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Schistosoma mansoni
cluster # 10292 cluster # 10292       Sequences # 15       consensus # 3


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10292#0 length = 1529 sequences # 10  
consensus_10292#1 length = 777 sequences # 4  
consensus_10292#2 length = 535 sequences # 1  

consensusID : consensus_10292#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 1529
fasta sequence
                              [ATATTATTTCTCCATTTTGTTGGCCCCCACTATTTGCCCCAAATACCAAGTGGAATACGTATCTATTGCACACTTGGGACCTTGCTTGTTAAAAGCATATGGATTTCAACAATGTGATTTCGTTTTAAGCTTTCGAAAGGGTCTAGTGTATGACGATAGCATGTTGTATCTTGAAAGTTGTCGATCTGCTATCCCGAGAATGCCTGTAAACCTCGAGTACTTAGGCTTTAAGCTGCCTGGAAATGTGGATGAGAAATATGTACAATTCAAGCTAAAATATAGAAAACAGTATCATGAGACAGAAGATGAGATTAGGTTCAATATCTTCAAGTCGAATATCTTGAAAGCACAATTGTATCAGGTATTTGAAAGAGGTTCAGCCATTTATGGAGTGACACCTTATTCAGATTTAACAACTGATGAATTCGCACGCACT-CATCTAACTGCTTCCTGGGTAGTGCCGTCTAGTAGAAGTAATACACCAACTTCGCTGGGAAAGGAGGTTAATAATATACCAAAAAACTTCGATTGGAGAGAAAAAGGCGCCGTAACTGAAGTAAAAAATCAAGGAATGTGTGGCTCTTGTTGGGCATTCTCAACCACTGGTAATGTTGAAAGTCAGTGGTTCCGCAAAACTGGAAAATTATTATCACTAAGTGAGCAGCAACTTGTTGACTGCGACGGTTTAGATGATGGTTGTAATGGTGGTCTTCCATCGAATGCCTATGAATCAATCATAAAAATGGGTGGTTTAATGCTTGAAGATAATTATCCTTATGATGCTAAAAATGAGAAATGTCATTTGAAAACTGATGGTGTTGCAGTTTACATTAATAGTTCAGTAAATTTAACTCAAGATGAAACAGAACTTGCTGCATGGCTCTATCATAATTCAACAATTAGTGTTGGTATGAATGCATTGCTTTTACAGTTTTATCAACATGGAATTAGTCATCCATGGTGGATCTTCTGTTCAAAGTATCTGCTTGATCATGCGGTTTTACTTGTTGGTTATGGAGTTTCCGAGAAAAATGAGCCCTTCTGGATTGTAAAAAATAGTTGGGGTGTTGAATGGGGTGAAAACGGTTACTTCCGTATGTATCGAGGTGATGGTACATGTGGTATTAATACTGTTGCTACGTCAGCGTTGATCTACTAGGGAGATTGTGCGTACATGTGTTTCTTATTCCATCCCAAAACTATTTATCTTATTCCTAACAGAATCTCAATTCAATTCCGTATTATTTTGTTGAAAATACTTTTTTCCAGATTCTGATTTTTATAACCCCCCACTTCTCTCATCATCCTCCTACATTTTTTTAATTAATGAATAAACTCCA-CTTGGAATCTCTGTAAAACGCTCACTTTTCGTTTTTTTATTTTGATGGTGGATGGGAAGGGGGTGAATAATCTCTTTTGAACAATTGCCTTTCTAATTTCATTAATCTCATAAACATTTTGTATTGATTATTTTTAAAGACATTATGCTCAATGCTTTAGGTCACAATTTTCTTAAATATAACATTCAA]

[-] EMBL CD092875             [ATATTATTTCTCCATTTTGTTGGCCCCCACTATTTGCCCCAAATACCAAGTGGAATACGTATCTATTGCACACTTGGGACCTTGCTTGTTAAAAGCATATGGATTTCAACAATGTGATTTCGTTTTAAGCTTTCGAAAGGGTCTAGTGTATGACGATAGCATGTTGTATCTTGAAAGTTGTCGATCTGCTATCCCGAGAATGCCTGTAAACCTCGAGTACTTAGGCTTTAAGCTGCCTGGAAATGTGGATGAGAAATATGTACAATTCAAGCTAAAATATAGAAAACAGTATCATGAGACAGAAGATGAGATTAGGTTCAATATCTTCAAGTCGAATATCTTGAAAGCACAATTGTATCAGGTATTTGAAAGAGGTTCAGCCATTTATGGAGTGACACCTTATTCAGATTTAACAACTGATGAATTCGCACGCACT CATCTAACTGCTTCCTGGGTAGTGCCGTCTAGTAGAAGTAATACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD191513             [                                            ACCAAGTGGAATACGTATCTATTGCACACTTGGGACCTTGCTTGTTAAAAGCATATGGATTTCAACAATGTGATTTCGTTTTAAGCTTTCGAAAGGGTCTAGTGTATGACGATAGCATGTTGTATCTTGAAAGTTGTCGATCTGCTATCCCGAGAATGCCTGTAAACCTCGAGCACTTAGGCTTTAAGCTGCCTGGAAATGTGGATGAGAAATATGTACAATTCAAGCTAAAATATAGAAAACAGTATCATGAGAC   AGATGAGATTAGGTTCAATATCTTCAAGTCGAATATCTTGAAGGCACAATTGTATCAGGTATTTGAAAGAGGTTCAGCCATTTATGGAGTGACACCTTATTCAGATTTAACAACTGATGAATTCGCACGCACT CATCTAACTGCTTCCTGGGTAGTGCCGTCTAGTAGAAGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD191535             [                                            ACCAAGTGGAATACGTATCTATTGCACACTTGGGACCTTGCTTGTTAAAAGCATATGGATTTCAACAATGTGATTTCGTTTTAAGCTTTCGAAAGGGTCTAGTGTATGACGATAGCATGTTGTATCTTGAAAGTTGTCGATCTGCTATCCCGAGAATGCCTGTAAACCTCGAGTACTTAGGCTTTAAGCTGCCTGGAAATGTGGATGAGAAATATGTACAATTCAAGCTAAAATATAGAAAACAGTATCATGAGAC   AGATGAGATTAGGTTCAATATCTTCAAGTCGAATATCTTGAAAGCACAATTGTATCAGGTATTTGAAAGAGGTTCAGCCATTTATGGAGTGACACCTTATTCAGATTTAACAACTGATGAATTCGCACGCACT CATCTAACTGCTTCCTGGGTAGTGCCGTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD191570             [                                            ACCAAGTGGAATACGTATCTATTGCACACTTGGGACCTTGCTTGTTAAAAGCATATGGATTTCAACAATGTGATTTCGTTTTAAGCTTTCGAAAGGGTCTAGTGTATGACGATAGCATGTTGTATCTTGAAAGTTGTCGATCTGCTATCCCGAGAATGCCTGTAAACCTCGAGTACTTAGGCTTTAAGCTGCCTGGAAATGTGGATGAGAAATATGTACAATTCAAGCTAAAATATAGAAAACAGTATCATGAGAC   AGATGAGATTAGGTTCAATATCTTCAAGTCGAATATCTTGAAAGCACAATTGTATCAGGTATTTGAAAGAGGTTCAGCCATTTATGGAGTGACACCTTATTCAGATTTAACCACTGATGAATTCGCACGCACTCCATCTAACTGCTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD131426             [                                             CCAAGTGGAATACGTATCTATTGCACACTTGGGACCTTGCTTGTTAAAAGCATATGGATTTCAACAATGTGATTTCGTTTTAAGCTTTCGAAAGGGTCTAGTGTATGACGATAGCATGTTGTATCTTGAAAGTTGTCGATCTGCTATCCCGAGAATGCCTGTAAACCTCGAGTACTTAGGCTTTAAGCTGCCTGGAAATGTGGATGAGAAATATGTACAATTCAAGCTAAAATATAGAAAACAGTATCATGAGACAGAAGATGAGATTAGGTTCAATATCTTCAAGTCGAATATCTTGAAAGCACAATTGTATCAGGTATTTGAAAGAGGTTCAGCCATTTATGGAGTGACACCTTATTCAGATTTAACAACTGATGAATTCGCACGCACT CATCTAACTGCTTCCTGNGTAGTGCCGTCTAGTAGAAGTAATACACCAACTTCGCTGGGAAAGGAGGTTAATAATATACCAAAAAACTTCGATTGGAGAG AAAAGGCGCCGNTACTGAAGTAAAAAATCAAGGAATGTGTGGCTCTTGTTGGGCATTCTCAACCACTGGTAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD168446             [                                                                                                                                               TAGTGTATGACGATAGCATGTTGTATCTTGAAAGTTGTCGATCTGCTATCCCGAGAATGCCTGTAAACCTCGAGTGCTTAGGCTTTAAGCTGCCTGGAAATGTGGATGAGAAATATGTACAATTCAAGCTAAAATATAGAAAACAGTATCATGAGACAGAAGATGAGATTAGGTTCAATATCTTCAAGTCGAATATCTTGAAAGCACAATTGTATCAGGTATTTGAAAGAGGTTCAGCCATTTATGGAGTGACACCTTATTCAGATTTAACAACTGATGAATTCGCACGCACT CATCTAACTGCTTCCTGGGTAGAGCCGTCTAGTATAAGTAATACACCAACTTTGCTGGGAAAGGAGGGGAATAATATACCAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL SM07345              [                                                                                                                                                                                  TGTCGATCTGCTATCCCGAGAATGCCTGTAAACCTCGAGTACTTAGGCTTTAAGCTCCCTGGAAATGTGGATGAGAAATATGTACAATTCAAGCTAAAATATAGAAAACAGTATCATGAGACAGAAGATGAGATTAGGTTCAATATCTTCAAGTCGAATATCTTGAAAGCACAATTGTATCAGGTATTTGTAAGAGGTTCAGCCATTTATGGAGTGACACCTTATTCAGATTTAACAACTGATGAATTCGCACGCACT CATCTAACTGCTTCCTGGGTAGTGCCGTCTAGTAGAAGTAATACACCAACTTCGCTGGGTAAGGAGGTTAATAATATACCAAAAAACTTCGATTGGAGAGAAAAAGGCGCCGTAACTGAAGTAAAAAATCAAGGAATGTGTGGCTCTTGTTGGGCATTCTCAACCACTGGTAATGTTGAAAGTCAGTGGTTCCGCAAAACTGGAAAATTATTATCACTAAGTGAGCAGCAACTTGTTGACTGCGACGGTTTAGATGATGGTTGTAATGGTGGTCTTCCATCGAATGCCTATGAATCAATCATAAAAATGGGTGGTTTAATGCTTGAAGATAATTATCCTTATGATGCTAAAAATGAGAAATGTCATTTGAAAACTGATGGTGTTGCAGTTTACATTAATAGTTCAGTAAATTTAACTCAAGATGAAACAGAACTTGCTGCATGGCTCTATCATAATTCAACAATTAGTGTTGGTATGAATGCATTGCTTTTACAGTTTTATCAACATGGAATTAGTCATCCATGGTGGATCTTCTGTTCAAAGTATCTGCTTGATCATGCGGTTTTACTTGTTGGTTATGGAGTTTCCGAGAAAAATGAGCCCTTCTGGATTGTAAAAAATAGTTGGGGTGTTGAATGGGGTGAAAACGGTTACTTCCGTATGTATCGAGGTGATGGCTCATGTGGTATTAATACTGTTGCTACGTCAGCGATGATCTACTAGGGGGATTGTGCGTACATGTGTTTCTTATTCCATCCCCAAACTATTTATCTTATTCCTAACAGAATCTCAATACAATTCCGTATTATTTTGTTGAAAATACTTTTTTCCAGATTCTGATTTTTATAA CCCCCACTTCTCTCATCATCCTCCTACATTTTTCTAATTAATGAATAAACTCCA CTTGGAATCTCTGTAAAACGCTCACTTTTCGTTTTTTTATTTTGATGGTGGATGGGAAGGGGGTGAATAATCTCTTTTGAACAATTGCCTTTCTAATTTCATTAATCTCATAAACATTTTGTATTGATTATTTTTAAAGACATTATGCTCAATGCTTTAGGTCACAATTTTCTTAAATATAACATTCAA]
[+] EMBL AI977278             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TAGGTTCAATATCTTCAAGTCGAATATCTTGAAAGCACAATTGTATCAGGTATTTGAAAGAGGTTCAGCCATTTATGGAGTGACACCTTATTCAGATTTAACAACTGATGAATTCGCACGCACT CATCTAACTGCTTCCTGGGTAGTGCCGTCTAGTAGAAGTAATACACCAACTTCGCTGGGAAAGGAGGGTTATTATATACCAAAAAACTTCGATTGGAGAGAAAAAGGCGCCGTAACTGAAGTAAAAAATCAAGGAATGTGTGGCTCTTGTTGGGCATTCTCAACCACTGGTAATGTTGAAAGTCAGTGGGTCCGCAAAACTGGAAAATTATTATCACTAAGTGAGCAGCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD075306             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TATCTGCTTGATCATGCGGTTTTACTTGTTGGTTATGGAGTTTCCGAGAAAAATGAGCCCTTCTGGATTGTAAAAAATAGTTGGGGTGTTGAATGGGGTGAAAACGGTTACTTCCGTATGTATCGAGGTGATGGTACATGTGGTATTAATACTGTTGCTACGTCAGCGTTGATCTACTAGGGAGATTGTGCGTACATGTGTTTCTTATTCCATCCCAAAACTATTTATCTTATTCCTAACAGAATCTCAATTCAATTCCGTATTATTTTGTTGAAAATACTTTTTTCCAGATTCTGATTTTTATAACCCCCCACTTCTCTCATCATCCTCCTACATTTTTTTAATTAATGAATAAACTCCA CTTGGAATCTCTGTAAAACGCTCACTTTTCGTTTTTTTATTTTGATGGTGGATGGGAAGGGGGTGAATAATCTCTTTTGAACAATTGCCTTTCTAATTTCATTAATCTCATAAACATTTTGTATTGATTATTTTTAAAGACATTATGCTCAATGCTTTAGGTCACAATTTTCTTAAATATAACATTCAA]
[-] EMBL CD074579             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATAGTTGGGGTGTTGAATGGGGTGAAAACGGTTACTTCCGTATGTATCGAGGTGATGGTACATGTGGTATTAATACTGTTGCTACGTCAGCGTTGATCTACTAGGGAGATTGTGCGTACATGTGTTTCTTATTCCATCCCAAAACTATTTATCTTATTCCTAACAGAATCTCAATTCAATTCCGTATTATTTTGTTGAAAATACTTTTTTCCAGATTCTGATTTTTATAACCCCCCACTTCTCTCATCATCCTCCTACATTTTTTTAATTAATGAATAAACTCCAGCTTGGAATCTCTGTAAAACGCTCACTTTTCGTTTTTTTATTTTGATGGTGGATGGGAAGGGGGTGAATAATCTCTTTTGAACAATTGCCTTTCTAATTTCATTAATCTCATAAACATTTTGTATTGATTATTTTTAAAGACATTATGCGCAATGCTTTAGGGCACAATTTTCTTAAATAAAACATTCAA]


>consensus_10292#0 ATATTATTTCTCCATTTTGTTGGCCCCCACTATTTGCCCCAAATACCAAGTGGAATACGT ATCTATTGCACACTTGGGACCTTGCTTGTTAAAAGCATATGGATTTCAACAATGTGATTT CGTTTTAAGCTTTCGAAAGGGTCTAGTGTATGACGATAGCATGTTGTATCTTGAAAGTTG TCGATCTGCTATCCCGAGAATGCCTGTAAACCTCGAGTACTTAGGCTTTAAGCTGCCTGG AAATGTGGATGAGAAATATGTACAATTCAAGCTAAAATATAGAAAACAGTATCATGAGAC AGAAGATGAGATTAGGTTCAATATCTTCAAGTCGAATATCTTGAAAGCACAATTGTATCA GGTATTTGAAAGAGGTTCAGCCATTTATGGAGTGACACCTTATTCAGATTTAACAACTGA TGAATTCGCACGCACTCATCTAACTGCTTCCTGGGTAGTGCCGTCTAGTAGAAGTAATAC ACCAACTTCGCTGGGAAAGGAGGTTAATAATATACCAAAAAACTTCGATTGGAGAGAAAA AGGCGCCGTAACTGAAGTAAAAAATCAAGGAATGTGTGGCTCTTGTTGGGCATTCTCAAC CACTGGTAATGTTGAAAGTCAGTGGTTCCGCAAAACTGGAAAATTATTATCACTAAGTGA GCAGCAACTTGTTGACTGCGACGGTTTAGATGATGGTTGTAATGGTGGTCTTCCATCGAA TGCCTATGAATCAATCATAAAAATGGGTGGTTTAATGCTTGAAGATAATTATCCTTATGA TGCTAAAAATGAGAAATGTCATTTGAAAACTGATGGTGTTGCAGTTTACATTAATAGTTC AGTAAATTTAACTCAAGATGAAACAGAACTTGCTGCATGGCTCTATCATAATTCAACAAT TAGTGTTGGTATGAATGCATTGCTTTTACAGTTTTATCAACATGGAATTAGTCATCCATG GTGGATCTTCTGTTCAAAGTATCTGCTTGATCATGCGGTTTTACTTGTTGGTTATGGAGT TTCCGAGAAAAATGAGCCCTTCTGGATTGTAAAAAATAGTTGGGGTGTTGAATGGGGTGA AAACGGTTACTTCCGTATGTATCGAGGTGATGGTACATGTGGTATTAATACTGTTGCTAC GTCAGCGTTGATCTACTAGGGAGATTGTGCGTACATGTGTTTCTTATTCCATCCCAAAAC TATTTATCTTATTCCTAACAGAATCTCAATTCAATTCCGTATTATTTTGTTGAAAATACT TTTTTCCAGATTCTGATTTTTATAACCCCCCACTTCTCTCATCATCCTCCTACATTTTTT TAATTAATGAATAAACTCCACTTGGAATCTCTGTAAAACGCTCACTTTTCGTTTTTTTAT TTTGATGGTGGATGGGAAGGGGGTGAATAATCTCTTTTGAACAATTGCCTTTCTAATTTC ATTAATCTCATAAACATTTTGTATTGATTATTTTTAAAGACATTATGCTCAATGCTTTAG GTCACAATTTTCTTAAATATAACATTCAA



consensusID : consensus_10292#1
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NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
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fasta sequence
                              [CGGAGCCATTAATTCGGCACGCAGGATGATGCTAAAAATGAGAAATGTCATTTGAAAACTGATGGTGTTGCAGTTTACATTAATAGTTCAGTAAATTTAACTCAAGATGAAACAGAACTTGCTGCATGGCTCTATCATAATTCAACAATTAGTGTTGGTATGAATGCATTGCTTTTACAGTTTTATCAACATGGAATTAGTCATCCATGGTGGATCTTCTGTTCAAAGTATCTGCTTGATCATGCGGTTTTACTTGTTGGTTATGGAGTTTCCGAGAAAAATGAGCCCTTCTGGATTGTAAAAAATAGTTGGGGTGTTGAATGGGGTGAAAACGGTTACTTCCGTATGTATCGAGGTGATGGTACATGTGGTATTAATACTGTTGCTACGTCAGCGTTGATCTACTAGGGAGATTGTGCGTACATGTGTTTCTTATTCCATCCCAAAACTATTTATCTTATTCCTAACAGAATCTCAATTCAATTCCGTATTATTTTGTTGAAAATACTTTTTTCCAGATTCTGATTTTTATAACCCCCCACTTCTCTCATCATCCTCCTACATTTTTTTAATTAATGAATAAACTCCACTTGGAATCTCTGTAAAACGCTCACTTTTCGTTTTTTTATTTTGATGGTGGATGGGAAGGGGGTGAATAATCTCTTTTGAACAATTGCCTTTCTAATTTCATTAATCTCATAAACATTTTGTATTGATTATTTTTAAAGACATTATGCTCAATGCTTTAGGTCACAATTTTCTTAAATATAACATTCA]

[+] EMBL CD081482             [CGGAGCCATTAATTCGGCACGCAGGATGATGCTAAAAATGAGAAATGTCATTTGAAAACTGATGGTGTTGCAGTTTACATTAATAGTTCAGTAAATTTAACTCAAGATGAAACAGAACTTGCTGCATGGCTCTATCATAATTCAACAATTAGTGTTGGTATGAATGCATTGCTTTTACAGTTTTATCAACATGGAATTAGTCATCCATGGTGGATCTTCTGTTCAAAGTATCTGCTTGATCATGCGGTTTTACTTGTTGGTTATGGAGTTTCCGAGAAAAATGAGCCCTTCTGGATTGTAAAAAATAGTTGGGGTGTTGAATGGGGTGAAAACGGTTACTTCCGTATGTATCGAGGTGATGGTACATGTGGTATTAATACTGTTGCTACGTCAGCGTTGATCTACTAGGGAGATTGTGCGTACATGTGTTTCTTATTCCATCCCAAAACTATTTATCTTATTCCTAACAGAATCTCAATTCAATTCCGTATTATTTTGTTGAAAATACTTTTTTCCAGATTCTGATTTTTATAACCCCCCACTTCTCTCATCATCCTCCTACATTTTTTTAATTAATGAATAAACTCCACTTGGAATCTCTGTAAAACGCTCACTTTTCGTTTTTTTATTTTGATGGTGGATGGGAAGGGGGTGAATAATCTCTTTTGAACAATTGCCTTTCTAATTTCATTAATCTCATAAACATTTTGTATTGATTATTTTTAAAGACATTATGCTCAATGCTTTAGGTCACAATTTTCTTAAATATAACATTCA]
[-] EMBL CD062994             [                                                    TGAAAACTGATGGTGTTGCAGTTTACATTAATAGTTCAGTAAATTTAACTCAAGATGAAACAGAACTTGCTGCATGGCTCTATCATAATTCAACAATTAGTGTTGGTATGAATGCATTGCTTTTACAGTTTTATCAACATGGAATTAGTCATCCATGGTGGATCTTCTGTTCAAAGTATCTGCTTGATCATGCGGTTTTACTTGTTGGTTATGGAGTTTCCGAGAAAAATGAGCCCTTCTGGATTGTAAAAAATAGTTGGGGTGTTGAATGGGGTGAAAACGGTTACTTCCGTATGTATCGAGATGATGGTACATGTGGTATTAATACTGTTGCTACGTCAGCGTTGATCTACTAGGGgagc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD141096             [                                                               GGTGTTGCAGTTTACATTAATAGTTCAGTAAATNTAACTCAAGATGAAACAGAACTTGCTGCATGGCTCTATCATAATTCAACAATTAGTGTTGGTATGAATGCATTGCTTTTACAGTTTTATCAACATGGAATTAGTCATCCATGGTGGATCTTCTGTTCAAAGTATCTGCTTGATCATGCGGTTTTACTTGTTGGTTATGGAGTTTCCGAGAAAAATGAGCCCTTCTGGATTGTAAAAAATAGTTGGGGTGTTGAATGGGGTGAAAACGGTT CTTCCGTATGTATCGAGGTGATGGTACATGTGGTATTAATACTGTTGCTACGTCAGCGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD201829             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GAGGTGATGGTACATGTGGTATTAATACTGTTGCTAGGTCAGCGTTGATGTACTAGGGAGATTGTGCGTACATGTGTTTCTTATTCCATCCCAAAACTATTTATGTTATTCCTAACAGAATCTCAATTCGATTCCGTATTATTGTGTTGAAAATACTTTTTTCCAGATTGTGATTTTTATAACCCCCCACTTCTCTCATCATCCTCCTACATTTTTGTAATTAATGAATAAACTCC                                                                                                                                                                                             ]


>consensus_10292#1 CGGAGCCATTAATTCGGCACGCAGGATGATGCTAAAAATGAGAAATGTCATTTGAAAACT GATGGTGTTGCAGTTTACATTAATAGTTCAGTAAATTTAACTCAAGATGAAACAGAACTT GCTGCATGGCTCTATCATAATTCAACAATTAGTGTTGGTATGAATGCATTGCTTTTACAG TTTTATCAACATGGAATTAGTCATCCATGGTGGATCTTCTGTTCAAAGTATCTGCTTGAT CATGCGGTTTTACTTGTTGGTTATGGAGTTTCCGAGAAAAATGAGCCCTTCTGGATTGTA AAAAATAGTTGGGGTGTTGAATGGGGTGAAAACGGTTACTTCCGTATGTATCGAGGTGAT GGTACATGTGGTATTAATACTGTTGCTACGTCAGCGTTGATCTACTAGGGAGATTGTGCG TACATGTGTTTCTTATTCCATCCCAAAACTATTTATCTTATTCCTAACAGAATCTCAATT CAATTCCGTATTATTTTGTTGAAAATACTTTTTTCCAGATTCTGATTTTTATAACCCCCC ACTTCTCTCATCATCCTCCTACATTTTTTTAATTAATGAATAAACTCCACTTGGAATCTC TGTAAAACGCTCACTTTTCGTTTTTTTATTTTGATGGTGGATGGGAAGGGGGTGAATAAT CTCTTTTGAACAATTGCCTTTCTAATTTCATTAATCTCATAAACATTTTGTATTGATTAT TTTTAAAGACATTATGCTCAATGCTTTAGGTCACAATTTTCTTAAATATAACATTCA



consensusID : consensus_10292#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 535
fasta sequence
                              [TGCCTTAATTAGATTCATCCTATTTGAGTGGCATAACAAAATATCATCAATCACGTAGTCATTGGTTAGTAGTATCATGAGTTTAACAAAAGGTTAATTTCCTGTAGCTAAACTAGTAAAAGGTGGAGAAGGAATGCCGAGTGCATCACAATGTTCCTTGTTTTTCTGTTGTTTGATACCTCGACGGATAAAAAACATTATCTCTTCCTTACTTTTTTGCTTTGTTTCAGTACTTAGGCTTTAAGCTGCCTGGAAATGTGGATGAGAAATATGTACAATTCAAGCTAAAATATAGAAAACAGTATCATGAGACAGAAGATGAGATTAGGTTCAATATCTTCAAGTCGAATATCTTGAAAGCACAATTGTATCAGGTATTTGAAAGAGGTTCAGCCATTTATGGAGTGACACCTTATTCAGATTTAACAAGTTGGTATACACATTTTTAGTAATCGTAATTATCATTAGCTGATGAATTCGCACGCACTCATCTAACTGCTTCCTGGGTAGTGCCGTCTAGTAGAAGTAATACACC]

[-] EMBL CD068715             [TGCCTTAATTAGATTCATCCTATTTGAGTGGCATAACAAAATATCATCAATCACGTAGTCATTGGTTAGTAGTATCATGAGTTTAACAAAAGGTTAATTTCCTGTAGCTAAACTAGTAAAAGGTGGAGAAGGAATGCCGAGTGCATCACAATGTTCCTTGTTTTTCTGTTGTTTGATACCTCGACGGATAAAAAACATTATCTCTTCCTTACTTTTTTGCTTTGTTTCAGTACTTAGGCTTTAAGCTGCCTGGAAATGTGGATGAGAAATATGTACAATTCAAGCTAAAATATAGAAAACAGTATCATGAGACAGAAGATGAGATTAGGTTCAATATCTTCAAGTCGAATATCTTGAAAGCACAATTGTATCAGGTATTTGAAAGAGGTTCAGCCATTTATGGAGTGACACCTTATTCAGATTTAACAAGTTGGTATACACATTTTTAGTAATCGTAATTATCATTAGCTGATGAATTCGCACGCACTCATCTAACTGCTTCCTGGGTAGTGCCGTCTAGTAGAAGTAATACACC]


>consensus_10292#2 TGCCTTAATTAGATTCATCCTATTTGAGTGGCATAACAAAATATCATCAATCACGTAGTC ATTGGTTAGTAGTATCATGAGTTTAACAAAAGGTTAATTTCCTGTAGCTAAACTAGTAAA AGGTGGAGAAGGAATGCCGAGTGCATCACAATGTTCCTTGTTTTTCTGTTGTTTGATACC TCGACGGATAAAAAACATTATCTCTTCCTTACTTTTTTGCTTTGTTTCAGTACTTAGGCT TTAAGCTGCCTGGAAATGTGGATGAGAAATATGTACAATTCAAGCTAAAATATAGAAAAC AGTATCATGAGACAGAAGATGAGATTAGGTTCAATATCTTCAAGTCGAATATCTTGAAAG CACAATTGTATCAGGTATTTGAAAGAGGTTCAGCCATTTATGGAGTGACACCTTATTCAG ATTTAACAAGTTGGTATACACATTTTTAGTAATCGTAATTATCATTAGCTGATGAATTCG CACGCACTCATCTAACTGCTTCCTGGGTAGTGCCGTCTAGTAGAAGTAATACACC



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10292#0      ATATTATTTCTCCATTTTGTTGGCCCCCACTATTTGCCCCAAATACCAAGTGGAATACGT 60
consensus_10292#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10292#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10292#0      ATCTATTGCACACTTGGGACCTTGCTTGTTAAAAGCATATGGATTTCAACAATGTGATTT 120
consensus_10292#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10292#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10292#0      CGTTTTAAGCTTTCGAAAGGGTCTAGTGTATGACGATAGCATGTTGTATCTTGAAAGTTG 180
consensus_10292#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10292#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10292#0      TCGATCTGCTATCCCGAGAATGCCTGTAAACCTCGAGTACTTAGGCTTTAAGCTGCCTGG 240
consensus_10292#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10292#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10292#0      AAATGTGGATGAGAAATATGTACAATTCAAGCTAAAATATAGAAAACAGTATCATGAGAC 300
consensus_10292#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10292#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10292#0      AGAAGATGAGATTAGGTTCAATATCTTCAAGTCGAATATCTTGAAAGCACAATTGTATCA 360
consensus_10292#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10292#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10292#0      GGTATTTGAAAGAGGTTCAGCCATTTATGGAGTGACACCTTATTCAGATTTAACAACTGA 420
consensus_10292#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10292#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10292#0      TGAATTCGCACGCACTCATCTAACTGCTTCCTGGGTAGTGCCGTCTAGTAGAAGTAATAC 480
consensus_10292#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10292#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10292#0      ACCAACTTCGCTGGGAAAGGAGGTTAATAATATACCAAAAAACTTCGATTGGAGAGAAAA 540
consensus_10292#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10292#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10292#0      AGGCGCCGTAACTGAAGTAAAAAATCAAGGAATGTGTGGCTCTTGTTGGGCATTCTCAAC 600
consensus_10292#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10292#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10292#0      CACTGGTAATGTTGAAAGTCAGTGGTTCCGCAAAACTGGAAAATTATTATCACTAAGTGA 660
consensus_10292#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10292#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10292#0      GCAGCAACTTGTTGACTGCGACGGTTTAGATGATGGTTGTAATGGTGGTCTTCCATCGAA 720
consensus_10292#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10292#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10292#0      TGCCTATGAATCAATCATAAAAATGGGTGGTTTAATGCTTGAAGATAATTATCCTTATGA 780
consensus_10292#1      -------------------------------CGGAGCCATTAATTCGGCACGCAGGATGA 29
consensus_10292#2      -------------------------------------------TGCCTTAATTAGATTCA 17
                                                                                * *

consensus_10292#0      TGCTAAAAATGAGAAATGTCATTTGAAAACTGATGGTGTTGCAGTTTACATTAATAGTTC 840
consensus_10292#1      TGCTAAAAATGAGAAATGTCATTTGAAAACTGATGGTGTTGCAGTTTACATTAATAGTTC 89
consensus_10292#2      TCCTATTTGAGTGGCATAACAAAATATCATCAATCACGTAGTCATTG--GTTAGTAGTAT 75
                       * ***     * *  **  **    *  *   **   ** *   **    *** ****  

consensus_10292#0      AGTAAATTTAACTCAAGATGAAACAGAACTTGCTGCATGGCTCTATCATAATTCAACAAT 900
consensus_10292#1      AGTAAATTTAACTCAAGATGAAACAGAACTTGCTGCATGGCTCTATCATAATTCAACAAT 149
consensus_10292#2      CATGAGTTTAACAAAAGGTTAATTT---CCTGTAGCTAAACTA-GTAAAAGGTGGAGAAG 131
                         * * ******  *** * **      * **  **    **   * * *  *  * ** 

consensus_10292#0      TAGTGTTGGTATGAATGCATTGCTT-TTACAGTTTTATCAACATGGAATTAGTCATCCAT 959
consensus_10292#1      TAGTGTTGGTATGAATGCATTGCTT-TTACAGTTTTATCAACATGGAATTAGTCATCCAT 208
consensus_10292#2      GAATGCCGAGTGCATCACAATGTTCCTTGTTTTTCTGTTGTTTGATACCTCGACGGATAA 191
                        * **  *     *   ** ** *  **    ** * *        *  * * *    * 

consensus_10292#0      GGTGGATCTTCTGTTCAAAGTATCTGCTTGATCATGCGGTTTTACTTGTTGGTTATGGAG 1019
consensus_10292#1      GGTGGATCTTCTGTTCAAAGTATCTGCTTGATCATGCGGTTTTACTTGTTGGTTATGGAG 268
consensus_10292#2      AAAACATTATCTCTTC------CTTACTTTTTTGCTTTGTTTCAGTACTTAGGCTTTAAG 245
                            **  *** ***        * ***  *      **** * *  ** *   *  **

consensus_10292#0      TTTCCGAGAAAAATGAGCCCTTCTGGATTGTAAAAAATAGTTGGGGTGTTGAATGGGGTG 1079
consensus_10292#1      TTTCCGAGAAAAATGAGCCCTTCTGGATTGTAAAAAATAGTTGGGGTGTTGAATGGGGTG 328
consensus_10292#2      CTGCCTGGAAATGTGGA----TGAGAAATATGTACAAT--TCAAGCTAAAATATAG---- 295
                        * **  ****  **      *  * * * *  * ***  *   * *     ** *    

consensus_10292#0      AAAACGGTTACTTCCG-TATGTATCGAGGTGATGGTACATGTGGTATTAATACTGTTGCT 1138
consensus_10292#1      AAAACGGTTACTTCCG-TATGTATCGAGGTGATGGTACATGTGGTATTAATACTGTTGCT 387
consensus_10292#2      AAAACAGTATCATGAGACAGAAGATGAGATTAGGTTCAATAT--CTTCAAGTCGAATATC 353
                       ***** **  * *  *  *      *** * * * *  ** *    * **  *   *   

consensus_10292#0      ACGTCAGCGTTGATCTACTAGGGAGATTGTGCGTACATGTGTTTCTTATTCCATCCCAAA 1198
consensus_10292#1      ACGTCAGCGTTGATCTACTAGGGAGATTGTGCGTACATGTGTTTCTTATTCCATCCCAAA 447
consensus_10292#2      TTGAAAGCACAATTGTATCAGG-------TATTTGAAAGAGGTTCA---GCCATTTATGG 403
                         *  ***     * **  ***       *   *  * * * ***     ****      

consensus_10292#0      ACTATTTATCTTATTCCTAACAGAATCTCAATTCAATTCCGTATTATTTTGTTGAAAATA 1258
consensus_10292#1      ACTATTTATCTTATTCCTAACAGAATCTCAATTCAATTCCGTATTATTTTGTTGAAAATA 507
consensus_10292#2      AGTGAC-ACCTTATTCAGATTTAA----CAAGTTGGTAT-ACACATTTTTAGTAATCGTA 457
                       * *    * *******  *    *    *** *   *     *   ****  * *   **

consensus_10292#0      CTTTTTTCCAGATTCTGATTTTTATAACCCCCCACTTCTCTCATCATCCTCCTACATTTT 1318
consensus_10292#1      CTTTTTTCCAGATTCTGATTTTTATAACCCCCCACTTCTCTCATCATCCTCCTACATTTT 567
consensus_10292#2      ATTATCATTAGCTGATGAATTCG-----CACGCACTCATCTAACTG-CTTCCTGGGTAGT 511
                        ** *    ** *  *** **       * * ****  *** *    * ****   *  *

consensus_10292#0      TTTAATTAATGAATAAACTCCACTTGGAATCTCTGTAAAACGCTCACTTTTCGTTTTTTT 1378
consensus_10292#1      TTTAATTAATGAATAAACTCCACTTGGAATCTCTGTAAAACGCTCACTTTTCGTTTTTTT 627
consensus_10292#2      GCCGTCTAGTAGAAGTAATACACC------------------------------------ 535
                             ** *  *   * * ***                                     

consensus_10292#0      ATTTTGATGGTGGATGGGAAGGGGGTGAATAATCTCTTTTGAACAATTGCCTTTCTAATT 1438
consensus_10292#1      ATTTTGATGGTGGATGGGAAGGGGGTGAATAATCTCTTTTGAACAATTGCCTTTCTAATT 687
consensus_10292#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10292#0      TCATTAATCTCATAAACATTTTGTATTGATTATTTTTAAAGACATTATGCTCAATGCTTT 1498
consensus_10292#1      TCATTAATCTCATAAACATTTTGTATTGATTATTTTTAAAGACATTATGCTCAATGCTTT 747
consensus_10292#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10292#0      AGGTCACAATTTTCTTAAATATAACATTCAA 1529
consensus_10292#1      AGGTCACAATTTTCTTAAATATAACATTCA- 777
consensus_10292#2      -------------------------------
                                                      




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)