|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10423#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 976 fasta sequence
[GAGCCAGATTCGGCACGAGGGAAATACACAATTCTGGATTGATATCTTTAAATGTTCTATGTTGTGTAGCATGAATACCGCTGGGTCGTTGAATCCCACAATTCCAAATCAAAATGATATTCATACGAACTTAATGTATAGAAGAGATTTACTTGACTATATATTAAATTATATGAATAGTAACCGGATGGATGTTATATGCTCAAACTCATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCTATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCTTTGAATCACCTAAGAATACATTAGAATCTAATTCCAGATTATTAATTCATCAATACTTAGAAATAGATCATTGTAATTCAATGAAAATAAATGAAAATTCATCAATTACACCACGTATAAAACGTTATAAATGTACATATCCTAATTGTAC-A-AAGCATA-TTATAAACGTTCTCATTTAAATG-ACATTAT-CA-TTACATACTGGTGCTAANCCACA-TTATGT-ATCAACCTGG-NTGT-ATGCACGTTTAACGTGCTGATCATATCCGGNATGACGTGC-CTACTGGGGACGTATTTCATGAATGGTGGTTAACGTTTAAACGAAGGACCTTTAAGTCATTAATAAAATGTGGCAAATTATTTTTAAC-GTTTTCTATTTCCAA]
[+] EMBL CD080043 [GAGCCAGATTCGGCACGAGGGAAATACACAATTCTGGATTGATATCTTTAAATGTTCTATGTTGTGTAGCATGAATACCGCTGGGTCGTTGAATCCCACAATTCCAAATCAAAATGATATTCATACGAACTTAATGTATAGAAGAGATTTACTTGACTATATATTAAATTATATGAATAGTAACCGGATGGATGTTATATGCTCAAACTCATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCTATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAACTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCTTTGAATCACCTAAGAATACATTAGAATCTAATTCCAGATTATTAATTCATCAATACTTAGAAATAGATCATTGTAATTCAATGAAAATAAATGANAATTCATCAATTACACCACGTATAANACGTTATAAATGTACATATCCTAATTGTAC A AAGCATATTTAT AACGTTCTCATTTAAATG ACATTATNCA TTACATACTGGTGCTAANCCACA TTATGT ATCAAACTGGNNTGT ATGCACGTTTAACGTGCTGATCATATCCGGNATGACGTGC CTACTGGGGACGTATTTCATGAATGGTGGTTAACGTTTAAACGAAGGACCTTTAAGTCATTAATAAAATGTGGCAAATTATTTTTAAC GTTTTCTATTTCCAA]
[+] EMBL CD080055 [ GAAATACACAATTCTGGATTGATATCTTTAAATGTTCTATGTTGTGTAGCATGAATACCGCTGGGTCGTTGAATCCCACAATTCCAAATCAAAATGATATTCATACGAACTTAATGTATAGAAGAGATTTACTTGACTATATATTAAATTATATGAATAGTAACCGGATGGATGTTATATGCTCAAACTCATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCTATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAACTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCTTTGAATCACCTAAGAATACATTAGAATCTAATTCCAGATTATTAATTCATCAATACTTAGAAATAGATCATTGTAATTCAATGAAAATAAATGAAAATTCATCAATTACACCACGTATAAAACGTTATAAATGTACATATCCTAATTGTAC A AAGCATA TTATAAACGTTCTCATTT AATG AACTTAT CA TTACATACT GTGCTAA CCACA TTATGT ATCAACCTGG TGT ATGCACGTTTACCGTGCTGACAATATCAGGTATGAC TGCACTACTGTGGACGTATTTCATGTATGTTGGTT ACGTTTAACCG TGGACCTTTAAATCATTACTGAAA GTTGTAAATTA TTTAAACGGTTTTTTATTTaaa ]
[+] EMBL AI068238 [ CAAACTCATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCTATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCATTGAATCACCTAAGAATA ]
[+] EMBL AI067175 [ CAAACTCATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCTATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCTTTGAATCACCTAAGAATACATTAGAATCTAATTCCAGATTATTAATTCATCAATACTTAGAAATAGATCATTGTAATTCAATGAAAATAAATGAAAATTCATCAATTACACCACGTATAAAACGTTATAAATGTACATATCCTAATTGTAC ACAAGCATA TTATAAACGTTCTCATTTAAATGAACATTAT CATTTACATACTGGTG ]
[+] EMBL AI067231 [ CATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCTATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCTTTGAATCACCTAAGAATACATTAGAATCTAATTCCAGATTATTAATTCATCAATACTTAGAAATAGATCATTGTAATTCAATGAAAATAAATGAAAATTCATCAATTACACCACGTATAAAACGTTATAAATGTACATATCCTAATTGTACAA AAGCATA TTATAAACGTTCTCATTTAAATGAACATTAT CATTTACATACTGGTGCTAAACCACATTTATGTAATCAACCTGG TTGTAATGCACGTTTt ]
[+] EMBL AI068052 [ CATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCTATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCTTTGAATCACCTAAGAATACATTAGAATCTAA ]
[+] EMBL AI068306 [ CATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCTATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCTTTGAATCACCTAAGAATACATTAGAATCTAATTCCAGATTATTAA ]
[+] EMBL AI068303 [ CATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCTATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCTTTGAATCACCTAAGAATA ]
[+] EMBL AI068361 [ CATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCTATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCTTTGAATCACCTAAGAATA ]
[+] EMBL AI067118 [ CATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCTATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCTTTGAATCACCTAAGAATA ]
[+] EMBL AI067141 [ CATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCTATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAGTTATTCATCAACATCAGCTACATATAATA ]
consensusID : consensus_10423#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 953 fasta sequence
[TCGCGGCCAAAAATTCGGCACGAGGGAATACCGCTGGGTCGTTGAATCCCACAATTCCAAATCAAAATGATATTCATATGAACTTAATGTATAGAAGAGATTTACTTGACTATATATTAAATTATATGAATAGTAACCGGATGGATGTTATATGCTCAAACTCATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAAT-GTATTCTACGCT-ATTTCTTAACAACTCATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCTTTGAATCACCTAAGAATACTTTAGAATCTAATTCCAGATTATTAATTCATCAATACTTAGAAATAGATCATTGTAATTCAATGAANATAAATGAGNATTCATCAATTACACCACGTATAAAACGTTATAAATGTACATATCCTAATTGTACAAAAGCATATTATAAACGTTCTCATTTAAATGAACATTATCNATTACATACTGGNTGCTAACCACATTTATGNTATCAACCTGGNTGTAATGCACGTTTACACGTGCTGATCAATATCACGTCATAGACGTGCCATACTGGNGAACGTATTTTCATTGAATGGGTTGTTAAACGTTTAAACGTATGATCATTAAAGTCATTAACTAAAATGTTGTACAAATTTTTATTACTGTTTTTTTCATATTCGAAA]
[+] EMBL CD079860 [TCGCGGCCAAAAATTCGGCACGAGGGAATACCGCTGGGTCGTTGAATCCCACAATTCCAAATCAAAATGATATTCATATGAACTTAATGTATAGAAGAGATTTACTTGACTATATATTAAATTATATGAATAGTAACCGGATGGATGTTATATGCTCAAACTCATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAAT GTATTCTACGCT ATTTCTTAACAACTCATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCTTTGAATCACCTAAGAATACTTTAGAATCTAATTCCAGATTATTAATTCATCAATACTTAGAAATAGATCATTGTAATTCAATGAANATAAATGAGNATTCATCAATTACACCACGTATAAAACGTTATAAATGTACATATCCTAATTGTACAAAAGCATATTATAAACGTTCTCATTTAAATGAACATTATCNATTACATACTGGNTGCTAACCACATTTATGNTATCAACCTGGNTGTAATGCACGTTTACACGTGCTGATCAATATCACGTCATAGACGTGCCATACTGGNGAACGTATTTTCATTGAATGGGTTGTTAAACGTTTAAACGTATGATCATTAAAGTCATTAACTAAAATGTTGTACAAATTTTTATTACTGTTTTTTTCATATTCGAAA]
[+] EMBL AI067034 [ CATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGGTA TCTACGCTNATTcnn ]
[+] EMBL AI067066 [ CATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCAATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCCCTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATCAGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAAT GTATTCT ]
consensusID : consensus_10423#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 696 fasta sequence
[CAACAACATCAAAATCATCAGATTCTAAATTGTACTAATGACCGGTTGGAGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCTATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCTTTGAATCACCTAAGAATACATTAGAATCTAATTCCAGATTATTAATTCATCAATACTTAGAAATAGATCATTGTAATTCAATGAAAATAAATGAAAATTCATCAATTACACCACGTATAAAACGTTATAAATGTACATATCCTAATTGTACAAAAGCATATTATAAACGTTCTCATTTAAATGAACATTATCATTTACATACTGGTGGCTAAACCACATTTATGTAATCAACCTGGTTGTAATGGCACGTTTTACACGTGCTGATCAATTATCACGTCATAGACGTGCACATACTAGGTGAACGTAATTNTCATTGGTATGGTTTGTTTAAAACGTTTTAAACGTAGTGATCATTTAAAAGTACATTTAACTAGAAATGTATGTACAAAA-TTAATTTATAAACTGGTTTTTTTTTC-TATATATTTCG-AAAAAAAGAA]
[+] EMBL CD082375 [CAACAACATCAAAATCATCAGATTCTAAATTGTACTAATGACCGGTTGGAGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTAATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCTATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCTTTGAATCACCTAAGAATACATTAGAATCTAATTCCAGATTATTAATTCATCAATACTTAGAAATAGATCATTGTAATTCAATGAAAATAAATGAAAATTCATCAATTACACCACGTATAAAACGTTATAAATGTACATATCCTAATTGTACAAAAGCATATTATAAACGTTCTCATTTAAATGAACATTATCATTTACATACTGGTGGCTAAACCACATTTATGTAATCAACCTGGTTGTAATGGCACGTTTTACACGTGCTGATCAATTATCACGTCATAGACGTGCACATACTAGGTGAACGTAATTNTCATTGGTATGGTTTGTTTAAAACGTTTTAAACGTAGTGATCATTTAAAAGTACATTTAACTAGAAATGTATGTACAAAA TTAATTTATAAACTGGTTTTTTTTTC TATATATTTCG AAAAAAAGAA]
[-] EMBL CD075976 [ CAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCAATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGNCGATATGTTCTTTGAATCCCCTAAGAATACATTAGAATCTAATTCCAGATTATTAATTCATCAATACTTAGAAATAGATCATTGTAATTCAATGAAAATAAATGAAAATTCATCAATTACCCCACGTATAAAACGTTATAAATGTACATATCCTAATTGTACAAAAGCATATTATAAACGTTCTCATTTAAATGAACATTATCATTTACATACTGGT GCTAAACCCCATTTATGTAATCAACCTGGTTGTAAT GCACGTTTTACACGTGCTGATCAATTATCACGTCATAGACGTGCACATACT GGTGAACGTAATTTTCATT GTAATGTTTGTTTAAAACGTTTTAAACGTAGTGATCATTTAAAAGTACATTTAACTAGAAATGTATGTACAAAATTTAATTTATAAACT GTTTTTTTTTCATATATATTTCGAAAAAAAAGAA]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_10423#0 GAGCCAGATTCGGCACGAGGGAAATACACAATTCTGGATTGATATCTTTAAATGTTCTAT 60
consensus_10423#1 ------------------------------------------------TCGCGGCCAAAA 12
consensus_10423#2 ------------------------------------------------------------
consensus_10423#0 GTTGTGTA-GCATGAATACCGCTGGGTCGTTGAATCCCACAATTCCAAATCAAAATGATA 119
consensus_10423#1 ATTCGGCACGAGGGAATACCGCTGGGTCGTTGAATCCCACAATTCCAAATCAAAATGATA 72
consensus_10423#2 ------------------------------------------------------------
consensus_10423#0 TTCATACGAACTTAATGTATAGAAGAGATTTACTTGACTATATATTAAATTATATGAATA 179
consensus_10423#1 TTCATATGAACTTAATGTATAGAAGAGATTTACTTGACTATATATTAAATTATATGAATA 132
consensus_10423#2 ------------------------------------------------------------
consensus_10423#0 GTAACCGGATGGATGTTATATGCTCAAACTCATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCA 239
consensus_10423#1 GTAACCGGATGGATGTTATATGCTCAAACTCATTTATAATGGATTCTTTGTTAAATTTCA 192
consensus_10423#2 ------------------------------------------------------------
consensus_10423#0 ATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCC 299
consensus_10423#1 ATTCACAATTAAGTCATAACACTGTATTACATAATAATCAGTTCTACTCAACATTGATCC 252
consensus_10423#2 ------------------------------------------------------------
consensus_10423#0 CTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATC 359
consensus_10423#1 CTTATTTATTTCCTATGGATTTAAATCTTAATTCATTGCAACAACAACATCAAAATCATC 312
consensus_10423#2 -----------------------------------------CAACAACATCAAAATCATC 19
*******************
consensus_10423#0 AGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTA 419
consensus_10423#1 AGATACAAAATTGTACTAATGACTGGTTGGTGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTA 372
consensus_10423#2 AGATTCTAAATTGTACTAATGACCGGTTGGAGGGTAATGATCATATCAATAATAACGGTA 79
**** * **************** ****** *****************************
consensus_10423#0 ATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCT 479
consensus_10423#1 ATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCT 432
consensus_10423#2 ATAATACTTCGGATCCAACATTAATGTACCTTGCAGTAGCTACCCAATGTATTCTACGCT 139
************************************************************
consensus_10423#0 ATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCA 539
consensus_10423#1 ATTTCTTAACAACTCATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCA 492
consensus_10423#2 ATTTCTTAACAACACATAATTATCAACAAATTTTATATCTCAATTCATTTCTTCATTCCA 199
************* **********************************************
consensus_10423#0 ATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCT 599
consensus_10423#1 ATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCT 552
consensus_10423#2 ATTATTCATCAACATCAGCTACATATAATAATACAAGTAGTCAGAATGACGATATGTTCT 259
************************************************************
consensus_10423#0 TTGAATCACCTAAGAATACATTAGAATCTAATTCCAGATTATTAATTCATCAATACTTAG 659
consensus_10423#1 TTGAATCACCTAAGAATACTTTAGAATCTAATTCCAGATTATTAATTCATCAATACTTAG 612
consensus_10423#2 TTGAATCACCTAAGAATACATTAGAATCTAATTCCAGATTATTAATTCATCAATACTTAG 319
******************* ****************************************
consensus_10423#0 AAATAGATCATTGTAATTCAATGAAAATAAATGAAAATTCATCAATTACACCACGTATAA 719
consensus_10423#1 AAATAGATCATTGTAATTCAATGAANATAAATGAGNATTCATCAATTACACCACGTATAA 672
consensus_10423#2 AAATAGATCATTGTAATTCAATGAAAATAAATGAAAATTCATCAATTACACCACGTATAA 379
************************* ******** ************************
consensus_10423#0 AACGTTATAAATGTACATATCCTAATTGTACAAA-GCATATTATAAACGTTCTCATTTAA 778
consensus_10423#1 AACGTTATAAATGTACATATCCTAATTGTACAAAAGCATATTATAAACGTTCTCATTTAA 732
consensus_10423#2 AACGTTATAAATGTACATATCCTAATTGTACAAAAGCATATTATAAACGTTCTCATTTAA 439
********************************** *************************
consensus_10423#0 ATGA-CATTATCA-TTACATACTGGTG-CTAANCCACATT-ATGT-ATCAACCTGGNTGT 833
consensus_10423#1 ATGAACATTATCNATTACATACTGGNT-GCTAACCACATTTATGNTATCAACCTGGNTGT 791
consensus_10423#2 ATGAACATTATCATTTACATACTGGTGGCTAAACCACATTTATGTAATCAACCTGGTTGT 499
**** ******* *********** * ******* *** ********** ***
consensus_10423#0 A-TG-CACGTTT-A-ACGTGCTGATCA--TATC-CGGNAT-GACGTGC-C-TACTGGG-G 882
consensus_10423#1 AATG-CACGTTT-ACACGTGCTGATCAA-TATCACGTCATAGACGTGC-CATACTGGN-G 846
consensus_10423#2 AATGGCACGTTTTACACGTGCTGATCAATTATCACGTCATAGACGTGCACATACTAGGTG 559
* ** ******* * ************ **** ** ** ******* * **** * *
consensus_10423#0 A-CGTA--TTTCA--TGAATGG--TGGTTAACG---TTTAAACGAAG-GACCTTT--AA- 928
consensus_10423#1 AACGTA--TTTTCATTGAATGGGTTGTTAAACG---TTTAAACGTAT-GATCATT--AAA 898
consensus_10423#2 AACGTAATTNTCATTGGTATGGTTTGTTTAAAACGTTTTAAACGTAGTGATCATTTAAAA 619
* **** * * * **** ** * ** ******** * ** * ** **
consensus_10423#0 GT-CATT-AA-TAAAA---TGTGG--CAAATTATTTTTAACGTTTTCT--ATTTCCAA-- 976
consensus_10423#1 GT-CATT-AACTAAAA---TGTTGTACAAATTTTTATTACTGTTTTTTTCATATTCGAAA 953
consensus_10423#2 GTACATTTAACTAGAAATGTATGTACAAAATTAATTTATAAACTGGTTTTTTTTTCTATA 679
** **** ** ** ** * * ***** * * * * * * * *
consensus_10423#0 -----------------
consensus_10423#1 -----------------
consensus_10423#2 TATTTCGAAAAAAAGAA 696
|
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||