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Schistosoma mansoni
cluster # 10165 cluster # 10165       Sequences # 14       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10165#0 length = 1331 sequences # 14  

consensusID : consensus_10165#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 14
consensus length = 1331
fasta sequence
                              [AATACCAAGATTTTGTGGCACCACCCGACACATCTCGTTTTCTCCAGTTTTATTCAAACAACCGTTTCATGACAGACTACGATCTAAAAGGGCCAACCCACCACCACACCATTCACTCCCTTTTTATGATGAAGCACCAACTGATACCTTCCCGAGTAAACAAGTGGATATTGTTGGTCAATGGGGTTCTACCGACAGTAGTATAAAGAAATTAAGGTTTCGTCATGGTGAATTCTTAAAAACTATACCAACGTCATTTGAAAAACTCCATGAGTTGTATCATCTTGAGGATAACATGTGGTTTCATTCCATTGATATTCCTTTACAACATTCTGAAATGTTAGAATTTTCTCAATTTGTTACACGTACAAAACTCATCCCATGGATACCAGAGTCATACGACAGCAACCCAATTTTGTCGAGTTATTTAAAGTATCTTTTTTCTGAAGAGTTACATTCGGTCAACAGTAAGCCTGTTAATATCCATGATCAAAGTGTTAATGGACTTAATGTACGCTCAGATTATCGGCGCAAAAAAATATCAATGATTATGGAAACCGTATATCGGTCATTTTTATCTGCTGGGACAGAATCACTAGTTAATGAGTTATCCACACAAATTGATGAACGTGGTACCATAGAAATGTTTTTAAAACGACTAGTCGATCATAAAGTATTCGAAAACGAGGATGTAAATGAAGATGTTTATGAACCCGTAAACGAGACAATTGTTGACGTCGAGCGTTGTGTACATTATCGTATTCGGTCTGAATTAGCTTGGCAGTTACGGGGACCATTTCCTTTAAAGCCTCATTTTAATTTAGACGATCCAATTTGCTTTCTAGAAAACCCTATTGTATGCAATTATCGCCCAGAAGCATTTGATTTGCAACTTGTCGAGTGTTATAATTTCAATTGTTTACCATTTGCAAGAACGATCGATTTTTCCGAATTCGCTCGATCAATTGCAGGCTATTGGGCTCGTACACCATTCTGGGAAGGAGATCCTTGTGAATTTGGTTTACTTGGAGTTCTTGATTTAAATCGTTCTGAATGTGTACGAAATGAAATTAGTTGTTCTCGTCTTCCAGATAATGTAAAAAATAATATTTTAATACGACATGGAATTGCTGAGGGTATTCTTACAGCATTTGCATGGGCTTCAGCCCAAGCTTACAATCAAGGTTTTACTTTATATAATGAGTTAACTTATCCATTTTTGCGTTCAACTAATTCTAATGGATGGGAACTATATTCAGTTGTTACGCTTTCAATTGAATTC-ATAACATCGTTATGGAAAGCCGAGGATTTCAATGTTACCATATAATTTA]

[+] EMBL CD159997             [AATACCAAGATTTTGTGGCACCACCCGACACATCTCGTTTTCTCCAGTTTTATTCAAACAACCGTTTCATGACAGACTACGATCTAAAAGGGCCAACCCACCACCACACCATTCACTCCCTTTTTATGATGAAGCGCCAACTGATACCTTCCCGAGTAAACAAGTGGATATTGTTGGTCAATGGGGTTCTACCGACAGTAGTATAAAGAAATTAAGGTTTCGTCATGGTGAATTCTTAAAAACTATACCAACGTCATTTGAAAAACTCCATGAGTTGTATCATCTTGAGGATAACATGTGGTTTCATTCCATTGATATTCCTTTACAACATTCTGAAATGTTAGAATTTTCTCAATTTGTTACACGTACAAAACTCATCCCATGGATACCAGAGTCATACGACAGCAACCCAATTTTGTCGAGTTATTTAAAGTATCTTTTTTCTGAAGAGTTACATTCGGTCAACAGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD160233             [AATACCAAGATTTTGTGGCACCACCCGACACATCTCGTTTTCTCCAGTTTTATTCAAACAACCGTTTCATGACAGACTACGATCTAAAAGGGCCAACCCACCACCACACCATTCACTCCCTTTTTATGATGAAGCACCAACTGATACCTTCCCGAGTAAACAAGTGGATATTGTTGGTCAATGGGGTTCTACCGACAGTAGTATAAAGAAATTAAGGTTTCGTCATGGTGAATTCTTAAAAACTATACCAACGTCATTTGAAAAACTCCATGAGTTGTATCATCTTGAGGATAACATGTGGTTTCATTCCATTGATATTCCTTTACAACATTCTGAAATGTTAGAATTTTCTCAATTTGTTACACGTACAAAACTCATCCCATGGATACCAGAGTCATACGACAGCAACCCAATTTTGTCGAGTTATTTAAAGTATCTTTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD160219             [ ATACCAAGATTTTGTGGCACCACCCGACACATCTCGTTGTCTCCAGTTTAATTCAAACAACCGTTTCAAGACAGACTACGATCTAAAAGGGCCAACCCACCACCACACCATTCACTCCCTTTTTATGATGAAGCGCCAACTGATACCTTCCCGAGTAAACAAGTGGATATTGTTGGTCAATGGGGTTCTACCGACAGTAGTATAAAGAAATTAAGGTTTCGTCATGGTGAATTCTTAAAAACTATACCAACGTCATTTGAAAAACTCCATGAGTTGTATCATCTTGAGGATAACATGTGGTTTCATTCCATTGATATTCCTTTACAACATTCTGAAATGTTAGAATTTTCTCAATTTGTTACACGTACAAAACTCATCCCATGGATACCAGAGTCATACGACAGCAACCCAATTTTGTCGAGTTATTTAAAGTATCTTTTTTCTGAAGAGTTACATTCGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD160028             [            TTGTGGCACCACCCGACACATCTCGTTTTCTCCAGTTTTATTCAAACAACCGTTTCATGACAGACTACGATCTAAAAGGGCCAACCCACCACCACACCATTCACTCCCTTTTTATGATGAAGCACCAACTGATACCTTCCCGAGTAAACAAGTGGATATTGTTGGTCAATGGGGTTCTACCGACAGTAGTATAAAGAAGTTAAGGTTTCGTCATGGTGAATTCTTAAAAACTATACCAACGTCATTTGAAAAACTCCATGAGTTGTATCATCTTGAGGATAACATGTGGTTTCATTCCATTGATATTCCTTTACAACATTCTGAAATGTTAGAATTTTCTCAATTTGTTACACGTACAAAACTCATCCCATGGATACCAGAGTCATACGACAGCAACCCAATTTTGTCGAGTTATTTAAAGTATCTTTTTTCTGAAGAGTTACATTCGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD160193             [                                                                            CTACGATCTAAAAGGCCCAACCCACCACCACACCATTCACTCCCTTTTTATGATGAAGCACCAACTGATACCTTCCCGAGTAAACAGGTGGATATTGTTGGTCAATGGGGTTCTACCGACAGTAGTATAAAGAAATTAAGGTTTCGTCATGGTGAATTCTTAAAAACTATACCAACGTCATTTGAAAAACTCCATGAGTTGTATCATCTTGAGGATAACATGTGGTTTCATTCCATTGATATTCCTTTACAACATTCTGAAATGTTAGAATTTTCTCAATTTGTTACACGTACAAAACTCATCCCATGGATACCAGAGTCATACGACAGCAACCCAATTTTGTCGAGTTATTTAAAGTATCTTTTTTCTGAAGAGTTACATTCGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD158159             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CATACGACAGCAACCCAATTTTGTCGAGTTATTTAAAGTATCTTTTTTCTGAAGAGTTACATTCGGTCAACAGTAAGCCTGTTAATATCCATGATCAAAGTGTTAATGGACTTAATGTACGCTCAGATTATCGGCGCAAAAAAATATCAATGATTATGGAAACCGTATATCGGTCATTTTTATCTGCTGGGACAGAATCACTAGTTAATGAGTTATCCACACAAATTGATGAACGTGGTACCATAGAAATGTTTTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD158298             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CATACGACAGCAACCCAATTTTGTCGAGTTATTTAAAGTATCTTTTTTCTGAAGAGTTACATTCGGTCAACAGTAAGCCTGTTAATATCCATGATCAAAGTGTTAATGGACTTAATGTACGCTCAGATTATCGGCGCAAAAAAATATCAATGATTATGGAAACCGTATATCGGTCATTTTTATCTGCTGGGACAGAATCACTAGTTAATGAGTTATCCACACAAATTGATGAACGTGGTACCATAGAAATGTTTTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD158128             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CATACGACAGCAACCCAATTTTGTCGAGTTATTTAAAGTATCTTTTTTCTGAAGAGTTACATTCGGTCAACAGTAAGCCTGTTAATATCCATGATCAAAGTGTTAATGGACTTAATGTACGCTCAGATTATCGGCGCAAAAAAATATCAATGATTATGGAAACCGTATATCGGTCATTTTTATCCGCTGGGACAGAATCACTAGTTAATGAGTTATCCACACAAATTGTTGAACGTGGTACCATAGAAATGTTTTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD157972             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CATACGACAGCAACCCAATTTTGTCGAGTTATTTAAAGTATCTTTTTTCTGAAGAGTTACATCCGGTCAACAGTAAGCCTGTTAATATCCATGATCAAAGTGTTAATGGACTTAATGTACGCTCAGATTATCGGCGCAAAAAAATATCAATGATTATGGAAACCGTATATCGGTCATTTTTATCTGCTGGGACAGAATCACTAGTTAATGAGTTATCCACACAAATTGATGAACGTGGTACCATAGAAATGTTTTTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD158078             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATACGACAGCAACCCAATTTTGTCGAGTTATTTAAAGTATCTTTTTTCTGAAGAGTTACATTCGGTCAACAGTAAGCCTGTTAATATCCATGATCAAAGTGTTAATGGACTTAATGTACGCTCAGATTATCGGCGCAAAAAAATATCAATGATTATGGAAACCGTATATCGGTCATTTTTATCTGCTGGGACAGAATCACTAGTTAATGAGTTATCCACACAAAATGATGAACGTGGTACCATAGAAATGTTTTTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD118573             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TAAGCCTGTTAATATCCATGATCAAAGCGTTAATGGACTTAATGTACGCTCAGATTATCGGCGCAAAAAAATATCAATGATTATGGAAACCGTATATCGGTCATTTTTATCTGCTGGGACAGAATCACTAGTTAATGAGTTATCCACACAAATTGATGAACGTGGTACCATAGAAATGTTTTTAAAACGACTAGTCGATCATAAAGTATTCGAAAACGAGGATGTAAATGAAGATGTTTATGAACCCGTAAACGAGACAATTGTTGACGTCGAGCGTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL BF936565             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGATCATAAAGTATTCGAAAACGAGGATGTAAATGAAGATGTTTATGAACCCGTAAACGAGACAATTGTTGACGTCGAGCGTTGTGTACATTATCGTATTCGGTCTGAATTAGCTTGGCAGTTACGGGGACCATTTCCTTTAAAGCCTCATTTTAATTTAGACGATCCAATTTGCTTTCTAGAAAACCCTATTGTATGCAATTATCGCCCAGAAGCATTTGATTTGCAACTTGTCGAGTGTTATAATTTCAATTGTTTACCATTTGCAAGAACGATCGATTTTTCCGAATTCGCTCGATCAATTGCAGGCTATTGGGCTCGTACACCATTCTGGGAAGGAGATCCTTGTGAATTTGGTTTACTTGGAGTTCTTGATTTAAATCGTTCTGAATGTGTACGAAATGAAATTAGTTGTTCTCGTCTTCCAGATAATGTAAAAAATAATATTTTAATACGACATGGAATTGCTGAGGGTATTCTTACAGCATTTGCATGGGCTTCAGCCCAAGCTTACAATCAAGGTTTTACTTTATATAATGAGTTAACTTATCCATTTTTGCGTTCAACTAATTCTAATGGATGGGAACTATATTCAGTTGTTACGCTTTCAATTGAATTC ATAACATCGTTATGGAAAGCCGAGGATTTCAATGTTACCATATAATTTA]
[+] EMBL AI976228             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGATCATAAAGTATTCGAAAACGAGGATGTAAATGAAGATGTTTATGAACCCGTAAACGAGACAATTGTTGACGTCGAGCGTTGTGTACATTATCGTATTCGGTCTGAATTAGCTTGGCAGTTACGGGGACCATTTCCTTTAAAGCCTCATTTTAATTTAGACGATCCAATTTGCTTTCTAGAAAACCCTATTGTATGCAATTATCGCCCAGAAGCATTTGATTTGCAACTTGTCGAGTGTTATAATTTCAATTGTTTACCATTTGCAAGAACGATCGATTTTTCCGAATTCGCTCGATCAATTGCAGGCTATTGGGCTCGTACACCATTCTGGGAAGGAGATCCTTGTGAATTTGGTTTACTTGGAGTTCTTGATTTAAATCGTTCTGAATGTGTACGAAATGAAATTAGGTGTTCTCGTCTTCCAGATAATGTAAAAAATAATATTTTAATACGACATGGAATTGCTGAGGGTATTCTTACAGCATTTGCATGGGCTTCAGCCCAAGCTTACAATCAAGGTTTTACTTTATATAATGAGTTAACTTATCCA TTTTGCGTTCAACTAATTCTAATGGATGGGAACTATATTCAGTTGTTACGCTCTCAATTGAATTCAATAACATCGNTATGGAAAGCCGAGGA TTCAATGTTACC          ]
[+] EMBL AI975111             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGATCATAAAGTATTCGAAAACGAGGATGTAAATGAAGATGTTTATGAACCCGTAAACGAGACAATTGTTGACGTCGAGCGTTGTGTACATTATCGTATTCGGTCTGAATTAGCTTGGCAGTTACGGGGACCATTTCCTTTAAAGCCTCATTTTAATTTAGACGATCCAATTTGCTTTCTAGAAAACCCTATTGTATGCAATTATCGCCCAGAAGCATTTGATTTGCAACTTGTCGAGTGTTATAATTTCAATTGTTTACCATTTGCAAGAACGATCGATTTTTCCGAATTCGCTCGATCAATTGCAGGCTATTGGGCTCGTACACCATTCTGGGAAGGAGATCCTTGTGAATTTGGTTTACTTGGAGTTCTTGATTTAAATCGTTCTGAATGTGTACGAAATGAAATTAGTTGTTCTCGTCTTCCAGATAATGTAAAAAATAATATTTTAATACGACATGGAATTGCTGAGGGTATTCTTACAGCATTTGCATGGGCTTCAGCCCAAGCTTACAATCAA GTTTTACTTTATATAATGAG TAAC                                                                                                                           ]


>consensus_10165#0 AATACCAAGATTTTGTGGCACCACCCGACACATCTCGTTTTCTCCAGTTTTATTCAAACA ACCGTTTCATGACAGACTACGATCTAAAAGGGCCAACCCACCACCACACCATTCACTCCC TTTTTATGATGAAGCACCAACTGATACCTTCCCGAGTAAACAAGTGGATATTGTTGGTCA ATGGGGTTCTACCGACAGTAGTATAAAGAAATTAAGGTTTCGTCATGGTGAATTCTTAAA AACTATACCAACGTCATTTGAAAAACTCCATGAGTTGTATCATCTTGAGGATAACATGTG GTTTCATTCCATTGATATTCCTTTACAACATTCTGAAATGTTAGAATTTTCTCAATTTGT TACACGTACAAAACTCATCCCATGGATACCAGAGTCATACGACAGCAACCCAATTTTGTC GAGTTATTTAAAGTATCTTTTTTCTGAAGAGTTACATTCGGTCAACAGTAAGCCTGTTAA TATCCATGATCAAAGTGTTAATGGACTTAATGTACGCTCAGATTATCGGCGCAAAAAAAT ATCAATGATTATGGAAACCGTATATCGGTCATTTTTATCTGCTGGGACAGAATCACTAGT TAATGAGTTATCCACACAAATTGATGAACGTGGTACCATAGAAATGTTTTTAAAACGACT AGTCGATCATAAAGTATTCGAAAACGAGGATGTAAATGAAGATGTTTATGAACCCGTAAA CGAGACAATTGTTGACGTCGAGCGTTGTGTACATTATCGTATTCGGTCTGAATTAGCTTG GCAGTTACGGGGACCATTTCCTTTAAAGCCTCATTTTAATTTAGACGATCCAATTTGCTT TCTAGAAAACCCTATTGTATGCAATTATCGCCCAGAAGCATTTGATTTGCAACTTGTCGA GTGTTATAATTTCAATTGTTTACCATTTGCAAGAACGATCGATTTTTCCGAATTCGCTCG ATCAATTGCAGGCTATTGGGCTCGTACACCATTCTGGGAAGGAGATCCTTGTGAATTTGG TTTACTTGGAGTTCTTGATTTAAATCGTTCTGAATGTGTACGAAATGAAATTAGTTGTTC TCGTCTTCCAGATAATGTAAAAAATAATATTTTAATACGACATGGAATTGCTGAGGGTAT TCTTACAGCATTTGCATGGGCTTCAGCCCAAGCTTACAATCAAGGTTTTACTTTATATAA TGAGTTAACTTATCCATTTTTGCGTTCAACTAATTCTAATGGATGGGAACTATATTCAGT TGTTACGCTTTCAATTGAATTCATAACATCGTTATGGAAAGCCGAGGATTTCAATGTTAC CATATAATTTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)