACCACACAATCAGTTGAT
TCATCGAAAACTACAGATATTTGGATTTTAGTTTATGGTGGTGTTGGTATATCGGTTGGT
CTTTGGATATGGGGTAGACGAGTTATTCAAACATTAGGTGAAGATCTGACGAAAATATCA
CCCTCTAGTGGTGTTTGTATTGAGATTGGTTCAGCCCTAACTGTATTAATTGCTAGTAAA
ATTGGTCTACCATATCAACTACACATTGTAAAGTTGGTTCAGTTGTATTTGTTGGACGTG
CACGTTCTAAAGACAATGTTAATTAGGGTATACTTCGTAATATTCTAATTGCATGGTTAG
TAACCTTA

consensusID : consensus_10110#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 536
fasta sequence

                              [GGGGAATCGATCGAAAAGCAAGGGGCACTA-CTACAATGGTGAAGAACCAGATCCTATGGACTCTGTTAAAGATCGTCCTGCTGAAGCTCAGGTTTTCTCTTCTTTACAAATTTTAACAGCTGTTTTTGGGTCATTTGCTCATGTGTGGTAATGACAGTAAGTAATNGCTATCTGGACCCGTTGATCCGGTTTATAGGCTTATCGCCACNCACACANATCAGTTGATTCATCGANAAACTACAGATATTTGGATTTTAGTTTATGGTGGTGTTGGTATATCGGTTGGTCTTTGGATATGGGGTAGACGAGTTATTCAAACATTAGGTGAAGATCTGACGAAAATATCACCCTCTAGTGGTGTTTGTATTGAGATTGGTTCAGCCCTAACTGTATTAATTGCTAGTAAAATTGGTCTACCAATATCAACTACACATTGTAAAGTTGGTTCAGTTGTATTTGTTGGACGTGCACGTTCTAAAGACAATGTTAATTAGGGTATATTTCGTAATATTCTAATTGCATGGTTAGTAACCTTA]

[+] EMBL CD164345             [GGGGAATCGATCGAAAAGCAAGGGGCACTA CTACAATGGTGAAGAACCAGATCCTATGGACTCTGTTAAAGATCGTCCTGCTGAAGCTCAGGTTTTCTCTTCTTTACAAATTTTAACAGCTGTTTTTGGGTCATTTGCTCATGTGTGGTAATGACAGTAAGTAATNGCTATCTGGACCCGTTGATCCGGTTTATAGGCTTATCGCCACNCACACANATCAGTTGATTCATCGANAAACTACAGATATTTGGATTTTAGTTTATGGTGGTGTTGGTATATCGGTTGGTCTTTGGATATGGGGTAGACGAGTTATTCAAACATTAGGTGAAGATCTGACGAAAATATCACCCTCTAGTGGTGTTTGTATTGAGATTGGTTCAGCCCTAACTGTATTAATTGCTAGTAAAATTGGTCTACCAATATCAACTACACATTGTAAAGTTGGTTCAGTTGTATTTGTTGGACGTGCACGTTCTAAAGACAATGTTAATTAGGGTATATTTCGTAATATTCTAATTGCATGGTTAGTAACCTTA]
[+] EMBL CD164349             [ GGGAATCGATCGAAAAGCAAGGGGCACTATCTACAATGGTGAAGAACCAGATCCTATGGACTCTGTTAAAGATCGTCCTGCTGAAGCTCAGGTTTTCTCTTCTTTACAAATTTTAACAGCTGTTTTTGGGTCATTTGCTCATGTGTGGTAATGACAGTAAGTAATNGCTATCTGGACCCGTTGATCCGGTTTATAGGCTTATCGCCACNCACACANATCAGTTGATTCATCGANAAACTACAGATATTTGGATTTTAGTTTATGGTGGTGTTGGTATATCGGTTGGTCTTTGGATATGGGGTAGACGAGTTATTCAAACATTAGGTGAAGATCTGACGAAAATATCACCCTCTAGTGGTGTTTGTATTGAGATTGGTTCAGCCCTAACTGTATTAATTGCTAGTAAAATTGGTCTACCAATATCAACTACACATTGTAAAGTTGGTTCAGTTGTATTTGTTGGACGTGCACGTTCTAAAGACAATGTTAATTAGGGTATATTTCGTAATATTCTAATTGCATGGTTAGTAACCTTA]




>consensus_10110#1
GGGGAATCGATCGAAAAGCAAGGGGCACTACTACAATGGTGAAGAACCAGATCCTATGGA
CTCTGTTAAAGATCGTCCTGCTGAAGCTCAGGTTTTCTCTTCTTTACAAATTTTAACAGC
TGTTTTTGGGTCATTTGCTCATGTGTGGTAATGACAGTAAGTAATNGCTATCTGGACCCG
TTGATCCGGTTTATAGGCTTATCGCCACNCACACANATCAGTTGATTCATCGANAAACTA
CAGATATTTGGATTTTAGTTTATGGTGGTGTTGGTATATCGGTTGGTCTTTGGATATGGG
GTAGACGAGTTATTCAAACATTAGGTGAAGATCTGACGAAAATATCACCCTCTAGTGGTG
TTTGTATTGAGATTGGTTCAGCCCTAACTGTATTAATTGCTAGTAAAATTGGTCTACCAA
TATCAACTACACATTGTAAAGTTGGTTCAGTTGTATTTGTTGGACGTGCACGTTCTAAAG
ACAATGTTAATTAGGGTATATTTCGTAATATTCTAATTGCATGGTTAGTAACCTTA

consensusID : consensus_10110#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 395
fasta sequence

                              [GGATTTTAGTTTATGGGGGGGTTGGGAAATCGGTTGGTTTTTGGATATGGGGTAGACGAGTTATTCAAACATTAGGTGAAGATTTGACGAAAATATCCCCCTCTAATGGGGTTTGTATTGAAATTGGTTCAGCCCTAACTGTATTAATTGGTAGTAAAATTGGTTTACCAATATCAACTACCCATTGTAAAGTTGGTTCAGTTGTATTTGTTGGACGGGCCCGTTTTAAAAACAATGTTAATTGGGGGAAATTTTGTAAAATTTTAATTGCATGGTTAGTAACCTTACCCCCTGGTGGGGGTATTTTTGCTTTACTCATGTAAAAATTTACGTTTGTTGTATGAATTTTGTTTATTATATTATTAATAAATATTTTATGATTCAAAAAATTTGTT]

[-] EMBL CD074226             [GGATTTTAGTTTATGGGGGGGTTGGGAAATCGGTTGGTTTTTGGATATGGGGTAGACGAGTTATTCAAACATTAGGTGAAGATTTGACGAAAATATCCCCCTCTAATGGGGTTTGTATTGAAATTGGTTCAGCCCTAACTGTATTAATTGGTAGTAAAATTGGTTTACCAATATCAACTACCCATTGTAAAGTTGGTTCAGTTGTATTTGTTGGACGGGCCCGTTTTAAAAACAATGTTAATTGGGGGAAATTTTGTAAAATTTTAATTGCATGGTTAGTAACCTTACCCCCTGGTGGGGGTATTTTTGCTTTACTCATGTAAAAATTTACGTTTGTTGTATGAATTTTGTTTATTATATTATTAATAAATATTTTATGATTCAAAAAATTTGTT]




>consensus_10110#2
GGATTTTAGTTTATGGGGGGGTTGGGAAATCGGTTGGTTTTTGGATATGGGGTAGACGAG
TTATTCAAACATTAGGTGAAGATTTGACGAAAATATCCCCCTCTAATGGGGTTTGTATTG
AAATTGGTTCAGCCCTAACTGTATTAATTGGTAGTAAAATTGGTTTACCAATATCAACTA
CCCATTGTAAAGTTGGTTCAGTTGTATTTGTTGGACGGGCCCGTTTTAAAAACAATGTTA
ATTGGGGGAAATTTTGTAAAATTTTAATTGCATGGTTAGTAACCTTACCCCCTGGTGGGG
GTATTTTTGCTTTACTCATGTAAAAATTTACGTTTGTTGTATGAATTTTGTTTATTATAT
TATTAATAAATATTTTATGATTCAAAAAATTTGTT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10110#0      TGGGCATGTACTCTTGATGGCCGGACAGGTTGCCGCTCTGGGTGGTTCTTGTATTTGGCT 60
consensus_10110#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10110#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10110#0      CTTGGTTGCTACATTCTTCCGTCTTCCAGTCTCTGGTACACATAGTATTGTAGGTGCAAC 120
consensus_10110#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10110#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10110#0      GATGGGTTTTAGTCTTGTTATCTTTGGACTCAATGCTATTCAATGGAAAGGACTAATTAA 180
consensus_10110#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10110#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10110#0      AATTGTTGGATCATGGTTTCTCTCACCTCTTCTGAGCGGTTTGGCATCTATTGGAGTATT 240
consensus_10110#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10110#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10110#0      TTTCCTAATGCGTTTTATGGTGCTCAGAAAGGAAGATCCTCTTGAACCTGCACTTAAACT 300
consensus_10110#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10110#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10110#0      TATCCCAGGTTTTTTCGGTACGGTGGTGCTAGTCAATAGTTTTTCCATATTTTACGAAGG 360
consensus_10110#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10110#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10110#0      ACCTTCAATGCTAAAATTCGATAGAATACCTCTTTATGGAATATTTATAATTAGTTGTGG 420
consensus_10110#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10110#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10110#0      TCTAGGCATTATCACTGTTCTACTTGTGAAGTTTATTGGGTACCTTTGGTTCGTCGACGT 480
consensus_10110#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10110#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10110#0      ATTTTAACGGGAGAATCGAGTAGACATATTTTGAAAGGCTATTTTTCCCGTAAGAGCAAA 540
consensus_10110#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10110#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10110#0      AAGAAATTATCTGTCGCTGTAGACGATAAGTATCAGTCTATTGAGGATAATAAATCTTCC 600
consensus_10110#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10110#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10110#0      AAACGTTCAAGCAGTAATCATGAAACAATTGACATGGATACGTATGTACCTCATACAGAT 660
consensus_10110#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10110#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10110#0      GAAGAGGCTGTGGTTGGATTTCGAAATAATGTTGCTAGAGGAAATACGGATAATAAAGAC 720
consensus_10110#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10110#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10110#0      AAACTTGAACGATTTACAAGTGAAAATAATGGTGTAATACAAGGATTAGAAAATCAGAAT 780
consensus_10110#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10110#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10110#0      AAAGTTTCAAGTCATTTTGAAGTGAAACCAAGTAATCCAGATGAAACAGGTCATAAAAGA 840
consensus_10110#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10110#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10110#0      AATCAGTTAAATTGGGTTTTGGATTATTCCTCAAGTGATCAAAATGCCATCACGGATGGT 900
consensus_10110#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10110#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10110#0      AGTCATAATTTAACCAATGGTAAAATGAATGTATC-ACTTCCTCCTAACCTATCTACAAT 959
consensus_10110#1      -----------------------GGGGAATCGATCGAAAAGCAAGGGGCACTACTACAAT 37
consensus_10110#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10110#0      TGGTGAAGAACCAGATCCTATGGACTCTGTTAAAGATCGTCCTGCTGAAGCTCAGGTTTT 1019
consensus_10110#1      -GGTGAAGAACCAGATCCTATGGACTCTGTTAAAGATCGTCCTGCTGAAGCTCAGGTTTT 96
consensus_10110#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10110#0      CTCTTCTTTACAAATTTTAACAGCTGTTTTTGGGTCATTTGCTCATG-GTGGTAATGAC- 1077
consensus_10110#1      CTCTTCTTTACAAATTTTAACAGCTGTTTTTGGGTCATTTGCTCATGTGTGGTAATGACA 156
consensus_10110#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10110#0      GTAAGTAATG-CTATCGGA--CCGTTGATC-GGTTTAT-GGCTTATCGCCACC-ACACAA 1131
consensus_10110#1      GTAAGTAATNGCTATCTGGACCCGTTGATCCGGTTTATAGGCTTATCGCCACNCACACAN 216
consensus_10110#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10110#0      -TCAGTTGATTCATCGAAAA-CTACAGATATTTGGATTTTAGTTTATGGTGGTGTTGGTA 1189
consensus_10110#1      ATCAGTTGATTCATCGANAAACTACAGATATTTGGATTTTAGTTTATGGTGGTGTTGGTA 276
consensus_10110#2      ---------------------------------GGATTTTAGTTTATGGGGGGGTTGGGA 27
                                                        **************** ** ***** *

consensus_10110#0      TATCGGTTGGTCTTTGGATATGGGGTAGACGAGTTATTCAAACATTAGGTGAAGATCTGA 1249
consensus_10110#1      TATCGGTTGGTCTTTGGATATGGGGTAGACGAGTTATTCAAACATTAGGTGAAGATCTGA 336
consensus_10110#2      AATCGGTTGGTTTTTGGATATGGGGTAGACGAGTTATTCAAACATTAGGTGAAGATTTGA 87
                        ********** ******************************************** ***

consensus_10110#0      CGAAAATATCACCCTCTAGTGGTGTTTGTATTGAGATTGGTTCAGCCCTAACTGTATTAA 1309
consensus_10110#1      CGAAAATATCACCCTCTAGTGGTGTTTGTATTGAGATTGGTTCAGCCCTAACTGTATTAA 396
consensus_10110#2      CGAAAATATCCCCCTCTAATGGGGTTTGTATTGAAATTGGTTCAGCCCTAACTGTATTAA 147
                       ********** ******* *** *********** *************************

consensus_10110#0      TTGCTAGTAAAATTGGTCTACCA-TATCAACTACACATTGTAAAGTTGGTTCAGTTGTAT 1368
consensus_10110#1      TTGCTAGTAAAATTGGTCTACCAATATCAACTACACATTGTAAAGTTGGTTCAGTTGTAT 456
consensus_10110#2      TTGGTAGTAAAATTGGTTTACCAATATCAACTACCCATTGTAAAGTTGGTTCAGTTGTAT 207
                       *** ************* ***** ********** *************************

consensus_10110#0      TTGTTGGACGTGCACGTTCTAAAGACAATGTTAATTAGGGTATACTTCGTAATATTCTAA 1428
consensus_10110#1      TTGTTGGACGTGCACGTTCTAAAGACAATGTTAATTAGGGTATATTTCGTAATATTCTAA 516
consensus_10110#2      TTGTTGGACGGGCCCGTTTTAAAAACAATGTTAATTGGGGGAAATTTTGTAAAATTTTAA 267
                       ********** ** **** **** ************ *** * * ** **** *** ***

consensus_10110#0      TTGCATGGTTAGTAACCTTA---------------------------------------- 1448
consensus_10110#1      TTGCATGGTTAGTAACCTTA---------------------------------------- 536
consensus_10110#2      TTGCATGGTTAGTAACCTTACCCCCTGGTGGGGGTATTTTTGCTTTACTCATGTAAAAAT 327
                       ********************                                        

consensus_10110#0      ------------------------------------------------------------
consensus_10110#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10110#2      TTACGTTTGTTGTATGAATTTTGTTTATTATATTATTAATAAATATTTTATGATTCAAAA 387
                                                                                   

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consensus_10110#2      AATTTGTT 395