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Schistosoma mansoni
cluster # 10617 cluster # 10617       Sequences # 19       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10617#0 length = 735 sequences # 19  

consensusID : consensus_10617#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 19
consensus length = 735
fasta sequence
                              [TATGTATTGTGATGGATGGGTGGTCGTATGGCTGCGTATGTTGCTTTGGCGAAATTTCCCAAGGTTGAGGTCTGACCACGAGCACTTGTGTAGACATCTTCGATACCAGCCATTTGAAGAAGCTTTTTGGG-AACTGGGGCACCAACAATGCCTGTTCCACGA-GGGGCTGGAATCAAACGTACTGACACAGAACCACATTTTCCAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATTTGATTACCCCAGTATCCTTTCCTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT--CCCATTGCAACAATTGCTTTA-AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCGCAGCCACGTCCTCGTCCGCGTCCTCTTCCNCTAGCTCNCAACGAACCACGAAAACCACCGCGACCCCCACCTGACGAATCCATTTGATAGCCTCTGATTCCCACGCTCGATGATCTT]

[-] EMBL BG931907             [TATGTATTGTGATGGATGGGTGGTCGTATGGCTGCGTATGTTGCTTTGGCGAAATTTCCCAAGGTTGAGGTCTGACCACGAGCACTTGTGTAGACATCTTCGATACCAGCCATTTGAAGAAGCTTTTTGGG AACTGGGGCACCAACAATGCCTGTTCCACGA GGGGCTGGAATCAAACGTACTGACACAGAACCACATTTTCCAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATTTGATTACCCCAGTATCCTTTCCTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGac                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD141755             [                                                                         atcttCGGGCACTTGTGTAGACATCTTCGATACCAGCCATTTGAAGAAGCTTTTTGGG AACTGGGGCACCAACAATGCCTGTTCCACGA GGGGCTGGAATCAAACGTACTGACACAGAACCACATTTTCCAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATTTGATTACCCCAGTATCCTTTCCTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT  CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTGTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACCCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCGCAGCCACGTCCTCGTCCGCGTCCTCTTCCNCTAGCTCNCAACGAACCACGAAAACCACCGCGACCCCCACCTGACGAATCCATTTGATAGCCTCTGATTCCCACGCTCGATGATCTT]
[+] EMBL CD141766             [                                                                                           AGACATCTTCGATACCAGCCATTTGAAGGAGCTTTTTGGG AACTGGGGCACCAACAATGCCTGTTCCACGA GGGGCTGGAATCAAACGTACTGACACAGAACCACATTTTCCAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATTTGATTACCCCAGTATCCTTTCCTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT  CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTTTCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCC                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD141709             [                                                                                           AGACATCTTCGATACCAGCCATTTGAAGAAGCTTTTTGGG AACTGGGGCACCAACAATGCCTGTTCCACGA GGGGCTGGAATCAAACGTACTGACACAGAACCACATTTTCCAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATTTGATTACCCCAGTATCCTTTCCTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT  CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCC                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD141781             [                                                                                            GACATCTCGGATCCCAGCCATTTGAAAAAGCTTTCTGGGAAACTGGGGCACCAACAAAGCCTGTTCCACGAGGGGGCTGGAATCAAACGTACTGACACAGACCCACATTTTCCAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATTTGATTACCCCAGTATCCTTTCCTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT  CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCGCAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTCGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD141751             [                                                                                            GACATCTTCGAAACCAGCCATTTGANGAAGCTTTTTGGG ANCGGGGGCACCAACAATGCCTGTTCCACGA GGGGCTGGAATCAAACGTACTGACACAGAACCACATTTTCCAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATTTGATTACCCCAGTATCCTTTCTTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT  CCCATCGCAACAATTGCTNTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCCTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD141812             [                                                                                            GACATCTTCGATACCAGCCATTTGAAGAAGCTTTNTGGA AACTGGGGCACCAACAATG CTGTTCCACGA GGGGCTGGAATCAAACGTACTGACACAGAACCACATTTCCAAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATTTGATTACNNCAGTATCC TTCCTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCNAACGTGACAGTTATGGTCT  CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD098167             [                                                                                                                                                                                                   CACATTTTCCAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATTTGATTACCCCAGTATCCTTTCCTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT  CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATCTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCC                                                                                                                      ]
[-] EMBL BF936153             [                                                                                                                                                                                                    ACATTTTCCAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATTTGATTACCCCAGTATCCTTTCCTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCTTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT  CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD146755             [                                                                                                                                                                                                                                                                              GAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT  CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD097880             [                                                                                                                                                                                                                                                                               AATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCGCCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTGCTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT  CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD097748             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT  CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG                                                                                                                     ]
[-] EMBL AI976716             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTATGGTCT  CCCATTGCAACAATTGCTTTA AAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD110745             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CAG TAT GTCTNNCNCATGNCAACAA TGCTTAANAAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTNTAAACTGNAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTCCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD141825             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GGGTCTTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACNCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCCTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG                                                                                                                     ]
[+] EMBL BG930219             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTTTGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCC                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD113037             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATAATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCT ATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGCCCG                                                                                                                     ]
[-] EMBL BG931193             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTCCTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCACGACCACGACCTCGTCCG                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD149749             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AACGAACCACGAAAACCACCGCGACCCCCACGTGAGGAATCCATTTGATAGCCTATGATTCCCACGCTCGATGATCTT]


>consensus_10617#0 TATGTATTGTGATGGATGGGTGGTCGTATGGCTGCGTATGTTGCTTTGGCGAAATTTCCC AAGGTTGAGGTCTGACCACGAGCACTTGTGTAGACATCTTCGATACCAGCCATTTGAAGA AGCTTTTTGGGAACTGGGGCACCAACAATGCCTGTTCCACGAGGGGCTGGAATCAAACGT ACTGACACAGAACCACATTTTCCAGTCACTTTACATGGAACAGTGTGTGGTTTACCAATT TGATTACCCCAGTATCCTTTCCTTACAGGAATTATTGACAGCTTAGCCTGAATGATAGCG CCTCTAATTGCTGTAGCGACCTCCTTAGCACATTTTACTCCTAGCCCAACGTGACAGTTA TGGTCTCCCATTGCAACAATTGCTTTAAAGCGGGTTCTCTGGCCAGCACAAGTCTGCTTT TGAACTGGCATGATTTTAAGTACTTCATCTTTTAAACTTGAACCCAATATGGTATCTATA ATTTCACACTCCTTAATCGGGAGACTGAACATGTATATTTCTTCTAATGTAGTAATTTTC CTTTCGTTTACTAGACGTCCCAACTGGGTAACAGGCTTCCATTCTTTTGTTGCAACTCCA CGACCACGACCTCGTCCGCAGCCACGTCCTCGTCCGCGTCCTCTTCCNCTAGCTCNCAAC GAACCACGAAAACCACCGCGACCCCCACCTGACGAATCCATTTGATAGCCTCTGATTCCC ACGCTCGATGATCTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)