cluster # 1016

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Schistosoma mansoni
cluster # 1016 cluster # 1016 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1016#0 length = 828 sequences # 2

consensusID : consensus_1016#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 828
fasta sequence

                              [TGGTACGAGGACCGATTGAATGNGTCTCAAAATTGTCCCGATCGGTAAATCGTCGCGACAACATGATATCATTAAAGATTCTTCCTATATCATACATCATTACGATTACATCACTATGGTTACTTGAAGGATAGAAGCTACCATACATAGTGCGACTAAATTCAAACCGAAGATAAATTTGTCTTGATTTGATCGCTTTCGTAAAATCTTACGATTTGTCGATGTTACGCACCAGGTTTTTCAAGGTGTGGTCCTCATATGCTGAATTACACACACCAATTGAAGATGCCACTGGATCGTTTCCGGTTTGGTTTGATGCGTTTCCTCGTCGATTCATTTACTTGTCTACTATATTTGGTTGTTTTATTGATCTATTAATGTTTGGGAGATGTTAAGAAAAGCACACTCTGGGCGGTGTGGATTCGCTTCGATACAATTCATATCAGATCAGTCTAATCCAATCCTTGCTTTATTTCATTTCTTTAAAATTGCTGGTACAAAGGGGTTTACTTTTGGAAATAATCCATTATTATTATTTTTTAGTTCACTTGTGTCCAATGTTGATAATATAATTATAACTATTTGTCCAAGCATCTTAGACGGCATTTTTACGTTAAACAGTCAACATGAATCTCTCAGCATTTGTCAAGCACAGCACATGCAGTTCAATACAGGTCCTGGTGATTCTAAGAGCCAGTGTC-AAATCACTCC-ATTCACTTACAGAAA-GTCTAATTCTGGTGGT-ATGCT-CACTACTATTATCCATT-AATNCAGTC-TACTNTGATCGNTNAT-ACTACT-AAAATGATA--TTATGT-ATCACTT--ATATACATTTA]

[+] EMBL CD082122             [TGGTACGAGGACCGATTGAATGNGTCTCAAAATTGTCCCGATCGGTAAATCGTCGCGACAACATGATATCATTAAAGATTCTTCCTATATCATACATCATTACGATTACATCACTATGGTTACTTGAAGGATAGAAGCTACCATACATAGTGCGACTAAATTCAAACCGAAGATAAATTTGTCTTGATTTGATCGCTTTCGTAAAATCTTACGATTTGTCGATGTTACGCACCAGGTTTTTCAAGGTGTGGTCCTCATATGCTGAATTACACACACCAATTGAAGATGCCACTGGATCGTTTCCGGTTTGGTTTGATGCGTTTCCTCGTCGATTCATTTACTTGTCTACTATATTTGGTTGTTTTATTGATCTATTAATGTTTGGGAGATGTTAAGAAAAGCACACTCTGGGCGGTGTGGATTCGCTTCGATACAATTCATATCAGATCAGTCTAATCCAATCCTTGCTTTATTTCATTTCTTTAAAATTGCTGGTACAAAGGGGTTTACTTTTGGAAATAATCCATTATTATTATTTTTTAGTTCACTTGTGTCCAATGTTGATAATATAATTATAACTATTTGTCCAAGCATCTTAGACGGCATTTTTACGTTAAACAGTCAACATGAATCTCTCAGCATTTGTCAAGCACAGCACATGCAGTTCAATACAGGTCCTGGTGATTCTAAGAGCCAGTGTC AAATCACTCC ATTCACTTACAGAAA GTCTAATTCTGGTGGT ATGCT CACTACTATTATCCATT AATNCAGTC TACTNTGATCGNTNAT ACTACT AAAATGATA  TTATGT ATCACTT  ATATACAT   ]
[-] EMBL CD075737             [                                                                                                                                                                                                                                                                   TGCTGAATTACACACACCAATTGAAGATGCCACTGGATCGTTTCCGGTTTGGTTTGATGCGTTTCCTCGTCGATTCATTTACTTGTCTACTATATTTGGTTGTTTTATTGATCTATTAATGTTTGGGAGATGTTAAGAAAAGCACACTCTGGGCGGTGTGGATTCGCTTCGATACAATTCATATCAGATCAGTCTAATCCAATCCTTGCTTTATTTCATTTCTTTAAAATTGCTGGTACAAAGGGGTTTACTTTTGGAAATAATCCATTATTATTATTTTTTAGTTCACTTGTGTCCAATGTTGATAATATAATTATAACTATTTGTCCAAGCATCTTAGACGGCATTTTTACGTTAAACAGTCAACATGAATCTCTCAGCATTTGTCAAGCACAGCACATGCAGTTCAATACAGGTCCTGGTGATTTTAAGAGCCAGTGTCAAAATCACTCCAATTCACTTACAGAAAGGTCTAATTCTGGTGTTAATGCTACACTACTATTATCCATTAAATCCAGTCATACTTTGATCGTTTATCACTACTAAAAATGATAATTTATGTAATCACTTAAATATACATTTA]




>consensus_1016#0
TGGTACGAGGACCGATTGAATGNGTCTCAAAATTGTCCCGATCGGTAAATCGTCGCGACA
ACATGATATCATTAAAGATTCTTCCTATATCATACATCATTACGATTACATCACTATGGT
TACTTGAAGGATAGAAGCTACCATACATAGTGCGACTAAATTCAAACCGAAGATAAATTT
GTCTTGATTTGATCGCTTTCGTAAAATCTTACGATTTGTCGATGTTACGCACCAGGTTTT
TCAAGGTGTGGTCCTCATATGCTGAATTACACACACCAATTGAAGATGCCACTGGATCGT
TTCCGGTTTGGTTTGATGCGTTTCCTCGTCGATTCATTTACTTGTCTACTATATTTGGTT
GTTTTATTGATCTATTAATGTTTGGGAGATGTTAAGAAAAGCACACTCTGGGCGGTGTGG
ATTCGCTTCGATACAATTCATATCAGATCAGTCTAATCCAATCCTTGCTTTATTTCATTT
CTTTAAAATTGCTGGTACAAAGGGGTTTACTTTTGGAAATAATCCATTATTATTATTTTT
TAGTTCACTTGTGTCCAATGTTGATAATATAATTATAACTATTTGTCCAAGCATCTTAGA
CGGCATTTTTACGTTAAACAGTCAACATGAATCTCTCAGCATTTGTCAAGCACAGCACAT
GCAGTTCAATACAGGTCCTGGTGATTCTAAGAGCCAGTGTCAAATCACTCCATTCACTTA
CAGAAAGTCTAATTCTGGTGGTATGCTCACTACTATTATCCATTAATNCAGTCTACTNTG
ATCGNTNATACTACTAAAATGATATTATGTATCACTTATATACATTTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case