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Schistosoma mansoni
cluster # 10228 cluster # 10228       Sequences # 14       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10228#0 length = 1011 sequences # 14  

consensusID : consensus_10228#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 14
consensus length = 1011
fasta sequence
                              [CACTTTTTGTAGATTCGGGAGAAATTAAAGATGCATCTGAAGATAAGACAGGGACACCACCAACAACAGATGGAGAACTTATTGACGGCATACTAAATATATTTGTCAATCCAGGAGGAAGAGGTGCAGGAGGTGGGATATTTGAATTTTGTGTAAATGCTGAAGATGGAACGGAAGAGTGAGCATAGTTAAAATAATCTACAGGAACTTGAGTAGGATAAGTAGTTGGAAGTGGTTTCGATGACGGCGGGATTGTGGGTTCCATTGATGAAGAAACTAGAGGAACCTCACCAAATTGATTTGACGGTGTATTGTTGAATGTATACGAAGGTGGAGGATAACAAGGAGCAGCAACTCCGTTAGTAATTTCATTTGATGATGAAGGTGGTAATTTCGATTCACTAACGGTTGACGATTTCAAAGATTCCTGTGGATAATGTGACACATTATTCGGTAACTGTGGAGAAGATTCAGGCAGTGCTGATGCTGTTGTTGGAATACGATGTAAATAACCATAACCAATATCACAACCCAGTAAACCATTCCCACCCCAGTTGGAATCAGGTTTGAGATGTACTTCACGACATGAATCCAATTCAGAATTATAAACATACAATTGAATCACGTGCCCATCGGAAGAATCGATTAGTTCGAAAAAATCATCTCTATTATTCAATACAGAATTTGCACCAATTATATAATCTGTGTATGGTTTTAATCCAGCCAAATTCGCTGGCGATTTAGACTCTACACCTAATACGTGCCATACATTTTCATTAGCTCTGTCAAATGAACAATATCGAATGCTGACACCCATCAAACCCTGACCACCCCAATGATTATTGGGTATTAGAGTTACTTCACGACAAGATTGAGATTTAGACGAATAAACAAGTAAACGAACAGGTTTATCT-TTATTGGCCTGTAATAAATCTTTAATGCAGTCATTATCTTCCTCCAGACGTTTGTCACCAATTGCAACGATGAAATCAAAAAAGGCTTCCAAACCAG]

[+] EMBL CD071550             [CACTTTTTGTAGATTCGGGAGAAATTAAAGATGCATCTGAAGATAAGACAGGGACACCACCAACAACAGATGGAGAACTTATTGACGGCATACTAAATATATTTGTCAATCCAGGAGGAAGAGGTGCAGGAGGTGGGATATTTGAATTTTGTGTAAATGCTGAAGATGGAACGGAAGAGTGAGCATAGTTAAAATAATCTACAGGAACTTGAGTAGGATAAGTAGTTGGAAGTGGTTTCGATGACGGCGGGATTGTGGGTTCCATTGATGAAGAAACTAGAGGAACCTCACCAAATTGATTTGACGGTGTATTGTTGAATGTATACGAAGGTGGAGGATAACAAGGAGCAGCAACTCCGTTAGTAATTTCATTTGATGATGAAGGTGGTAATTTCGATTCACTAACGGTTGACGATTTCAAAGATTCCTGTGGATAATGTGACACATTATTCNGTAACTGTGGAGAAGATTCAGGCAGTGCTGATGCTGTTGTTGGAATACGATGTAAATAACCATAACCAATATCACAACCCAGTAAACCATTCCCAGCCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD191081             [        GTAGATTCGGGAGAAATTAAAGATGCATCTGAAGATAAGAGAGGGACACCACCAACAACAGATGGAGAACTTATTGACGGCATACTAAATATATTTGTCAATCCAGGAGGAAGAGGTGCAGGAGGTGGGATATTTGAATTTTGTGTAAATGCTGAAGATGGAACGGAAGAGTGAGCATAGTTAAAATAATCTACAGGAACTTGAGTAGGATAAGTAGTTGGAAGTGGTTTCGATGACGGCGGGATTGTGGGTTCCATTGATGAAGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD178632             [                                                                                                                                   GGTGGGATATTTGAATTTTGTGTAAATGCTGAAGATGGAACGGAAGAGTGAGCATAGTTAAAATAATCTACAGGAACTTGAGTAGGATAAGTAGTTGGAAGTGGTTTCGATGACGGCGGGATTGTGGGTTCCATTGATGAAGAAACTAGAGGAACCTCACCAAATTGATTTGACGGTGTATTGTTGAATGTATACGAAGGTGGAGGATAACAAGGAGCAGCAACTCCGTTAGTAATTTCATTTGATGATGAAGGTGGTAATTTCGATTCACTAACGGTTGACGATTTCAAAGATTCCTGTGGATAATGTGACACATTATTCGGTAACTGTGGAGAAGATTCAGGCAGTGCTGATGCTGTTGTTGGAATACGATGTAAATAACCATAACCAATATCACAACCCAGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD178370             [                                                                                                                                                                                       CATAGTTAAAATAATCTACAGGAACTTGAGTAGGATAAGTAGTTGGAAGTGGTTTCGATGACGGCGGGATTGTGGGTTCCATTGATGAAGAAACTAGAGGAACCTCACCAAATTGATTTGACGGTGTATTGTTGAATGTATACGAAGGTGGAGGATAACAAGGAGCAGCAACTCCGTTAGTAATTTCATTTGATGATGAAGGTGGTAATTTCGATTTACTAACGGTTGACGATTTCAAAGATTCCTGTGGATAATGTGACACATTATTCGGTAACTGTGGAGAAGATTCAGGCAGTGCTGATGCTGTTGTTGGAATACGATGTAAATAACCATAACCAATATCACAACCCAGTAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD129401             [                                                                                                                                                                                                                       GGATAAGTAGTTGGAAGTGGTTTCGATGACGGCGGGATTGTGGGTTCCATTGATGAAGAAACTAGAGGAACCTCACCAAATTGATTTGACGGTGTATTGTTGAATGTATACGAAGGTGGAGGATAACAAGGAGCAGCAACTCCGTTAGTAATTTCATTTGATGATGAAGGTGGTAATTTCGATTCACTAACGGTTGACGATTTCAAAGATTCCTGTGGATAATGTGACACATTATTCGGTAACTGTGGAGAAGATTCAGGCAGTGCTGATGCTGTTGTTGGAATACGATGTAAATAACCATAACCAATATCACAACCCAGTAAACCATTCCCACCCCAGTTGGAATCAGGTTTGAGATGTACTTCACGACATGAATCCAATTCAGAATTATAAACATACAATTGAATCACGTGCCCATCGGAAGAATCGATTAGTTCGAAAAAATCATCTCTATTATTCAATACAGAATTTGCACCAATTATATAATCTGTGTATGGTTTTAATCCAGCCAAATTCGCTGGCGATTTAGACTCTACACCTAATACGTGCCATACATTTTCATTAGCTCTGTCAAATGAACAATATCGAATGCTGACACCCATCAAACCCTGACCACCCCAATGATTATTGGGTATTAGAGTTACTTCACGACAAGATTGAGATTTAGACGAATAAACAAGTAAACGAA                                                                                                             ]
[+] EMBL BG932065             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGGGTTTCGTTGAATGTATACGAAGGTGGAGGATAACAAGGAGCAGCAACTCCGTTAGTAATTTCATTTGATGATGAAGGTGGTAATTTCGATTCACTAACGGTTGACGATTTCAAAGATTCCTGTGGATAATGTGACACATTATTCGGTAACTGTGGAGAAGATTCAGGCAGTGCTGATGCTGTTGTTGGAATACGATGTAAATAACCATAACCAATATCACAACCCAGTAAACCATTCCCACCCCAGTTGGAATCAGGTTTGAGATGTACTTCACGACATGAATCCAATTCAGAATTATAAACATACAATTGAATCACGTGCCCATCGGAAGAATCGATTAGTTCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD178920             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AGCAGCAACTCCGTTAGTAATTTCATTTGATGATGAAGGTGGTAATTTCGATTCACTAACGGTTGACGATTTCAAAGATTCCTGTGGATAATGTGACACATTATTCGGTAACTGTGGAGAAGATTCAGGCAGTGCTGATGCTGTTGTTGGAATACGATGTAAATAACCATAACCAATATCACAACCCAGTAAACCATTCCCACCCCAGTTGGAATCAGGTTTGAGATGTACTTCACGACATGAATCCAATTCAGAATTATAAACATACAATTGAATCACGTGCCCATCGGAAGAATCGATTAGTTCGAAAAAATCATCTCTATTATTCAATACAGAATTTGCACCAATTATATAATCTGTGTATGGTTTTAATCCAGCCAAATTCGCTGGCGATTTAGACTCTACACCTAATACGTGCCATACATTTTCATTAGCTCTGTCAAATGAACAATATCGAATGCTGACACCCATCAA                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD146986             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GCAGCAACTCCGTTAGTAATTTCATTTGATGATGAAGGTGGTAATTTCGATTCACTAACGGTTGACGATTTCAAAGATTCCTGTGGATAATGTGACACATTATTCGGTAACTGTGGAGAAGATTCAGGCAGTGCTGATGCTGTTGTTGGAATACGATGTAAATAACCATAACCAATATCACAACCCAGTAAACCATTCCCACCCCAGTTGGAATCAGGTTTGAGATGTACTTCACGACATGAATCCAATTCAGAATTATAAACATACAATTGAATCACGTGCCCATCGGAAGAATCGATTAGTTCGAAAAAATCATCTCTATTATTCAATACAGAATTTGCACCAATTATATAATCTGTGTATGGTTTTAATCCAGCCAAATTCGCTGGCGATTTAGACTCTACACCTAATACGTGCCATACATTTTCATTAGCTCTGTCAAATGAACAATATCGAATGCTGACACCCATCAAACCCTGAC                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD096101             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAGCAACTCCGTTAGTAATTTCATNTGATGATGAAGGTGGTAATTTCGATTCACTAACGGTTGACGATTTCAAAGATTCCTGTGGATAATGTGACACATTATTCGGTAACTGTGGAGAAGATTCAGGCAGTGCTGATGCTGTTGTTGGAATACGATGTAAATAACCATAACCAATATCACAACCCAGTAAACCATTCCCACCCCAGTTGGAATCAGGTTTGAGATGTACTTCACGACATGAATCCTATTCAGAATTATAAACGTACAATTGAATCACGTGCCCATCGGAAGAATCGATTAGTTCGAAAAAATCATCTCTATTATTCAATACAGAATTTGCACCAATTATATAATCTGTGTATGGTTTTAATCCAGCCAAATTCGCTGGCGATTTAGACTCTACACCTAATACGTGCCATACATTTTCATTAGCTCTGTCAAATGAACAATATCGAATGCTGACACCCATCAAACCCTGACCACCCCAATGATTATTGGGTATTAGAGTTACTTCACGACAAGATTGAGATTTAGACGAATAAACAAGTAAACGAACAGGTTTATCT TTATTGGCCTGTAATAAATCTTTAATGCAG                                                                   ]
[+] EMBL CD167904             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CCGTTAGTAATTTCATTTGATGATGAAGGTGGTAATTTCGATTCACTAACGGTTGACGATTTCAAAGATTCCTGTGGATAATGTGACACATTATTCGGTAACTGTGGAGAAGATTCAGGCAGTGCTGATGCTGTTGTTGGAATACGATGTAAATAACCATAACCAATATCACAACCCAGTAAACCATTCCCACCCCAGTTGGAATCAGGTTTGAGATGTACTTCACGACATGAATCCAATTCAGAATTATAAACATACAATTGAATCACGTGCCCATCGGAAGAATCGATTAGTTCGAAAAAATCATCTCTATTATTCAATACAGAATTTGCACCAATTATATAATCTGTGTATGGTTTTAATCCAGCCAAATTCGCTGGCGATTTAGACTCTACACCTAATACGTGCCATACATTTTCATTAGCTCTGTCAAATGAACAATATCGAATGCTGACACCCATCAAACCCTGACCACCCCAATGATTATTGGGTATTAGAGTTACTTCACGACAAGATTGAGATTTAGACGAATAAACAAGTAAACGAACAGGTTTATCT TTATTGGCCTGTAATAAATCTTTAATGCAGTCATTA                                                             ]
[+] EMBL CD114256             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CACTAACGGTTGACGATTTCAAAGATTCCTGTGGATAATGTGACACATTATTCGGTAACTGTGGAGAAGATTCAGGCAGTGCTGATGCTGTTGTTGGAATACGATGTAAATAACCATAACCAATATCACAACCCAGTAAACCATTCCCACCCCAGTTGGAATCAGGTTTGAGATGTACTTCACGACATGAATCCAATTCAGAATTATAAACATACAATTGAATCACGTGCCCATCGGAAGAATCGATTAGTTCGAAAAAATCATCTCTATTATTCAATACAGAATTTGCACCAATTATATAATCTGTGTATGGTTTTAATCCAGCCAAATTCGCTGGCGATTTAGACTCTACACCTAATACGTGCCATACATTTTCATTAGCTCTGTCAAATGAACAATATCGAATGCTGACACCCATCAAACCCTGACCACCCCAATGATTATTGGGTATTAGAGTTACTTCACGACAAGATTGAGATTTAGACGAATAAACAAGTAAACGAACAGGTTTATCT TTATTGGCCTGTAATAAATCTTTAATGCAGTCATTATCTTCCTCCAGACGTTTGTCACCAATTGCAACGATGAAATCAAAAAAGGCTTCCAAACCAG]
[-] EMBL CD095761             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TCAGGCAGTGCTGATGCTGTTGTTGGAATACGATGTAAGTATCCATAACCAATATCACAACCCAGTAAACCATTCCCACCCCAGTTGGAATCAGGTTTGAGATGTACTTCACGACATGAATCCAATTCAGAATTATAAACATACAATTGAATCACGTGCCCATCGGAAGAATCGATTAGTTCGAAAAAATCATCTCTATTATTCAATACAGAATTTGCACCAATTATATAATCTGTGTATGGTTTTAATCCAGCCAAATTCGCTGGCGATTTAGACTCTACACCTAATACGTGCCATACATATTCATTAGCTCTGTCAAATGAACAATATCGAATGCTGACACCCATCAAACCCTGACCACCCCAATGATTATTGGGTATTAGAGTTACTTCACGACAAGATTGAGATTTAGACGAATAAACAAGTAAACGAACAGGTTTATCTAGTATTGGCCTGTAATAAATCTTTAATGCAG                                                                   ]
[-] EMBL CD116375             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GTTGGAATACGATGTAAATAACCATAACCAATATCACAACCCAGTAAACCATTCCCACCCCAGTTGGAATCAGGTTTGAGATGTACTTCACGACATGAATCCAATTCAGAATTATAAACATACAATTGAATCACGTGCCCATCGGAAGAATCGATTAGTTCGAAAAAATCATCTCTATTATTCAATACAGAATTTGCACCAATTATATAATCTGTGTATGGTTTTAATCCAGCCAAATTCGCTGGCGATTTAGACTCTACGCCTAATACGTGCCATACATTTTCATTAGCTCTGTCAAATGAACAATATCGAATGCTGACACCCATCAAACCCTGACCACCCCAATGATTATTGGGTATTAGAGTTACTTCACGACAAGATTGAGATTTAGACGAATAAACAAGTAAACGAACAGGTTTATCT TTATTGGCCTGTAATAAATCT                                                                            ]
[-] EMBL BG931792             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TAACCATAACCAATATCACAACCCAGTAAACCATTCCCACCCCAGTTGGAATCAGGTTTGAGATGTACTTCACGACATGAATCCAATTCAGAATTATAAACATACAATTGAATCACGTGCCCATCGGAAGAATCGATTAGTTCGAAAAAATCATCTCTATTATTCAATACAGAATTTGCACCAATTATATAATCTGTGTATGGTTTTAATCCAGCCAAATTCGCTGGCGATTTAGACTCTACACCTAATACGTGCCATACATTTTCATTAGCTCTGTCAAATGAACAATATCGAATGCTGAC                                                                                                                                                                                                         ]


>consensus_10228#0 CACTTTTTGTAGATTCGGGAGAAATTAAAGATGCATCTGAAGATAAGACAGGGACACCAC CAACAACAGATGGAGAACTTATTGACGGCATACTAAATATATTTGTCAATCCAGGAGGAA GAGGTGCAGGAGGTGGGATATTTGAATTTTGTGTAAATGCTGAAGATGGAACGGAAGAGT GAGCATAGTTAAAATAATCTACAGGAACTTGAGTAGGATAAGTAGTTGGAAGTGGTTTCG ATGACGGCGGGATTGTGGGTTCCATTGATGAAGAAACTAGAGGAACCTCACCAAATTGAT TTGACGGTGTATTGTTGAATGTATACGAAGGTGGAGGATAACAAGGAGCAGCAACTCCGT TAGTAATTTCATTTGATGATGAAGGTGGTAATTTCGATTCACTAACGGTTGACGATTTCA AAGATTCCTGTGGATAATGTGACACATTATTCGGTAACTGTGGAGAAGATTCAGGCAGTG CTGATGCTGTTGTTGGAATACGATGTAAATAACCATAACCAATATCACAACCCAGTAAAC CATTCCCACCCCAGTTGGAATCAGGTTTGAGATGTACTTCACGACATGAATCCAATTCAG AATTATAAACATACAATTGAATCACGTGCCCATCGGAAGAATCGATTAGTTCGAAAAAAT CATCTCTATTATTCAATACAGAATTTGCACCAATTATATAATCTGTGTATGGTTTTAATC CAGCCAAATTCGCTGGCGATTTAGACTCTACACCTAATACGTGCCATACATTTTCATTAG CTCTGTCAAATGAACAATATCGAATGCTGACACCCATCAAACCCTGACCACCCCAATGAT TATTGGGTATTAGAGTTACTTCACGACAAGATTGAGATTTAGACGAATAAACAAGTAAAC GAACAGGTTTATCTTTATTGGCCTGTAATAAATCTTTAATGCAGTCATTATCTTCCTCCA GACGTTTGTCACCAATTGCAACGATGAAATCAAAAAAGGCTTCCAAACCAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)