cluster # 10823

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Schistosoma mansoni
cluster # 10823 cluster # 10823 Sequences # 22 consensus # 2

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consensus_10823#0 length = 2178 sequences # 21

consensus_10823#1 length = 431 sequences # 1

consensusID : consensus_10823#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 21
consensus length = 2178
fasta sequence

                              [CCTTTTGCCAGGTTGAACGTCAATTAAGCAAACAAAAAGGTGTTTTGGCTTTAATTGGACGATTATTATTATTTGGACATGAACATGTTGGAGAAAATGATACGTGGCAAGTTGTAGAAGAAAAATCTTATTCATTAGAGTCTAGTTTTTGTGCTTGGTGGACACCTACATGGTTAGAAGATATGCGAGAAAATGCTATGGTATTATTAGTCAATGTTGCTGGTTATTTAGAATTAATTCAATTTGATGAGTCAATAGTACGTCCTATTCTAGAAGGTCTTTTACATTGGATAACATGTTCAACATCAGCTTCAGTTGATCCTTTCCCAGGACATCGAACTCTTAGTCCTCGCCGTTTAGCACTTGAAGCTTTAAATCGTCTTTGTGTACATGAGACAAATGTTGATCTTCTATTGTCAACACCTTCTGATGAAAAAGTTCTTAGTAGATTATTTGATAGACTTGCTACTTGGCTTGCTGTACCAGAAGATCAAGTGACACGTGAATTAGCTTTATCTACTATGCATTATCTTGCTGGTGGAGGTGCTACATTTTCTAGCTCTTCTCTATCTTCAAATATTGGAAAAGTTACTACTAACGAAACAAATGCATCCTCAGGGACATATATTGGTACAACTATGCTTGCTGATGCCAAACCTTGTCCTATCTCTGGATTATTGTCATTTATTGAAGCGGCTGAAGCAACAACTAGGCGAGTTATTGATCAATATGGTGTACAAGCTCTACAAGAAAGACCAGAATTAATGGGAACAAGTTTAGAAATGGTTCGTCGTGCAGGTGCACTACTTGATAGACTAGCTATCGATTCTAAAGGTCGATTAGCTTTTACACCGGACTTAGAGCTACGTTTGATGGATCTAGTAACTTCACGTGTATTAGATGCTACTGTTGCGCATCTTTTATGCGGTGCGCTACATCGTTTACTTCCAGATTTTAATCAACTAGATAATGATAATGTAAAAATTTCAACAATCCCACCGATCCCAACTCCTTCCGCTATAGCAGAACTTTTAACACAGTCCTCAGCAGTAACTGTTGTATTGCCAGAGACAGTGATAGGTGTTAATCAAATCTCACAAGAGTCATCTACGATTATTCCAAGTCATAAATATGTAGATAAAGTAGAAGTGTTCAAAAAACAATCACAACAACAGTCAACAAACATAATGCCAACAACACCAACATGTTCTGACATCGATCATAATCAACAACAAACAGTACTGAACAATTCAACTGATAATAATAATTTAATAATTAAAGAAGCTGATTCATCGCTCCCTTCTAATGAGCATTTTAATAAACCAATTGATAACAATATTGACGATCATGATAATTCTGTAGATAACAAAACAATCCCATTGAATAATAATTGTGTGAATAATACATCATTAATTGATAAACATCCTGCTACTACACTTTCAGATGACTCTTTAATTATTGAAAGTAGAAAACAGATGAATGGATCTGTTGTCGACAATGGTGGTGATAATGATAATGTAAATTGTTGTAAAACTGAAACTTTTGATTTCCGAAC-TAATTTAACAGTGAATAATTGCGGTACCGCTAACTTTACTACTATTACTACTACTAACAATATTAATAGTAATAAAGATACTACAACTACTGTTTCTATGAATAATGACACTGTTGTTGATCCCAATATTTACTGCAATAACACAGACTCTCCTCAGCCGAAAGTAAATTGTGTCGATTCTTCATGAAGTATGTGTGTGTGTTACACTGCTATAATGCCATTTTCCCACTTTGTGTTTCGATCACTTCAGTTCCATCCTCACACTTTTGTTTGTTCCCCCACTTTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCTTCTGTGAATTCTTTTATGATTTGTGATGTCAAATAAAAAATTTTCTATTTAGAAATAAAATAAAACAACAAGCAAAAACACTTTGTTGTTGATTTTTTCTCTCTCCTTTCAACCAGCTCATAGTTGACTAAAATGGTCACTCACCCAGTAACTAAATACACTAACCAACATGAATCCAGTCACCTACAGTATGAATGAAATGAACTTGNAGGACNGCATTNNNTTTCTTTNCTCTCTCTCTCTATCCCGGGCCCTCTTTCGAACAATTAAAATTACTGGGNATTGGATTGNNGAAAACCCTTCCTTATATATCTTTAT]

[+] EMBL CD151820             [CCTTTTGCCAGGTTGAACGTCAATTAAGCAAACAAAAAGGTGTTTTGGCTTTAATTGGACGATTATTATTATTTGGACATGAACATGTTGGAGAAAATGATACGTGGCAAGTTGTAGAAGAAAAATCTTATTCATTAGAGTCTAGTTTTTGTGCTTGGTGGACACCTACATGGTTAGAAGATATGCGAGAAAATGCTATGGTATTATTAGTCAATGTTGCTGGTTATTTAGAATTAATTCAATTTGATGAGTCAATAGTACGTCCTATTCTAGAAGGTCTTTTACATTGGATAACATGTTCAACATCAGCTTCAGTTGATCCTTTCCCAGGACATCGAACTCTTAGTCCTCGCCGTTTAGCACTTGAAGCTTTAAATCGTCTTTGTGTACATGAGACAAATGTTGATCTTCTATTGTCAACACCTTCTGATGAAAAAGTTCTTAGTAGATTATTTGATAGACTTGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD161850             [                                                                                                                                             CTAGTTTTTGTGCTTGGTGGACACCTACATGGTTAGAAGATATGCGAGAAAATGCTATGGTATTATTAGTCAATGTTGCTGGTTATTTAGAATTAATTCAATTTGATGAGTCAATAGTACGTCCTATTCTAGAAGGTCTTTTACATTGGATAACATGTTCAACATCAGCTTCAGTTGATCCTTTCCCAGGACATCGAACTCTTAGTCCTCGCCGTTTAGCACTTGAAGCTTTAAATCGTCTTTGTGTACATGAGACAAATGTTGATCTTCTATTGTCAACACCTTCTGATGAAAAAGTTCTTAGTAGATTATTTGATAGACTTGCTACTTGGCTTGCTGTACCAGAAGATCAAGTGACACGTGAATTAGCTTTATCTACTATGCATTATCTTGCTGGTGGAGGTGCTACATTTTCTAGCTCTTCTCTATCTTCAAATATTGGAAAAGTTACTACTAACGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD189441             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTAGTAGATTATTTGATAGACTTGCTACTTGGCTTGCTGTACCAGAAGATCAAGTGACACGTGAATTAGCTTTATCTACTATGCATTATCTTGCTGGTGGAGGTGCTACATTTTCTAGCTCTTCTCTATCTTCAAATATTGGAAAAGTTACTACTAACGAAACAAATGCATCCTCAGGGACATATATTGGTACAACTATGCTTGCTGATGCCAAACCTTGTCCTATCTCTGGATTATTGTCATTTATTGAAGCGGCTGAAGCAACAACTAGGCGAGTTATTGATCAATATGGTGTACAAGCTCTACAAGAAAGACCAGAATTAATGGGAACAAGTTTAGAAATGGTTCGTCGTGCAGGTGCACTACTTGATAGACTAGCTATCGATTCTAAAGGTCGATTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD133380             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTAGTAGATTATTTGATAGACTTGCTACTTGGCTTGCTGTACCAGAAGATCAAGTGACACGTGAATTAGCTTTATCTACTATGCATTATCTTGCTGGTGGAGGTGCTACATTTTCTAGCTCTTCTCTATCTTCAAATATTGGAAAAGTTACTACTAACGAAACAAATGCATCCTCAGGGACATATATTGGTACAACTATGCTTGCTGATGCCAAACCTTGTCCTATCTCTGGATTATTGTCATTTATTGAAGCGGCTGAAGCAACAACTAGGCGAGTTATTGATCAATATGGTGTACAAGCTCTACAAGAAAGACCAGAATTAATGGGAACAAGTTTAGAAATGGTTCGTCGTGCAGGTGCACTACTTGATAGACTAGCTATCGATTCTAAAGGTCGATTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD156104             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AATGCATCCTCAGGGACATATATTGGTACAACTATGCTTGCTGATGCCAAACCTTGTCCTATCTCTGGATTATTGTCATTTATTGAAGCGGCTGAAGCAACAACTAGGCGAGTTATTGATCAATATGGTGTACAAGCTCTACAAGAAAGACCAGAATTAATGGGAACAAGTTTAGAAATGGTTCGTCGTGCAGGTGCACTACTTGATAGACTAGCTATCGATTCTAAAGGTCGATTAGCTTTTACACCGGACTTAGAGCTACGTTTGATGGATCTAGTAACTTCACGTGTATTAGATGCTACTGTTGCGCATCTTTTATGCGGTGCGCTACATCGTTTACTTCCAGATTTTAATCAACTAGATAATGATAATGTAAAAATTTCAACAATCCCACCGATCCCAACTCCTTCCGCTATAGCAGAACTTTTAACACAGTCCTCAGCAGTAACTGTTGTATTGCCAGAGACAGTGATAGGTGTTAATCAAATCTCACAAGAGTCATCTACGATTATTCCAAGTCATAAATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD156316             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AATGCATCCTCAGGGACATATATTGGTACAACTATGCTTGCTGATGCCAAACCTTGTCCTATCTCTGGATTATTGTCATTTATTGAAGCGGCTGAAGCAACAACTAGGCGAGTTATTGATCAATGGGGTGACCACTCTCTACAAAAAAGACCATAATTAGTGGGAACAAGTTTAGAAATGGTTCGTCGCGCAGGCGCACTATTTGATAGACTACCTATCGATTCTAAAGGTCGATTAGCTTTTACACCGGACTTAGAGCTACGTTTGATGGATCTAGTAACTTCACGTGTATTAGATGCTACTGTTGCGCATCTTTTATGCGGTGCGCTACATCGTTTACTTCCAGATTTTAATCAACTAGATAATGATAATGTAAAAATTTCAACAATCCCACCGATCCCAACTCCTTCCGCTATAGCAGAACTTTTAACACAGTCCTCAGCAGTAACTGTTGTATTGCCAGAGACAGTGATAGGTGTTAATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD156338             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AATGCATCCTCAGGGACATATATTGGTACAACTATGCTTGCTGATGCCAAACCTTGTCCTATCTCTGGATTATTGTCATTTATTGAAGCGGCTGAAGCAACAACTAGGCGAGTTATTGATCAATATGGTGTACAAGCTCTACAAGAAAGACCAGAATTAATGGGAACAAGTTTAGAAATGGTTCGTCGTGCAGGTGCACTACTTGATAGACTAGCTATCGATTCTAAAGGTCGATTAGCTTTTACACCGGACTTAGAGCTACGTTTGATGGATCTAGTAACTTCACGTGTATTATATGCTACTGTTGCGCATCTTTTATGCGGTGCGCTACATCGTTTACTTCCAGATTTTAATCAACTAGATAATGATAATGTAAAAATTTCAACAATCCCACCGATCCCAACTCCTTCCGCTATAGCAGAACTTTTAACACAGTCCTCAGCAGTAACTGTTGTATTGCCAGAGACAGTGATAGGTGTTAATCAAATCTCACAAGAGTCATCTACGATTATTCCAAGTCATAAATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD063756             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATGGTTCGTCGTGCAGGTGCACTACTTGATAGACTAGCTATCGATTCTAAAGGTCGATTATCTTTTACACCGGACTTAGAGCTACGTTTGATGGATCTAGTAACTTCACGTGTATTAGATGCTACTGTTGCGCATCTTTTATGCGGTGCGCTACATCGTTTACTTCCAGATTTTAATCAACTAGATAATGATAATGTAAAAATTTCAACAATCCCACCGATCCCAACTCCTTCCGCTATAGCAGAACTTTTAACACAGTCCTCAGCAGTAACTGTTGTATTGCCAGAGACAGTGATAGGTGTTAATCAAATCTCACAAGAGTCATCTACGATTATTCCAAGTCATAAATATGTAGATAAAGTAGAAGTGTTCAAAAAACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD196424             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTATTCCAAGTCATAAATATGTAGATAAAGTAGAAGTGTTCAAAAAACAATCACAACAACAGTCAACAAACATAATGCCAACAACACCAACATGTTCTGACATCGATCATAATCAACAACAAACAGTACTGAACAATTCAACTGATAATAATAATTTAATAATTAAAGAAGCTGATTCATCGCTCCCTTCTAATGAGCATTTTAATAAACCAATTGATAACAATATTGACGATCATGATAATTCTGTAGATAACAAAACAATCCCATTGAATAATAATTGTGTGAATAATACATCATTAATTGATAAACATCCTGCTACTACACTTTCAGATGACTCTTTAATTATTGAAAGTAGAAAACAGATGAATGGATCTGTTGTCGACAATGGTGGTGATAATGATAATGTAAATTGTTGTAAAACTGAAACTTTTGATTTCCGAAC TAATTTAACAGTGAATAATTGCGGTACCGCTAACTTTACTACTATTACTACTACTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD196661             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTATTCCAAGTCATAAATATGTAGATAAAGTAGAAGTGTTCAAAAAACAATCACAACAACAGTCAACAAACATAATGCCAACAACACCAACATGTTCTGACATCGATCATAATCAACAACAAACAGTACTGAACAATTCAACTGATAATAATAATTTAATAATTAAAGAAGCTGATTCATCGCTCCCTTCTAATGAGCATTTTAATAAACCAATTGATAACAATATTGACGATCATGATAATTCTGTAGATAACAAAACAATCCCATTGAATAATAATTGTGTGAATAATACATCTTTAATTGATAAACATCCTGCTACTACACTTTCAGATGACTCTTTAATTATTGAAAGTAGAAAACAGATGAATGGATCTGTTGTCGACAATGGTGGTGATAATGATAATGTAAATTGTTGTAAAACTGAAACTTTTGATTTCCGAAC TAATTTAACAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD196589             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTATTCCAAGTCATAAATATGTAGAT AAGTAGAAGTGTTCAAAAAACAATCACAACATCAGTCAACAAACATAATGCCAACAACACCAACATGTTCTGACATCGATCATAATCAACAACAAACAGTACTGAACAATTCAACTGATAATAATAATTTAATAATTAAAGAAGCTGATTCATCGCTCCCTTCTAATGAGCATTTTAATAAACCAATTGATAACAATATTGACGATCATGATAATTCTGTAGATAACAAAACAATCCCATTGAATAATAATTGTGTGAATAATACATCATTAATTGATAAACATCCTGCTACTACACTTTCAGATGACTCTTTAATTATTGAAAGTAGAAAACAGATGAATGGATCTGTTGTCGACAATGGTGGTGATAATGATAATGTAAATTGTTGTAAAACTGAAACTTTTGATTTCCGAAC TA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD140397             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTATTCCAAGTCATAAATATGTAGAT AAGTAGAAGTGTTCAAAAAACAATCACAACAACAGTCAACAAACATAATGCCAACAACACCAACATGTTCTGACATCGATCATAATCAACAACAAACAGTACTGAACAATTCAACTGATAATAATAATTTAATAATTAAAGAAGCTGATTCATCGCTCCCTTCTAATGAGCATTTTAATAAACCAATTGATAACAATATTGACGATCATGATAATTCTGTAGATAACAAAACAATCCCATTGAATAATAATTGTGTGAATAATACATCATTAATTGATAAACATCCTGCTACTACACTTTCAGATGACTCTTTAATTATTGAAAGTAGAAAACAGATGAATGGATCTGTTGTCGACAATGGTGGTGATAATGACTATGTAAATTGTTGTAAAACTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD140331             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTATTCCAAGTCATAAATATGTAGATAAAGTAGAAGTGTTCAAAAAACAATCACAACAACAGTCAACAAACATAATGCCAACAACACCAACATGTTCTGACATCGATCATAATCAACAACAAACAGTACTGAACAATTCAACTGATAATAATAATTTAATAATTAAAGAAGCTGATTCATCGCTCCCTTCTAATGAGCATTTTAATAAACCAATTGATAACAATATTGACGATCATGATAATTCTGTAGATAACAAAACAATCCCATTGAATAATAATTGTGTGAATAATACATCATTAATTGATAAACATCCTGCTACTACACTTTCAGATGACTCTTTAATTATTGAAAGTAGAAAACAGATGAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD079308             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATCATGATAATTCTGTAGATAACAAAACAATCCCATTGAATAATAATTGTGTGAATAATACATCATTAATTGATAAACATCCTGCTACTACACTTTCAGATGACTCTTTAATTATTGAAAGTAGAAAACAGATGAATGGATCTGTTGTCGACAATGGTGGTGATAATGATAATGTAAATTGTTGTAAAACTGAAACTTTTGATTTCCGAAC TAATTTAACAGTGAATAATTGCGGTACCGCTAACTTTACTACTATTACTACTACTAACAATATTAATAGTAATAAAGATACTACAACTACTGTTTCTATGAATAATGACACTGTTGTTGATCCCAATATTTACTGCAATAACACAGACTCTCCTCAGCCGAAAGTAAATTGTGTCGATTCTTCATGAAGTATGTGTGTGTGTTACACTGCTATAATGCCATTTTCCCACTTTGTGTTTCGATCACTTCAGTTCCATCCTCACACTTTTGTTTGTTCCCCCACTTTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCTTCTGTGAATTCTTTTATGATTTGTGATGTCAAATAAAAAATTTTCTATTTAGAAATAAAATAAAACAACAAGCAAAAACACTTTGTTGTTGATTNTTTCTCTCTCCTTTCAACCAGCTCATAGTTGACTAAAATGGTCACTCACCCAGTAACTANATACACTAACCAACATGAATCCAGTCACCTACAGTATGAATGAAATGAACTTGNAGGACNGCATTNNNTTTCTTTNCTCTCTCTCTCTATCCCGGGCCCTCTTTCGAACAATTAAAATTACTGGGNATTGGATTGNNGAAAACCCTTCCTTATATATCTTTAT]
[-] EMBL CD197589             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAGATAACCAAACAATCCCATTGAATAATAATTGTGTGAATAATACATCATTAATTGATAAACATCCTGCTACTACACTTTCAGATGACTCTTTAATTATTGAAAGTAGAAAACAGATGAATGGATCTGTTGTCGACAATGGTGGTGATAATGATAATGTAAATTGTTGTAAAACTGAAACTTTTGATTTCCGAACATAATTTAACAGTGAATAATTGCGGTACCGCTAACTTTACTACTATTACTACTACTAACAATATTAATAGTAATAAAGATACTACAACTACTGTTTCTATGAATAATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD192328             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTGATAAACATCCTGCTACTACACTTTCAGATGACTCTTTAATTATTGAAAGTAGAAAACAGATGAATGGATCTGTTGTCGACAATGGTGGTGATAATGATAATGTAAATTGTTGTAAAACTGAAACTTTTGATTTCCGAAC TAATTTAACAGTGAATAATTGCGGTACCGCTAACTTTACTACTATTACTACTACTAACAATATTAATAGTAATAAAGATACTACAACTACTGTTTCTATGAATAATGACACTGTTGTTGATCCCAATATTTACTGCAATAACACAGACTCTCCTCAGCCGAAAGTAAATTGTGTCGATTCCTCATGAAGTATGTGTGTGTGTTACACTGCTATAATGCCATTTTCCCACTTTGTGTTTCGATCACTTCAGTTCCATCCTCACACTTTTGTTTGTTCCCCCACTTTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCTTCTGTGAATTCTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD196613             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATAAACATCCTGCTACTACACTTTCAGATGACTCTTTAATTATTGAAAGTAGAAAACAGATGAATGGATCTGTTGTCGACAATGGTGGTGATAATGATAATGTAAATTGTTGTAAAACTGAAACTTTTGATTTCCGAAC TAATTTAACAGTGAATAATTGCGGTACCGCTAACTTTACTACTATTACTACCACTAACAATATTAATAGTAATAAAGATACTACAACTACTGTTTCTATGAATAATGACACTGTTGTTGATCCCAATATTTACTGCAATAACACAGACTCTCCTCAGCTGAAAGTAAATTGTGTCGATTCTTCATGAAGTATGTGTGTGTGTTACACTGCTATAATGCCATTTTCCCACTTTGTGTTTCGATCACTTCAGTTCCATCCCCACACTTTTGTTTGTTCCCCCACTTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD073588             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AACTTTTGATTTCCGAAC TAATTTAACAGTGAATAATTGCGGTACCGCTAACTTTACTACTATTACTACTACTAACAATATTAATAGTAATAAAGATACTACAACTACTGTTTCTATGAATAATGACACTGTTGTTGATCCCAATATTTACTGCAATAACACAGACTCTCCTCAGCCGAAAGTAAATTGTGTCGATTCTTCATGAAGTATGTGTGTGTGTTACACTGCTATAATGCCATTTTCCCACTTTGTGTTTCGATCACTTCAGTTCCATCCTCACACTTTTGTTTGTTCCCCCACTTTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCTTCTGTGAATTCTTTTATGATTTGTGATGTCAAATAAAAAATTTTCTATTTAGAAATAAAATAAAACAACAAGCAAAAACACTTTGTTGTTGATTTTTTCTCTCTCCTTTCAACCAGCTCATAGTTGACTAAAATGGTCACTCACCCAGTAACTAAATACACTAACCAACATGAATCCAGTCACCTACAGTATGAATGAAATGAACTTGga                                                                                                            ]
[-] EMBL CD192841             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TATGAATAATGACACTGTTGTTGATCCCGATATTTACTGCAATAACACAGACTCTCCTCAGCCGAAAGTAAATTGTGTCGATTCTTCATGAAGTATGTGTGTGTGTTACACTGCTATAATGCCATTTTCCCACTTTGTGTTTCGATCACTTCAGTTCCATCCTCACACTTTTGTTTGTTCCCCCACTT  TCTCTCTCTCTCTTTTTCTTCTGTGAATTCTTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD136809             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGACGCTGTTGTTGATCCCAATATTTACTGCAATAACACAGACTCTCCTCAGCCGAAAGTAAATTGTGTCGATTCTTCATGAAGTATGTGTGTGTGTTACACTGCTATAATGCCATTTTCCCACTTTGTGTTTCGATCACTTCAGTTCCATCCTCACACTTTTGTTTGTTCCCCCACTTTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCTTCTGTGAATTCTTTTATGATTTGTGATGTCAAATAAAAAATTTTCTATTTAGAAATAAAATAAAACAACAAGCAAAAATACTTTGTTGTTGATTTTTTCTCTCTCCTTTCAACCAGCTCATAGTTGACTAAAATGGTCACTCACCCAGTAACTAAATACACTAACCAACATGAATCCAG                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD137099             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GACGCTGTTGTTGATCCCAATATTTACTGCAATAACACAGACTCTCCTCAGCTGAAAGTAAATTGTGTCGATTCTTCATGAAGTATGTGTGTGTGTTACACTGCTATAATGCCATTTTCCCACTTTGTGTTTCGATCACTTCAGTTCCATCCTCACACTTTTGTTTGTTCCCCCACTT  TCTCTCTCTCTCTTTTTCTTCTGTGAATTCTTTTATGATTTGTGATGTCAAATAAAAAATTTTCTATTTAGAAATAAAATAAAACAACAAGCAAAAATACTTTGTTGTTGATTTTTTCTCTCTCCTTTCAACCAGCTCATAGTTGACTAAAATGGTCACTCACCCAGTAACTAAATACACTAACCAACATGAATCCAGT                                                                                                                                          ]




>consensus_10823#0
CCTTTTGCCAGGTTGAACGTCAATTAAGCAAACAAAAAGGTGTTTTGGCTTTAATTGGAC
GATTATTATTATTTGGACATGAACATGTTGGAGAAAATGATACGTGGCAAGTTGTAGAAG
AAAAATCTTATTCATTAGAGTCTAGTTTTTGTGCTTGGTGGACACCTACATGGTTAGAAG
ATATGCGAGAAAATGCTATGGTATTATTAGTCAATGTTGCTGGTTATTTAGAATTAATTC
AATTTGATGAGTCAATAGTACGTCCTATTCTAGAAGGTCTTTTACATTGGATAACATGTT
CAACATCAGCTTCAGTTGATCCTTTCCCAGGACATCGAACTCTTAGTCCTCGCCGTTTAG
CACTTGAAGCTTTAAATCGTCTTTGTGTACATGAGACAAATGTTGATCTTCTATTGTCAA
CACCTTCTGATGAAAAAGTTCTTAGTAGATTATTTGATAGACTTGCTACTTGGCTTGCTG
TACCAGAAGATCAAGTGACACGTGAATTAGCTTTATCTACTATGCATTATCTTGCTGGTG
GAGGTGCTACATTTTCTAGCTCTTCTCTATCTTCAAATATTGGAAAAGTTACTACTAACG
AAACAAATGCATCCTCAGGGACATATATTGGTACAACTATGCTTGCTGATGCCAAACCTT
GTCCTATCTCTGGATTATTGTCATTTATTGAAGCGGCTGAAGCAACAACTAGGCGAGTTA
TTGATCAATATGGTGTACAAGCTCTACAAGAAAGACCAGAATTAATGGGAACAAGTTTAG
AAATGGTTCGTCGTGCAGGTGCACTACTTGATAGACTAGCTATCGATTCTAAAGGTCGAT
TAGCTTTTACACCGGACTTAGAGCTACGTTTGATGGATCTAGTAACTTCACGTGTATTAG
ATGCTACTGTTGCGCATCTTTTATGCGGTGCGCTACATCGTTTACTTCCAGATTTTAATC
AACTAGATAATGATAATGTAAAAATTTCAACAATCCCACCGATCCCAACTCCTTCCGCTA
TAGCAGAACTTTTAACACAGTCCTCAGCAGTAACTGTTGTATTGCCAGAGACAGTGATAG
GTGTTAATCAAATCTCACAAGAGTCATCTACGATTATTCCAAGTCATAAATATGTAGATA
AAGTAGAAGTGTTCAAAAAACAATCACAACAACAGTCAACAAACATAATGCCAACAACAC
CAACATGTTCTGACATCGATCATAATCAACAACAAACAGTACTGAACAATTCAACTGATA
ATAATAATTTAATAATTAAAGAAGCTGATTCATCGCTCCCTTCTAATGAGCATTTTAATA
AACCAATTGATAACAATATTGACGATCATGATAATTCTGTAGATAACAAAACAATCCCAT
TGAATAATAATTGTGTGAATAATACATCATTAATTGATAAACATCCTGCTACTACACTTT
CAGATGACTCTTTAATTATTGAAAGTAGAAAACAGATGAATGGATCTGTTGTCGACAATG
GTGGTGATAATGATAATGTAAATTGTTGTAAAACTGAAACTTTTGATTTCCGAACTAATT
TAACAGTGAATAATTGCGGTACCGCTAACTTTACTACTATTACTACTACTAACAATATTA
ATAGTAATAAAGATACTACAACTACTGTTTCTATGAATAATGACACTGTTGTTGATCCCA
ATATTTACTGCAATAACACAGACTCTCCTCAGCCGAAAGTAAATTGTGTCGATTCTTCAT
GAAGTATGTGTGTGTGTTACACTGCTATAATGCCATTTTCCCACTTTGTGTTTCGATCAC
TTCAGTTCCATCCTCACACTTTTGTTTGTTCCCCCACTTTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCT
TCTGTGAATTCTTTTATGATTTGTGATGTCAAATAAAAAATTTTCTATTTAGAAATAAAA
TAAAACAACAAGCAAAAACACTTTGTTGTTGATTTTTTCTCTCTCCTTTCAACCAGCTCA
TAGTTGACTAAAATGGTCACTCACCCAGTAACTAAATACACTAACCAACATGAATCCAGT
CACCTACAGTATGAATGAAATGAACTTGNAGGACNGCATTNNNTTTCTTTNCTCTCTCTC
TCTATCCCGGGCCCTCTTTCGAACAATTAAAATTACTGGGNATTGGATTGNNGAAAACCC
TTCCTTATATATCTTTAT

consensusID : consensus_10823#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 431
fasta sequence

                              [CATAGAAACAGTAGTTGTAGTATCTTTACCACTATTACTACTACTAACAATATTAATAGTAATAAAGATACTACAACTACTGTTTCTATGAATAATGACACTGTTGTTGATCCCAATATTTACTGCAATAACACAGACTCTCCTCAGCCGAAAGTAAATTGTGTCGATTCTTCATGAAGTATGTGTGTGTGTTACACTGCTATAATGCCATTTTCCCACTTTGTGTTTCGATCACTTCAGTTCCATCCTCACACTTTTGTTTGTTCCCCCACTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCTTCTGTGAATTCTTTTATGATTTGTGATGTCAAATAAAAAATTTTCTATTTAGAAATAAAATAAAACAACAAGCAAAAACACTTTGTTGTTGATTTTTTCTCTCTCCTTTCAACCAGCTCATAGTTGACTAAAAT]

[-] EMBL CD200991             [CATAGAAACAGTAGTTGTAGTATCTTTACCACTATTACTACTACTAACAATATTAATAGTAATAAAGATACTACAACTACTGTTTCTATGAATAATGACACTGTTGTTGATCCCAATATTTACTGCAATAACACAGACTCTCCTCAGCCGAAAGTAAATTGTGTCGATTCTTCATGAAGTATGTGTGTGTGTTACACTGCTATAATGCCATTTTCCCACTTTGTGTTTCGATCACTTCAGTTCCATCCTCACACTTTTGTTTGTTCCCCCACTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCTTCTGTGAATTCTTTTATGATTTGTGATGTCAAATAAAAAATTTTCTATTTAGAAATAAAATAAAACAACAAGCAAAAACACTTTGTTGTTGATTTTTTCTCTCTCCTTTCAACCAGCTCATAGTTGACTAAAAT]




>consensus_10823#1
CATAGAAACAGTAGTTGTAGTATCTTTACCACTATTACTACTACTAACAATATTAATAGT
AATAAAGATACTACAACTACTGTTTCTATGAATAATGACACTGTTGTTGATCCCAATATT
TACTGCAATAACACAGACTCTCCTCAGCCGAAAGTAAATTGTGTCGATTCTTCATGAAGT
ATGTGTGTGTGTTACACTGCTATAATGCCATTTTCCCACTTTGTGTTTCGATCACTTCAG
TTCCATCCTCACACTTTTGTTTGTTCCCCCACTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCTTCT
GTGAATTCTTTTATGATTTGTGATGTCAAATAAAAAATTTTCTATTTAGAAATAAAATAA
AACAACAAGCAAAAACACTTTGTTGTTGATTTTTTCTCTCTCCTTTCAACCAGCTCATAG
TTGACTAAAAT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10823#0      CCTTTTGCCAGGTTGAACGTCAATTAAGCAAACAAAAAGGTGTTTTGGCTTTAATTGGAC 60
consensus_10823#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10823#0      GATTATTATTATTTGGACATGAACATGTTGGAGAAAATGATACGTGGCAAGTTGTAGAAG 120
consensus_10823#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10823#0      AAAAATCTTATTCATTAGAGTCTAGTTTTTGTGCTTGGTGGACACCTACATGGTTAGAAG 180
consensus_10823#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10823#0      ATATGCGAGAAAATGCTATGGTATTATTAGTCAATGTTGCTGGTTATTTAGAATTAATTC 240
consensus_10823#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10823#0      AATTTGATGAGTCAATAGTACGTCCTATTCTAGAAGGTCTTTTACATTGGATAACATGTT 300
consensus_10823#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10823#0      CAACATCAGCTTCAGTTGATCCTTTCCCAGGACATCGAACTCTTAGTCCTCGCCGTTTAG 360
consensus_10823#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10823#0      CACTTGAAGCTTTAAATCGTCTTTGTGTACATGAGACAAATGTTGATCTTCTATTGTCAA 420
consensus_10823#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10823#0      CACCTTCTGATGAAAAAGTTCTTAGTAGATTATTTGATAGACTTGCTACTTGGCTTGCTG 480
consensus_10823#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10823#0      TACCAGAAGATCAAGTGACACGTGAATTAGCTTTATCTACTATGCATTATCTTGCTGGTG 540
consensus_10823#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10823#0      GAGGTGCTACATTTTCTAGCTCTTCTCTATCTTCAAATATTGGAAAAGTTACTACTAACG 600
consensus_10823#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10823#0      AAACAAATGCATCCTCAGGGACATATATTGGTACAACTATGCTTGCTGATGCCAAACCTT 660
consensus_10823#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10823#0      GTCCTATCTCTGGATTATTGTCATTTATTGAAGCGGCTGAAGCAACAACTAGGCGAGTTA 720
consensus_10823#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10823#0      TTGATCAATATGGTGTACAAGCTCTACAAGAAAGACCAGAATTAATGGGAACAAGTTTAG 780
consensus_10823#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10823#0      AAATGGTTCGTCGTGCAGGTGCACTACTTGATAGACTAGCTATCGATTCTAAAGGTCGAT 840
consensus_10823#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10823#0      TAGCTTTTACACCGGACTTAGAGCTACGTTTGATGGATCTAGTAACTTCACGTGTATTAG 900
consensus_10823#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10823#0      ATGCTACTGTTGCGCATCTTTTATGCGGTGCGCTACATCGTTTACTTCCAGATTTTAATC 960
consensus_10823#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10823#0      AACTAGATAATGATAATGTAAAAATTTCAACAATCCCACCGATCCCAACTCCTTCCGCTA 1020
consensus_10823#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10823#0      TAGCAGAACTTTTAACACAGTCCTCAGCAGTAACTGTTGTATTGCCAGAGACAGTGATAG 1080
consensus_10823#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10823#0      GTGTTAATCAAATCTCACAAGAGTCATCTACGATTATTCCAAGTCATAAATATGTAGATA 1140
consensus_10823#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10823#0      AAGTAGAAGTGTTCAAAAAACAATCACAACAACAGTCAACAAACATAATGCCAACAACAC 1200
consensus_10823#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10823#0      CAACATGTTCTGACATCGATCATAATCAACAACAAACAGTACTGAACAATTCAACTGATA 1260
consensus_10823#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10823#0      ATAATAATTTAATAATTAAAGAAGCTGATTCATCGCTCCCTTCTAATGAGCATTTTAATA 1320
consensus_10823#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10823#0      AACCAATTGATAACAATATTGACGATCATGATAATTCTGTAGATAACAAAACAATCCCAT 1380
consensus_10823#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10823#0      TGAATAATAATTGTGTGAATAATACATCATTAATTGATAAACATCCTGCTACTACACTTT 1440
consensus_10823#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10823#0      CAGATGACTCTTTAATTATTGAAAGTAGAAAACAGATGAATGGATCTGTTGTCGACAATG 1500
consensus_10823#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10823#0      GTGGTGATAATGATAATGTAAATTGTTGTAAAACTGAAACTTTTGATTTCCGAACTAATT 1560
consensus_10823#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10823#0      TAACAGTGAATAATTGCGGTACCGCTAACTTTACTACTATTACTACTACTAACAATATTA 1620
consensus_10823#1      ---CATAGA--AACAGTAGTTGTAGTATCTTTACCACTATTACTACTACTAACAATATTA 55
                          **  **  **  *  **     ** ****** *************************

consensus_10823#0      ATAGTAATAAAGATACTACAACTACTGTTTCTATGAATAATGACACTGTTGTTGATCCCA 1680
consensus_10823#1      ATAGTAATAAAGATACTACAACTACTGTTTCTATGAATAATGACACTGTTGTTGATCCCA 115
                       ************************************************************

consensus_10823#0      ATATTTACTGCAATAACACAGACTCTCCTCAGCCGAAAGTAAATTGTGTCGATTCTTCAT 1740
consensus_10823#1      ATATTTACTGCAATAACACAGACTCTCCTCAGCCGAAAGTAAATTGTGTCGATTCTTCAT 175
                       ************************************************************

consensus_10823#0      GAAGTATGTGTGTGTGTTACACTGCTATAATGCCATTTTCCCACTTTGTGTTTCGATCAC 1800
consensus_10823#1      GAAGTATGTGTGTGTGTTACACTGCTATAATGCCATTTTCCCACTTTGTGTTTCGATCAC 235
                       ************************************************************

consensus_10823#0      TTCAGTTCCATCCTCACACTTTTGTTTGTTCCCCCACTTTCTCTCTCTCTCTCT--TTTT 1858
consensus_10823#1      TTCAGTTCCATCCTCACACTTTTGTTTGTTCCCCCACTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTT 295
                       ******************************************************  ****

consensus_10823#0      CTTCTGTGAATTCTTTTATGATTTGTGATGTCAAATAAAAAATTTTCTATTTAGAAATAA 1918
consensus_10823#1      CTTCTGTGAATTCTTTTATGATTTGTGATGTCAAATAAAAAATTTTCTATTTAGAAATAA 355
                       ************************************************************

consensus_10823#0      AATAAAACAACAAGCAAAAACACTTTGTTGTTGATTTTTTCTCTCTCCTTTCAACCAGCT 1978
consensus_10823#1      AATAAAACAACAAGCAAAAACACTTTGTTGTTGATTTTTTCTCTCTCCTTTCAACCAGCT 415
                       ************************************************************

consensus_10823#0      CATAGTTGACTAAAATGGTCACTCACCCAGTAACTAAATACACTAACCAACATGAATCCA 2038
consensus_10823#1      CATAGTTGACTAAAAT-------------------------------------------- 431
                       ****************                                            

consensus_10823#0      GTCACCTACAGTATGAATGAAATGAACTTGNAGGACNGCATTNNNTTTCTTTNCTCTCTC 2098
consensus_10823#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10823#0      TCTCTATCCCGGGCCCTCTTTCGAACAATTAAAATTACTGGGNATTGGATTGNNGAAAAC 2158
consensus_10823#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10823#0      CCTTCCTTATATATCTTTAT 2178
consensus_10823#1      --------------------