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Schistosoma mansoni
cluster # 10344 cluster # 10344       Sequences # 15       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10344#0 length = 687 sequences # 15  

consensusID : consensus_10344#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 15
consensus length = 687
fasta sequence
                              [TATATGCATATATATTTGGTATATTTGACATTATACAACTATTTCTGTCAGTACACAAATACTTCTTTTTTTAAAATGGTGTAACCAAACAAAAAAAAGGGTATAACACTGTTGAATAGAGTTCTTTCCAAATCAAGAAAAGAAAGTCGACTAGAAAACACACACAAAAAAAACGGATTGGTCCTTTGTTGAATATGTCATATCGAAGGATCCGATTGTATACATGTTTCTGTATGAATTAATGTTTTATCTAAGAAGATTATTATTATTATTATATGAATGACCTAATGTGTCAAAATGGATATTGATTCGAGAGTTTCTATGTCGCGACAATGAATGAACAACGCCCTTAAATGCAATTAGGAAAAAAAAAGAGAAGTAATTATTGCACATATAGAAGAAAACTATTTTCTGGGGGTGGGGTGGGAAATAAATTACAATGAAATATAGAAAACAAAAAAAATAAAATAAAACTAGACA-AAATAATATTGAACAGAATAATCTCTGTATGTTATGGTTACCAGTATAGGGTGACAAATGATGGTTTCTACCATTTCTACCATGGTAAATAATAAATGCCGTTTTTC-T-TTTTTTTTTCTTTCTTTCGTCTTTTGTTTTAAATAAAATGTACAAAACACAATAATTGGATAAAAATCTATAATGTTTTACAAATTACTAACTAAGTAG]

[+] EMBL CD185220             [TATATGCATATATATTTGGTATATTTGACATTATACAACTATTTCTGTCAGTACACAAATACTTCTTTTTTTAAAATGGTGTAACCAAAC AAAAAAAGGGTATAACACTGTTGAATAGAGTTCTCTCCAAATCAAGAAAAGAAAGTCAACTAGAAAACACACACAAAAAAAACGGATTGGTCCTTTGTTGAATATGTCATATCGAAGGATCCGATTGTATACATGTTTCTGTATGAATTAATGTTTTATCTAAGAAGATTATTATTATTATTATATGAATGACCTAATGTGTCAAAATGGATATTGATTCGAGAGTTTCTATGTCGCGACAATGAATGAACAGCGCCCTTAAATGCAATTAGGAAAAAAAAAGAGAAGTAATTATTGCACATATAGAAGAAAACTATTTTCTGGGGGTGGGGTGGGAAATAAATTACAATGAAATATAGAAAACAAAAAAAATAAAATAAAACTAGACA AAATAATATTGAACAGAATAATCTCTGTATGTTATGGTTACCAGTATAGGGTGACAAATGATGGTTTCTACCATTTCTACCATGGTAAATAA                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD131236             [                                                                                 TAACCAAACAAAAAAAAGGGTATAACACTGTTGAATAGAGTTCTTTCCAAATCAAGAAAAGAAAGTCGACTAGAAAACACACACAAAAAAAACGGATTGGTCCTTTGTTGAATATGTCATATCGAAGGATCCGATTGTATACATGTTTCTGTATGAATTAATGTTTTATCTAAGAAGATTATTATTATTATTATATGAATGACCTAATGTGTCAAAATGGATATTGATTCGAGAGTTTCTATGTCGCGACAATGAATGAACAACGCCCTTAAATGCAATTAGGAAAAAAAAAGAGAAGTAATTATTGCACATATAGAGGAAAACTATTTTCTGGGGGTGGGGTGGGAAATAAATTACAATGAAATATAGAAAACAAAAAAAATAAAATAAAACTAGACA AAATAATATTGAACAGAATAATCTCTGTATGTTATGGTTACCAGTATAGGGTGACAAATGATGGTTTCTACCATTTCTACCATGGTAAATAATAAATGCCGNNTTTC TNTTATTTTTTCTTTCTTTCGTCTTTTGGTNTAAAATAAATGTACAAAACACAATATTTGGATAAAAATCTATAATGTTTTACAAA TACTAACTAAGTA ]
[+] EMBL CD131295             [                                                                                 TAACCAAACAAAAAAAAGGGTATAACACTGTTGAATAGAGTTCTTTCCAAATCAAGAAAAGAAAGTCGACTAGAAAACACACACAAAAAAAACGGATTGGTCCTTTGTTGAATATGTCATATCGAAGGATCCGATTGTATACATGTTTCTGTATGAATTAATGTTTTATCTAAGAAGATTATTATTATTATTATATGAATGACCTAATGTGTCAAAATGGATATTGATTCGAGAGTTTCTATGTCGCGACAATGAATGAACAACGCCCTTAAATGCAATTAGGAAAAAAAAAGAGAAGTAATTATTGCACATATAGAGGAAAACTATTTTCTGGGGGTGGGGTGGGAAATAAATTACAATGAAATATAGAAAACAAAAAAAATAAAATAAAACTAGACA AAATAATATTGAACAGAATAATCTCTGTATGTTATGGTTACCAGTATAGGGTGACAAATGATGGTTTCTACCATTTCTACCATGGTAAATAATAAATGCCGTTTTTCTT TTTTTTTTTCCTTCTTTCGTCTTTTGTTTTAAATAAAATGTACAAAACACAATAATTGG                                        ]
[+] EMBL CD131492             [                                                                                 TAACCAAACAAAAAAAAGGGTATAACACTGTTGAATAGAGTTCTTTACAAATCAAGAAAAGAAAGTCGACTAGAAAACACACACAAAAAAAACGGATTGGTCCTTTGTTGAATATGTCATATCGAAGGATCCGATTGTATACATGTTTCTGTATGAATTAATGTTTTATCTAAGAAGATTATTATTATTATTATATGAATGACCTAATGTGTCAAAATGGATATTGATTCGAGAGTTTCTATGTCGCGACAATGAATGAACAACGCCCTTAAATGCAATTAGG AAAAAAAAGAGAAGTAATTATTGCACATATAGAAGAAAACTATTTTCTGGGGGTGGGGTGGGAAATAAATTACAATGAAATATAGAAAACAAAAAAAATAAAATAAAACTAGACA AAATAATATTGAACAGAATAATCTCTGTATGTTATGGTTACCAGTATAGGGTGACAAATGATGGTTTCTACCATTTCTACCATGGTAAATAATAAATGCCGNTTTTC   TTTNTTTTTCTTTCTTTCGTCTTTTGTTTTAAATAAAATGTACAAAACACAATAATTGGA                                       ]
[-] EMBL CD131709             [                                                                                    CCAAAC AAAAAAAGGGTATAACACTG TGAATAGAGTTC TTCCAAATCAAGAAAAGAAAGTCGACTAGAAAACACACACAAAAAAAACGGATTGGTCCTCTGTTGAATATGTCATATCGAAGGATCCGATTGTATACATGTTTCTGTATGAATTAATGTTTTATCTAAGAAGATTATTATTATTATTATATGAATGACCTAATGTGTCAAAATGGATATTGATTCGAGAGTTTCTATGTCGCGACAATGAATGAACAACGCCCTTAAATGCAATTAGGAAAAAAAAAGAGAAGTAATTATTGCACATATAGAAGAAAACTATTTTCTGGGGGTGGGGTGGGAAATAAATTACAATGAAATATAGAAAACAAAAAAAATAAAATAAAACTAGACA AAATAATATTGAACAGAATAATCTCTGTATGTTATGGTTACCAGTATAGGGTGACAAATGATGGTTTCTACCATTTCTACCATGGTAAATAATAAATGCCGTTTTTC   TTTTTTTTTCTTTCTTTCGTCTTTTGTTTTAAATAAAATGTACAAAACACAATAATTGGATAAAAATCTATAATGTTTTACAAATTACTAACTAAGTAG]
[-] EMBL CD131554             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAAAAAAAGAGAAGTAATTATTGCACATATAGAAGAAAACTATTTTCTGGGGGTGGGGTGGGAAATAAATTACAATGAAATATAGAAAACAAAAAAAATAAAATAAAACTAGACA AAATAATATTGAACAGAATAATCTCTGTATGTTATGGTTACCAGTATAGGGTGACAAATGATGGTTTCTACCATTTCTACCATGGTAAATAATAAATGCCGTTTTTCTT TTTTTTTTTCTTTCTTTCGTCTTTTGTTTTAAATAAAATGTACAAAACACAATAATTGGATAAAAATCTATAATGTTTTACAAATTACTAACTAAGTAG]
[-] EMBL CD185285             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAAAAAAAGAGAAGTAATTATTGCACATATAGAAGAAAACTATTTTCTGGGGGTGGGGTGGGAAATAAATTACAATGAAATATAGAAAACAAAAAAAATAAAATAAAACTAGACA AAATAATATTGAACAGAATAATCTCTGTATGTTATGGTTACCAGTATAGGGTGACAAATGATGGTTTCTACCATTTCTACCATGGTAAATAATAAATGCCGTTTTTC T TTTTTTTTTCTTTCCTTCGTCTTTTGTTTTAAGTAAAATGTACAAAACACAATAATTGGATAAAAATCTATAATGTTTTACAAATTACTAACTAAGTAG]
[-] EMBL CD185210             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAAAAAAAGAGAAGTAATTATTGCACATATAGAAGAAAACTATTTTCTGGGGGTGGGGTGGGAAATAAATTACAATGAAATATAGAAAACAAAAAAAATAAAATAAAACTAGACA AAATAATATTGAACAGAATAATCTCTGTATGTTATGGTTACCAGTATAGGGTGACAAATGATGGTTTCTACCATTTCTACCATGGTAAATAATAAATGCCGTTTTTC T TTTTTTTTTCTTTCTTTCGTCTTTTGTTTTAAATAAAATGTACAAAACACAATAATTGGATAAAAATCTATAATGTTTTACAAATTACTAACTAAGTAG]
[-] EMBL CD131468             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAAAAAAAGAGAAGTAATTATTGCACATATAGAAGAAAACTATTTTCTGGGGGTGGGGTGGGAAATAAATTACAATGAAATATAGAAAACAAAAAAAATAAAATAAAACTAGACA AAATAATATTGAACAGAATAATCTCTGTATGTTATGGTTACCAGTATAGGGTGACAAATGATGGTTTCTACCATTTCTACCATGGTAAATAATAAATGCCGTTTTTC T TTTTTTTTTCTTTCTTTCGTCTTTTGTTTTAAATAAAATGTACAAAACACAATAATTGGATAAAAATCTATAATGTTTTACAAATTACTAACTAAGTAG]
[-] EMBL CD133784             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAAAAAAAGAGAAGTAATTATTGCACATATAGAAGAAAACTATTTTCTGGGGGTGGGGTGGGAAATAAATTACAATGAAATATAGAAAACAAAAAAAATAAAATAAGACTAGACA AAATAATATTGAACAGAATAATCTCTGTATGTTATGGTTACCAGTATAGGGTGACAAATGATGGTTTCTACCATTTCTACCATGGTAAATAATAAATGCCGTTTTTC   TTTTTTTTTCTTTCTTTCGTCTTTTGTTTTAAATAAAATGTACAAAGCACAATAATTGGATAAAAATCTATAATGTTTTACAAATTACTAACTAAGTAG]
[+] EMBL CD131604             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAAAAAAAGAGAAGTAATTATTGCACATATAGAAGAAAACTATTTTCTGGGGGTGGGGTGGGAAATAAATTACAATGAAATATAGAAAACAAAAAAAATAAAATAAAACTAGACA AAATAATATTGAACAGAATAATCTCTGTATGTTATGGTTACCAGTATAGGGTGACAAATGATGGTTTCTACCATTTCTACCATGGTAAATAATAAATGCCGTTTTTC T TTTTTTTTTCTTTCTTTCGTCTTTTGTTTTAAATAAAATGTACAAAACACAATAATTGGATAAAAATCTATAATGTTTTACAAATTACTAACTAAGTA ]
[-] EMBL CD131533             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAAAAAAGAGAAGTAATTATTGCACATATAGAAGAAAACTATTTTCTGGGGGTGGGGTGGGAAATAAATTACAATGAAATATAGAAAACAAAAAAAATAAAATAAAACTAGACA AAATAATATTGAACAGAATAATCTCTGTATGTTATGGTTACCAGTATAGGGTGACAAATGATGGTTTCTACCATTTCTACCATGGTAAATAATAAATGCCGTTTTTC T TTTTTTTTTCTTTCTTTCGTCTTTTGTTTTAAATAAAATGTACAAAACACAATAATTGGATAAAAATCTATAATGTTTTACAAATTACTAACTAAGTAG]
[+] EMBL CD131473             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAAAAAAGAGAAGTAACTATTGCACATATAGAAGAAAACTATTTTCTGGGGGTGGGGTGGGAGATAAATTACAATGAAATATAGAAAACAAAAAAAATAAAATAAAACTAGACA AAATAATATTGGACAGAATAATCTCTGTATGTTATGGTTACCAGTATAGGGTGACAAATGATGGTTTCTACCATTTCTACCATGGTAAATAATAAATGCCGTTTTTC T TTTTTTTTTCTTTCTTTCGTCTTTTGTTTTAAATAAAATGTACAAAACACAATAATTGGATAAAAATCTATAATGTTTTACAAATTACTAACTAAGTA ]
[+] EMBL CD131374             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAAAAAAGAGAAGTAACTATTGCACATATAGAAGAAAACTATTTTCTGGGGGTGGGGTGGGAGATAAATTACAATGAAATATAGAAAACAAAAAAAATAAAATAAAACTAGACA AAATAATATTGGACAGAATAATCTCTGTATGTTATGGTTACCAGTATAGGGTGACAAATGATGGTTTCTACCATTTCTACCATGGTAAATAATAAATGCCGTTTTTC T TTTTTTTTTCTTTCTTTCGTCTTTTGTTTTAAATAAAATGTACAAAACACAATAATTGGATAAAAATCTATAATGTTTTACAAATTACTAACTAAGTA ]
[+] EMBL CD131286             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAAAAAAGAGAAGTAATTATTGCACATATAGAAGAAAACTATTTTCTGGGGGTGGGGTGGGAAATAAATTACAATGAAATATAGAANACAAAAATAATAAAATAAAACTAGACANNAAT ATATTGAACAGAATAATCTCTGTAT                                                                                                                                                                                   ]


>consensus_10344#0 TATATGCATATATATTTGGTATATTTGACATTATACAACTATTTCTGTCAGTACACAAAT ACTTCTTTTTTTAAAATGGTGTAACCAAACAAAAAAAAGGGTATAACACTGTTGAATAGA GTTCTTTCCAAATCAAGAAAAGAAAGTCGACTAGAAAACACACACAAAAAAAACGGATTG GTCCTTTGTTGAATATGTCATATCGAAGGATCCGATTGTATACATGTTTCTGTATGAATT AATGTTTTATCTAAGAAGATTATTATTATTATTATATGAATGACCTAATGTGTCAAAATG GATATTGATTCGAGAGTTTCTATGTCGCGACAATGAATGAACAACGCCCTTAAATGCAAT TAGGAAAAAAAAAGAGAAGTAATTATTGCACATATAGAAGAAAACTATTTTCTGGGGGTG GGGTGGGAAATAAATTACAATGAAATATAGAAAACAAAAAAAATAAAATAAAACTAGACA AAATAATATTGAACAGAATAATCTCTGTATGTTATGGTTACCAGTATAGGGTGACAAATG ATGGTTTCTACCATTTCTACCATGGTAAATAATAAATGCCGTTTTTCTTTTTTTTTTCTT TCTTTCGTCTTTTGTTTTAAATAAAATGTACAAAACACAATAATTGGATAAAAATCTATA ATGTTTTACAAATTACTAACTAAGTAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)