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consensusID : consensus_11120#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 12 consensus length = 1265 fasta sequence
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[+] EMBL CD185277 [ cTGGAGCCGCCGAAATGGAACTCAGTGGCTATCTTC GCAAAGAAGCTCTTCAAATTGGTGGGCGTGAACAACTGTTGA TAAGCGCTATGGCTAGAGCTTTTGAAGTTATCCCTAGACAATTGTGCGATAATGCTGGATTGG ACTCAACTATTATTCTAAACCAACTGCGTCACAGTCATGCAAAAGGCGATATTTGGTATGCCGTTAACATTGAAAAAGAGTGCGTATGTGACAATTTCGAAAGTGGCGTCT GGGAACCAGCACTTGTGAAAAGCAATTCCATAATATCGGCCACCGAAGCGGCTTGTCTTCTGTTAAGTGTAGACGAAACGATCAAAAATCCAGAATCAAAGGGTGCTGAAGATAATACGCCTGTTCGGCCTCCTGGAATGAGGCATTAAAGTACTATCTGCGTTGTGCTTTTAAAATGAATAGGCTGAAATAAATAA]
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consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
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consensus_11120#1 ------------------------------------------------------------
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consensus_11120#1 ------------------------------------------------------------
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*** * ** **
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* * * * * ** * *** * * * * * *** * ** **
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** * * ** * * * * * * **** * * ** * * ***
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****** *** ** * * * * ** * *
consensus_11120#0 TGCTCTATTGGAAAAGTGTGCGTCAAC-TGCTTTAAGCTCTAAGTTAGTAGCTGGATATA 536
consensus_11120#1 TGTTTTGTGCCGGTCGTGTACCTGAAGATGATCTAAAACGTACTCAAATGGCTTGTGGTG 250
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consensus_11120#0 AACAGTTTTTCTCCAAATTGGTCGTTGATGCTGTCAGTTTGCTGGATTCATACTTACCGT 596
consensus_11120#1 GA-AGCGTTCAAACAA-CTGTTCATGGA--CTTTCAGAT-----AATGCTCTCGGAAC-T 300
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consensus_11120#0 TGAAGATGATTGGAATCAAAAAGGTTTCTGGTGGAGCATTGGAAGATTCACTTCTAATTG 656
consensus_11120#1 TGTGAATCCTT-----TGGGGAAATTCAGATTGGATCA--GAAAGATTTAATA-TATTTG 352
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consensus_11120#0 CAGGTGTAGCATTTAAAAAAACTTTCAGCTATGCTGGTTTTGA-AATGCAACCCAAATCT 715
consensus_11120#1 AAGGCTGTCCGCAAGCCAAAACTTGCACAATTATTCTTCGTGGTGGAGCTGAACAATTTA 412
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consensus_11120#0 TACAAGTCACCGAAAATTGCACTTTTAAATATTGAATTAGAATT---AAAAGCTGAGAAA 772
consensus_11120#1 TGGAAGAAACTGAAAGGT-CACTGCATGATGCTATCATGGTAGTTCGAAGAGCTGTTAAA 471
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consensus_11120#0 GAGAATGCCGAAATTCGTGTCACTTCGGTGGAGGAATACCAGAAGGTAGTTGATGCTGAG 832
consensus_11120#1 AATGATGC----ATT--TGTTGCT--GGTGGTGGAGCCGCCGAAA-----TGGAACTCAG 518
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consensus_11120#0 TGGCAAATTCTTTATGAAAAGCT-----AGATATTTTATATAAAAAAGGGGTTCAAATTG 887
consensus_11120#1 TGGCTATCTTCGCA-AAGAAGCTCTTCAAATTGGTGGGCGTGAACAACTGTTGATAAGCG 577
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consensus_11120#0 TTTTATCCAAGCTACCCATTGGAGATGTCGCTACTCAGTTTTTTGCTGATCGTGATATGT 947
consensus_11120#1 CTATGGCTAG---AGCTTTTGAAGTTATCCCTAGACAATTGTGCGATAATGCTGGATTGG 634
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consensus_11120#0 TTTGTGCCGGTCGTGTACCTGAAGATGATCTAAACGTACTCAAATGGCTTGTGGTGGAAG 1007
consensus_11120#1 ACTCAACTATTATTCTAAACCAAC-TGCGTCACAGTCATGCAAAAGGCGATATTTGGTAT 693
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consensus_11120#0 CGTTCAAACAACAGTTCATGGACTTTCAGATAATGCCCTCGGAACTTGTGAATCCTTTGG 1067
consensus_11120#1 GGCGTTAACATTGAA--AAGAGTGCGTATGTGACAATTTCGAAAGTGGCG-----TCTGG 746
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consensus_11120#0 GGAAATTCAGATTGGATCAGAAAGTTTGTAGAAGTCATTACCAA-AGTTTGACT-TGATA 1125
consensus_11120#1 GAA---CCACACTTGTGAAAGCAATTCATAATATCGGCCACCAACGGCTTGTCTCTGTTA 803
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consensus_11120#0 ATTT--CAAATAAATTGAACATTGGGTAGATTGTTTTTAATAGTAATAATATATTTGTAA 1183
consensus_11120#1 GTGTAACGAAACGATCAAAAATCCAG-AATCAAAGGGTGCTGAAGATAATACGCCTGTTC 862
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consensus_11120#0 TATCTCAATAAGCAGAAAAATTAAGTATGGTCAGACCTGTTTTTGATTGATCTCACCANA 1243
consensus_11120#1 GGCCTCCTGGAATGAGGCATTAAAGTACTATCTGCGTTGTGCTT--TTAA----AATGAA 916
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consensus_11120#0 TATTCTTGCTTGATTNCTTTGT 1265
consensus_11120#1 TAGGCTGAAATAAATAA----- 933
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| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||