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Schistosoma mansoni
cluster # 10710 cluster # 10710       Sequences # 20       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10710#0 length = 791 sequences # 20  

consensusID : consensus_10710#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 20
consensus length = 791
fasta sequence
                              [CATTTTGGTTTCTTTTGTCATTGGTTTGGTATTTGGGAGTTTTTGCTCCGGGAACCTACAAAATTGAAGAACGACTTTGGTCGATTATTTGTGAATTGCGAATAAACGTGGTATCTTATTTGGAGTTTTGGTTCTCTTGCCTACTTGGGTTCATAATTTGCGAATATCGACGGCCAGTACTTCAATAGTTGGAACGGACATAAACTCATAAATTGGACGTAACATAAAGTTCTTCAATTACTGGTTCTTTGTTCACACTGGATTAGTCTGGACAGTAATTTGGGTCCAAATTCTGGTTCTACTGAACGAAGGTGTACTATGGAAACTCGAAGCAAAAGACAGAAGGAAAACGACGAATTGGACGGTAAAATTTCCAGAGCTGTTTGTGGTATGTA--TGACGTTAACGATGA-TAAATGTGATGATATT-AGTCTTAATAGTATGTCCTCTAGCCAGCTAAGTACTTCTAGATTAAAGTTAGACAAAGCATTACTGAGGAAAAAGAATTTAGAAAAGAGACTTGAGTTGGAACGGCAACTTAAGATGTTAGAT-CTTCAAGAAGAGGTTGATATGGCCGAATTAG-AATGCAACGTCATCAAGGACGATGAACGATTGCCCGTAGATAAATGTGAAATAAATGCTAAAGTGGAAAATTATTTGAATGGTGAAACGGGGGGTAATAATCACTCAGGAGAGGTATGTAGCATTTCAAAAATCGATTGGGTTGATGAACTGAGGGACACTTTACATACATTGGTCGGTAACATGGTTTTACCTAAGATCGATATGATTTA]

[+] EMBL CD092986             [CATTTTGGTTTCTTTTGTCATTGGTTTGGTATTTGGGAGTTTTTGCTCCGGGAACCTACAAAATTGAAGAACGACTTTGGTCGATTATTTGTGAATTGCGAATAAACGTGGTATCTTATTTGGAGTTTTGGTTCTCTTGCCTACTTGGGTTCATAATTTGCGAATATCGATGGCCAGTACTTCAATAGCTGGCACGGACATACACTCATAAATTGGACGTAACATAAAGTTCTTCAATTACTGGTTCTTTGNTCACACTGGATTAGTCTGGACAGTAATTTGGGTCCAAATTCTGGTTCTACTGAACGAAGGTGTACTATGGAAACTCGAAGCAAAAGACAGAAGGAAAATGACGAATTGGACGGTAAAATTTCCAGAGCTGTTTGTGGTATGTA  TGACGTTAACGATGA TAAATGTGATGATATT AGTCTTAATAGTATGTCCTCTAGCCAGCTAAGTACTTCTAGATTAAAGTTAGACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD131229             [                         TTGAAATTTGGGAGTTTTTGCTCCGGGAACCTACAAAATTGAAGAACGACTTTGGTCGATTATTTGTGAATTGCGAATAAACTTGGTATCTTATTTGGAGTTTTGGTTCTCTTGCCTACTTGGGTTCGTAATTTGCGAATATCGACGGCCAGTACTTCAATAGTTGGAACGGGCA AAACTCAT AATTGGACGTAACATAAAGTTCTTCAATTATTGGTTCTGTGTT  CACTGGATTAGTCTGGACAGTAATTTGGGTCTAAATTCTGGTTCTCCTGAACGAAGGTGTACTATGGAAACTCGAAGCAAAAGACAGAAGGAAAACGACGAATTGGACGGTAAAATTTCCAGAGCTGTTTGTGGTATGTA  TGACGTTAACGATGA TAAATGTGATGATATT AGTCTTAATAGTATGTCCTCTAGCCAGCTAAGTACTTCTAGGTTAAAGTTAGACAAGGCATTACTGAGGAAAAGGAATTTAGAAAAGAGACTTGAGTTGGAACGGCAACTTAAGATG                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD185476             [                                           TGCTCCGGGAACCTACAAAATTGAAGAACGACTTTGGTCGATTATTTGTGAATTGCGAATAAACGTGGTATCTTATTTGGAGTTTTGGTTCTCTTGCCTACTTGGGTACATAATTTGCGAATATCGACGGCCAGTACTTCAATAGTTGGAACGGACATAAACTCATAAATTGGACGTAACATAAAGTTCTTCAATTACTGGTTCTTTGTTCACACTGGATTAGACTGGACAGTAATTTGGGTCCAAATTCTGGTTCTACTGAACGAAGGTGTACTATGGGAACTCGAAGCAAAAGACAGAAGGAAAATGACGAATTGGACGGTAAAATTTCCAGAGCTGTTTGTGGTATGTA  TGACGTTAACGATGA TAAATGTGATGATATT AGTCTTAATAGTATGTCCTCTAGCCAGCTAAGTACTTCTAGATTAAAGTTAGACAAAGCATTACTGAGGAAAAGGAATTTAGAAAAGAGACTTGAGTTGGAACGGCAACTTAAGATGTTAGAT CTTCAAGAAGAGGTTGATATGGCCGAATTAGAAATGC ACGT                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD147595             [                                                                                                                                                                                         TAGTTGGAACGTACATTAACTCATAAATTGGACGTAACATAAAGTTCTTCAATTACTGGTTCTTTGTTCACACTGGATTAGTCTGGACAGTAATTTGGGTCCAAATTCTGGTTCTACTGAACGAAGGTGTACTATGGAAACTCGAAGCACAAGACAGAAGGAAAATGACGAATTGGACGGTAAAATTTCCAGAGCTGTCTGTGGTATGTA  TGACGTTGACGATGATTACATGTGATGATATTAAGTC TAATAGTATGTCCTCTAGCCAGCTAAGTACTTCTAGATTAAAGTTAGACGAAGCATTACTGAGGAAAAGGAATTTAGAAAAGAGACTTGAGTTGGAACGGCAACTTAAGATGTTAGATCCTTC AGAA                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD147407             [                                                                                                                                                                                         TAGTTGGAACGGACAT AACTCATAAATTGGACGTAACATAAAGTTCTTCAATTACTGGTTCTTTGTTCACACTGGATTAGTCTGGACAGTAATTTGGGTCCAAATTCTGGTTCTACTGAACGAAGGTGTACTATGGAAACTCGAAGCAAAAGACAGAAGGAAAATGACGAATTGGACGGTAAAATTTCCAGAGCTGTTTGTGGTATGTA  TGACGTTAACGATGA TAAATGTGATGATATT AGTCTTAATAGTATGTCCTCTAGCCAGCTAAGTACTTCTAGATTAAAGTTAGACGAAGCATTACTGAGGAAAAGGAATTTAGAAAAGAGACTTGAGTTGGAACGGCAACTTAAGATGTTAGAT CTTCAAGAA                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD147366             [                                                                                                                                                                                          AGTTGGAACGGACATAAACTCATAAATTGGACGTAACATAAAGTTCTTCAATTACTGGTTCTTTGTTCACACTGGATTAGTCTGGACAGTAATTTGGGTCCAAATTCTGGTTCTACTGAACGAAGGTGTACTATGGAAACTCGAAGCAAAAGACAGAAGGAAAATGACGAATTGGACGGTAAAATTTCCAGAGCTGTTTGTGGTATGTA  TGACGTTAACGATGA TAAATGTGATGATATT AGTCTTAATAGTATGTCCTCTAGCCAGCTAAGTACTTCTAGATTAAAGTTAGACGAAGCATTACTGAGGAAAAGGAATTTAGAAAAGAGACTTGAGTTGGAACGGCAACTTAAGATGTTAGAT CTTCAAGAAG                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD156033             [                                                                                                                                                                                                                                                 TGGTTCTGTGTTCACACTGGATTAGTCTGGACAGTAATTTGGGTCCAAATTCTGGTTCTACTGAACGAAGGTGTACTATGGAAACTCGAAGCAAAAGACAGAAGGAAAACGACGAATTGGACGGTAAAATTTCCAGAGCTGTTTGTGGTATGTA  TGACGTTAACGATGA TAAATGTGATGATATT AGTCTTAATAGTATGTCCTCTAGCCAGCTAAGTACTTCTAGATTAAAGTTAGACAAAGCATTACTGAGGAAAAAGAATTTAGAAAAGAGACTTGAGTTGGAACGGCAACTTAAGATGTTA                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD156161             [                                                                                                                                                                                                                                                 TGGTTCTGTGTTCACACTGGATTAGTCTGGACAGTAATTTGGGTCCAAATTCTGGTTCTACTGAACGAAGGTGTACTATGGAAACTCGAAGCAAAAGACAGAAGGAAAACGACGAATTGGACGGTAAAATTTCCAGAGCTGTTTGTGGTATGTA  TGACGTTAACGATGA TAAATGTGATGATATT AGTCTTAATAGTATGTCCTCTAGCCAGCTAAGTACTTCTAGATTAAAGTTAGACAAAGCATTACTGAGGAAAAAGAATTTAGAAAAGAGACTTGAGTTGGAACGGCAACTTAAGATGTTA                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD180468             [                                                                                                                                                                                                                                                                  cttcccgcTCTGGACAGTAATTNGGGTCCAAATTCTGGTTCTACTGAACGAAGGTGTACTATGGAAACTCGAAGCAAAAGACAGAAGGAAAACGACGAATTGGACGGTAAAATTTCCAGAGCTGTTTGTGGTATGTA  TGACGTTAACGATGA TAAATGTGATGATATT AGTCTTAATAGTATGTCCTCTAGCCAGCTAAGTACTTCTAGATTAAAGTTAGACAAAGCATTACTGAGGAAAAAGAATTTAGAAAAGAGACTTGAGTTGGAACGGCAACTTAAGATGTTAGAT CTTCAAGAAGAGGTTGATATAGCCGAATTAG AATGCAACGTCATCAAGGACGATGAACGATTGCCCGTAGATAAATGTGAAATAAATGCTAAAGTGGAAAATTATTTGAATGGTGAAACGGCGGGaaga                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD163661             [                                                                                                                                                                                                                                                                                    AATTGGGGTCCAAATTCTGGTTCTACTGAACGAAGGTGTACTATGGAAACTCGAAGCAAAAGACAGAAGGAAAACGACGAATTGGACGGTAAAATTTCCAGAGCTGTTTGTGGTATGTA  TGACGTTAACGATGA TAAATGTGATGATATT AGTCTTAATAGTATGTCCTCTAGCCAGCTAAGTACTTCTAGATTAAAGTTAGACAAAGCATTACTGAGGAAAAAGAATTTAGAAAAGAGACTTGAGTTGGAACGGCAACTTAAGATGTTAGAT CTTCAAGAAGAGGTTGATATAGCCGAATTAG AATGCAACGTCATCAAGGACGATGAACGATTGCCCGTAGATAAATGTGAAATAAATGCTAAAGTGGAAAATTATTTGAAT                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD071128             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GTTCTACTGAACGAAGGTGTACTATGGAAACTCGAAGCAAAAGACAGAAGGAAAACGACGAATTGGACGGTAAAATTTCCAGAGCTGTTTGTGGTATGTA  TGACGTTAACGATGA TAAATGTGATGATATT AGTCTTAATAGTATGTCCTCTAGCCAGCTAAGTACTTCTAGATTAAAGTTAGACAAAGCATTACTGAGGAAAAAGAATTTAGAAAAGAGGCTTGAGTTGGAACGGCAACTTAAGATGTTAGAT CTTCAAGAAGAGGTTGATATGGCCGAATTAG AATGCAACGTCATCAAGGACGATGAACGATTGCCCGTAGATAAATGTGAAATAAATGCTAAAGTGGAAAATTATT                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD071040             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GTTCTACTGAACGAAGGTGTACTATGGAAACTCGAAGCAAAAGACAGAAGGAAAACGACGAATTGGACGGTAAAATTTCCAGAGCTGTTTGTGGTATGTA  TGACGTTAACGATGA TAAATGTGATGATATT AGTCTTAATAGTATGTCCTCTAGCCAGCTAAGTACTTCTAGATTAAAGTTAGACAAAGCATTACTGAGGAAAAAGAATTTAGAAAAGAGACTTGAGTTGGAACGGCAACTTAAGATGTTAGAT CTTCAAGAAGAGGTTGATATGGCCGAATTAG AATGCAACGTCATCAAGGACGATGAACGATTGCCCGTAGATAAATGTGAAATAAATGCTAAAGTGGAAAATTATT                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD071035             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GTTCTACTGAACGAAGGTGTACTATGGAAACTCGAAGCAAAAGACAGAAGGAAAACGACGAATTGGACGGTAAAATTTCCAGAGCTGTTTGTGGTATGTA  TGACGTTAACGATGA TAAATGTGATGATATT AGTCTTAATAGTATGTCCTCTAGCCAGCTAAGTACTTCTAGATTAAAGTTAGACAAAGCATTACTGAGGAAAAAGAATTTAGAAAAGAGACTTGAGTTGGAACGGCAACTTAAGATGTTAGAT CTTCAAGAAGAGGTTGATATGGCCGAATTAG AATGCAACGTCATCAAGGACGATGAACGATTGCCCGTAGATAAATGTGAAATAAATGCTAAAGTGGAAAATTATT                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD071042             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GTTCTACTGAACGAAGGTGTACTATGGAAACTCGAAGCAAAAGACAGAAGGAAAACGACGAATTGGACGGTAAAATTTCCAGAGCTGTTTGTGGTATGTA  TGACGTTAACGATGA TAAATGTGATGATATT AGTCTTAATAGTATGTCCTCTAGCCAGCTAAGTACTTCTAGATTAAAGTTAGACAAAGCATTACTGAGGAAAAAGAATTTAGAAAAGAGACTTGAGTTGGAACGGCAACTTAAGATGTTAGAT CTTCAAGAAGAGGTTGATATGGCCGAATTAG AATGCAACGTCATCAAGGACGATGAACGATTGCCCGTAGATAAATGCGAAATAAATGCTAAAGTGGAAAATTATT                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD071085             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GTTCTACTGAACGAAGGTGTACTATGGAAACTCGAAGCAAAAGACAGAAGGAAAACGACGAATTGGACGGTAAAATTTCCAGAGCTGTTTGTGGTATGTA  TGACGTTAACGATGA TAAATGTGATGATATT AGTCTTAATAGTATGTCCTCTAGCCAGCTAAGTACTTCTAGATTAAAGTTAGACAAAGCATTACTGAGGAAAAAGAATTTAGAAAAGAGACTTGAGTTGGAACGGCAACTTAAGATGTTAGAT CTTCAAGAAGAGGTTGATATGGCCGAATTAG AATGCAACGTCATCAAGGACGATGAACGATTGCCCGTAGGTAAATGTGAAATAAATGCTAAAGTGGAAAATTATT                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD180797             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTGAACGAAGGTGTACTATGGAAACTCGAAGCAAAAGACAGAAGGAAAACGACGAATTGGACGGTAAAATTTCCAGAGCTGTTTGTGGTATGTA  TGACGTTAACGATGA TAAATGTGATGATATT AGTCTTAATAGTATGTCCTCTAGCCAGCTAAGTACTTCTAGATAAAAGTTAGACAAAGCATTACTGAGGAAAAAGAATTTAGAAAAGAGACTTGAGTTGGAACGGCAACTTAAGATGTTAGAT CTTCAAGAAGAGGTTGATATGGCCGAATTAG AATGCAACGTCATCAAGGACGATGAACGATTGCCCGTAGATAAATGTGAAATAAATGCTAAAGTGGAAAATTATTTGAATGGTGAAACGGGGGGTAATAATCACTCAGGAGAGGTATGTAGCATTTCAAAAATCGATTG                                                                        ]
[-] EMBL CD155895             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGGTGTACTATGGAAACTCGAAGCAAAAGACAGAAGGAAAATGACGAATTGGACGGTAAAATTTCCAGAGCTGTTTGTGGTATGTA  TGACGTTAACGATGA TAAATGTGATGATATT AGTCTTAATAGTATGTCCTCTAGCCAGCTAAGTACTTCTAGATTAAAGTTAGACAAAGCATTACTGAGGAAAAGGAATTTAGAAAAGAGACTTGAGTTGGAACGGCAACTTAAGATGTTAGAT CTTCAAGAAGAGGTTGATATGGCCGAATTAG AATGCAACGTCATCAAGGACGATGAACGATTGCCCGTAGATAAATGTGAAATAAATGCTAAAGTGGAAAATTATTTGAATGGTGAAACGGGGGGTAAT                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD091616             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGTACTATGGAAACTCGAAGCAAAAGAGAGAAGGGAAACGACAAATTGGACGGTAAAATTTCCAGAGCTGTTTGTGGTATGTA  TGACGTTAACGATGA TAAATGTGATGATATT AGCCTTAATAGTATGTTCTTTAGCCAGCTAAGTACTTCTAGATTAAAGTTAGACAAAGCATTGCTGAGGAAAAGGAATTTAGAAAAGAGACTTGAATTGGAACGGCAACTTAAGATGTTAGAT CTTCAAGAAGAGGTTGATATCGTCGAATTAG AATGCAACGTCATCAAGGACGATGAACGATTGCCCGTAGATAAATGTGGAATAAATGCTAAAGTGGAAAATTATTTGAATTGTGAAACTGGGTGTAATAATCACTCAGGAGAGGCATGTAACACCTCAAAAATCGATTGGGTTGATGAACTGAGGGACACTTTACATACATTGGTCGGTAACATGGTTTTACCTAAGATCGATATGATTTA]
[+] EMBL CD155122             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACGAATTGGACGGTAAAATTTCCAGAGCTGTTTGTGGTATGTA  TGACGTTAACGATGA TAAATGTGATGATATT AGTCTTAATAGTATGTCCTCTAGCCAGCTAAGTACTTCTAGATTAAAGTTAGACAAAGCATTACTGAGG AAAAGAATTTTAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD135806             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tgcgaGTATCTACGCGACGTTAACGATGA TAAATGTGATGATATT AGTCTTAATAGTATGTCCTCTAGCCAGCTAAGTACTTCTAGATTAAAGTTAGACAAAGCATTACTGAGGAAAAAGAATTTAGAAAAGAGACTTGAGTTGGAACGGCAACTTAAGATGT                                                                                                                                                                                                                                                         ]


>consensus_10710#0 CATTTTGGTTTCTTTTGTCATTGGTTTGGTATTTGGGAGTTTTTGCTCCGGGAACCTACA AAATTGAAGAACGACTTTGGTCGATTATTTGTGAATTGCGAATAAACGTGGTATCTTATT TGGAGTTTTGGTTCTCTTGCCTACTTGGGTTCATAATTTGCGAATATCGACGGCCAGTAC TTCAATAGTTGGAACGGACATAAACTCATAAATTGGACGTAACATAAAGTTCTTCAATTA CTGGTTCTTTGTTCACACTGGATTAGTCTGGACAGTAATTTGGGTCCAAATTCTGGTTCT ACTGAACGAAGGTGTACTATGGAAACTCGAAGCAAAAGACAGAAGGAAAACGACGAATTG GACGGTAAAATTTCCAGAGCTGTTTGTGGTATGTATGACGTTAACGATGATAAATGTGAT GATATTAGTCTTAATAGTATGTCCTCTAGCCAGCTAAGTACTTCTAGATTAAAGTTAGAC AAAGCATTACTGAGGAAAAAGAATTTAGAAAAGAGACTTGAGTTGGAACGGCAACTTAAG ATGTTAGATCTTCAAGAAGAGGTTGATATGGCCGAATTAGAATGCAACGTCATCAAGGAC GATGAACGATTGCCCGTAGATAAATGTGAAATAAATGCTAAAGTGGAAAATTATTTGAAT GGTGAAACGGGGGGTAATAATCACTCAGGAGAGGTATGTAGCATTTCAAAAATCGATTGG GTTGATGAACTGAGGGACACTTTACATACATTGGTCGGTAACATGGTTTTACCTAAGATC GATATGATTTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)