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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10224#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 14 consensus length = 889 fasta sequence
[CAATCATGTTTCATGCATTAACGAACAATTATCCCATTGTTTCTTTTCAAATATTCTCCAACTAGTTGACCTGGTAACTGTTCAAATAATTTAAATTCATCCGTAGATGTAGTAACT-TCATCAGTTTCAAGACGATTTACAACTGTTACACAAACTAGGATGGCTCGATGACCGGTTAAATAGCAATGAGATGTAATTGCTGTACCCTCCATTTCCATATTTCTTATTCCATGCTCATAAGCCGACTGAAGAAAAGCTAACTTCTCTTCTTTGCTAAAAGTACAAATCGATCCATTCAATCTTCCTAGCTCTTCATAAAAGTCATTGGCAGTGATTGTACCACCAACAACAACTGAACATTTCAACGAAAGATTCTCAGAAAGCTTTTTCAACTCATTTACAGCATTTGAGTCCACTTTAGTTTGTCGACGGACAGGTTTACCAAGAATACACAATTCGTTATATGGTTCTAATTTGGTATTCACGCAACGATCGGACAACACTATTGTACCAGGTTTCACTCCTAAACC-ATCGGATGT-TCCTAAACGTATAAACAACACATCTTTGCAACCAGCA-TAATGTAATAATTTCGTCACTTCATGCAGCATAATTAATGCTGATGGTATGCCCATTCCATGATCTGCAAATAATATATGATCCACTTTGTAAAGTACAAATCTGGCATGCGAACCGGCTATATTTTCTACAGGTAATGCCAAACCAGCTAATTTAGCCATTGATATTGCAAAATTATGGATTCTACCACTGCTACCACATACACAGACG-CCTCTGACATCACCAAACTTCTCTTTGAAATCAAATGACTTTGTGGTGAATCCGAAATGATGGAACACATCTTCATCTAGTTCACTTAAATGACTATTCACAA]
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[+] EMBL CD096501 [ AATCATGTTTCATGCATTAACGAACAATTATCCCATTGTTTCTTTTCAAATATTCTCCAACTAGTTGACCAGGTCTCTGTGCAAATAATGTAAATTCATCGGTAGATATAGTAATT TGATCACCTTCAAGACGATTTACAGCTGTTACACAAACTAGAATAGCTCGATGACCGGTTAAATAGCAATGAGATGTAATTGCTGTACCCTCCATTTCCATATTTCTTATTCCATGCTCATAAGCCGACTGAAGAAAAGCTAACTTCTCTTCTTTGCTAAAAGTACAAATCGATCCATCCAATCTTCCTTGCTCTTCATAAAAGTCATTGGCAGCGATTGTACCACCAACAACAACTGAACATTCCAACGAAAGATTCTCAGAAAGCTTTTTCAACTCATTTACAGTGTTTAAGTCCACTATAGTTTGTCGACGGACAGGTTTACCAAGAATACACAATTCGTTATATGGTTCTAATTTGGTATTCACGCAACGATCGGACAACACTATTGTACCAGGTTTCACTCCTAGACC ACCGGATGT TCCTAAACGTATAAACAACACATCTTTGCAACCAGCA TAATGTAATAATTTCGTTACTTCATGCAGCATAATTAATGCTGATGGTATGCCCATTCCATGATCTGC AATAATATATGATCCACTTTGTAANGTAC ]
[+] EMBL CD147127 [ AATCATGTTTCATGCATTAACGAACAATTATCCCATTGTTTCTTTTCAAATATTCTCCAACTAGTTGACCTGGTAACTGTTCAAATAATTTAAATTCATCCGTAGATGTAGTAACT TCATCAGTTTCAAGACGATTTACAACTGTTACACAAACTAGGATGGCTCGATGACCGGTTAAATTGCAATGAGATGTAATTGCAGCACCCTCCATTTCCATATTTCTTATTCCATGATCATAAACTGACTGAAGAAAAGCTAACTTCTCTTCTTTGCTAAAAGTACAAATCGATCCATTCAATCTTCCTAGCTCTTCATAAAAGTCATTGGCAGTGATTGTACCACCAACAACAACTGAACATTTCAACGAAAGATTCTCAGAAAGCTTTTTCAACTCATTTACAGCATTTGAGTCCACCTTAGTTTGTCGACGGACAGGTTTACCAAGAATACACAATTCGTTATATGGTTCTAATTTGGTATTCACGCAACGATCGGACAACACTATTGTACCAGGTTTCACTCCTAAACC ATCGGATGT ]
[+] EMBL CD147117 [ AATCATGTTTCATGCATTAACGAACAATTATCCCATTGTTTCTTTTCAAATATTCTCCAACTAGTTGACCTGGTAACTGTTCAAATAATTTAAATTCATCCGTAGATGTAGTAACT TCATCAGTTTCAAGACGATTTACAACTGTTACACAAACTAGGATGGCTCGATGACCGGTTAAATTGCAATGAGATGTAATTGCAGCACCCTCCATTTCCATATTTCTTATTCCATGATCATAAACTGACTGAAGAAAAGCTAACTTCTCTTCTTTGCTAAAAGTACAAATCGATCCATTCAATCTTCCTAGCTCTTCATAAAAGTCATTGGCAGTGATTGTACCACCAACAACAACTGAACATTTCAACGAAAGATTCTCAGAAAGCTTTTTCAACTCATTTACAGCATTTGAGTCCACCTTAGTTTGTCGACGGACAGGTTTACCAAGAATACACAATTCGTTATATGGTTCTAATTTGGTATTCACGCAACGATCGGACAACACTATTGTACCAGGTTTCACTCCTAA ]
[+] EMBL CD143625 [ AATCATGTTTCATGCATTAACGAACAATTATCCCATTGTTTCTTTTCAAATATTCTCCAACTAGTTGACCAGGTCTCTGTGCAAATAATGTAAATTCATCGGTAGATATAGTAATT TGATCACCTTCAAGACGATTTACAGCTGCTACACGAACTAGAATAGCTCGATGACCGGTTAAATAGCAATGAGATGTAATTGCTGTACCCTCCATTTCCATATTTCTTATTCCATGCTCATAAGCCGACTGAAGAAAAGCTAACTTCTCTTCTTTGCTAAAAGTACAAATCGATCCATCCAATCTTCCTTGCTCTTCATAAAAGTCATTGGCAGCGATTGTACCACCAACAACAACTGAACATTCCAACGAAAGATTCTCAGAAAGCTTTTTCAACTCATTTACAGTGTTTAAGTCCACTATAGTTTGTCGACGGACAGGTTTACCAAGAATACACAATTCGTTATATGGTTCTAATTTGGTATTCACGCAACGATCGGACAACACTATTGTACCAGGTTTCACTCCTAGACC ACCGGATGTNCCCTAA ]
[-] EMBL CD096582 [ TGCATTAACGAACAATTATCCCA TGTTTCTTTTCAAATATTCTCCAACTAGTTGACCTGGTAACTGTTCAAATAATTTAAATTCATCCGTAGATGTAGTAACT TCATCAGTTTCAAGACGATTTACAACTGTTACACAAACTAGGATGGCTCGATGACCGGTTAAATAGCAATGAGATGTAATTGCTGTACCCTCCATTTCCATATTTCTTATTCCATGCTCATAAGCCGACTGAAGAAAAGCTAACTTCTCTTCTTTGCTAAAAGTACAAATCGATCCATTCAATCTTCCTAGCTCTTCATAAAAGTCATTGGCAGTGATTGTACCACCAACAACAACTGAACATTTCAACGAAAGATTCTCAGAAAGCTTTTTCAACTCATTTACAGCATTTGAGTCCACTTTAGTTTGTCGACGGACAGGTTTACCAAGAATACACAATTCGTTATATGGTTCTAATTTGGTATTCACGCAACGATCGGACAACACTATTGTACCAGGTTTCACTCCTAANCCAATCCCATGA TCTGCAAATAATATATGATCCA CTTTGTAAagtaca ]
[-] EMBL CD077366 [ GACCTGGTAACTGTTCAAATAATTTAAATTCATCCGTAGATGTAGTAACT TCATCAGTTTCAAGACGATTTACAACTGTTACACAAACTAGGATGGCTCGATGACCGGTTAAATAGCAATGAGATGTAATTGCTGTACCCTCCATTTCCATATTTCTTATTCCATGCTCATAAGCCGACTGAAGAAAAGCTAACTTCTCTTCTTTGCTAAAAGTACAAATCGATCCATTCAATCTTCCTAGCTCTTCATAAAAGTCATTGGCAGTGATTGTACCACCAACAACAACTGAACATTTCAACGAAAGATTCTCAGAAAGCTTTTTCAACTCATTTACAGCATTTGAGTCCACTTTAGTTTGTCGACGGACAGGTTTACCAAGAATACACAATTCGTTATATGGTTCTAATTTGGTATTCACGCAACGATCGGACAACACTATTGTACCAGGTTTCACTCCTAAACC ATCGGATGT TCCTAAACGTATAAACAACACATCCTTGCAACCgg ]
[+] EMBL CD134360 [ tctCTGTGCAAATAATGTAAATTCATCGGTAGATATAGTAATT TGATCACCTTCAAGACGA TTACAGCTG TACACAAACTAGAATAGCTCGATGACCGGTTAAATAGCAATGAGATGTAATTGCTGTACCCTCCATTTCCATATTTCTTATTCCATGCTCATAAGCCGACTGAAGAAAAGCTAACTTCTCTTCTTTGCTAAAAGTACAAATCGATCCATCCAATCTTCCTTGCTCTTCATAAAAGTCATTGGCAGCGATTGTACCACCAACAACAACTGAACATTCCAACGAAAGATTCTCAGAAAGCTTTTTCAACTCATTTACAGTGTTTAAGTCCACTATAGTTTGTCGACGGACAGGTTTACCAAGAATACACAATTCGTTATATGGTTCTAATTTGGTATTCACGCAACGATCGGACAACACTATTGTACa ]
[-] EMBL CD096549 [ gTCAAATAA TTAAATTCATCCGTAGATGTAGTAACT TCATCAGTTTCAAGACGATTTACAACTGTTACACAAACTAGGATGGCTCGATGACCGGTTAAATAGCAATGAGATGTAATTGCTGTACCCTCCATTTCCATATTTCTTATTCCATGCTCATAAGCCGACTGAAGAAAAGCTAACTTCTCTTCTTTGCTAAAAGTACAAATCGATCCATTCAATCTTCCTAGCTCTTCATAAAAGTCATTGGCAGTGATTGTACCACCAACAACAACTGAACATTTCAACGAAAGATTCTCAGAAAGCTTTTTCAACTCATTTACAGCATTTGAGTCCACTTTAGTTTGTCGACGGACAGGTTTACCAAGAATACACAATTCGTTATATGGTTCTAATTTGGTATTCACGCAACGATCGGACAACACTATTGTACCAGGTTTCACTCCTAAACC ATCGGATGT TCCTAAACGTATAAACAACACATCCTTGCAACCGGCA TAATATAATAATTTTGTCACTTCATGCATTAAAATTAATGTTGATGGTATACCAATTCCATGATCTGCAAATAATATATGATCCACTTTGTAAAGTACA ]
[-] EMBL CD096513 [ TTCATCCGTAGATGTAGTANCT TCATCAGTTTCAAGACGATTTACAACTGTTACACAAACTAGGATGGCTCGATGACCGGTTAAATTGCAATGAGATGTAATTGCAGCACCCTCCATTTCCATATTTCTTATTCCATGATCATAAACTGACTGAAGAAAAGCTAACTTCTCTTCTTTGCTAAAAGTACAAATCGATCCATTCAATCTTCCTAGCTCTTCATAAAAGTCATTGGCAGTGATTGTACCACCAACAACAACTGAACATTTCAACGAAAGATTCTCAGAAAGCTTTTTCAACTCATTTACAGCATTTGAGTCCACTTTAGTTTGTCGACGGACAGGTTTACCAAGAATACACAATTCGTTATATGGTTCTAATTTGGTATTCACGCAACGATCGGACAACACTATTGTACCAGGTTTCACTCCTAAACC ATCGGATGT TCCTAAACGTATAAACAACACATCCTTGCAACCGGCA TAATATAATAATTTTGTCACTTCATGCATTAAAATTAATGTCGATGGTATACCAATTCCATGATCTGCAAATAATATATGATCCACTTTGTAAAGTACA ]
[-] EMBL AI820466 [ gcCCGGTTAAATTGCACTGGGATGT GTTGTCGCCCCCCCCATTTCCATATTT TTTTTCCATGATCATAAACTGACTGAGGAAAAGCTAACTTCTCTTCTTTGCTAAAAGTACAAATCGATCCATTCAATCTTCCTAGCTCTTCATAAAAGTCATTGGCAGTGATT TACCACCAACAACAACTGAACATTTCAACGAAAGATTCTCAGAAAGCTTTTTCAACTCATTTACAGCATTTGAGTCCACTTTAGTTTGTCGACGGACAGGTTTACCAAGAATACACAATTCGTTATATGGTTCTAATTTGGTATTCACGCAACGATCGGACAACACTATTGTACCAGGTTTCACTCCTAAACC ATCGGATG ]
[+] EMBL CD136714 [ AAGAAAAGCTAACTTCTCTTCTTTGCTAAAAGTACAAATCGATCCATCCAATCTTCCTTGCTCTTCATAAAAGTCATTGGCAGCGATTGTACCACCAACAACAACTGAACATTCCAACGAAAGATTCTCAGAAAGCTTTTTCAACTCATTTACAGTGTTTAAGTCCACTATAGTTTGTCGACGGACAGGTTTACCAAGAATACACAATTCGTTATATGGTTCTAATTTGGTATTCACGCAACGATCGGACAACACTATTGTACCAGGTTTCACTCCTAGACC ACCGGATGT TCCTAAACGTATAAACAACACATCTTTGCAACCAGCA TAATGTAATAATTTCGTCACTTCATGCAGCATAATTAATGCTGATGGTATGCCCATTCCATGATCTGC ]
[-] EMBL CD077623 [ TTTGC ACCAGCANTAATGTAATAATTTCGTCACTTCATGCAGCATAATTAATGCTGATGGTATGCCCATTCCATGATCTGCAAATAATATATGATCCACTTTGTAAAGTACAAATCTGGCATGCGAACCGGCTATATTTTCTACAGGTAATGCCAAACCAGCTAATTTAGCCATTGATATTGCAAAATTATGGATTCTACCACTGCTACCACATACACAGACG CCTC ]
[+] EMBL CD156554 [ CAAACCAGCTAATTTAGCCATTGATATTGCAAAATTATGGATTCTACCACTGCTACCACATACACAGACGAACT TGACATCACCAAACTTCTCTTTGAAATCAAATGACTTTGTGGTGAATCCGAAATGATGGAACACATCTTCATCTAGTTCACTTAAATGACTATTCACAA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||