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Schistosoma mansoni
cluster # 10465 cluster # 10465       Sequences # 16       consensus # 2


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10465#0 length = 922 sequences # 14  
consensus_10465#1 length = 426 sequences # 2  

consensusID : consensus_10465#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 14
consensus length = 922
fasta sequence
                              [ATAACTTGTTGAGGCAATTTGGTCATTATTGTTGGGAAAGGGAGGAAAAAAACCTGGGATAAAGGTTTTAATTTGATAATATCCATTTATATAGATAGCAACTA-AGAAAGAGATAAACAGTATAGGTCATTGTTACTATTATCA-TCAACATGGAATACTGGATTCAGCTTTAGGTGGTTCATGTAATTCTATGCCATATTTAGCAAATCGAGCTTCCAATTCAGGACGAAAATGTCGAATAAGACCTTGAACAGGCCATGCAGCTCCATCGGCTAAAGCACAAATTGTACGTCCTTCCATTTGTTTAGAAATTTCCCAAATCATATCGATTTCATCCTTATTAGCG-TTACCTTTAACAAATCTAGTCATAATTTGACTTAACCAACGACATCCTTCACGACATGGAGTACACTGACCACAACT-TTCATGTTCATAGAATTTAATAAGACGTGAAATACAATTTACAACATCAGCTGATCGATTCATTACAATTAATGCTGCTGTACCTAAACCAGAATTAGCTTGTACAAGAGCATCGAAATCCATTAGGACAGTACTACAAATGTCTTTAGGTAATAATGGAGTAGAGCTACCACCGGGAATAACAGCTAATAAATTATCCCAACCACCGATTACACCTCCAGCATGTCGTTCAATTAAATCACGCATTGGTATGGACATTTCTTCTTCAACGGTGCATGGATTATTTACAT-GTCCCGAAATATTGAATAATTTAGTGCCACGATTTCTTTCACGTCCAAAGCTTG-C-AACCAATCACCACCACGACGACAAATTGTAGGC-G-AACAGCTACAGTTTCAACATTTGTCACAGTTGT-CGGACAGCC-A-ACA-ATC--C-ATATCCGCTGGAAAAGGTGGTTTCAAACGGGGCTTTCCCTGTTTTCCTTCAAGAGATTCAATTAGAGCAG]

[-] EMBL AI977583             [ATAACTTGTTGAGGCAATTTGGTCATTATTGTTGGGAAAGGGAGGAAAAAAACCTGGGATAAAGGTTTTAATTTGATAATATCCATTTATATAGATAGCAACTA AGAAAGAGATAAACAGTATAGGTCATTGTTACTATTATCA TCAACATGGAATACTGGATTCAGCTTTAGGTGGTTCATGTAATTCTATGCCATATTTAGCAAATCGAGCTTCCAATTCAGGACGAAAATGTCGAATAAGACCTTGAACAGGCCATGCAGCTCCATCGGCTAAAGCACAAATTGTACGTCCTTCCATTTGTTTAGAAATTTCCCAAATCATATCGATTTCATCCTTATTAGCG TTACCTTTAACAAATCTAGTCATAATTTGACTTAACCAACGACATCCTTCACGACATGGAGTACACTGACCACAACT TTCATGTTCATAGAATTTAATAAGACGTGAAATACAATTTACAACATCAGCTGATCGATTCATTACAATTAATGCTGCTGTACCTAAACCAGAATTAGCTTGTACAAGAGCATCGAAATCCATTAGGACAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD145249             [                                                               GGTTTTAATTTGATAATATCCATTTATATAGATAGCAACTA AGAAAGAGATAAACAGTATAGGTCATTGTTACTATTATCA TCAACATGGAATACTGGATTCAGCTTTAGGTGGTTCATGTAATTCTATGCCATATTTAGCAAATCGAGCTTCCAATTCAGGACGAAAATGTCGAATAAGACCTTGAACAGGCCATGCAGCTCCATCGGCTAAAGCACAAATTGTACGTCCTTCCATTTGTTTAGAAATTTCCCAAATCATATCGATTTCATCCTTATTAGCG TTACCTTTAACAAATCTAGTCATAATTTGACTTAACCAACGACATCCTTCACGACATGGAGTACACTGACCACAACT TTCATGTTCATAGAATTTAATAAGACGTGAAATACAATTTACAACATCAGCTGATCGATTCATTACAATTAATGCTGCTGTACCTAAACCAGAATTAGCTTGTACAAGAGCATCGAAATTCATTAGGACAGTACTACAAATGTCTTTAGGTAATAATGGAGTAGAGCTACCACCGGGAATAACAGCTAATANATTATCCCAACCACCGATTACACCTNCAGCATGTCGTTCAATTAAATCACGCATTGGTATGGACATTTCTTTCTCAACGGTGCATGGGATATTTACATGGTCCCG AATATTGAATAA TTAGTGGCACGA TTCTTTTACGTCCAAAGCTTG C AACCCATCACCA CACGACGAACAATGGTA GC G AACAGCTACAG TTCAACATTTGTCACAGNTGTCCGGAC GCC A ACA ATC  C ATATTCGCTGGAAAAGGgg                                                   ]
[+] EMBL CD145279             [                                                               GGTTTTAATTTGATAATATCCATTTATATAGATAGCAACTA AGAAAGAGATAAACAGTATAGGTCATTGTTACTATTATCA TCAACATGGAATACTGGATTCAGCTTTAGGTGGTTCATGTAATTCTATGCCATATTTAGCAAATCGAGCTTCCAATTCAGGACGAAAATGTCGAATAAGACCTTGAACAGGCCATGCAGCTCCATCGGCTAAAGCACAAATTGTACGTCCTTCCATTTGTTTAGAAATTTCCCAAATCATATCGATTTCATCCTTATTAGCG TTACCTTTAACAAATCTAGTCATAATTTGACTTAACCAACGACATCCTTCACGACATGGAGTACACTGACCACAACT TTCATGTTCATAGAATTTAATAAGACGTGAAATACAATTTACAACATCAGCTGATCGATTCATTACAATTAATGCTGCTGTACCTAAACCAGAATTAGCTTGTACAAGAGCATCGAAATCCATTAGGACAGTACTACAAATGTCTNTAGGTAATAATGGAGTAGAGCTACCACCGGGAATAACAGCTAATANATTATCCCAACCACCGATTACACCTNCAGCATGTCGTTCAATTAAATCACGCATTGGTATGGACATTTCTTCTTC ACGGTGCATGGATTATNTACAT GTCCCCGAATATTTGATAATTNAGTGCCACGANTTCTTTCACGTCCAAAGCTTG C AAACCATCA CACCACGACGACAAATGGTA GC G AACAACTACAGTTNC ACATTTG NACAGNTGT CGGACAGCA A ACA ATC  C ATATTCGCTGG AAAGGTG                                                   ]
[+] EMBL CD145284             [                                                               GGTTTTAATTTGATAATATCCATTTATATAGATAGCAACTA AGAAAGAGATAAACAGTATAGGTCATTGTTACTATTATCA TCAACATGGAATACTGGATTCAGCTTTAGGTGGTTCATGTAATTCTATGCCATATTTAGCAAATCGAGCTTCCAATTCAGGACGAAAATGTCGAATAAGACCTTGAACAGGCCATGCAGCTCCATCGGCTAAAGCACAAATTGTACGCCCTTCCATTTGTTTAGAAATTTCCCAAATCATATCGATTTCATCCTTATTAGCG TTACCTTTAACAAATCTAGTCATAATTTGACTTAACCAGCGACATCCTTCACGACATGGAGTACACTGACCACAACT TTCATGTTCATAGAATTTAATAAGACGTGAAATACAATGTACAACATCAGCTGATCGATTCATTACAATTAATGCTGCTGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD145326             [                                                               GGTTTTAATTTGATAATATCCATTTATATAGATAGCAACTA AGAAAGAGATAAACAGTATAGGTCATTGCTACTATTATCAGTCAACATGGAATACTGGATTCAGCTTTAGGTGGTTCATGTAATTCTATGCCATATTTAGCAAATCGAGCTTCCAATTCAGGACGAAAATGTCGAATAAGACCTTGAACAGGCCATGCAGCTCCATCGGCTAAAGCACAAATTGTACGTCCTTCCATTTGTTTAGAAATTTCCCAAATCATATCGATTTCATCCTTATTAGCG TTACCTTTAACAAATCTAGTCATAATTTGACTTAACCAACGACATCCTTCACGACATGGAGTACACTGACCACAACT TTCATGTTCATAGAATTTAATAAGACGTGAAATACAATTTACAACATCAGCTGATCGATTCATTACAATTAATGCTGCTGTACCTAAACCAGAATTAGCTTGTACAAGAGCATCGAAATCCATTAGGACAGTACTACAAATGTCTTTAGGTAATAATGGAGTAGAGCTACCACCGGGAATAACAGCTAATAAATTATCCCAACCACCGATTACACCTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD145321             [                                                               GGTTTTAATTTGATAATATCCATTTATATAGATAGCAACTATAGAAAGAGATAAACAGTATAGGTCATTGTTACTATTATCA TCAACATGGAATACTGGATTCAGCTTTAGGTGGTTCATGTAATTCTATGCCATATTTAGCAAATCGAGCTTCCAATTCAGGACGAAAATGTCGAATAAGACCTTGAACAGGCCATGCAGCTCCATCGGCTAAAGCACAAATTGTACGTCCTTCCATTTGTTTAGAAATTTCCCAAATCATATCGATTTCATCCTTATTAGCG TTACCTTTAACAAATCTAGTCATAATTTGACTTAACCAACGACATCCTTCACGACATGGAGTACACTGACCACAACT TTCATGTTCATAGAATTTAATAAGACGTGAAATACAATTTACAACATCAGCTGATCGATTCATTACAATTAATGCTGCTGTACCTAAACCAGAATTAGCTTGTACAAGAGCATCGAAATCCATTAGGACAGTACTACAAATGTCTTTAGGTAATAATGGAGTAGAGCTACCACCGGGAATAACAGCTAATAAATTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD202078             [                                                               GGTTTTAATTTGATAATATCCATTTATATAGATAGCAACTA AGAAAGAGATGAACAGTATAGGTCATTGCTACTATTATGA TCAACATGGAATACTGGATTCAGCTTTAGGTGGTTCATGTAATTCTATGCCATATTTAGCAAATCGAGCTTCCAATTCAGGACGAAAATGTCGAATAAGACCTTGAGCAGGCCATGCAGCTCCATCGGCTAAAGCACAAATTGTACGTCCTTCCATTTGTTTAGAAATTTCCCAAATCATATCGATTTCATCCTTATTAGCG TCACCTTTAACAAATCTAGTCATAATTTGACTTAACCAACGACATCCTTCACGACATGGAGTACACTGACCACAACT TTCATGTTCATAGAATTTAATAAGACGTGAAATACAATTTACAACATCAGCTGATCGATTCATTACAATTAATGCTGCTGTACCTAAACCAGAATTAGCTTGTACAAGAGCATCGGAATCCATTANGACAGTACTACGAATGTCTNTAGGTAATAATGGAGTAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD145362             [                                                               GGTCTTAATTTGATAATATCCATTTATATAGATAGCAACTA AGAAAGAGATAAACAGTATAGGTCATTGCTACTATTATCA TCAACATGGAATACTGGATTCAGCTTTAGGTGGTTCATGTAATTCTATGCCATATTTAGCAAATCGAGCTTCCAATTCAGGACGAAAATGTCGAATAAGACCTTGAACAGGCCATGCAGCTCCATCGGCTAAAGCACAAATTGTACGTCCTTCCATTTGTTTAGAAATTTCCCAAATCATATCGATTTCATCCTTATTAGCG TTACCTTTAACAAATCTAGTCATAATTTGACTTAACCAACGACATCCTTCACGACATGGAGTACACTGACCACAACT TTCATGTTCATAGAATTTAATAAGACGTGAAATACAATTTACAACATCAGCTGATCGATTCATTACAATTAATGCTGCTGTACCTAAACCAGAATTAGCTTGTACAAGAGCATCGAAATCCATTAGGACAGTACTACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD145254             [                                                               GGTTTTAATTTGATAATATCCATTTATATAGATAGCAACTA AGAAAGAGATAAACAGTATAGGTCATTGTTACTATTATCA TCAACATGGAATACTGGATTCAGCTTTAGGTGGTTCATGTTATTCTATGCCATATTTAGCAAATCGAGCTTCCAATTCAGGACGAAAATGTCGAATAAGACCTTGAACAGGCCATGCAGCTCCATCGGCTAAAGCACAAATTGTACGTCCTTCCATTTGTTTAGAAATTTTCCAAATCATATCGATTTCATCCTTATTAGCG TTACCTTTAACAAATCTAGTCATAATTTGACTTAACCAACGACATCCTTCACGACATGGAGTACACTGACCACAACT TTCATGTTCATAGAATTTAATAAGACGTGAAATACAATTTACAACATCAGCTGATCGATTCATTACAATTAATGCTGCTGTACCTAAACCAGAATTAGCTTGTACAAGAGCATCGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD145233             [                                                               GGTTTTAATTTGATAATATCCATTTATATAGATAGCAACTA AGAAAGAGATAAACAGTATAGGTCATTGTTACTATTATCA TCAACATGGAATACTGGATTCAGCTTTAGGTGGTTCATGTAATTCTATGCCATATTTAGCAAATCGAGCTTCCAATTCAGGACGAAAATGTCGAATAAGACCTTGAACAGGCCATGCAGCTCCATCGGCTAAAGCACAAATTGTACGTCCTTCCATTTGTTTAGAAATTTCCCAAATCATATCGATTTCATCCTTATTAGCG TTACCTTTAACAAATCTAGTCATAATTTGACTTAACCAACGACATCCTTCACGACATGGAGTACACTGACCACAACT TTCATGTTCATAGAATTTAATAAGACGTGAAATACAATTTACAACATCAGCTGATCGATTCATTACAATTAATGCTGCTGTACCTAAACCAGAATTAGCTTGTACAAGAGCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD145165             [                                                                  TTTAATTTGATAA A CCCTTTA AAAGAAAGCAA TA AGAAAGAG TAAACAGTA AGGGCCTTGTTACTA TATCA TCACCA GGGATACT GATTCAGC TTAGTTGGTTCATGT ATTTTATG CATAATTAGCAAATCGAGCTTCCCATTCAGGACGAAAAATTCGAATAAGACTTTGAACAGGCCATGCAGCTCCATCGGGTAAAGCACAAATTGTACGT CTTCCATTTG TTAGAAATTTCCCAAATCATATCGATTTCATCCTTA TAGCGTTTACC TTAACAAATCTAGTCATAATTTGACTTACCCAACGACATCCTTCACGACATGGAGTACACTGACCAC ACTNNTCATGTTCATAGAATTTAATAAGACGTGAAATACAATTTACAACATCAGCTGATCGATTCATTACAATTAATGCTGCTGTACCTAAACCAGAATTAGCTTGTACAAGAGCATCGAAATCCATTAGGACAGTACTACAAATGTCTTTAGGTAATAATGGAGTAGAGCTACCACCGGGAATAACAGCTAATAAATTATCCCAACCACCGATTACACCTCCAGCATGTCGTTCAATTAAATCACGCATTGGTATGGACATTTCTTCTTCAACGGTGCATGGATTATTTACAT GTCCCGAAATATTGAATAATTTAGTGCCACGATTTCTTTCACGTCCAAAGCGGG CTATCCAATCACCACCACGACGACAAATTGTAGGC GAAACAGCTACAGTTTCAACATTTGTCACAGTTGT GGGACAGCC AGACAGATC  CAATATCCGCTGGAAAAGGTGGT                                                 ]
[+] EMBL CD197178             [                                                                                                                          ATAGGTCATTGTTACTATTATCA TCAACATGGAGTACTGGATTCAGCTTTAGGTGGTTCATGTAATTCTACGCCATATTTAGCAAATCGAGCTTCTAATTCAGGACGAAAATGTCGAATAAGACCTTGAACAGGCCATGCAGCTCCATCGGCTAAAGCACAAATTGTACGTCCTTCCATTTGTTTAGAAATTTCCCAAATCATATCGATTTCATCCTTATTAGCG TTACCTTTAACAAATCTAGTCATAATTTGACTTAACCAACGACATCCTTCACGACATGGAGTACACTGACCAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD145204             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ACGACATCCTTCACGACATGGAGTACACTGACCGCAACT TTCATGTTCATAGAATTTAATAAGACGTGAAATACAATTTACAACATCAGCTGATCGATTCATTACAATTAATGCTGCTGTACCTAAACCAGAATTAGCTTGTACAAGAGCATCGAAATCCATTAGGACAGTACTACAAATGTCTTTAGGTAATAATGGAGTAGAGCTACCACCGGGAATAACAGCTAATAAATTATCCCAACCACCGATTACACCTCCAGCATGTCGTTCAATTAAATCACGCATTGGTATGGACATTTCTTCTTCAACGGTGCATGGATTATTTACAT GTCCCGAAATATTGAATAATTTAGTGCCACGATTTCTTTCACGTCCAAAGCGGGTT TTCCAATCACCACCGCGACGACAAATTGTAGGCGG AACAGTTACAGTTTCAACATATGTCACAGTTGT GGGACAGCC AGACAGATCCAC AGATCCGCTGGAAAAGGTGGTTTCAA                                            ]
[-] EMBL CD187050             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATGCTGCTGTACCTAAACCAGAATTAGCTTGTACAAGAGCATCGAAATCCATTAGGACAGTACTACAAATGTCTTTAGGTAATAATGGAGTAGAGCTACCACCGGGAATAACAGCTAATAAATTATCCCAACCACCGATTACACCTCCAGCATGTCGTTCAATTAAACCACGCATTGGTATGGACATTTCTTCTTCAACGGTGCATGGATTATTTACAT GTCCCGAAATATTGAATAATTTAGTGCCACGATTTCTTTCACGTCCAAAGCTTG CAAACCAATCACCACCACGACGACAAATTGTAGGC GAAACAGCTACAGTTTCAACATTTGTCACAGTTGT CGGACAGCCAA ACA ATC  CAATATCCGCTGGAAAAGGTGGTTTCAAACGGGGCTTTCCCTGTTTTCCTTCAAGAGATTCAATTAGAGCAG]


>consensus_10465#0 ATAACTTGTTGAGGCAATTTGGTCATTATTGTTGGGAAAGGGAGGAAAAAAACCTGGGAT AAAGGTTTTAATTTGATAATATCCATTTATATAGATAGCAACTAAGAAAGAGATAAACAG TATAGGTCATTGTTACTATTATCATCAACATGGAATACTGGATTCAGCTTTAGGTGGTTC ATGTAATTCTATGCCATATTTAGCAAATCGAGCTTCCAATTCAGGACGAAAATGTCGAAT AAGACCTTGAACAGGCCATGCAGCTCCATCGGCTAAAGCACAAATTGTACGTCCTTCCAT TTGTTTAGAAATTTCCCAAATCATATCGATTTCATCCTTATTAGCGTTACCTTTAACAAA TCTAGTCATAATTTGACTTAACCAACGACATCCTTCACGACATGGAGTACACTGACCACA ACTTTCATGTTCATAGAATTTAATAAGACGTGAAATACAATTTACAACATCAGCTGATCG ATTCATTACAATTAATGCTGCTGTACCTAAACCAGAATTAGCTTGTACAAGAGCATCGAA ATCCATTAGGACAGTACTACAAATGTCTTTAGGTAATAATGGAGTAGAGCTACCACCGGG AATAACAGCTAATAAATTATCCCAACCACCGATTACACCTCCAGCATGTCGTTCAATTAA ATCACGCATTGGTATGGACATTTCTTCTTCAACGGTGCATGGATTATTTACATGTCCCGA AATATTGAATAATTTAGTGCCACGATTTCTTTCACGTCCAAAGCTTGCAACCAATCACCA CCACGACGACAAATTGTAGGCGAACAGCTACAGTTTCAACATTTGTCACAGTTGTCGGAC AGCCAACAATCCATATCCGCTGGAAAAGGTGGTTTCAAACGGGGCTTTCCCTGTTTTCCT TCAAGAGATTCAATTAGAGCAG



consensusID : consensus_10465#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 426
fasta sequence
                              [ACCTTTAACAAATCTAGTCATAATNTGACTTAACCAACGACATCCTTCACGACATGGAGTACACTGACCACAACTTTCATGTTCATAGAATTTAATAAGACGTGAAATACAATTTACAACATCAGCTGATCGATTCATTACAATTAATGCTGCTGTACCTAAACCAGAATTAGCTTGTACAAGAGCATCGAAATCCATTAGGACAGTACTACAAATGTCTTTAGGTAATAATGGAGTAGAGCTACCACCGGGAATAACAGCTAATAAATTATCCCAACCACCGATTACACCTCCAGCATGTCGTTCAATTAAATCACGCATTGGTATGGACATTTCTTCTTCAACGGTGCATGGATTATTTACATGTCCCGAAATATTGAATAATTTAGTGCCACGATTTCTTTCACGTCCAAAGAGGGCTTTCCA]

[-] EMBL CD145174             [ACCTTTAACAAATCTAGTCATAATNTGACTTAACCAACGACATCCTTCACGACATGGAGTACACTGACCACAACTTTCATGTTCATAGAATTTAATAAGACGTGAAATACAATTTACAACATCAGCTGATCGATTCATTACAATTAATGCTGCTGTACCTAAACCAGAATTAGCTTGTACAAGAGCATCGAAATCCATTAGGACAGTACTACAAATGTCTTTAGGTAATAATGGAGTAGAGCTACCACCGGGAATAACAGCTAATAAATTATCCCAACCACCGATTACACCTCCAGCATGTCGTTCAATTAAATCACGCATTGGTATGGACATTTCTTCTTCAACGGTGCATGGATTATTTACATGTCCCGAAATATTGAATAATTTAGTGCCACGATTTCTTTCACGTCCAAAGAGGGCTTTCCA]
[-] EMBL CD145198             [                                      GACATCCTTCACGACATGGAGTACACTGACCACAACTTTCATGTTCATAGAATTTAATAAGACGTGAAATACAATTTACAACATCAGCTGATCGATTCATTACAATTAATGCTGCTGTACCTAAACCAGAATTAGCTTGTACAAGAGCATCGAAATCCATTAGGACAGTACTACAAATGTCTTTAGGTAATAATGGAGTAGAGCTACCACCGGGAATAACAGCTAATAAATTATCCCAACCACCGATTACACCTCCAGCATGTCGTTCAATTAAATCACGCATTGGTATGGACATTTCTTCTTCAACGGTGCATGGATTATTTACATGTCCCGAAATATTGAATAATTTAGTGCCACGATTTCTTTCACGTCCAAAGCGGGTTTTa  ]


>consensus_10465#1 ACCTTTAACAAATCTAGTCATAATNTGACTTAACCAACGACATCCTTCACGACATGGAGT ACACTGACCACAACTTTCATGTTCATAGAATTTAATAAGACGTGAAATACAATTTACAAC ATCAGCTGATCGATTCATTACAATTAATGCTGCTGTACCTAAACCAGAATTAGCTTGTAC AAGAGCATCGAAATCCATTAGGACAGTACTACAAATGTCTTTAGGTAATAATGGAGTAGA GCTACCACCGGGAATAACAGCTAATAAATTATCCCAACCACCGATTACACCTCCAGCATG TCGTTCAATTAAATCACGCATTGGTATGGACATTTCTTCTTCAACGGTGCATGGATTATT TACATGTCCCGAAATATTGAATAATTTAGTGCCACGATTTCTTTCACGTCCAAAGAGGGC TTTCCA



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10465#0      ATAACTTGTTGAGGCAATTTGGTCATTATTGTTGGGAAAGGGAGGAAAAAAACCTGGGAT 60
consensus_10465#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10465#0      AAAGGTTTTAATTTGATAATATCCATTTATATAGATAGCAACTAAGAAAGAGATAAACAG 120
consensus_10465#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10465#0      TATAGGTCATTGTTACTATTATCATCAACATGGAATACTGGATTCAGCTTTAGGTGGTTC 180
consensus_10465#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10465#0      ATGTAATTCTATGCCATATTTAGCAAATCGAGCTTCCAATTCAGGACGAAAATGTCGAAT 240
consensus_10465#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10465#0      AAGACCTTGAACAGGCCATGCAGCTCCATCGGCTAAAGCACAAATTGTACGTCCTTCCAT 300
consensus_10465#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10465#0      TTGTTTAGAAATTTCCCAAATCATATCGATTTCATCCTTATTAGCGTTACCTTTAACAAA 360
consensus_10465#1      ------------------------------------------------ACCTTTAACAAA 12
                                                                       ************

consensus_10465#0      TCTAGTCATAATTTGACTTAACCAACGACATCCTTCACGACATGGAGTACACTGACCACA 420
consensus_10465#1      TCTAGTCATAATNTGACTTAACCAACGACATCCTTCACGACATGGAGTACACTGACCACA 72
                       ************ ***********************************************

consensus_10465#0      ACTTTCATGTTCATAGAATTTAATAAGACGTGAAATACAATTTACAACATCAGCTGATCG 480
consensus_10465#1      ACTTTCATGTTCATAGAATTTAATAAGACGTGAAATACAATTTACAACATCAGCTGATCG 132
                       ************************************************************

consensus_10465#0      ATTCATTACAATTAATGCTGCTGTACCTAAACCAGAATTAGCTTGTACAAGAGCATCGAA 540
consensus_10465#1      ATTCATTACAATTAATGCTGCTGTACCTAAACCAGAATTAGCTTGTACAAGAGCATCGAA 192
                       ************************************************************

consensus_10465#0      ATCCATTAGGACAGTACTACAAATGTCTTTAGGTAATAATGGAGTAGAGCTACCACCGGG 600
consensus_10465#1      ATCCATTAGGACAGTACTACAAATGTCTTTAGGTAATAATGGAGTAGAGCTACCACCGGG 252
                       ************************************************************

consensus_10465#0      AATAACAGCTAATAAATTATCCCAACCACCGATTACACCTCCAGCATGTCGTTCAATTAA 660
consensus_10465#1      AATAACAGCTAATAAATTATCCCAACCACCGATTACACCTCCAGCATGTCGTTCAATTAA 312
                       ************************************************************

consensus_10465#0      ATCACGCATTGGTATGGACATTTCTTCTTCAACGGTGCATGGATTATTTACATGTCCCGA 720
consensus_10465#1      ATCACGCATTGGTATGGACATTTCTTCTTCAACGGTGCATGGATTATTTACATGTCCCGA 372
                       ************************************************************

consensus_10465#0      AATATTGAATAATTTAGTGCCACGATTTCTTTCACGTCCAAAGCTTGCAACCAATCACCA 780
consensus_10465#1      AATATTGAATAATTTAGTGCCACGATTTCTTTCACGTCCAAAGAGGGCTTTCCA------ 426
                       *******************************************   **   * *      

consensus_10465#0      CCACGACGACAAATTGTAGGCGAACAGCTACAGTTTCAACATTTGTCACAGTTGTCGGAC 840
consensus_10465#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10465#0      AGCCAACAATCCATATCCGCTGGAAAAGGTGGTTTCAAACGGGGCTTTCCCTGTTTTCCT 900
consensus_10465#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10465#0      TCAAGAGATTCAATTAGAGCAG 922
consensus_10465#1      ----------------------
                                             




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)