These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10560#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 18 consensus length = 1600 fasta sequence [TACAAGACATCCAAATGTATAGATTGTGGATTTCAGGCTCATAAACGATGTGCTGATCTTGTACCGTGTGACTGTGTACCAGATATTAAACAAATGAAACGAGTGTTCGGTGTGGACTTGACTAATTTGGCGAG-AGCTGAAAACAAGACTGTGCCAACTCTGCTAATTAAATGCATTCAAGAGGTAGAACGTCGAGATGGTTTGTGTTGTGAAGGCCTGTATCGTATTCCTGGAAATTATGATCTTGTGGAAGAACTACGTACTGAATTCGATAAAGATCCGGAATTGGCAAATGTATCTGAGTCACGTGTTCGAGATATCAATGTTTTGACAAGTTTGATTAAATCATTTCTGCGTCAATTGCCTGTCCCATTAATCACTTATGAGGCATATCCAGATTTACTGGATGTTGTTAGAGATGATCGACTTAATGAACAAGAGAAATTAGATATGTTAAGGAAAATATTTGCTCGCTTACCCGGTGCCCATTATGAAAGTTTACGTTATTTTATAAACCATATACACAGAGTGGCTGAAAAGCAAGATGTGAATATGATGACTACAGCTAATTTAGCTATTGTTCT-ATCACCTACTTTACTGAGTTCATCTTATACTGATCCTATAAGTTGTTTAGCTGGAACACTTTTTGAACATACCTTAATAGAATTACTTATAAAACATTGTACTTACTTGCTTCCATCAAACGGACGATGGTTAGCTAGTAGACCTACTGAATTAGCCGACAATGCAATCCATTCACCATCCCATCGTCATAGTCAAATCATTACCAATAATAATTTTACTCCACCAGCCACTACGGTATCACCACCCAGTATACCATCTTATAAGAAATGGAATTTTTTAAGAAGTCGATCATCCACAGATACCCGTACAGTGCCAACTTTATCACCTATCCCGTGAAATTGGATGGAAGTTTCATCGATCTCTTTCTTCGTCTGTCTGCAGATAATTATTGTGTCAGTATGAATAAATTATTGTGTAATGTTATATTTTTTACTACCTATCTTACCACTATATCGTTCTCAAATTGTTCTGTATCGACAAATATTTGTTAACACATTCCACCATTTTTTCCATATAACTTTTTGATTATGTTCATTTTTTGCATTTCACAAAACGTCTGGTTCTTAACAAACTTGTACACATATATTTGTTCTTTTCTCGAATTCCATAATATTTGTGTGTGCTTGGTTTAAAGAAATCATTCATAAGTGATACTTTTATTGTCTTCCAGTTATTCTTTCTTTTATCTACTTCTTTAAACCATCTAAATGCGGACAATATATTTTCGAGTTTATATGGCCACTTAAACGCATATTTATATAGATATAGCGTGTTTCTAACAGCTGATTGTGTATTTCTATCCTATCCTATTGTTCAACTCACTATCTTTGAATATATGCTTGTTGTTCAACTCTTATTATATGGGGATTATGCTGAGACATCTTTAAAAATTATTTAATGATAAACTTATATGATGGTACCATTTTTATTTGATTTTTATAAATAGGACTGATAATGCAAGACAAGAAAAAGAAATAACACTTTGTACATATACATATACCTGTATTAATAAACT] [+] EMBL CD059238 [TACAAGACATCCAAATGTATAGATTGTGGATTTCAGGCTCATAAACGGTGTGCTGATCTTGTACCGTGTGACTGTGTACCAGATATTAAACAAATGAAACGAGTGTTCGGTGTGGACTTGACTAATTTGGCGAGTAGCTGTAAACAAGACTGTGCCAACTCTGCTAATGAAATGCATTCAAGAGGTAAAACGTCGAGATGGTTTGTGTTGTGAAGGCCTGTATCGTATTCCTGG ] [+] EMBL CD059277 [ ATGTATAGATTGTGGATTTCAGGCTCATAAACGATGTGCTGATCTTGTACCGTGTGACTGTGTACCAGATATTAAACAAATGAAACGAGTGTTCGGTGTGGACTTGACTAATTTGGCGAG AGCTGAAAACAAGACTGTGCCAACTCTGCTAATTAAATGCATTCAAGAGGTACAACGTCGAGATGGTTTGTGTTGTGAAGGCCTGTATCGTATTCCTGG ] [-] EMBL CD059284 [ TGTATAGATTGTGGATTTCAGGCTCATAAACGATGTGCTGATCTTGTACCGTGTGACTGTGTACCAGATATTAAACAAATGAAACGAGTGTTCGGTGTGGACTTGACTAATTTGGCGAG AGCTGAAAACAAGACTGTGCCAACTCTGCTAATTAAATGCATTCAAGAGGTAGAACGTCGAGATGGTTTGTGTTGTGAAGGCCTGTATCGTATTCCTGGA ] [+] EMBL CD059176 [ GTATAGATTGTGGATTTCAGGCTCATAAACGATGTGCTGATCTTGTACCGTGTGACTGTGTACCAGATATTAAACAAATGAAACGAGTGTTCGGTGTGGACTTGACTAATTTGGCGAG AGCTGAAAACAAGACTGTGCCAACTCTGCTAATTAAATGCATTCAAGAGGTAGAACGTCGAGATGGTTTGTGTTGTGAAGGCCTGTATCGTATTCCTGG ] [+] EMBL CD059202 [ GTATAGATTGTGGATCTCAGGCTCATAAACGACGTGCTGATCTTGTACCGTGTGACTGTGTACCAGATATTAAACAAATGAAACGAGTGTTCGGTGTGGACTTGACTAATTTGGCGAG AGCTGAAAACAAGACTGTGCCAACTCTGCTAATTAAATGCATTCAAGAGGTAGAACGTCGAGATGGTTTGTGTTGTGAAGGCCTGTATCGTATTCCTGG ] [-] EMBL CD059278 [ TATAGATTGTGGATTTCAGGCTCATAAACGGTGTGCTGATCTTGTACCGTGTGACTGTGTACCAGATATTAAACAAATGAAACGAGTGTTCGGTGTGGACTTGACTAATTTGGCGAG AGCTGAAAACAAGACTGTGCCAACTCTGCTAATTAAATGCATTCAAGAGGTAGAACGTCGAGATGGTTTGTGTTGTGAAGGCCTGTATCGTATTCCTGGA ] [-] EMBL CD198593 [ TTTCAGGCTCATAGACGATGTGCTGATCTTGTACCGTGTGACTGTGTACCAGATATTAAACAAATGAAACGAGTGTTCGGTGTGGACTTGACTAATTTGGCGAG AGCTGAAAACAAGACTGTGCCAACTCTGCTAATTAAATGCATTCAAGAGGTAGAACGTCGAGATGGTTTGTGTTGTGAAGGCCTGTATCGTATTCCTGGAAATTATGATCTTGTGGAAGAACTACGTACTGAATTCGATAAAGATCCGGAATTGGCAAATGTATCTGAGTCACGTGTTCGAGATATCAATGTTTTGACAAGTTTGATTAAATCATTTCTGCGTCAATTGCCTGTCCCATTAATCACTTATGAGGCATATCCAGATTTACTGGATGTTGTTAGAGATGATCGACTTAATGAACAAGAGAAATTAGATATGTTAAGGAAAAT ] [-] EMBL CD127244 [ TGCTGATCTTGTACCGTGTGACTGTGTACCAGATATTAAACAAATGAAACGAGTGTTCGGTGTGGACTTGACTAATTTGGCGAG AGCTGAAAACAAGACTGTGCCAACTCTGCTAATTAAATGCATTCAAGAGGTAGAACGTCGAGATGGTTTGTGTTGTGAAGGCCTGTATCGTATTCCTGGAAATTATGATCTTGTGGAAGAACTACGTACTGAATTCGATAAAGATCCGGAATTGGCAAATGTATCTGAGTCACGTGTTCGAGATATCAATGTTTTGACAAGTTTGATTAAATCATTTCTGCGTCAATTGCCTGTCCCATTAATCACTTATGAGGCATATCCAGATTTACTGGATGTTGTTAGAGATAATCGACTTAATGAACAAGAGAAATTAGATATGTTAAGGAAAATATTTGCTCGCTTACCCGGTGCCCATTATGAAAGTTTACGTTATTTTATAAACCATATACACAGAGTGGCTGAAAAGCAAGATGTGAATATGATGACTACAGCTAATTTAGATATTGTTCT ATCACCTACTatgtctcat ] [+] EMBL CD165098 [ AGCTGAAAACAAGACTGTGCCAACTCTGCTAATTAAATGCATTCAAGAGGTAGAACGTCGAGATGGTTTGTGTTGTGAAGGCCTGTATCGTATTCCTGGAATTTATGATCTTGTGGAAGAACTACGTACTGAATTCGATAAAGATCCGGAATTGG ] [+] EMBL CD081231 [ GATATCAATGTTTTGACAAGTTTGATTAAATCATTTCTGCGTCAATTGCCTGTCCCATTAATCACTTATGAGGCATATCCAGATTTACTGGATGTTGTTAGAGATGATCGACTTAATGAACAAGAGAAATTAGATATGTTAAGGAAAATATTTGCTCGCTTACCCGGTGCCCATTATGAAAGTTTACGTTATTTTATAAACCATATACACAGAGTGGCTGAAAAGCAAGATGTGAATATGATGACTACAGCTAATTTAGCTATTGTTCT ATCACCTACTTTACTGAGTTCATCTTATACTGATCCTATAAGTTGTTTAGCTGGAACACTTTTTGAACATACCTTAATAGAATTACTTATAAAACATTGTACTTACTTGCTTCCATCAAACGGACGATGGTTAGCTAGTAGACCTACTGAATTAGCCGACAATGCAATCCATTCACCATCCCATCGTCATAGTCAAATCATTACCAATAATAATTTTACTCCACCAGCCACTACGGTATCACCACCCAGTATACCATCTTATAAGAAATGGAATTTTTTAAGAAGTCGATCATCCACAGATACCCGTACAGTGCCAACTTTATCACCTATCCCGTGAAATTGGATGGAAGTTTCATCGATCTCTTTCTTCGTCTGTCTGCAGATAATTATTGTGTCAGTATGAATAAATTATTGTGTAATGTTATATTTTTTACTACCTATCTTACCACTATATCG ] [+] EMBL CD065225 [ caggatccCCTGTCCCATTAATCACTTANGTGGCATATCCAGATTTACTGGATGTTGTTAGAGATGATCGACTTAATGAACAAGAGAAATTAGATATGTTAAGGAAAATATTTGCTCGCTTACCCGGTGCCCATTATGAAAGTTTACGTTATTTTATAAACCATATACACAGAGTGGCTGAAAAGCAAGATGTGAATATGATGACTACAGCTAATTTAGCTATTGTTCT ATCACCTACTTTACTGAGTTCATCTTATACTGATCCTATAAGTTGTTTAGCTGGAACACTTTTTGAACATACCTTAATAGAATTACTTATAAAACATTGTACTTACTTGCTTCCATCAAACGGACGATGGT ] [+] EMBL CD170203 [ GATGTGAATATGATGACTACAGCTAATTTAGCTATTGTTCT ATCACCTACTTTACTGAGTTCATCTTATACTGATCCTATAAGTTGTTTAGCTGGAACACTTTTTGAACATACCTTAATAGAATTACTTATAAAACATTGTACTTACTTGCTTCCATCAAACGGACGATGGTTAGCTAGTAGAC ] [+] EMBL CD136381 [ GATGTGAATATGATGACTACAGCTAATTTAGCTATTGTTCT ATCACCTACTTTACTGAGTTCATCTTATACTGATCCTATAAGTTGTTTAGCTGGAACACTTCTTGAACATACCTTAATAGAATTACTTATAAAACATTGTACTTACTTGCTTCCATCAAACGGACGATGGTTAGCTAGTAGAC ] [-] EMBL CD193645 [ GATGTGAATATGATGACTACAGCTAATTTAGCTATTGTTCTCATCACCTACTTTACTGAGTTCATCTTATACTGATCCTATAAGTTGTTTAGCTGGAACACTTTTTGAACATACCTTAACAGAATTACTTATAAAACATTGTACTTACTTGCTTCCATCAAACGGACGATGGTTAGCTAGTAGGCCTACTGA ] [-] EMBL CD193743 [ ATGTGAATATGATGACTACAGCTAATTTAGCTATTGTTCT ATCACCTACTTTACTGAGTTCATCTTATACTGATCCTATAAGTTGTTTAGCGGGAACACTTTTTGAACATACCTTAATAGAATTACTTATAAAACATTGTACTTACTTGCTTCCATCAAACGGACGATGGTTAGCTAGTAGACCTACTGAATT ] [+] EMBL CD097054 [ GTATACCATCTTATAAGAAATGGAATTTTTTAAGAAGTCGATCATCCACAGATACCCGTACAGTGCCAACTTTATCACCTATCCCGTGAAATTGGATGGAAGTTTCATCGATCTCTTTCTTCGTCTGTCTGCAGATAATTATTGTGTCAGTATGAATAAATTATTGTGTAATGTTATATTTTTTACTACCTA ] [+] EMBL CD131033 [ GTATACCATCTTATAAGAAATGGAATTTTTTAAGAAGTCGATCATCCACAGATACCCGTACAGTGCCAACTTTATCACCTATCCCGTGAAATTGGATGGAAGTTTCATCGATCTCTTTCTTCGTCTGTCTGCAGATAATTATTGTGTCAGTATGAATAAATTATTGTGTAATGTTATATTTTTTACTACCTATCTTACCACTATATCGTTCTCAAATTGTTCTGTATCGACAAATATTTGTTAACACATTCCACCATTTTTTCCATATAACTTTTTGATTATGTTCATTTTTTGCATTTCACAAAACGTCTGGTTCTTAACAAACTTGTACACATATATTTGTTCTTTTCTCGAATTCCATAATATTTGTGTGTGCTTGGTTTAAAGAAATCATTCATAAGTGATACTTTTATTGTCTTCCAGTTATTCTTTCTTTTATCTACTTCTTTAAA ] [-] EMBL CD075062 [ CANAACGTCTGGTTCTTAACAAACTTGTACACATATATTTGTTCTTTTCTCGAATTCCATAATATTTGTGTGTGCTTGGTTTAAAGAAATCATTCATAAGTGATACTTTTATTGTCTTCCAGTTATTCTTTCTTTTATCTACTTCTTTAAACCATCTAAATGCGGACAATATATTTTCGAGTTTATATGGCCACTTAAACGCATATTTATATAGATATAGCGTGTTTCTAACAGCTGATTGTGTATTTCTATCCTATCCTATTGTTCAACTCACTATCTTTGAATATATGCTTGTTGTTCAACTCTTATTATATGGGGATTATGCTGAGACATCTTTAAAAATTATTTAATGATAAACTTATATGATGGTACCATTTTTATTTGATTTTTATAAATAGGACTGATAATGCAAGACAAGAAAAAGAAATAACACTTTGTACATATACATATACCTGTATTAATAAACT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||