These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10617#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 19 consensus length = 735 fasta sequence [TATGTATTGTGATGGATGGGTGGTCGTATGGCTGCGTATGTTGCTTTGGCGAAATTTCCCAAGGTTGAGGTCTGACCACGAGCACTTGTGTAGACATCTTCGATACCAGCCATTTGAAGAAGCTTTTTGGG-AACTGGGGCACCAACAATGCCTGTTCCACGA-GGGGCTGGAATCAAACGTACTGACACAGAACCACATTTTCCAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATTTGATTACCCCAGTATCCTTTCCTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT--CCCATTGCAACAATTGCTTTA-AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCGCAGCCACGTCCTCGTCCGCGTCCTCTTCCNCTAGCTCNCAACGAACCACGAAAACCACCGCGACCCCCACCTGACGAATCCATTTGATAGCCTCTGATTCCCACGCTCGATGATCTT] [-] EMBL BG931907 [TATGTATTGTGATGGATGGGTGGTCGTATGGCTGCGTATGTTGCTTTGGCGAAATTTCCCAAGGTTGAGGTCTGACCACGAGCACTTGTGTAGACATCTTCGATACCAGCCATTTGAAGAAGCTTTTTGGG AACTGGGGCACCAACAATGCCTGTTCCACGA GGGGCTGGAATCAAACGTACTGACACAGAACCACATTTTCCAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATTTGATTACCCCAGTATCCTTTCCTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGac ] [+] EMBL CD141755 [ atcttCGGGCACTTGTGTAGACATCTTCGATACCAGCCATTTGAAGAAGCTTTTTGGG AACTGGGGCACCAACAATGCCTGTTCCACGA GGGGCTGGAATCAAACGTACTGACACAGAACCACATTTTCCAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATTTGATTACCCCAGTATCCTTTCCTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTGTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACCCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCGCAGCCACGTCCTCGTCCGCGTCCTCTTCCNCTAGCTCNCAACGAACCACGAAAACCACCGCGACCCCCACCTGACGAATCCATTTGATAGCCTCTGATTCCCACGCTCGATGATCTT] [+] EMBL CD141766 [ AGACATCTTCGATACCAGCCATTTGAAGGAGCTTTTTGGG AACTGGGGCACCAACAATGCCTGTTCCACGA GGGGCTGGAATCAAACGTACTGACACAGAACCACATTTTCCAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATTTGATTACCCCAGTATCCTTTCCTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTTTCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCC ] [+] EMBL CD141709 [ AGACATCTTCGATACCAGCCATTTGAAGAAGCTTTTTGGG AACTGGGGCACCAACAATGCCTGTTCCACGA GGGGCTGGAATCAAACGTACTGACACAGAACCACATTTTCCAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATTTGATTACCCCAGTATCCTTTCCTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCC ] [-] EMBL CD141781 [ GACATCTCGGATCCCAGCCATTTGAAAAAGCTTTCTGGGAAACTGGGGCACCAACAAAGCCTGTTCCACGAGGGGGCTGGAATCAAACGTACTGACACAGACCCACATTTTCCAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATTTGATTACCCCAGTATCCTTTCCTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCGCAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTCGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG ] [-] EMBL CD141751 [ GACATCTTCGAAACCAGCCATTTGANGAAGCTTTTTGGG ANCGGGGGCACCAACAATGCCTGTTCCACGA GGGGCTGGAATCAAACGTACTGACACAGAACCACATTTTCCAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATTTGATTACCCCAGTATCCTTTCTTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT CCCATCGCAACAATTGCTNTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCCTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG ] [-] EMBL CD141812 [ GACATCTTCGATACCAGCCATTTGAAGAAGCTTTNTGGA AACTGGGGCACCAACAATG CTGTTCCACGA GGGGCTGGAATCAAACGTACTGACACAGAACCACATTTCCAAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATTTGATTACNNCAGTATCC TTCCTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCNAACGTGACAGTTATGGTCT CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG ] [+] EMBL CD098167 [ CACATTTTCCAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATTTGATTACCCCAGTATCCTTTCCTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATCTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCC ] [-] EMBL BF936153 [ ACATTTTCCAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATTTGATTACCCCAGTATCCTTTCCTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCTTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG ] [-] EMBL CD146755 [ GAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG ] [-] EMBL CD097880 [ AATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTGCTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG ] [-] EMBL CD097748 [ CTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG ] [-] EMBL AI976716 [ ACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG ] [-] EMBL CD110745 [ CAG TAT GTCTNNCNCATGNCAACAA TGCTTAANAAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTNTAAACTGNAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTCCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG ] [-] EMBL CD141825 [ GGGTCTTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACNCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCCTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG ] [+] EMBL BG930219 [ gTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCC ] [-] EMBL CD113037 [ TACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCT ATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGCCCG ] [-] EMBL BG931193 [ ACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG ] [-] EMBL CD149749 [ AACGAACCACGAAAACCACCGCGACCCCCACGTGAGGAATCCATTTGATAGCCTATGATTCCCACGCTCGATGATCTT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||