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Schistosoma mansoni
cluster # 10864 cluster # 10864       Sequences # 23       consensus # 5


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10864#0 length = 1133 sequences # 11  
consensus_10864#1 length = 1038 sequences # 5  
consensus_10864#2 length = 976 sequences # 2  
consensus_10864#3 length = 747 sequences # 4  
consensus_10864#4 length = 405 sequences # 1  

consensusID : consensus_10864#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 1133
fasta sequence
                              [GGGGGGGGCGCGTGGTTGGTCTTGTCGTCAATGGGTATTGAAGCTTTAGTTAGTTCCGCAG-ACGAAAACACCG-ATGAGGCTACTCAGGCTCAACAGGAAGCGATCGAAAAA-ATATGAA-G-TCTACGTGCCTAATTTCTGCAATACTTCCACTTTCGACACTCGATGAAGACTTCACTGGCCATTTAGTTTACTTGGAAAAACTGAAGCTTATGAAACAAAATTACCGAGGGATTCGTCGACTTCGACGTGATGGAAACTGCTTTTATCGAGCATTTGGTTTTGCGTATATCGAGTACCTGCTAAATGGCAAGCTAATTAAAGAAGCTGGGAGATTCAAGAAGAAGTGTGACGAGTGTAAAGATACACTAATTGCTAATGGTTATACACAGTTTACTGTGGAGGATTTCCATGAACAGTTCGTCGGGATGGTGGATCGGTTTACTGTTGATGGTGGTACATTGGAAGAATTAGAAGGAGTTTTTAACGATCAGGCATATTCAGATTATTATGTTGTATTTTTACGACTTTTAGTTTCTGCGTACATTCAAAAAAACGCTGGATATTTTGTAAATTTTATTGATGAAGGTAAAACAATTAATCAGTTTTGTGAAACAGAAGTTGAACCAATGGCCCGTGAATCAGATAATATACATGTAGCTGCTTTAGCATTAGCTGTTGAATTACCTATTTATGTAGAAAATTGTCAACAATCGGGTGAATTAAATCGTATCGAATTTCCTGCATATAGTGATTTATTATTAGATAATGTCGGTGAAACAAGCAATAATGATCATGATATTCACAATAAACAAGTATCTAATGATAAAAATTCTTTTATTAATAATTATAAACAGAATAATAGTTCACCACCAGTTACATTATTGTATAGACCAGGTCATTATGATATATTATATCCTAATTCATCAAACTATTAAACAAACTAATCAGATTGAAATTGTAAATGGAATAATACTTTATGTATCATTAATAATCATATTACAGTAGGTTNTTATGTTTTGGATGTTACTTTATAATTAGATTTAACTTCATGATGATTTTTTTTGTGTGCTGNGTTGNCTGATGGNGCTATGATTTCTGGGATATTTCTTTTTTGAATAGAGCCTTACTAGATN]

[-] EMBL CD187397             [GGGGGGGGCGCGTGGTTGGTCTTGTCGTCAATGGGTATTGAAGCTTTAGTTAGTTCCGCAG ACGAAAACACCG ATGAGGCTACTCAGGCTCAACAGGAAGCGATCGAAAAAGATATGAA G TCTACGTGCCTAATTTCTGCAATACTTCCACTTTCGACACTCGATGAAGACTTCACTGGCCATTTAGTTTACTTGGAAAAACTGAAGCTTATGAAACAAAATTACCGAGGGATTCGTCGACTTCGACGTGATGGAAACTGCTTTTATCGAGCATTTGGTTTTGCGTATATCGAGTACCTGCTAAATGGCAAGCTAATTAAAGAAGCTGGGAGATTCAAGAAGAAGTGTGACGAGTGTAAAGATACACTAATTGCTAATGGTTATACACAGTTTACTGTGGAGGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD083454             [                                                    GTTCCGCAGCACGAAAACACCGCATGAGGCTACTCAGGCTCAACAGGAAGCGATCGAAAAAGATATGAACGCTCTACGTGCCTAATTTCTGCAATACTTCCACTTTCGACACTCGATGAAGACTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD081584             [                                                                              gccaTATTC GGCACAACGGGAAGCGATCGAAAAA ATATGAA G TCTACGTGCCTAATTTCTGCAATACTTCCACTTTCGACACTCGATGAAGACTTCACTGGCCATTTAGTTTACTTGGAAAAACTGAAGCTTATGAAACAAAATTACCGAGGGATTCGTCGACTTCGACGTGATGGAAACTGCTTTTATCGAGCATTTGGTTTTGCGTATATCGAGTACCTGCTAAATGGCAAGCTAATTAAAGAAGCTGGGAGATTCAAGAAGAAGTGTGACGAGTGTAAAGATACACTAATTGCTAATGGTTATACACAGTTTACTGTGGAGGATTTCCATGAACAGTTCGTCGGGATGGTGGATCGGTTTACTGTTGATGGTGGTACATTGGAAGAATTAGAAGGAGTTTTTAACGATCAGGCATATTCAGATTATTATGTTGTATTTTTACGACTTTTAGTTTCTGCGTACATTCAAAAAAACGCTGGATATTTTGTAAATTTTATTGATGAAGGTAAAACAATTAATCAGTTTTGTGAAACAGAAGTTGAACCAATGGCCCGTGAATCAGATAATATACATGTAGCTGCTTTAGCATTAGCTGTTGAATTACCTATTTATGTAGAAAATTGTCAACAATCGGGTGAATTAAATCGTATCGAATTTCCTGCATATAGTGATTTATTATTAGATAATGTCGGTGAAACAAGCAATAATGATCATGATATTCACAATAAACAAGTATCTAATGATAAAAATTCTTTTATTAATAATTATAAACAGAAATATAGTTCACCACCAGTTACATTATTGTATAGACCAGGTCATTATGATATATTATATCCTAATTCATCAAACTATTAAACAAACTAATCAGATTGAAATTGTAAATGGAATAATACTTTATGTATCATTAATAATCATATTACAGTAGGTTNTTATGTTTTGGATGTTACTTTATAATTAGATTTAACTTCATGATGATTTTTTTTGTGTGCTGNGTTGNCTGATGGNGCTATGATTTCTGGGATATTTCTTTTTTGAATAGAGCCTTACTAGATN]
[+] EMBL CD141189             [                                                                                                           aAAAAG ATATGAA G TCTACGTGCCTAATTTCTGCAATACTTCCACTTTCGACACTCGATGAAGACTTCACTGGCCATTTAGTTTACTTGGAAAAACTGAAGCTTATGAAACAAAATTACCGAGGGATTCGTCGACTTCGACGTGATGGAAACTGCTTTTATCGAGCATTTGGTTTTGCGTATATCGAGTACCTGCTANATGGCAAGCTAATTANAGAAGCTGGGAGATTCAAGAAGAAGTGTGACGAGTGTAAAGATACACTAATTGCTAATGGTTATACACAGTTTACTGTGGAGGATTCCNAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD147372             [                                                                                                                                                                                                                                                  GACTTCGACGTGATGGAAACTGCTTTTATCGAGCATTTGGTTTTGCGTATATCGAGTACCTGCTAAATGGCAAGCTAATTAAAGAAGCTGGGAGATTCAAGAAGAAGTGTGACGAGTGTAAAGATACACTAATTGCTAATGGTTATACACAGTTTACTGTGGAGGATTTCCATGAACAGTTCGTCGGGATGGTGGATCGGTTTACTGTTGATGGTGGTACATTGGAAGAATTAGAAGGAGTTTTTAACGATCAGGCATATTCAGATTATTATGTTGTATTTTTACGACTTTTAGTTTCTGCGTACATTCAAAAAAACGCTGGATATTTTGTAAATTTTATTGATGAAGGTAAAACAATTAATCAGTTTTGTGAAACAGAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD147757             [                                                                                                                                                                                                                                                  GACTTCGACGTGATGGAAACTGCTTTTATCGAGCATTTGGTTTTGCGTATATCGAGTACCTGCTAAATGGCAAGCTAATTAAAGAAGCTGGGAGATTCAAGAAGAAGTGTGACGAGTGTAAAGATACACTAATTGCTAATGGTTATACACAGTTTACTGTGGAGGATTTCCATGAACAGTTCGTCGGGATGGTGGATCGGTTTACTGTTGATGGTGGTACATTGGAAGAATTAGAAGGAGTTTTTAACGATCAGGCATATTCAGATTATTATGTTGTATTTTTACGACTTTTAGTTTCTGCGTACATTCAAAAAAACGCTGGATATTTTGTAAATTTTATTGATGAAGGTAAAACAATTAATCAGTTTTGTGAAACAGAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD147377             [                                                                                                                                                                                                                                                  GACTTCGACGTGATGGAAACTGCTTTTATCGAGCATTTGGTTTTGCGTATATCGAGTACCTGCTAAATGGCAAGCTAATTAAAGAAGCTGGGAGATTCAAGAAGAAGTGTGACGAGTGTAAAGATACACTAATTGCTAATGGTTATACACAGTTTACTGTGGAGGATTTCCATGAACAGTTCGTCGGGATGGTGGATCGGTTTACTGTTGATGGTGGTACATTGGAAGAATTAGAAGGAGTTTTTAACGATCAGGCATATTCAGATTATTATGTTGTATTTTTACGACTTTTAGTTTCTGCGTACATTCAAAAAAACGCTGGATATTTTGTAAATTTTATTGATGAAGGTAAAACAATTAATCAGTTTTGTGAAACAGAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD147365             [                                                                                                                                                                                                                                                  GACTTCGACGTGATGGAAACTGCTTTTATCGAGCATTTGGTTTTGCGTATATCGAGTACCTGCTAAATGGCAAGCTAATTAAAGAAGCTGGGAGATTCAAGAAGAAGTGTGACGAGTGTAAAGATACACTAATTGCTAATGGTTATACACAGTTTACTGTGGAGGATTTCCATGAACAGTTCGTCGGGATGGTGGATCGGTTTACTGTTGATGGTGGTACATTGGAAGAATTAGAAGGAGTTTTTAACGATCAGGCATATTCAGATTATTATGTTGTATTTTTACGACTTTTAGTTTCTGCGTACATTCAAAAAAACGCTGGATATTTTGTAAATTTTATTGATGAAGGTAAAACAATTAATCAGTTTTGTGAAACAGAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD078676             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGGAGATTCAAGAAGAAGTGTGACGAGTGTAAAGATACACTAATTGCTAATGGTTATACACAGTTTACTGTGGAGGATTTCCATGAACAGTTCGTCGGGATGGTGGATCGGTTTACTGTTGATGGTGGTACATTGGAAGAATTAGAAGGAGTTTTTAACGATCAGGCATATTCAGATTATTATGTTGTATTTTTACGACTTTTAGTTTCTGCGTACATTCAAAAAAACGCTGGATATTTTGTAAATTTTATTGATGAAGGTAAAACAATTAATCAGTTTTGTGAAACAGAAGTTGAACCAATGGCCCGTGAATCAGATAATATACATGTAGCTGCTTTAGCATTAGCTGTTGAATTACCTATTTATGTAGAAAATTGTCAACAATCGGGTGAATTAAATCGTATCGAATTTCCTGCATATAGTGATTTATTATTAGATAATGTCGGTGAAACAAGCAATAATGATCATGATATTCACAATAAACAAGTATCTAATGATAAAAATTCTTTTATTAATAATTATAAACAGAATAATAGTTCACCACCAGTTACATTATTGTATAGACCAGGTCATTATGATATATTATATCCTAATTCATCAAACTATTAAA                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD112324             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACTGTTGATGGTGGTACATTGGAAGAATTAGAAGGAGTTTTTAACGATCAGGCATATTCAGATTATTATGTTGTATTTTTACGACTTTTAGTTTCTGCGTACATTCAAAAAAACGCTGGATATTTTGTAAATTTTATTGATGAAGGTAAAACAATTAATCAGTTTTGTGAAACAGAAGTTGAACCAATGGCCCGTGAATCAGATAATATACATGTAGCTGCCTTAGCATTAGCTGTTGAATTACCTATTTATGTAGAAAATTGTCAACAATCGGGTGAATTAAATCGTATCGAATTTCCTGCACATAGTGATTTATTATTAGATAATGTCGGTGAAACAAGCAATAATGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD200391             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AACCAATGGCCCGTGAATCAGATAATATACATGTAGCTGCTTTAGCATTAGCTGTTGAATTACCTATTTATGTAGAAAATTGTCAACAATCGGGTGAATTAAATCGTATCGAATTTCCTGCATATAGTGATTTATTATTAGATAATGTCGGTGAAACAAGCAATAATGATCATGATATTCACAATAAACAAGTATCTAATGATAAAAATTCTTTTATTAATAATTATAAACAGAATAATAGTTCACCACCAGNTACATTATT                                                                                                                                                                                                                                                          ]


>consensus_10864#0 GGGGGGGGCGCGTGGTTGGTCTTGTCGTCAATGGGTATTGAAGCTTTAGTTAGTTCCGCA GACGAAAACACCGATGAGGCTACTCAGGCTCAACAGGAAGCGATCGAAAAAATATGAAGT CTACGTGCCTAATTTCTGCAATACTTCCACTTTCGACACTCGATGAAGACTTCACTGGCC ATTTAGTTTACTTGGAAAAACTGAAGCTTATGAAACAAAATTACCGAGGGATTCGTCGAC TTCGACGTGATGGAAACTGCTTTTATCGAGCATTTGGTTTTGCGTATATCGAGTACCTGC TAAATGGCAAGCTAATTAAAGAAGCTGGGAGATTCAAGAAGAAGTGTGACGAGTGTAAAG ATACACTAATTGCTAATGGTTATACACAGTTTACTGTGGAGGATTTCCATGAACAGTTCG TCGGGATGGTGGATCGGTTTACTGTTGATGGTGGTACATTGGAAGAATTAGAAGGAGTTT TTAACGATCAGGCATATTCAGATTATTATGTTGTATTTTTACGACTTTTAGTTTCTGCGT ACATTCAAAAAAACGCTGGATATTTTGTAAATTTTATTGATGAAGGTAAAACAATTAATC AGTTTTGTGAAACAGAAGTTGAACCAATGGCCCGTGAATCAGATAATATACATGTAGCTG CTTTAGCATTAGCTGTTGAATTACCTATTTATGTAGAAAATTGTCAACAATCGGGTGAAT TAAATCGTATCGAATTTCCTGCATATAGTGATTTATTATTAGATAATGTCGGTGAAACAA GCAATAATGATCATGATATTCACAATAAACAAGTATCTAATGATAAAAATTCTTTTATTA ATAATTATAAACAGAATAATAGTTCACCACCAGTTACATTATTGTATAGACCAGGTCATT ATGATATATTATATCCTAATTCATCAAACTATTAAACAAACTAATCAGATTGAAATTGTA AATGGAATAATACTTTATGTATCATTAATAATCATATTACAGTAGGTTNTTATGTTTTGG ATGTTACTTTATAATTAGATTTAACTTCATGATGATTTTTTTTGTGTGCTGNGTTGNCTG ATGGNGCTATGATTTCTGGGATATTTCTTTTTTGAATAGAGCCTTACTAGATN



consensusID : consensus_10864#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1038
fasta sequence
                              [AGATATGAAGTCTACGTGCCTAATTTCTGCAATACTTCCACTTTCGACACTCGATGAAGACTTCACTGGCCATTTAGTTTACTTGGAAAAACTGAAGCTTATGAAACAAAATTACCGAGGGATTCGTCGACTTCGACGTGATGGAAACTGCTTTTATCGAGCATTTGGTTTTGCGTATATCGAGTACCTGCTAAATG-GCAAGCTAATTAAAGAAGCTGGGAGATTCAAGAAGAAGTGTGACGAGTGTAAAGATACACTAATTGCTAATGGTTATACACAGTTTACTGTGGAGGATTTCCATGAACAGTTCGTCGGGATGGTGGATCGGTTTACTGTTGATGGTGGTACATTGGAAGAATTAGAAGGAGTTTTTAACGATCAGACTTTTAGTTTCTGCGTACATTCAAAAAAACGCTGGATATTTTGTAAATTTTATTGATGAAGGTAAAACAATTAATCAGTTTTGTGAAACAGAAGTTGAACCAATGGCCCGTGAATCAGATAATATACATGTAGCTGCTTTAGCATTAGCTGTTGAATTACCTATTTATGTAGAAAATTGTCAACAATCGGGTGAATTAAATCGTATCGAATTTCCTGCATATAGTGATTTATTATTAGATAATGTCGGTGAAACAAG-CAATAATGATCATGATATTCACAATAAACAAGTATCTAATGATAAAAATTCTTTTATTAATAATTATAAACAGAATAATAGTTCCCCCCCAGTTACATTATTGTATAGACCAGGTCATTATGATATATTATATCCTAATTCATCAAACTATTAAACAAACTAATCAGATTGAAATTGTTAAATGGAATAATACTTTATGTATCATTAATAATCAATATTACAGTAGGTTTTTATGTTTTGGATGTTACTTTATAATTTAGATTAACTTTCAATGATGATTTTTTTTGTTGTTGCTGTGTTTGTCTGTATGTGTGCTTATGTATTTCTGGGGATTATTTTCTTTTTTTTGTAATATGATGCCTTTCACTAAAGAATAATTCAATCGATAGTAAAATATT]

[+] EMBL CD079926             [AGATATGAAGTCTACGTGCCTAATTTCTGCAATACTTCCACTTTCGACACTCGATGAAGACTTCACTGGCCATTTAGTTTACTTGGAAAAACTGAAGCTTATGAAACAAAATTACCGAGGGATTCGTCGACTTCGACGTGATGGAAACTGCTTTTATCGAGCATTTGGTTTTGCGTATATCGAGTACCTGCTAAATG GCAAGCTAATTAAAGAAGCTGGGAGATTCAAGAAGAAGTGTGACGAGTGTAAAGATACACTAATTGCTAATGGTTATACACAGTTTACTGTGGAGGATTTCCATGAACAGTTCGTCGGGATGGTGGATCGGTTTACTGTTGATGGTGGTACATTGGAAGAATTAGAAGGAGTTTTTAACGATCAGACTTTTAGTTTCTGCGTACATTCAAAAAAACGCTGGATATTTTGTAAATTTTATTGATGAAGGTAAAACAATTAATCAGTTTTGTGAAACAGAAGTTGAACCAATGGCCCGTGAATCAGATAATATACATGTAGCTGCTTTAGCATTAGCTGTTGAATTACCTATTTATGTAGAAAATTGTCAACAATCGGGTGAATTAAATCGTATCGAATTTCCTGCATATAGTGATTTATTATTAGATAATGTCGGTGAAACAAGNNCAT ATGATCATGATATTCACAATANACAAGTATCTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD141265             [                                                                                                                                                                                   TCGAGTACCTGCTAAATGTTCAGACTAATTAGAGAAGCTGGGAGATTCAAGAAGAAGTGTGACGAGTGTAAAGATACACTAATTGCTAATGGTTATACACAGTTTACTGTGGAGGATTTCCATGAACAGTTCGTCGGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD074122             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATTGGAAGAATTAGAAGNAGTTTTTAACGATCAGACTTTTAGTTTCTGCGTACATTCAAAAAAACGCTGGATATTTTGTAAATTTTATTGATGAAGGTAAAACAATTAATCAGTTTTGTGAAACAGAAGTTGAACCAATGGCCCGTGAATCAGATAATATACATGTAGCTGCTTTAGCATTAGCTGTTGAATTACCTATTTATGTAGAAAATTGTCAACAATCGGGTGAATTAAATCGTATCGAATTTCCTGCATATAGTGATTTATTATTAGATAATGTCGGTGAAACAAG CAATAATGATCATGATATTCACAATAAACAAGTATCTAATGATAAAAATTCTTTTATTAATAATTATAAACAGAATAATAGTTCACCACCAGTTACATTATTGTATAGACCAGGTCATTATGATATATTATATCCTAATTCATCAAACTATTAAACAAACTAATCAGATTGAAATTGTTAAATGGAATAATACTTTATGTATCATTAATAATCAATATTACAGTAGGTTTTTATGTTTTGGATGTTACTTTATAATTTAGATTAACTTTCAATGATGATTTTTTTTGTTGTTGCTGTGTTTGTCTGTATGTGTGCTTATGTATTTCTGGGGATTATTTTCTTTTTTTTGTAATATGATGCCTTTCACTAAAGAATAATTCA                 ]
[-] EMBL CD075408             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGTTTTGTGAAACAGAAGTTGAACCAATGGCCCGTGAATCAGATAATATACATGTAGCTGCTTTAGCATTAGCTGTTGAATTACCTATTTATGTAGAAAATTGTCAACAATCGGGTGAATTAAATCGTATCGAATTTCCTGCATATAGTGATTTATTATTAGATAATGTCGGTGAAACAAG CAATAATGATCATGATATTCCCAATAAACAAGTATCTAATGATAAAAATTCTTTTATTAATAATTATAAACAGAATAATAGTTCCCCCCCAGTTACATTATTGTATAGACCAGGTCATTATGATATATTATATCCTAATTCATCAAACTATTAAACAAACTAATCAGATTGAAATTGTTAAATGGAATAATACTTTATGTATCATTAATAATCAATATTACAGTAGGTTTTTATGTTTTGGATGTTACTTTATAATTTAGATTAACTTTCAATGATGATTTTTTTTGTTGTTGCTGTGTTTGTCTGTATGTGTGCTTATGTATTTCTGGGGATTATTTTCTTTTTTTTGTAATATGATGCCTTTCACTAAAGAATAATTCA                 ]
[-] EMBL CD073139             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GTGAATTAAATCGTATCGAATTTCCTGCATATAGTGATTTATTATTAGATAATGTCGGTGAAACAAG CAATAATGATCATGATATTCCCAATAAACAAGTATTTAATGATAAAAATTTTTTTATTAATAATTATAAACAGAATAATAGTTCCCCCCCAGTTACATTATTGTATAGACCAGGTCATTATGATATATTATATCCTAATTCATCAAACTATTAAACAAACTAATCAGATTGAAATTGTTAAATGGAATAAAACTTTATGTATCATTAATAATCAATATTCCAGTAGGTTTTTATGTTTTGGATGTTACTTTATAATTTAGATTAACTTTCAATGATGATTTTTTTTGTTGTTGCTGTGTTTGTCTGTATGTGGGCTTATGTATTTTTGGGGATTATTTTCTTTTTTTTGTAATATGATGCCTTTCACTAAAGAATAATTCAATCGATAGTAAAATATT]


>consensus_10864#1 AGATATGAAGTCTACGTGCCTAATTTCTGCAATACTTCCACTTTCGACACTCGATGAAGA CTTCACTGGCCATTTAGTTTACTTGGAAAAACTGAAGCTTATGAAACAAAATTACCGAGG GATTCGTCGACTTCGACGTGATGGAAACTGCTTTTATCGAGCATTTGGTTTTGCGTATAT CGAGTACCTGCTAAATGGCAAGCTAATTAAAGAAGCTGGGAGATTCAAGAAGAAGTGTGA CGAGTGTAAAGATACACTAATTGCTAATGGTTATACACAGTTTACTGTGGAGGATTTCCA TGAACAGTTCGTCGGGATGGTGGATCGGTTTACTGTTGATGGTGGTACATTGGAAGAATT AGAAGGAGTTTTTAACGATCAGACTTTTAGTTTCTGCGTACATTCAAAAAAACGCTGGAT ATTTTGTAAATTTTATTGATGAAGGTAAAACAATTAATCAGTTTTGTGAAACAGAAGTTG AACCAATGGCCCGTGAATCAGATAATATACATGTAGCTGCTTTAGCATTAGCTGTTGAAT TACCTATTTATGTAGAAAATTGTCAACAATCGGGTGAATTAAATCGTATCGAATTTCCTG CATATAGTGATTTATTATTAGATAATGTCGGTGAAACAAGCAATAATGATCATGATATTC ACAATAAACAAGTATCTAATGATAAAAATTCTTTTATTAATAATTATAAACAGAATAATA GTTCCCCCCCAGTTACATTATTGTATAGACCAGGTCATTATGATATATTATATCCTAATT CATCAAACTATTAAACAAACTAATCAGATTGAAATTGTTAAATGGAATAATACTTTATGT ATCATTAATAATCAATATTACAGTAGGTTTTTATGTTTTGGATGTTACTTTATAATTTAG ATTAACTTTCAATGATGATTTTTTTTGTTGTTGCTGTGTTTGTCTGTATGTGTGCTTATG TATTTCTGGGGATTATTTTCTTTTTTTTGTAATATGATGCCTTTCACTAAAGAATAATTC AATCGATAGTAAAATATT



consensusID : consensus_10864#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 976
fasta sequence
                              [CCGAGGCCAGAATTCGGCACGAGGGACCCACTGCAGTTATTTACTGTTAATAGTCATTATGCTACTTGTATAGTAAAGCAAAGCATATTAATTCACTTAGTCTTCGATTTAGTTATCTTACTGGTATTACATGTGGAATAAATAAACTTTCTGTTACTGGTTTAGGACTACTGATAAGAAATATGCAACCTCCGCCCCCCACACTATCACCCGTTAATGAGTCACATTCATGACATTCGAATTTCGCGGTAAACATGATAACATCAAGTCAAAATCTAATAATTTATATCATTAACTTTATTCATTCTATTTTCGTTTTAATTATTACTAATTTAATTTGATTTTAAATTGTATCGCTTTTAGACTTTTAGTTTCTGCGTACATTCAAAAAAACGCTGGATATTTTGTAAATTTTATTGATGAAGGTAAAACAATTAATCAGTTTTGTGAAACAGAAGTTGAACCAATGGCCCGTGAATCAGATAATATACATGTAGCTGCTTTAGCATTAGCTGTTGAATTACCTATTTATGTAGAAAATTGTCAACAATCGGGTGAATTAAATCGTATCGAATTTCCTGCATATAGTGATTTATTATTAGATAATGTCGGTGAAACAAGCAATAATGATCATGATATTCACAATAAACAAGTATCTAATGATAAAAATTCTTTTATTAATAAATTATAACAGAAATATAGTTCACCACCAGTTACATTATTGTATAGACCAGGTCATTATGATATATTATATCCTAATTCATCANACTATTAAAAAACTATCAGATTGAANTTGNTAANTGGANNTATACTTATGTATCATTATAATCATATTACAGTAGGTTNNNTATGTTTGGGATGTACTTTATAATTNAGATAAACTTCATGATGATTNTTTTGNNTGTGCTGNGTTGNCTGATGNGGCCTAGNATTNCGGGGGATATTTTCTTTTTGNAAATGAGCCTTNACTAGAAAT]

[+] EMBL CD081905             [CCGAGGCCAGAATTCGGCACGAGGGACCCACTGCAGTTATTTACTGTTAATAGTCATTATGCTACTTGTATAGTAAAGCAAAGCATATTAATTCACTTAGTCTTCGATTTAGTTATCTTACTGGTATTACATGTGGAATAAATAAACTTTCTGTTACTGGTTTAGGACTACTGATAAGAAATATGCAACCTCCGCCCCCCACACTATCACCCGTTAATGAGTCACATTCATGACATTCGAATTTCGCGGTAAACATGATAACATCAAGTCAAAATCTAATAATTTATATCATTAACTTTATTCATTCTATTTTCGTTTTAATTATTACTAATTTAATTTGATTTTAAATTGTATCGCTTTTAGACTTTTAGTTTCTGCGTACATTCAAAAAAACGCTGGATATTTTGTAAATTTTATTGATGAAGGTAAAACAATTAATCAGTTTTGTGAAACAGAAGTTGAACCAATGGCCCGTGAATCAGATAATATACATGTAGCTGCTTTAGCATTAGCTGTTGAATTACCTATTTATGTAGAAAATTGTCAACAATCGGGTGAATTAAATCGTATCGAATTTCCTGCATATAGTGATTTATTATTAGATAATGTCGGTGAAACAAGCAATAATGATCATGATATTCACAATAAACAAGTATCTAATGATAAAAATTCTTTTATTAATAAATTATAACAGAAATATAGTTCACCACCAGTTACATTATTGTATAGACCAGGTCATTATGATATATTATATCCTAATTCATCANACTATTAAAAAACTATCAGATTGAANTTGNTAANTGGANNTATACTTATGTATCATTATAATCATATTACAGTAGGTTNNNTATGTTTGGGATGTACTTTATAATTNAGATAAACTTCATGATGATTNTTTTGNNTGTGCTGNGTTGNCTGATGNGGCCTAGNATTNCGGGGGATATTTTCTTTTTGNAAATGAGCCTTNACTAGAAAT]
[-] EMBL CD133241             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AACGCTGGATATTTTGTAAATTTTATTGATGAAGGTAAAACAATTAATCAGTTTTGTGAAACAGAAGTTGAACCAATGGCCCGTGAATCAGATAATATACATGTAGCTGCTTTAGCATTAGCTGTTGAATTACCTATTTATGTAGAAAATTGTCAACAATCGGGTGAATTAAATCGTATCGAATTTCCTGCATATAGTGATTTATTATTAGATAATGTCGGTGAAACAAGCGATAATGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]


>consensus_10864#2 CCGAGGCCAGAATTCGGCACGAGGGACCCACTGCAGTTATTTACTGTTAATAGTCATTAT GCTACTTGTATAGTAAAGCAAAGCATATTAATTCACTTAGTCTTCGATTTAGTTATCTTA CTGGTATTACATGTGGAATAAATAAACTTTCTGTTACTGGTTTAGGACTACTGATAAGAA ATATGCAACCTCCGCCCCCCACACTATCACCCGTTAATGAGTCACATTCATGACATTCGA ATTTCGCGGTAAACATGATAACATCAAGTCAAAATCTAATAATTTATATCATTAACTTTA TTCATTCTATTTTCGTTTTAATTATTACTAATTTAATTTGATTTTAAATTGTATCGCTTT TAGACTTTTAGTTTCTGCGTACATTCAAAAAAACGCTGGATATTTTGTAAATTTTATTGA TGAAGGTAAAACAATTAATCAGTTTTGTGAAACAGAAGTTGAACCAATGGCCCGTGAATC AGATAATATACATGTAGCTGCTTTAGCATTAGCTGTTGAATTACCTATTTATGTAGAAAA TTGTCAACAATCGGGTGAATTAAATCGTATCGAATTTCCTGCATATAGTGATTTATTATT AGATAATGTCGGTGAAACAAGCAATAATGATCATGATATTCACAATAAACAAGTATCTAA TGATAAAAATTCTTTTATTAATAAATTATAACAGAAATATAGTTCACCACCAGTTACATT ATTGTATAGACCAGGTCATTATGATATATTATATCCTAATTCATCANACTATTAAAAAAC TATCAGATTGAANTTGNTAANTGGANNTATACTTATGTATCATTATAATCATATTACAGT AGGTTNNNTATGTTTGGGATGTACTTTATAATTNAGATAAACTTCATGATGATTNTTTTG NNTGTGCTGNGTTGNCTGATGNGGCCTAGNATTNCGGGGGATATTTTCTTTTTGNAAATG AGCCTTNACTAGAAAT



consensusID : consensus_10864#3
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 747
fasta sequence
                              [AAACGCTGGATATTTTGTAAATTTTATTGATGAAGGTAAAGCAATTAAGCAGTTTTGTGAAACAGAAGTTGAACCAATGGCCCGTGAATCAGATAATATACATGTAGCTGCTTTATCATTAGCTGTTGAATTACCTATTTATGTAGAAAATTGTCAACAATCGGGTGAATTAAATCGTATCGAATTTCCTGCATATAGTGATTTATTATTAGATAATGTCGGTCCGTCGTGGCCGGTTAAAACCTTTAAAATCCCATACATTCCTGGATGATCATGTAAAGGTATACGAGAGCCAGGTTTCAAAATAAAAATACCCATAGAAAACACTTCATTCTCCATAATGTGCACATAAGCGACTGGAGCAGATGATATATTTGAGTCAGAAATCCATCGAATATCAAAGCCAACATCTTTTGGGGTAAGAGAGCGAACACATGCTAACAAACGAGATAAAGATTCCGATAACTGT-TTATGTTTTACCGGAAGATTTGGGGAAACGGGTTTGTCAGAATGTGTCGGAGAATTTCCATTTGTACAAGGATGAGAATCCCCCATCCCATTGTTAATATTAGCTGATGCTGGGCTCAATGCAGCTCGTGCTGAATGCTGTTGAAATGCATGAAAAGCCAAGTTGGCTACTGTTGCAATTTTTGTGGTCATGTGTTAGAAATAAATATCACAACATCCAAACTTTAAGGGGAAATTTACAAATCGACTTTACTCTTGAAGAGAAAGTCACCTTATTCA]

[+] EMBL CD192280             [AAACGCTGGATATTTTGTAAATTTTATTGATGAAGGTAAAGCAATTAAGCAGTTTTGTGAAACAGAAGTTGAACCAATGGCCCGTGAATCAGATAATATACATGTAGCTGCTTTATCATTAGCTGTTGAATTACCTATTTATGTAGAAAATTGTCAACAATCGGGTGAATTAAATCGTATCGAATTTCCTGCATATAGTGATTTATTATTAGATAATGTCGGTCCGTCGTGGCCGGTTAAAACCTTTAAAATCCCATACATTCCTGGATGATCATGTAAAGGTATACGAGAGCCAGGTTTCAAAATAAAAATACCCATAGAAAACACTTCATTCTCCATAATGTGCACATAAGCGACTGGAGCAGATGATATATTTGAGTCAGAAATCCATCGAATATCAAAGCCAACATCTTTTGGGGTAAGAGAGCGAACACATGCTAACAAACGAGATAAAGATTTCGATAACTGTGTTATGTTTACCCGG                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD192021             [                                                                                                                                                                                                                                          GGTTANAACCTTTAAAATCCCATACATTCCTGGATGATCATGTAAAGGTATACGAGAGCCAGGTTTCAAAATAAAAATACCCATAGAAAACACTTCATTCTCCATAATGTGCACATAAGCGACTGGAGCAGATGATATATTTGAGTCAGAAATCCATCGAATATCAAAGCCAACATCTTTTGGGGTAAGAGAGCGAACACATGCTAACAAACGAGATAAAGATTCCGATAACTGT TTATGTTTTACCGGAAGATTTGGGGAAACGGGTTTGTCAGAATGTGTCGGAGAATTTCCATTTGTACAAGGATGAGAATCCCCCATCCCATTGTTAATATTAGCTGATGCTGGGCTCAATGCAGCTCGTACTGAATGCTGTTGAAATGCATGAAAAGCCAAGTTGGCTACTGTTGCAATTTTTGTGGTCATGTGTTAGAAATAAATATCACAACATCCAAACTTTAAGGGGAAATTTACAAATCGACTTTACTCTTGAAGAGAAAGTCACCTTATTCA]
[-] EMBL AI975099             [                                                                                                                                                                                                                                                               ATACATTCCTGGATGATCATGTAAAGGTATACGAGAGCCAGGTTTCAAAATAAAAATACCCATAGAAAACACTTCATTCTCCATAATGTGCACATAAGCGACTGGAGCAGATGATATATTTGAGTCAGAAATCCATCGAATATCAAAGCCAACATCTTTTGGGGTAAGAGAGCGAACACATGCTAACAAACGAGATAAAGATTCCGATAACTGT TTATGTTTTACCGGAAGATTTGGGGAAACGGGTTTGTCAGAATGTGTCGGAGAATTTCCATTTGTACAAGGATGAGAATCCCCCATCCCATTGTTAATATTAGCTGATGCTGGGCTCAATGCAGCTCGTGCTGAATGCTGTTGAAATGCATGAAAAGCCAAGTTGGCTACTGTTGCAATTTTTGTGGTCATGTGTTAGAAATAAATATCACAACATCCAAACTTTAAGGGGAAATTTACAAATCGACTTTACTCTTGAAGAGAAAGTC          ]
[-] EMBL AI975667             [                                                                                                                                                                                                                                                                                      AAGGTATACGAGAGTCAGGTTTCTAAATATGAATACCCATAGAGAACACTTCATTCTCCATAATGTGCACATAAGCGACTGGAGCAGATGATATATTTGAGTCAGAAATCCATCGAATATCAAAGCCAACATCTTTTGGGGTAAGAGAGCGAACACATGCTAACAAACGAGATAAAGATTCCGATAGCTGT TTATGTTTTACCGGAAGATTTGGGGAAACGGGTTTGTCAGAATGTGTCGGAGAATTTCCATTTGTACAAGGATGAGAATCCCCCATCCCATTGTTAATATTAGCTGATGCTGGGCTCAATGCAGCTCGTGCTGAATGCTGTTGAAATGCATGAAAAGCCAAGTTGGCTACTGTTGCAATTTTTGTGGTCATGTGTTAGAAATAAATATCACAACATCCAAACTTTAAGGGGAAATTTACAAATCGACTTTACTCTTGAAGAGAAAGTC          ]


>consensus_10864#3 AAACGCTGGATATTTTGTAAATTTTATTGATGAAGGTAAAGCAATTAAGCAGTTTTGTGA AACAGAAGTTGAACCAATGGCCCGTGAATCAGATAATATACATGTAGCTGCTTTATCATT AGCTGTTGAATTACCTATTTATGTAGAAAATTGTCAACAATCGGGTGAATTAAATCGTAT CGAATTTCCTGCATATAGTGATTTATTATTAGATAATGTCGGTCCGTCGTGGCCGGTTAA AACCTTTAAAATCCCATACATTCCTGGATGATCATGTAAAGGTATACGAGAGCCAGGTTT CAAAATAAAAATACCCATAGAAAACACTTCATTCTCCATAATGTGCACATAAGCGACTGG AGCAGATGATATATTTGAGTCAGAAATCCATCGAATATCAAAGCCAACATCTTTTGGGGT AAGAGAGCGAACACATGCTAACAAACGAGATAAAGATTCCGATAACTGTTTATGTTTTAC CGGAAGATTTGGGGAAACGGGTTTGTCAGAATGTGTCGGAGAATTTCCATTTGTACAAGG ATGAGAATCCCCCATCCCATTGTTAATATTAGCTGATGCTGGGCTCAATGCAGCTCGTGC TGAATGCTGTTGAAATGCATGAAAAGCCAAGTTGGCTACTGTTGCAATTTTTGTGGTCAT GTGTTAGAAATAAATATCACAACATCCAAACTTTAAGGGGAAATTTACAAATCGACTTTA CTCTTGAAGAGAAAGTCACCTTATTCA



consensusID : consensus_10864#4
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 405
fasta sequence
                              [TAATTCACTTAGTCTTCGATTTAGTTATCTTACTGGTATTACATGTGGAATAAATAAACTTTCTGTTACTGGTTTAGGACTACTGATAAGAAATATGCAACCTCCGCCCCCCACACTATCACCCGTTAATGAGTCACATTCATGACATTCGAATTTCGCGGTAAACATGATAACATCAAGTCAAAATCTAATAATTTATATCATTAACTTTATTCATTCTATTTTCGTTTTAATTATTACTAATTTAATTTGATTTTAAATTGTATCGCTTTTAGACTTTTAGTTTCTGCGTACATTCAAAAAAACGCTGGATATTTTGTAAATTTTATTGATGAAGGTAAAACAATTAATCAGTTTTGTGAAACAGTAAGTTAATTTATCATAGATATTATTATATCGTGTGTT]

[+] EMBL CD200508             [TAATTCACTTAGTCTTCGATTTAGTTATCTTACTGGTATTACATGTGGAATAAATAAACTTTCTGTTACTGGTTTAGGACTACTGATAAGAAATATGCAACCTCCGCCCCCCACACTATCACCCGTTAATGAGTCACATTCATGACATTCGAATTTCGCGGTAAACATGATAACATCAAGTCAAAATCTAATAATTTATATCATTAACTTTATTCATTCTATTTTCGTTTTAATTATTACTAATTTAATTTGATTTTAAATTGTATCGCTTTTAGACTTTTAGTTTCTGCGTACATTCAAAAAAACGCTGGATATTTTGTAAATTTTATTGATGAAGGTAAAACAATTAATCAGTTTTGTGAAACAGTAAGTTAATTTATCATAGATATTATTATATCGTGTGTT]


>consensus_10864#4 TAATTCACTTAGTCTTCGATTTAGTTATCTTACTGGTATTACATGTGGAATAAATAAACT TTCTGTTACTGGTTTAGGACTACTGATAAGAAATATGCAACCTCCGCCCCCCACACTATC ACCCGTTAATGAGTCACATTCATGACATTCGAATTTCGCGGTAAACATGATAACATCAAG TCAAAATCTAATAATTTATATCATTAACTTTATTCATTCTATTTTCGTTTTAATTATTAC TAATTTAATTTGATTTTAAATTGTATCGCTTTTAGACTTTTAGTTTCTGCGTACATTCAA AAAAACGCTGGATATTTTGTAAATTTTATTGATGAAGGTAAAACAATTAATCAGTTTTGT GAAACAGTAAGTTAATTTATCATAGATATTATTATATCGTGTGTT



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10864#0      GGGGGGGGCGCGTGGTTGGTCTTGTCGTCAATGGGTATTGAAGCTTTAGTTAGTTCCGCA 60
consensus_10864#1      ------------------------------------------------------------
consensus_10864#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10864#4      ------------------------------------------------------------
consensus_10864#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10864#0      GACGAAAACACCGATGAGGCTACTCAGGCTCAACAGGAAGCGATCGAAAAAATATGAAGT 120
consensus_10864#1      -------------------------------------------------AGATATGAAGT 11
consensus_10864#2      --------------------------CCGAGGCCAGAATTCGGCACGAGGGACCCACTGC 34
consensus_10864#4      ------------------------------------------------------------
consensus_10864#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10864#0      CTACGTGCCTAATTTCTGCAATACTTCCACTTTCGACACTCGATGAAGACTTCACTGGCC 180
consensus_10864#1      CTACGTGCCTAATTTCTGCAATACTTCCACTTTCGACACTCGATGAAGACTTCACTGGCC 71
consensus_10864#2      AGTTATTTACTGTTAATAGTCATTATGCTACTTGTATAGTAAAGCAAAGCATATTAATTC 94
consensus_10864#4      ------------------------------------------------------TAATTC 6
consensus_10864#3      --------------------------------------------------------AAAC 4
                                                                                  *

consensus_10864#0      ATTTAGTTTACTTGGAAAAACTGAAGCTTATGAAACAAAATTACCGAGGGATTCGTCGAC 240
consensus_10864#1      ATTTAGTTTACTTGGAAAAACTGAAGCTTATGAAACAAAATTACCGAGGGATTCGTCGAC 131
consensus_10864#2      ACTTAGT---CTTCGATTTAGTTATCTTACTGGTATTACATGTGGAATAAATAAACTTTC 151
consensus_10864#4      ACTTAGT---CTTCGATTTAGTTATCTTACTGGTATTACATGTGGAATAAATAAACTTTC 63
consensus_10864#3      GCTGGAT--ATTTTG--TAAATTTTATTGATGAAGGTAAA---GCAATTAAGCAGTTTTG 57
                         *   *    ** *    * *     *  **     * *      *   *         

consensus_10864#0      TTCGACGTGATGGAAACTGCTTTT--ATCGAGCATTTGGTTTTGCGTATATCGAGTACCT 298
consensus_10864#1      TTCGACGTGATGGAAACTGCTTTT--ATCGAGCATTTGGTTTTGCGTATATCGAGTACCT 189
consensus_10864#2      TGTTACTGGTTTAGGACTACTGAT--AAGAAATATGCAACCTC-CGCCCCCCACACTATC 208
consensus_10864#4      TGTTACTGGTTTAGGACTACTGAT--AAGAAATATGCAACCTC-CGCCCCCCACACTATC 120
consensus_10864#3      TGAAACAGAAGTTGAACCAATGGCCCGTGAATCAGATAATATACATGTAGCTGCTTTATC 117
                       *   **         **   *         *  *       *                  

consensus_10864#0      GCTAAATGGCAAGCTA-ATTAAAGAAGCTGGGAGATTCAAGAAGAAGTGTGACGAGTGTA 357
consensus_10864#1      GCTAAATGGCAAGCTA-ATTAAAGAAGCTGGGAGATTCAAGAAGAAGTGTGACGAGTGTA 248
consensus_10864#2      ACCCGTTAATGAGTCACATTCATGACATTCGAA--TTTCGCGGTAAACATGATAA-CATC 265
consensus_10864#4      ACCCGTTAATGAGTCACATTCATGACATTCGAA--TTTCGCGGTAAACATGATAA-CATC 177
consensus_10864#3      ATTAGCTGTTGAATTA-CCTATTTATGTAGAAAATTGTCAACAATCGGGTGAATTAAATC 176
                             *    *   *   *    *       *  *             ***      * 

consensus_10864#0      AAGATACACTAATTGCTAATGGTTATACACAGTTTACTG-TGGAGGATTTCCATGAACAG 416
consensus_10864#1      AAGATACACTAATTGCTAATGGTTATACACAGTTTACTG-TGGAGGATTTCCATGAACAG 307
consensus_10864#2      AAGTCAAAAT-----CTAATAATT-TATATCATTAACTT-TA-------TTCATTCTATT 311
consensus_10864#4      AAGTCAAAAT-----CTAATAATT-TATATCATTAACTT-TA-------TTCATTCTATT 223
consensus_10864#3      GTATCGAATTTCCTGCATATAGTGATTTATTATTAGATAATGTCGGTCCGTCGTGGCCGG 236
                              * *     *  **  *  *  *   **   *  *          * *      

consensus_10864#0      TTCGTCGGGATGGTGGATCGGTTTACTGTTGATGGTGGTACATTGGAAGAATTAGAAGGA 476
consensus_10864#1      TTCGTCGGGATGGTGGATCGGTTTACTGTTGATGGTGGTACATTGGAAGAATTAGAAGGA 367
consensus_10864#2      TTCGTTTTAATTATTACTAATTTAATT-----TGATTTTAAATTGTATC----------- 355
consensus_10864#4      TTCGTTTTAATTATTACTAATTTAATT-----TGATTTTAAATTGTATC----------- 267
consensus_10864#3      TTAAAACCTTTAAAATCCCATACATTCCTGGATGATCATGTAAAGGTATACGAGAGCCAG 296
                       **        *                     ** *  *  *  *               

consensus_10864#0      GTTTTTAACGATCAGGCATATTCAGATTATTATGTTGTATTTTTACGACTTTTAGTTTCT 536
consensus_10864#1      GTTTTTAACGATCAG--------------------------------ACTTTTAGTTTCT 395
consensus_10864#2      GCTTTTAG---------------------------------------ACTTTTAGTTTCT 376
consensus_10864#4      GCTTTTAG---------------------------------------ACTTTTAGTTTCT 288
consensus_10864#3      GTTTCAAAATAAAAA--------------------TACCCATAGAAAACACTTCATTCTC 336
                       * **  *                                        **  **  **   

consensus_10864#0      GCGTACATTCAAAAAAACG-CTGGA-TATTTTGTAAATTTTATTGATGAA-------GGT 587
consensus_10864#1      GCGTACATTCAAAAAAACG-CTGGA-TATTTTGTAAATTTTATTGATGAA-------GGT 446
consensus_10864#2      GCGTACATTCAAAAAAACG-CTGGA-TATTTTGTAAATTTTATTGATGAA-------GGT 427
consensus_10864#4      GCGTACATTCAAAAAAACG-CTGGA-TATTTTGTAAATTTTATTGATGAA-------GGT 339
consensus_10864#3      CATAATGTGCACATAAGCGACTGGAGCAGATGATATATTTGAGTCAGAAATCCATCGAAT 396
                           *  * ** * ** ** *****  *  *  ** **** * * *  **         *

consensus_10864#0      AAAACAATTAATCAGTTTTGTGAAACAGAAGTTGAACCAATGGCCCGTGAATCAGATAAT 647
consensus_10864#1      AAAACAATTAATCAGTTTTGTGAAACAGAAGTTGAACCAATGGCCCGTGAATCAGATAAT 506
consensus_10864#2      AAAACAATTAATCAGTTTTGTGAAACAGAAGTTGAACCAATGGCCCGTGAATCAGATAAT 487
consensus_10864#4      AAAACAATTAATCAGTTTTGTGAAACAGTAAGTTAATTTAT----CATAGATATTATTAT 395
consensus_10864#3      ATCAAAGCCAACATCTTTTGGGGTA-AGAGAGCGAACACATG-CTAACAAACGAGATAAA 454
                       *  * *   **    ***** *  * **      **   **         *    ** * 

consensus_10864#0      -ATACATGTAGCTGCTTTAGCATTAGCTGTTGAATT----ACCTATTTATGTAGAAAATT 702
consensus_10864#1      -ATACATGTAGCTGCTTTAGCATTAGCTGTTGAATT----ACCTATTTATGTAGAAAATT 561
consensus_10864#2      -ATACATGTAGCTGCTTTAGCATTAGCTGTTGAATT----ACCTATTTATGTAGAAAATT 542
consensus_10864#4      -AT-CGTGTGTT------------------------------------------------ 405
consensus_10864#3      GATTCCGATAACTGTTTATGTTTTACCGGAAGATTTGGGGAAACGGGTTTGTCAGAATGT 514
                        ** *   *                                                   

consensus_10864#0      GTCAACAATCGGGTGAATTAAATCGTATCGAATTTCCTGCATATAGTGATTTATTATTAG 762
consensus_10864#1      GTCAACAATCGGGTGAATTAAATCGTATCGAATTTCCTGCATATAGTGATTTATTATTAG 621
consensus_10864#2      GTCAACAATCGGGTGAATTAAATCGTATCGAATTTCCTGCATATAGTGATTTATTATTAG 602
consensus_10864#4      ------------------------------------------------------------
consensus_10864#3      GTCGGAGAATTTCCATTTGTACAAGGATGAGAATCCCCCATCCCATTG--TTAATATTAG 572
                                                                                   

consensus_10864#0      ATAATGTCGGTGAAACAAGCAATAATGATCATGATATTCACAATAAACAAGTATCTAA-- 820
consensus_10864#1      ATAATGTCGGTGAAACAAGCAATAATGATCATGATATTCACAATAAACAAGTATCTAA-- 679
consensus_10864#2      ATAATGTCGGTGAAACAAGCAATAATGATCATGATATTCACAATAAACAAGTATCTAA-- 660
consensus_10864#4      ------------------------------------------------------------
consensus_10864#3      CTGATGCTGGGCTCAATGCAGCTCGTGCTGAATGCTGTTGAAATGCATGAAAAGCCAAGT 632
                                                                                   

consensus_10864#0      TGATAAAAATTCTTTTATTAATAATTATAAACAGAATAATAGTTCACCACCAGTTACATT 880
consensus_10864#1      TGATAAAAATTCTTTTATTAATAATTATAAACAGAATAATAGTTCCCCCCCAGTTACATT 739
consensus_10864#2      TGATAAAAATTCTTTTATTAATAAATTATAACAGAAATATAGTTCACCACCAGTTACATT 720
consensus_10864#4      ------------------------------------------------------------
consensus_10864#3      TGGCTACTGTTGCAATTTTTGTGGTCATGTGTTAGAAATAAATATCACAACATCCAAACT 692
                                                                                   

consensus_10864#0      ATTGTATAGACCAGGTCATTATGATATATTATATCCTAATTCATCAAACTATTAAACAAA 940
consensus_10864#1      ATTGTATAGACCAGGTCATTATGATATATTATATCCTAATTCATCAAACTATTAAACAAA 799
consensus_10864#2      ATTGTATAGACCAGGTCATTATGATATATTATATCCTAATTCATCANACTATTAAAAAAC 780
consensus_10864#4      ------------------------------------------------------------
consensus_10864#3      TTAAGGGGAAATTTACAAATCGACTTTACTCTTGAAGAGAAAGTCACCTTATTCA----- 747
                                                                                   

consensus_10864#0      CTAATCAGATTGAAATTGT-AAATGGAATAATACTTTATGTATCATTAATAATCA-TATT 998
consensus_10864#1      CTAATCAGATTGAAATTGTTAAATGGAATAATACTTTATGTATCATTAATAATCAATATT 859
consensus_10864#2      TATCAGATTGAANTTGNTAANTGGANNTATACTTATGTATCATTATAATCATATTACAGT 840
consensus_10864#4      ------------------------------------------------------------
consensus_10864#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10864#0      ACAGTAGGTTNTTATGTTTTGGATGTTACTTTATAATTAGATTTAACTTC--ATGATGAT 1056
consensus_10864#1      ACAGTAGGTTTTTATGTTTTGGATGTTACTTTATAATTTAGATTAACTTTCAATGATGAT 919
consensus_10864#2      AGGTTNNNTATGTTTGGGATGTACTTTATAATTNAGATAAACTTCATGATGATTNTTTTG 900
consensus_10864#4      ------------------------------------------------------------
consensus_10864#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10864#0      TTTTTTTGTG--TGCTGNGTT-GNCTG---ATGGNGCTATG-ATTTCTGGGA--TATTTC 1107
consensus_10864#1      TTTTTTTGTTGTTGCTGTGTTTGTCTGTATGTGTGCTTATGTATTTCTGGGGATTATTTT 979
consensus_10864#2      NNTGTGCTGNGTTGNCTGATGNGGCCTAGNATTNCGGGGGATATTTTCTTTTTGNAAATG 960
consensus_10864#4      ------------------------------------------------------------
consensus_10864#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10864#0      TTTTTT------GAATAGAGCCTT--ACTAGATN------------------------- 1133
consensus_10864#1      CTTTTTTTTGTAATATGATGCCTTTCACTAAAGAATAATTCAATCGATAGTAAAATATT 1038
consensus_10864#2      AGCCTTNACTAGAAAT------------------------------------------- 976
consensus_10864#4      -----------------------------------------------------------
consensus_10864#3      -----------------------------------------------------------
                                                                                  




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)