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Schistosoma mansoni
cluster # 11155 cluster # 11155       Sequences # 36       consensus # 5


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_11155#0 length = 1356 sequences # 14  
consensus_11155#1 length = 1153 sequences # 12  
consensus_11155#2 length = 1012 sequences # 8  
consensus_11155#3 length = 461 sequences # 1  
consensus_11155#4 length = 331 sequences # 1  

consensusID : consensus_11155#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 14
consensus length = 1356
fasta sequence
                              [CTCGNAGGCCAAAATTCGGCACGAGGTGTATCCTCATTGTTCCCATCATTACTATTACTGCTATTATTATTATTATTATTATTATCACTACTATTTTTAGTGTAATTCATCCATTCTCTCTTTTATTTCTTAATCTTGTGCAAATATTATCACTTCAACCTGTTTGGTTAGTGTTGTTGAGTTTCTGCTGTCGGTATATCGTTTTTATTAGTTATATGCTACATCCAATTTTAGAAAATATTTTAAACTATTCTTATGCAGTATACTCTTGTTTTGTAGTTTGGTCCTTAACTTTACATCTGAACATTTAGAAAAGAGTAGTTGTGTTTACAACTCACACATCTTTCAGTATCATATGATATTTATATTTAGTAACAACACATGCAAAAGATCTATATAACTGAGGGAGATTTTTTTGTGTGTATCGTTGAATTACTAATTATATTTAAAAACCGTTGATTTCCAGAAACAAACTTGTAAAGTTATACATGTGTAAAACGTCTTTTAGTTTCTTGAATTAATCAATGCCGATTAACTGTATTTTGTTTCAGAAGCTCCGCCAGACTCTGTACCAAATCCACAAAACGATCAGTCACCAGGTCCAGGAAGCTCGCCTGGTAGTGGCGGGAGTGGATTNTACGACTNTTTTGGTTCCAGTTCCACACATTCGTCTTCGGAGGCAACTGCTACAGAGTCTGCTAGTACTGTATCACCGAAATCTGGATTTATATTTCAATAGATCTACCATTTTGTTGTATAATTCAATAGTAGACTTTGTTTACTGTCTTCCATTCATGCTTGTGTATATAAAAATAATCACGCTAGTGTACTATTCAATAATAACGACAACAATAGGGATCCTCATAGTTTATCAGCATTCCCTTCTATATTCATCTTGATTTTATTAGTAATGTTTTTCGCTTTTTAATTATTACTTCATATTAGTTATGTAAAAAGAAAGTTAACTCTTATGACAGTGTATACATAGATCTACTTCACTGTTGTTGAAAGCATTTTCAGGTTGTTTGAATATTTCTATTATCAACTTCATCCTACTTGTGTCAACTTTGCGTTGTCTGTAGACTAATCTGTTTTTATAAAGGTACATTGGTATTAGAATTTGTATCATGTTTACTGTTATTTCTTCACAAGTTGGTTGATTGCTTCTGTTGTTTTGTCATTTTTC-CCCATCCTTGCGTTCATGCACATTC-TTTGAACTCTTACTTT-ATTCGTATTAACCTCGTTTTCGTCTCTCCTACAAGTTAGTCATCCATCTTTGAGCTTTCGCATATAATAGTAAAATGTCAATATAACGATACTATCTCTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL CD080420             [CTCGNAGGCCAAAATTCGGCACGAGGTGTATCCTCATTGTTCCCATCATTACTATTACTGCTATTATTATTATTATTATTATTATCACTACTATTTTTAGTGTAATTCATCCATTCTCTCTTTTATTTCTTAATCTTGTGCAAATATTATCACTTCAACCTGTTTGGTTAGTGTTGTTGAGTTTCTGCTGTCGGTATATCGTTTTTATTAGTTATATGCTACATCCAATTTTAGAAAATATTTTAAACTATTCTTATGCAGTATACTCTTGTTTTGTAGTTTGGTCCTTAACTTTACATCTGAACATTTAGAAAAGAGTAGTTGTGTTTACAACTCACACATCTTTCAGTATCATATGATATTTATATTTAGTAACAACACATGCAAAAGATCTATATAACTGAGGGAGATTTTTTTGTGTGTATCGTTGAATTACTAATTATATTTAAAAACCGTTGATTTCCAGAAACAAACTTGTAAAGTTATACATGTGTAAAACGTCTTTTAGTTTCTTGAATTAATCAATGCCGATTAACTGTATTTTGTTTCAGAAGCTCCGCCAGACTCTGTACCAAATCCACAAAACGATCAGTCACCAGGTCCAGGAAGCTCGCCTGGTAGTGGCGGGAGTGGATTNTACGACTNTTTTGGTTCCAGTTCCACACATTCGTCTTCGGAGGCAACTGCTACAGAGTCTGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD164596             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCCGCCAGACTCTGTACCAAATCCACAAAACGATCAGTCACCAGGTCCAGGAAGCTCGCCTGGTAGTGGCGGGAGTGGATTTTACGACTTTTTTGGTTCCAGTTCCACACATTCGTCTTCGGAGGCAACTGCTACAGAGTCTGCTAGTACTGTATCACCGAAATCTGGATTTATATTTCAATAGATCTACCATTTTGTTGTATAATTCAATAGTAGACTTTGTTTACTGTCTTCCATTCATGCTTGTGTATATAAAAATAATCACGCTAGTGTACTATTCAATAATAACAACAACAATAGGGATCCTCATAGTTTATCAGCATTCCCTTCTATATTCATCTTGATTTTATTAGTAATGTTTTTCGCTTTTTAATTATTACTTCATATTAGTTATGTAAAAAGAAAGTTAACTCTTATGACAGTGTATACATAGATCTACTTCACTGTTGTTGAAAGCATTTTCAGGTTGTTTGAATATTTCTATTATCAACTTCATCCTACTTGTGTCAACTTTGCGTTGTCTGTAGACTAATCTGTTTTTATAAAGGTACATTGGTATTAGAATTTGTATCATGTTTACTGTTATTTCTTCACAAGTTGGTTGATTGCTTCTGTTGTTTTGTCATTTTTCNCCCATCCTTGCGTTCATGCACATTC TTTGAACTCTTACTTT ACTCGTATTAAC                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD138666             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAATTCAATAGTAGACTTTGTTGACTGTCTTCCATTCATGCTTGTGTATATAAAAATAATCACGCTAGTGTACTATTCAATAATAACGACAACAATAGGGATCCTCATAGTTTATCAGCATTCCCTTCTATATTCATCTTGATTTTATTAGTAATGTTTTTCGCTTTTTAATTATTACTTCATATTAGTTATGTAAAAAGAAAGTTAACTCTTATGACAGTGTATACATAGATCTACTTCACTGTTGTTGAAAGCATTTTCAGGTTGTTTGAATATTTCTATTATCAACTTCATCCTACTTGTGTCAACTTTGCGTTGTCTGTAGACTAATCTGTTTTTATAAAGGTACATTGGTATTAGAATTTGTATCATGTTTACTGTTATTTCTTCACAAGTTGGTTGATTGCTTCTGTTGTTTTGTCATTTTTC CCCATCCTTGCGTTCATGCACATTCATTTGAACTCTCACTTA ATTCGTATTAAC                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD138643             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAATTCAATAGTAGACTTTGTTTACTGTCTTCCATTCATGCTTGTGTATATAAAAATAATCACGCTAGTGTACTATTCAATAATAACGACAACAATAGGGATCCTCATAGTTTATCAGCATTCCCTTCTATATTCATCTTGATTTTATTAGTGATGTTTTTCGCTTTTTAATTATTACTTCATATTAGTTATGTAAAAAGAAAGTTAACTCTTATGACAGTGTATACATAGATCTACTTCACTGTTGTTGAAAGCATTTTCAGGTTGTTTGAATATTTCTATTATCAACTTCATCCTACTTGTGTCAACTTTGCGTTGTCTGTATACTAATCTGTTTTTATAAAGGTACATTGGTATTAGAATTTGTATCATGTTTACTGTTATTTCTTCACAAGTTGGTTGATTGCTTCTGTTGTTTTGTCATTTTTC CCCATCCTTGCGTTCATGCACATTC TTTGAACTCTTACTTT ATTCGTATTAAC                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD138631             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AGACTTTGTTTACTGTCTTCCATTCATGCTTGTGTATATAAAAATAATCACGCTAGTGTACTATTCAATAATAACGACAACAATAGGGATCCTCATAGTTTATCAGCATTCCCTTCTATATTCATCTTGATTTTATTAGTAATGTTTTTCGCTTTTTAATTATTACTTCATATTAGTTATGTAAAAAGAAAGTTAACTCTTATGACAGTGTATACATAGATCTACTTCACTGTTGTTGAAAGCATTTTCAGGTTGTTTGAATATTTCTATTATCAACTTCATCCTACTTGTGTCAACTTTGCGTTGTCTGTAGACTAATCTGTTTTTATAAAGGTACATTGGTATTAGAATTTGTATCATGTTTACTGTTATTTCTTCACAAGTTGGTTGATTGCTTCTGTTGTTTTGTCATTTTTC CCCATCCTTGCGTTCATGCACATTC TTTGAACTCTTACTTT ATTCGTATTAAC                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD138628             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TACGGTCTTCCATTCATGCTTGTGTATATAAAAATAATCACGCTAGTGTACTATTCAATAATAACGACAACAATAGGGATCCTCATAGTTTATCAGCATTCCCTTCTATATTCATCTTGATTTTATTAGTAATGTTTTTCGCTTTTTAATTATTACTTCATATTAGTTATGTAAAAAGAAAGTTAACTCTTATGACAGTGTATACATAGATCTACTTCACTGTTGTTGAAAGCATTTTCAGGTTGTTTGAATATTTCTATTATCAACTTCATCCTACTTGTGTCAACTTTGCGTTGTCTGTAGACTAATCTGTTTTTATAAAGGTACATTGGTATTAGAATTTGTATCATGTTTACTGTTATTTCTTCACAAGTTGGTTGATTGCTTCTGTTGTTTTGTCATTTTTC CCCATCCTTGCGTTCATGCACATTC TTTGAACTCTTACTTT ATTCGTATTAAC                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD138654             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TCTTCCATTCATGCTTGTGTATATAAAAATAATCACGCTAGTGTACTATTCAATAATAACGACAACAGTAGGGATCCTCATAGTTTATCAGCATTCCCTTCTATATTCATCTAGATTTTATTAGTAATGTTTTTCGCTTTTTAATTATTACTTCATATTAGTTATGTAAAAAGAAAGTTAACTCTTATGACAGTGTATACATAGATCTACTTCACTGTTGTTGAAAGCATTTTCAGGTTGTTTGAATATTTCTATTATCAACTTCATCCTACTTGTGTCAACTTTGCGTTGTCTGTAGACTAATCTGTTTTTATAAAGGTACATTGGTATTAGAATTTGTATCATGTTTACTGTTATTTCTTCACAAGTTGGTTGATTGCTTCTGTTGTTTTGTCATTTTTC CCCATCCTTGCGTTCATGCACATTC TTTGAACTCTTACTTT ATTCGTATTAAC                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD138630             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CCATTCATGCTTGTGTATATAAAAATAATCACGCTAGTGTACTATTCAATAATAACGACAACAATAGGGATCCTCATAGTTTATCGGCATTCCCTTCTATATTCATCTTGATTTTATTAGTAATGTTTTTCGCTTTTTAATTATTACTTCATATTAGTTATGTAAAAAGAAAGTTAACTCTTATGACAGTGTATACATAGATCTACTTCACTGTTGTTGAAAGCATTTTCAGGTTGTTTGAATATTTCTATTATCAACTTCATCCTACTTGTGTCAACTTTGCGTTGTCTGTAGACTAATCTGTTTTTATAAAGGTACATTGGTATTAGAATTTGTATCATGTTTACTGTTATTTCTTCACAAGTTGGTTGATTGCTTCTGTTGTTTTGTCATTTTTC CCCATCCTTGCGTTCATGCACATTC TTTGAACTCTTACTTT ATTCGTATTAAC                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD138676             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATGCTTGTGTATATAAAAATAATCACGCTAGTGTACTATTCAATAATAACGACAACAATAGGGATCCTCATAGTTTATCAGCATTCCCTTCTATATTCATCTTGATTTTATTAGTAATGTTTTTCGCTTTTTAATTATTACTTCATATTAGTTATGTAAAAAGAAAGTTAACTCTTATGACAGTGTATACATAGATCTACTTCACTGTTGTTGAAAGCATTTTCAGGTTGTTTGAATATTTCTATTATCAACTTCATCCTACTTGTGTCAACTTTGCGTTGTCTGTAGACTAATCTGTTTTTATAAAGGTACATTGGTATTAGAATTTGTATCATGTTTACTGTTATTTCTTCACAAGTTGGTTGATTGCTTCTGTTGTTTTGTCATTTTTC CCCATCCTTGCGTTCATGCACATTC TTTGAACTCTTACTTTAATTCGTATTAAC                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD138650             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GTGTATATAAAAATAATCACGCTAGTGTACTATCCAATAATAACGACAACAATAGGGATCCTCATAGTTTATCAGCATTCCCTTCTATATTCATCTTGATTTTATTAGTAATGTTTTTCGCTTTTTAATTATTACTTCATATTAGTTATGTAAAAAGAAAGTTAACTCTTATGACAGTGTATACATAGATCTACTTCACTGTTGTTGAAAGCATTTTCAGGTTGTTTGAATATTTCTATTATCAACTTCATCCTACTTGTGTCAACTTTGCGTTGTCTGTAGACTAATCTGTTTTTATAAAGGTACATTGGTATTAGAATTTGTATCATGTTTACTGTTATTTCTTCACAAGTTGGTTGATTGCTTCTGTTGTTTTGTCATTTTTC CCCATCCTTGCGTTCATGCACATTC TTTGAACTCTTACTTT ATTCGTATTAAC                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD138640             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AGTGTACTATTCAATAATAACGACAACAATAGGGATCCTCATAGTTTATCAGCATTCCCTTCTATATTCATCTTGATTTTATTAGTAATGTTTTTCGCTTTTTAATTATTACTTCATATTAGTTATGTAAAAAGAAAGTTAACTCTTATGACAGTGTATACATAGATCTACTTCACTGTTGTTGAAAGCATTTTCAGGTTGTTTGAATATTTCTATTATCAACTTCATCCTACTTGTGTCAACTTTGCGTTGTCTGTAGACTAATCTGTTTTTATAAAGGTACATTGGTATTAGAATTTGTATCATGTTTACTGTTATTTCTTCACAAGTTGGTTGATTGCTTCTGTTGTTTTGTCATTTTTC CCCATCCTTGCGTTCATGCACATTC TTTGAACTCTTACTTT ATTCGTATTAAC                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD138663             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTCAATAATAACGACAACAATAGGGATCCTCATAGTTTATCAGCATTCCCTTCTATATTCATCTTGATTTTATTAGTAATGTTTTTCGCTTTTTAATTATTACTTCATATTAGTTATGTAAAAAGAAAGTTAACTCTTATGACAGTGTATACATAGATCTACTTCACTGTTGTTGAAAGCATTTTCAGGTTGTTTGAATATTTCTATTATCAACTTCATCCTACTTGTGTCAACTTTGCGTTGTCTGTAGACTAATCTGTTTTTATAAAGGTACATTGGTATTAGAATTTGTATCATGTTTACTGTTATTTCTTCACAAGTTGGTTGATTGCTTCTGTTGTTTTGTCATTTTTC CCCATCCTTGCGTTCATGCACATTC TTTGAACTCTTACTTT ATTCGTATTAAC                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD138633             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAATAACGACAACAATAGGGATCCTCATAGTTTATCAGCATTCCCTTCTATATTCATCTTGATTTTATTAGTAATGTTTTTCGCTTTTTAATTATTACTTCATATTAGTTATGTAAAAAGAAAGTTAACTCTTATGACAGTGTATACATAGATCTACTTCACTGTTGTTGAAAGCATTTTCAGGTTGTTTGAATATTTCTATTATCAACTTCATCCTACTTGTGTCAACTTTGCGTTGTCTGTAGACTAATCTGTTTTTATAAAGGTACATTGGTATTAGAATTTGTATCATGTTTACTGTGATTTCTTCACAAGTTGGTTGATTGCTTCTGTTGTTTTGTCATTTTTC CCCATCCTTGCGTTCATGCACATTC TTTGAACTCTCACTTTAATTCGTATTAAC                                                                                                                     ]
[-] EMBL AI395816             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ctTTGTGTCAACTTTGCGTTGTCTGTAGCTTAATCTGCTTTTTTAAAGGTACACTGGTATTAGAATTTGTATCATGTCTACTGTTATTTCTTCACAAGTTGGTTGATTGCTTCTGTTGTTTTGTCATTTTTC CCCATCCTTGCGTTCATGCACATTC TTTGAACTCTTACTTT ATTCGTATTAACCTCGTTTTCGTCTCTCCTACAAGTTAGTCATCCATCTTTGAGCTTTCGCATATAATAGTAAAATGTCAATATAACGATACTATCTCTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]


>consensus_11155#0 CTCGNAGGCCAAAATTCGGCACGAGGTGTATCCTCATTGTTCCCATCATTACTATTACTG CTATTATTATTATTATTATTATTATCACTACTATTTTTAGTGTAATTCATCCATTCTCTC TTTTATTTCTTAATCTTGTGCAAATATTATCACTTCAACCTGTTTGGTTAGTGTTGTTGA GTTTCTGCTGTCGGTATATCGTTTTTATTAGTTATATGCTACATCCAATTTTAGAAAATA TTTTAAACTATTCTTATGCAGTATACTCTTGTTTTGTAGTTTGGTCCTTAACTTTACATC TGAACATTTAGAAAAGAGTAGTTGTGTTTACAACTCACACATCTTTCAGTATCATATGAT ATTTATATTTAGTAACAACACATGCAAAAGATCTATATAACTGAGGGAGATTTTTTTGTG TGTATCGTTGAATTACTAATTATATTTAAAAACCGTTGATTTCCAGAAACAAACTTGTAA AGTTATACATGTGTAAAACGTCTTTTAGTTTCTTGAATTAATCAATGCCGATTAACTGTA TTTTGTTTCAGAAGCTCCGCCAGACTCTGTACCAAATCCACAAAACGATCAGTCACCAGG TCCAGGAAGCTCGCCTGGTAGTGGCGGGAGTGGATTNTACGACTNTTTTGGTTCCAGTTC CACACATTCGTCTTCGGAGGCAACTGCTACAGAGTCTGCTAGTACTGTATCACCGAAATC TGGATTTATATTTCAATAGATCTACCATTTTGTTGTATAATTCAATAGTAGACTTTGTTT ACTGTCTTCCATTCATGCTTGTGTATATAAAAATAATCACGCTAGTGTACTATTCAATAA TAACGACAACAATAGGGATCCTCATAGTTTATCAGCATTCCCTTCTATATTCATCTTGAT TTTATTAGTAATGTTTTTCGCTTTTTAATTATTACTTCATATTAGTTATGTAAAAAGAAA GTTAACTCTTATGACAGTGTATACATAGATCTACTTCACTGTTGTTGAAAGCATTTTCAG GTTGTTTGAATATTTCTATTATCAACTTCATCCTACTTGTGTCAACTTTGCGTTGTCTGT AGACTAATCTGTTTTTATAAAGGTACATTGGTATTAGAATTTGTATCATGTTTACTGTTA TTTCTTCACAAGTTGGTTGATTGCTTCTGTTGTTTTGTCATTTTTCCCCATCCTTGCGTT CATGCACATTCTTTGAACTCTTACTTTATTCGTATTAACCTCGTTTTCGTCTCTCCTACA AGTTAGTCATCCATCTTTGAGCTTTCGCATATAATAGTAAAATGTCAATATAACGATACT ATCTCTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA



consensusID : consensus_11155#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 12
consensus length = 1153
fasta sequence
                              [GACGAGTTCAGCAGAGATCCCTGTCCGTTTCGTATCGTCAGCGATTGTGGAGCTGCATTTGCTATGGGTACTATCGGTGGTAGTGTTTTACATTTCTACAGAGGCTATCGTAACGCTCCTTCGGGTTATACAAAAAAACTAGTAAGCGCAATGGTTAACAGTCGTCAACGTGCACCAATCACGGGTGGAGGGTTCGCTATATGGGGTGGAGTGTTTACTGCTGTCGATTGCTCTTTAGTTCTTGCTCGTCGAAAAGAGGATCCGTGGAATTCCATCACTAGTGGGGCTATAACGGGAGCTGCTCTGGCTGTTCGTCATGGTCCAACAGCTATGGTCGGTCAAGCATTTGTTGGTGGCGTTATATTGGCAATTATCGAGGGACTTGGAATCATGATAAATAGATTCGCTCCTATGCTGATGCAAGCTCCGCCAGACTCTGTACCAAATCCACAAAACGATCAGTCATCAGGTCCAGGAAGCTCGCCTGGTAGTGGCGGGAGTGGATTTTACGACTTTTTTGGTTCCAGTTCCACACATTCGTCTTCGGAGGCAACTGCTACAGAGTCTGCTAGTACAGTATCACCGAAATCTGGATTTATATTTCAATAGATCTACCATTTTGTTGTATAATTCAATAGTAGACTTTGTTTACTGTCTTCCATTCATGCTTGTGTATATAAAAATAATCACGCTAGTGTACTATTCAATAATAACGACAACAATAGGGATCCTCATAGTTTATCAGCATTCCCTTCTATATTCATCTTGATTTTATTAGTAATGTTTTTCGCTTTTTAATTATTACTTCATATNTAGTTATGTAAAANAGAAAGTTAACTTCTTATGACAGGTGTATACATAGTATTCTACTTTCACTGTTGTTNNGAAAGACATTTTCANNGGTTGTTTGNNAATATTTTCTATATATCAACTTTCATTCCTACTTGTGNTTCAACTTTGCNGTTGTTCTGTAGACATAATTCTGTTTNTTATAAAGGTCACATATGGTATATAGAAATTTGTATACATGTTGTACTGTTATCTTCTATCACCAAGTTGGTATGATTGCTCTCTGTTGTGTTTGTACATTTTTCCGCCATGCCTTGCGTTCATCGCACATTCATTTGAACTCTCTACTTTAATTCGTATTAAC]

[+] EMBL CD138625             [GACGAGTTCAGCAGAGATCCCTGTCCGTTTCGTATCGTCAGCGATTGTGGAGCTGCATTTGCTATGGGTACTATCGGTGGTAGTGTTTTACATTTCTACAGAGGCTATCGTAACGCTCCTTCGGGTTATACAAAAAAACTAGTAAGCGCAATGGTTAACAGTCGTCAACGTGCACCAATCACGGGTGGAGGGTTCGCTATATGGGGTGGAGTGTTTACTGCTGTCGATCGCTCTTTAGTTCTTGCTCGTCGAAAAGAGGATCCGTGGAATTCCATCACTAGTGGGGCTATAACGGGAGCTGCTCTGGCTGTTCGTCATGGTCCAACAGCTATGGTCGGTCAAGCATTTGTTGGTGGCGTTATATTGGCAATTATCGAGGGACTTGGACTCATGATCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD138668             [GACGAGTTCAGCAGAGATCCCTGTCCGTTTCGTATCGTCAGCGATTGTGGAGCTGCATTTGCTATGGGTACTATCGGTGGTAGTGTTTTACATTTCTACAGAGGCTATCGTAACGCTCCTTCGGGTTATACAAAAAAACTAGTAAGCGCAATGGTTAACAGTCGTCAACGTGCACCAATCACGGGTGGAGGGTTCGCTATATGGGGTGGAGTGTTTACTGCTGTCGATTGCTCTTTAGTTCTTGCTCGTCGAAAAGAGGATCCGTGGAATTCCATCACTAGTGGGGCTATAACGGGAGCTGCTCTGGCTGTTCGTCATGGTCCAACAGCTATGGTCGGTCAAGCATTTGTTGGTGGCGTTATATTGGCAATTATCGAGGGACTTGGAATCATGATAAATAGATTCGCTCCTATGCTGATGCAAGCTCCGCCAGACTCTGTACCAAATCCACAAAACGATCAGTCATCAGGTCCAGGAAGCTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD138639             [GACGAGTTCAGCAGAGATCCCTGTCCGTTTCGTATCGTCAGCGATTGTGGAGCTGCATTTGCTATGGGTACTATCGCTGGTAGTGTTTTACATTTCTACAGAGGCTATCGTAACGCTCCTTCGGGTTATAC AAAAAACTAGTAAGCGCAATGGTTAACAGTCGTCAACGTGCACCAATCACGAGTGGAGGGTTCGCTATATGGGGTGGAGTGTTTACTGCTGTCGATTGCTCTTTAGTTCTTGCTCGTCGAAAAGAGGATCCGTGGAATTCCATCACTAGTGGGGCTATAACGGGAGCTGCTCTGGCTGTTCGTCATGGTCCAACAGCTATGGTCGGTCAAGCATTTGTTGGTGGCGTTATATTGGCAATTATCGAGGGACTTGGAATCATGATAAATAGATTCGCTCCTATGCTGATGCAAGCTCCGCCAGACTCTGTACCAAATCCACAAAACGATCAGTCATCAGGTCCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD138638             [GACGAGTTCAGCAGAGATCCCTGTCCGTTTCGTATCGTCAGCGATTGTGGAGCTGCATTTGCTATGGGTACTATCGGTGGTAGTGTTTTACATTTCTACAGAGGCTATCGTAACGCTCCTTCGGGTTATGCAAAAAAACTAGTAAGCGCAATGGTTAACAGTCGTCAACGTGCACCAATCACGGGTGGAGGGTTCGCTATATGGGGTGGAGTGTTTACTGCTGTCGATTGCTCTTTAGTTCTTGCTCGTCGAAAAGAGGATCCGTGGAATTCCATCACTAGTGGGGCTATAACGGGAGCTGCTCTGGCTGTTCGTCATGGTCCAACAGCTATGGTCGGTCAAGCATTTGTTGGTGGCGTTATATTGGCAATTATCGAGGGACTTGGAATCATGATAAATAGATTCGCTCCTATGCTGATGCAAGCTCCGCCAGACTCTGTACCAAATCCACAAAACGATCAGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD138670             [GACGAGTTCAGCAGAGATCCCTGTCCGTTTCGTATCGTCAGCGATTGTGGAGCTGCATTTGCTATGGGTACTATCGGTGGTAGTGTTTTACATTTCTACAGAGGCTATCGTAACGCTCCTTCGGGTTATACAAAAAAACTAGTAAGCGCAATGGTTAACAGTCGTCAACGTGCACCAATCACGGGTGGAGGGTTCGCTATATGGGGTGGAGTGTTTACTGCTGTCGATTGCTCTTTAGTTCTTGCTCGTCGAAAAGAGGATCCGTGGAATTCCATCACTAGTGGGGCTATAACGGGAGCTGCTCTGGCTGTTCGTCATGGTCCAACAGCTATGGTCGGTCAAGCATTTGTTGGTGGCGTTATATTGGCAATTATCGAGGGACTTGGAATCATGATAAATAGATTCGCTCCTATGCTGATGCAAGCTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD138660             [GACGAGTTCAGCAGAGATCCCTGTCCGTTTCGTATCGTCAGCGATTGTGGAGCTGCATTTGCTATGGGTACTATCGGTGGTAGTGTTTTACATTTCTACAGAGGGTATCGTAACGCTCCTTCGGGTTATACAAAAAAACTAGTAAGCGCAATGGTTAACAGTCGTCAACGTGCACCAATCACGGGTGGAGGGTTCGCTATATGGGGTGGAGTGTTTACTGCTGTCGATTGCTCTTTAGTTCTTGCTCGTCGAAAAGAGGATCCGTGGAATTCCATCACTAGTGGGGCTATAACGGGAGCTGCTCTGGCTGTTCGTCATGGTCCAACAGCTATGGTCGGTCAAGCATTTGTTGGTGGCGTTATATTGGCAATTATCGAGGGACTTGGAATCATGATAAATAGATTCGCTCCTATGCTGATGCAAGCTCCGCCAGACTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD138627             [GACGAGTTCAGCAGAGATCCCTGTCCGTTTCGTATCGTCAGCGATTGTGGAGCTGCATTTGCTATGGGTACTATCGGTGGTAGTGTTTTACATTTCTACAGAGGCTATCGTAACGCTCCTTCGGGTTATACAAAAAAACTAGTAAGCGCAATGGTTAACAGTCGTCAACGTGCACCAATCACGGGTGGAGGGTTCGCTATATGGGGTGGAGTGTTTACTGCTGTCGATTGCTCTTTAGTTCTTGCTCGTCGAAAAGAGGATCCGTGGAATTCCATCACTAGTGGGGCTATAACGGGAGCTGCTCTGGCTGTTCGTCATGGTCCAACAGCTATGGTCGGTCAAGCATTTGTTGGTGGCGTTATATTGGCAATTATCGAGGGACTTGGAATCATGATTAATAGATTCGCTCCTATGCTGATGCAAGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD138675             [GACGAGTTCAGCAGAGATCCCTGTCCGTTTCGTATCGTCAGCGATTGTGGAGCTGCATTTGCTATGGGTACTATCGGTGGTAGTGTTTTACATTTCTACAGAGGCTATCGTAACGCTCCTTCGGGTTATACAAAAAAACTAGTAAGCGCAATGGTTAACAGTCGTCAACGTGCACCAATCACGGGTGGAGGGTTCGCTATATGGGGTGGAGTGTTTACTGCTGTCGATTGCTCTTTAGTTCTTGCTCGTCGAAAAGAGGATCCGTGGAATTCCATCACTAGTGGGGCTATAACGGGAGCTGCTCTGGCTGCTCGTCATGGTCCAACAGCTATGGTCGGTCAAGCATTTGTTGGTGGCGTTATATTGGCAATTATCGAGGGACTTGGAATCATGATAAATAGATTCGCTCCTATGCTGATGCCAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD138658             [GACGAGTTCAGCAGAGATCCCTGTCCGTTTCGTATCGTCAGCGATTGTGGAGCTGCATTTGCTATGGGTACTATCGGTGGTAGTGTTTTACATTTCTACAGAGGCTATCGTAACGCTCCTTCGGGTTATACAAAAAAACTAGTAAGCGCAATGGTTAACAGTCGTCAACGTGCACCAATCACGGGTGGAGGGTTCGCTATATGGGGTGGAGTGTTTACTGCTGTCGATTGCTCTTTAGTTCTTGCTCGTCGAAAAGAGGATCCGTGGAATTCCATCACTAGTGGGGCTATAACGGGAGCTGCTCTGGCTGTTCGTCATGGTCCAACAGCTATGGTCGGTCAAGCATTTGTTGGTGGCGTTATATTGGCAATTATCGAGGGACTTGGAATCTTGATAAATAGATTCGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD113008             [            AGAGATCCCTGTCCGTTTCGTATCGTCAGCGATTGTGGAGCTGCATTTGCTATGGGTACTATCGGTGGTAGTGTTTTACATTTCTACAGAGGCTATCGTAACGCTCCTTCGGGTTATACAAAAAAACTAGTAAGCGCAATGGTTAACAGTCGTCAACGTGCACCAATCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD178481             [                                                                                                                                                                                                          GGGGCGGAGTGTTTACTGCTGTCGATTGCTCTTTAGTTCTTGCTCGTCGAAAAGAGGATCCGTGGAATTCCATCACTAGTGGGGCTATAACGGGAGCTGCTCTGGCTGTTCGTCATGGTCCAACAGCTATGGTCGGTCAAGCATTTGTTGGTGGCGTTATATTGGCAATTATCGAGGGACTTGGAATCATGATAAATAGATTCGCTCCTATGCTGATGCAAGCTCCGCCAGACTCTGTACCAAATCCACAAAACGATCAGTCATCAGGTCCAGGAAGCTCGCCTGGTAGTGGCGGGAGTGGATTTTACGACTTTTTTGGTTCCAGTTCCACACATTCGTCTTCGGAGGCAACTGCTACAGAGTCTGCTAGTACAGTATCACCGAAATCTGGATTTATATTTCAATAGATCTACCATTTTGTTGTATAATTCAATAGTAGACTTTGTTTACTGTCTTCCATTCATGCTTGTGTATATAAAAATAATCACGCTAGTGTACTATTCAATAATAACGACAACAATAGGGATCCTCATAGTTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD138669             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TAGTGTACCATTCAATAATAACGA AACAATAGGGATCCTCATAGTTTATCAGCATTCCCTTCTATATTCATCTTGATTTTATTAGTAATGTTTTTCGCTTTTTAATTATTACTTCATATNTAGTTATGTAAAANAGAAAGTTAACTTCTTATGACAGGTGTATACATAGTATTCTACTTTCACTGTTGTTNNGAAAGACATTTTCANNGGTTGTTTGNNAATATTTTCTATATATCAACTTTCATTCCTACTTGTGNTTCAACTTTGCNGTTGTTCTGTAGACATAATTCTGTTTNTTATAAAGGTCACATATGGTATATAGAAATTTGTATACATGTTGTACTGTTATCTTCTATCACCAAGTTGGTATGATTGCTCTCTGTTGTGTTTGTACATTTTTCCGCCATGCCTTGCGTTCATCGCACATTCATTTGAACTCTCTACTTTAATTCGTATTAAC]


>consensus_11155#1 GACGAGTTCAGCAGAGATCCCTGTCCGTTTCGTATCGTCAGCGATTGTGGAGCTGCATTT GCTATGGGTACTATCGGTGGTAGTGTTTTACATTTCTACAGAGGCTATCGTAACGCTCCT TCGGGTTATACAAAAAAACTAGTAAGCGCAATGGTTAACAGTCGTCAACGTGCACCAATC ACGGGTGGAGGGTTCGCTATATGGGGTGGAGTGTTTACTGCTGTCGATTGCTCTTTAGTT CTTGCTCGTCGAAAAGAGGATCCGTGGAATTCCATCACTAGTGGGGCTATAACGGGAGCT GCTCTGGCTGTTCGTCATGGTCCAACAGCTATGGTCGGTCAAGCATTTGTTGGTGGCGTT ATATTGGCAATTATCGAGGGACTTGGAATCATGATAAATAGATTCGCTCCTATGCTGATG CAAGCTCCGCCAGACTCTGTACCAAATCCACAAAACGATCAGTCATCAGGTCCAGGAAGC TCGCCTGGTAGTGGCGGGAGTGGATTTTACGACTTTTTTGGTTCCAGTTCCACACATTCG TCTTCGGAGGCAACTGCTACAGAGTCTGCTAGTACAGTATCACCGAAATCTGGATTTATA TTTCAATAGATCTACCATTTTGTTGTATAATTCAATAGTAGACTTTGTTTACTGTCTTCC ATTCATGCTTGTGTATATAAAAATAATCACGCTAGTGTACTATTCAATAATAACGACAAC AATAGGGATCCTCATAGTTTATCAGCATTCCCTTCTATATTCATCTTGATTTTATTAGTA ATGTTTTTCGCTTTTTAATTATTACTTCATATNTAGTTATGTAAAANAGAAAGTTAACTT CTTATGACAGGTGTATACATAGTATTCTACTTTCACTGTTGTTNNGAAAGACATTTTCAN NGGTTGTTTGNNAATATTTTCTATATATCAACTTTCATTCCTACTTGTGNTTCAACTTTG CNGTTGTTCTGTAGACATAATTCTGTTTNTTATAAAGGTCACATATGGTATATAGAAATT TGTATACATGTTGTACTGTTATCTTCTATCACCAAGTTGGTATGATTGCTCTCTGTTGTG TTTGTACATTTTTCCGCCATGCCTTGCGTTCATCGCACATTCATTTGAACTCTCTACTTT AATTCGTATTAAC



consensusID : consensus_11155#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1012
fasta sequence
                              [CACGTTCTTNTTTCTTGTCCTTTTTGATCCCGGAGGTCGGAGTAGTAGCCATAAATACTTCGACTGTGATGCTATACTGACTAAAAGATGTCATCCCTCTCGTCATGATTATTGTCACCTGCAAGTCTAANTNAGAATTTGTTGATGTGATACATAATAAAAACCGTGATTCAGACAAACTGTNAATATCATGGTAAACGTCTTTAGTTCTGAATAATCAATGCGATTACNTGTATTTGTTTCAGAAGCTCCGCCAGACTCTGTANCCAATCCACANAACGATCAGTCANCAGGTCCAGAAAGCTCGCCTGGTAGTGGCNGGAGTGGATTTACGACTTTTTTGGTTCCAGTTCCACACATTCGTCTTCGGAGGCAACTGCTACAGAGTCTGCTAGTACAGTATCACCGAAATCTGGATTTATATTTCAATAGATCTACCATTTTGTTGTATAATTCAATAGTAGACTTTGTTTACTGTCTTCCATTCATGCTTGTGTATATAAAAATAATCACGCTAGTGTACTATT--CAATAATAACAACAA-CAATAGGGATCCTCA-TAGTTTATCAGCATTCCCTTCTATATTCATCTTGATTTTATTAGTAATGTTTTTCGCTTTTTAATTATTACTTCATATTAGTTATGTAAAAAGAAAGTTAACTCTTATGACAGTGTATACATAGATCTACTTCACTGTTGTTGAAAGCATTTTCAGGTTGTTTGAATATTTCTATTATCAACTTCATCCTACTTGTGTCAACTTTGCGTTGTCTGTAGACTAATCTGTTTTTATAAAGGTACAT-TGGTATTAGAATTTGTATCATGTTTACTGTTATTTCTTCACAAGTTGGTTGATTGCTTCTGTTGTTTTGTCATTTTTCCCCATCCTTGCGTTCATGCACATTCTTTGAACTCTTACTTTATTCGTATTAACCTCGTTTTCGTCTCTCCTACAAGTTAGTCATCCATCTTTGAGCTTTCGCATATAATAGTAAAATGTCAATATAACGATAC]

[-] EMBL CD074512             [CACGTTCTTNTTTCTTGTCCTTTTTGATCCCGGAGGTCGGAGTAGTAGCCATAAATACTTCGACTGTGATGCTATACTGACTAAAAGATGTCATCCCTCTCGTCATGATTATTGTCACCTGCAAGTCTAANTNAGAATTTGTTGATGTGATACATAATAAAAACCGTGATTCAGACAAACTGTNAATATCATGGTAAACGTCTTTAGTTCTGAATAATCAATGCGATTACNTGTATTTGTTTCAGAAGCTCCGCCAGACTCTGTANCCAATCCACANAACGATCAGTCANCAGGTCCAGAAAGCTCGCCTGGTAGTGGCNGGAGTGGATTTACGACTTTTTTGGTTCCAGTTCCACACATTCGTCTTCGGAGGCAACTGCTACAGAGTCTGCTAGTACAGTATCACCGAAATCTGGATTTATATTTCAATAGATCTACCATTTTGTTGTATAATTCAATAGTAGACTTTGTTTACTGTCTTCCATTCATGCTTGTGTATATAAAAATAATCACGCTAGTGTACTATT  CAATAATAACAACAA CAATAGGGATCCTCA TAGTTTATCAGCATTCCCTTCTATATTCATCTTGATTTTATTAGTAATGTTTTTCGCTTTTTAATTATTACTTCATATTAGTTATGTAAAAAGAAAGTTAACTCTTATGACAGTGTATACATAGATCTACTTCACTGTTGTTGAAAGCATTTTCAGGTTGTTTGAATATTTCTATTATCAACTTCATCCTACTTGTGTCAACTTTGCGTTGTCTGTAGACTAATCTGTTTTTATAAAGGTACAT TGGTATTAGAATTTGTATCATGTTTACTGTTATTTCTTCACAAGTTGGTTGATTGCTTCTGTTGTTTTGTCATTTTTCCCCATCCTTGCGTTCATGCACATTCTTTGAACTCTTACTTTATTCGTATTAACCTCGTTTTCGTCTCTCCTACAAGTTAGTCATCCATCTTTGAGCTTTCGCATATAATAGTAAAATGTCAATATAACGATAC]
[+] EMBL CD079216             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GTTCC CACATTCGTCTTCGGAGGCAACTGCTACAGAGTCTGCTAGTACAGTATCACCGAAATCTGGATTTATATTTCAATAGATCTACCATTTTGTTGTATAATTCAATAGTAGACTTTGTTTACTGTCTTCCATTCATGCTTGTGTATATAAAAATAATCACGCTAGTGTACTATT  CAATAATAACAACAA CAATAGGGATCCTCA TAGTTTATCAGCATTCCCTTCTATATTCATCTTGATTTTATTAGTAATGTTTTTCGCTTTTTAATTATTACTTCATATTAGTTATGTAAAAAGAAAGTTAACTCTTATGACAGTGTATACATAGATCTACTTCACTGTTGTTGAAAGCATTTTCAGGTTGTTTGAATATTTCTATTATCAACTTCATCCTACTTGTGTCAACTTTGCGTTGTCTGTAGACTAATCTGTTTTTATAAAGGTACAT TGGTATTAGAATTTGTATCATGTTTACTGTTATTTCTTCACAAGTTGGTTGATTGCTTCTGTTGTTTTGTCATTNTTCCCCATCCTTGCGTTCATGCACATTCTTTGAACTCTTACTTTATTCGTATTAACCTCGTTTTCGTCTCTCCTACAAGTTAGTCATCCATCTTTGAGCTNTCGCATATAATAGTANAATGT              ]
[-] EMBL CD074334             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TATTCCCAATAATAACAACAACCAATAGGGATCCTCANTAGTTTATCAGCATTCCCTTCTATATTCATCTTGATTTTATTAGTAATGTTTTTCGCTTTTTAATTATTACTTCATATTAGTTATGTAAAAAGAAAGTTAACTCTTATGACAGTGTATACATAGATCTACTTCACTGTTGTTGAAAGCATTTTCAGGTTGTTTGAATATTTCTATTATCAACTTCATCCTACTTGTGTCAACTTTGCGTTGTCTGTAGACTAATCTGTTTTTATAAAGGTACAT TGGTATTAGAATTTGTATCATGTTTACTGTTATTTCTTCACAAGTTGGTTGATTGCTTCTGTTGTTTTGTCATTTTTCCCCATCCTTGCGTTCATGCACATTCTTTGAACTCTTACTTTATTCGTATTAACCTCGTTTTCGTCTCTCCTACAAGTTAGTCATCCATCTTTGAGCTTTCGCATATAATAGTAAAATGTCAATATAACGATA ]
[-] EMBL CD138674             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AGTTTATCAGCATTCCCTTCTATATTCATCTTGATTTTATTAGTAATGTTTTTCGCTTTTTAATTATTACTTCATATTAGTTATGTAAAAAGAAAGTTAACTCTTATGACAGTGTATACATAGATCTACTTCACTGTTGTTGAAAGCATTTTCAGGTTGTTTGAATATTTCTATTATCAACTTCATCCTACTTGTGTCAACTTTGCGTTGTCTGTAGACTAATCTGTTTTTATAAAGGTACAT TGGTATTAGAATTTGTATCATGTTTACTGTTATTTCTTCACAAGTTGGTTGATTGCTTCTGTTGTTTTGTCATTTTTCCCCATCCTTGCGTTCATGCACATTCTTTGAACTCTTACTTTATTCGTATTAAC                                                                                ]
[-] EMBL CD164559             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTATATTCATCTTGATTTTATTAGTAATGTTTTTCGCTTTTTAATTATTACTTCATATTAGTTATGTAAAAAGAAAGTTAACTCTTATGACAGTGTATACATAGATCTACTTCACTGTTGTTGAAAGCATTTTCAGGTTGTTTGAATATTTCTATTATCAACTTCATCCTACTTGTGTCAACTTTGCGTTGTCTGTAGACTAATCTGTTTTTATAAAGGTACAT TGGTATTAGAATTTGTATCATGTTTACTGTTATTTCTTCACAAGTTGGTTGATTGCTTCTGTTGTTTTGTCATTTTTCCCCATCCTTGCGTTCATGCACATTCTTTGAACTCTCCCTTTATTCGTATTAACCTCGTTTTCGTCTCgtgt                                                              ]
[-] EMBL CD138664             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTATATTCATCTTGATTTTATTAGTAATGTTTTTCGCTTTTTAATTATTACTTCATATTAGTTATGTAAAAAGAAAGTTAACTCTTATGACAGTGTATACATAGATCTACTTCACTGTTGTTGAAAGCATTTTCAGGTTGTTTGAATATTTCTATTATCAACTTCATCCTACTTGTGTCAACTTTGCGTTGTCTGTAGACTAATCTGTTTTTATAAAGGTACATATGGTATTAGAATTTGTATAATGTTTACTGTTA                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD136508             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTGTCTGTAGACTAATCTGTTTTTATAAAGGTACAT TGGTATTAGAATTTGTATCATGTTTACTGTTATTTCTTCACAAGTTGGTTGATTGCTTCTGTTGTTTTGTCATTTTTCCCCATCCTTGCGTTCATGCACATTCTTTGAACTCTTACTTTATTCGTAga                                                                                   ]
[-] EMBL CD130321             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TAAAGGTACAT TGGTATTAGAATTTGTATCATGTTTACTGTTATTTCTTCACAAGTTGGTTGATTGCTTCTGCTGTTTTGTCATTTTTCCCCATCCTTGCGTTCATGCACATTCTTTGAACTCTTACTTTATTCGTATTAACCTCGTTTTCGTCTCTCCTACAAGTTAGTCAga                                                ]


>consensus_11155#2 CACGTTCTTNTTTCTTGTCCTTTTTGATCCCGGAGGTCGGAGTAGTAGCCATAAATACTT CGACTGTGATGCTATACTGACTAAAAGATGTCATCCCTCTCGTCATGATTATTGTCACCT GCAAGTCTAANTNAGAATTTGTTGATGTGATACATAATAAAAACCGTGATTCAGACAAAC TGTNAATATCATGGTAAACGTCTTTAGTTCTGAATAATCAATGCGATTACNTGTATTTGT TTCAGAAGCTCCGCCAGACTCTGTANCCAATCCACANAACGATCAGTCANCAGGTCCAGA AAGCTCGCCTGGTAGTGGCNGGAGTGGATTTACGACTTTTTTGGTTCCAGTTCCACACAT TCGTCTTCGGAGGCAACTGCTACAGAGTCTGCTAGTACAGTATCACCGAAATCTGGATTT ATATTTCAATAGATCTACCATTTTGTTGTATAATTCAATAGTAGACTTTGTTTACTGTCT TCCATTCATGCTTGTGTATATAAAAATAATCACGCTAGTGTACTATTCAATAATAACAAC AACAATAGGGATCCTCATAGTTTATCAGCATTCCCTTCTATATTCATCTTGATTTTATTA GTAATGTTTTTCGCTTTTTAATTATTACTTCATATTAGTTATGTAAAAAGAAAGTTAACT CTTATGACAGTGTATACATAGATCTACTTCACTGTTGTTGAAAGCATTTTCAGGTTGTTT GAATATTTCTATTATCAACTTCATCCTACTTGTGTCAACTTTGCGTTGTCTGTAGACTAA TCTGTTTTTATAAAGGTACATTGGTATTAGAATTTGTATCATGTTTACTGTTATTTCTTC ACAAGTTGGTTGATTGCTTCTGTTGTTTTGTCATTTTTCCCCATCCTTGCGTTCATGCAC ATTCTTTGAACTCTTACTTTATTCGTATTAACCTCGTTTTCGTCTCTCCTACAAGTTAGT CATCCATCTTTGAGCTTTCGCATATAATAGTAAAATGTCAATATAACGATAC



consensusID : consensus_11155#3
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 461
fasta sequence
                              [GAGCAATCGACAGCAGTAAACACTCCACCCCATATAGCGAACCCTCCACCCGTGATTGGTGCACGTGACGACTGTACCAATTGGCGCCTTTAACTAAGKTTTTTTTTTBGGTGGTAAACCCCCSGAAAGGAAGGCCGTTTTAACCGAATWAGCCCCTCCTTGTTAAGAAAAATTTTTWAAAAACCWMCTTAAHCCCGGCCCGTTWAAGACMAGGGCCCCCCCCTTTTGGCTTYCAACAWTCCATTGGGTAACCCGAAGRCCTCCGGAAWTTTCCGGTGAAATTCCAVGGGGGTBCCMAWWAAGGSCTGGTGTTTYCCCYKGTTGGTGGAAAAATTTTGKTTTAATCCCCGGCCTCCAACAAAWTTTCCCMACCAMCCAAACCWTTTAWCCGGAGDGCCCGGGAGAAAGCCWATTAAAAAAGKTGTGTDAAAAAAGCCCCTTGGGGGGGTTKGCCCYTAAAA]

[+] EMBL BE519439             [GAGCAATCGACAGCAGTAAACACTCCACCCCATATAGCGAACCCTCCACCCGTGATTGGTGCACGTGACGACTGTACCAATTGGCGCCTTTAACTAAGKTTTTTTTTTBGGTGGTAAACCCCCSGAAAGGAAGGCCGTTTTAACCGAATWAGCCCCTCCTTGTTAAGAAAAATTTTTWAAAAACCWMCTTAAHCCCGGCCCGTTWAAGACMAGGGCCCCCCCCTTTTGGCTTYCAACAWTCCATTGGGTAACCCGAAGRCCTCCGGAAWTTTCCGGTGAAATTCCAVGGGGGTBCCMAWWAAGGSCTGGTGTTTYCCCYKGTTGGTGGAAAAATTTTGKTTTAATCCCCGGCCTCCAACAAAWTTTCCCMACCAMCCAAACCWTTTAWCCGGAGDGCCCGGGAGAAAGCCWATTAAAAAAGKTGTGTDAAAAAAGCCCCTTGGGGGGGTTKGCCCYTAAAA]


>consensus_11155#3 GAGCAATCGACAGCAGTAAACACTCCACCCCATATAGCGAACCCTCCACCCGTGATTGGT GCACGTGACGACTGTACCAATTGGCGCCTTTAACTAAGKTTTTTTTTTBGGTGGTAAACC CCCSGAAAGGAAGGCCGTTTTAACCGAATWAGCCCCTCCTTGTTAAGAAAAATTTTTWAA AAACCWMCTTAAHCCCGGCCCGTTWAAGACMAGGGCCCCCCCCTTTTGGCTTYCAACAWT CCATTGGGTAACCCGAAGRCCTCCGGAAWTTTCCGGTGAAATTCCAVGGGGGTBCCMAWW AAGGSCTGGTGTTTYCCCYKGTTGGTGGAAAAATTTTGKTTTAATCCCCGGCCTCCAACA AAWTTTCCCMACCAMCCAAACCWTTTAWCCGGAGDGCCCGGGAGAAAGCCWATTAAAAAA GKTGTGTDAAAAAAGCCCCTTGGGGGGGTTKGCCCYTAAAA



consensusID : consensus_11155#4
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 331
fasta sequence
                              [CTCGCGGCCAGNAATTCGGTCCGAGGGGGAGCTGCTCTGGCTGTTCGTCATGGTCCAACAGCTATGGTCGGTCAAGCATTTGTTGGTGGCGTTATATTGGCAATTATCGAGGGACTTGGAATCATGATAAATAGATTCGCTCCTATGCTGATGCAAGCTCCGCCAGACTCTGTACCAAATCCACAAAACGATCAGTCATCAGGTCCAGGAAGCTCGCCTGGTAGTGGCGGGAGTGGATTTTACGACTTTTTTGGGTCCAGTTCCACACATTCGTCTTCGGAGGCAACTGCTACAGAGTCTGCTAGTACAGTATCACCGAAATCTGGATTTA]

[+] EMBL CD077820             [CTCGCGGCCAGNAATTCGGTCCGAGGGGGAGCTGCTCTGGCTGTTCGTCATGGTCCAACAGCTATGGTCGGTCAAGCATTTGTTGGTGGCGTTATATTGGCAATTATCGAGGGACTTGGAATCATGATAAATAGATTCGCTCCTATGCTGATGCAAGCTCCGCCAGACTCTGTACCAAATCCACAAAACGATCAGTCATCAGGTCCAGGAAGCTCGCCTGGTAGTGGCGGGAGTGGATTTTACGACTTTTTTGGGTCCAGTTCCACACATTCGTCTTCGGAGGCAACTGCTACAGAGTCTGCTAGTACAGTATCACCGAAATCTGGATTTA]


>consensus_11155#4 CTCGCGGCCAGNAATTCGGTCCGAGGGGGAGCTGCTCTGGCTGTTCGTCATGGTCCAACA GCTATGGTCGGTCAAGCATTTGTTGGTGGCGTTATATTGGCAATTATCGAGGGACTTGGA ATCATGATAAATAGATTCGCTCCTATGCTGATGCAAGCTCCGCCAGACTCTGTACCAAAT CCACAAAACGATCAGTCATCAGGTCCAGGAAGCTCGCCTGGTAGTGGCGGGAGTGGATTT TACGACTTTTTTGGGTCCAGTTCCACACATTCGTCTTCGGAGGCAACTGCTACAGAGTCT GCTAGTACAGTATCACCGAAATCTGGATTTA



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_11155#0      CTCGNAGGCCAAAATTCGGCACGAGGTGTATCCTCATTGTTCCCATCATTACTATTACTG 60
consensus_11155#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11155#1      ------------------------------------------------------------
consensus_11155#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11155#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11155#0      CTATTATTATTATTATTATTATTATCACTACTATTTTTAGTGTAATTCATCCATTCTCTC 120
consensus_11155#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11155#1      ----------------------------------------GACGAGTTCAGCAGAGATCC 20
consensus_11155#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11155#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11155#0      TTTTATTTCTTAATCTTGTGCAAATATTATCACTTCAACCTGTTTGGTTAGTGTTGTTGA 180
consensus_11155#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11155#1      CTGTCCGTTTCGTATCGTCAGCGATTGTGGAGCTGCATTTGCTATGGGTACTATCGGTGG 80
consensus_11155#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11155#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11155#0      GTTTCTGCTGTCGGTATATCGTTTTTATTAGTTATATGCTACATCCAATTTTAGAAAATA 240
consensus_11155#2      ------------------------------------------------------------
consensus_11155#1      TAGTGTTTTACATTTCTACAGAGGCTATCGTAACGCTCCTTCGGGTTATACAAAAAAACT 140
consensus_11155#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11155#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11155#0      TTTTAAACTATTCTTATGCAGTATACTCTTGTTTTGTAGTTTGGTCCTTAACTTTACATC 300
consensus_11155#2      ---------------------------CACGTTCTTNTTTCTTGTCCTT---TTTGATCC 30
consensus_11155#1      AGTAAGCGCAATGGTTAACAGTCGTCAACGTGCACCAATCACGGGTGGAGGGTTCGCTAT 200
consensus_11155#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11155#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11155#0      TGAACATTTAGAAAAGAGTAGTTGTGTTTACAACTCACACATCTTTCAGTATCATATGAT 360
consensus_11155#2      CGGAGGTCGGAGTAGTAGCCATAAATACTTCGACTGTGATGCTATACTG-ACTAAAAGAT 89
consensus_11155#1      ATGGGGTGGAGTGTTTACTGCTGTCGATTGCTCTTTAGTTCTTGCTCGT--CGAAAAGAG 258
consensus_11155#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11155#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11155#0      ATT-TATATTTAGTAACAACACATGCAAAAGATCTATATAACTGAGGGAGATTTTTTTGT 419
consensus_11155#2      GTCATCCCTCTCGTCATGATTATTGTCA----CCTGCAAGTCTAANTNAGAATTTGTTG- 144
consensus_11155#1      GATCCGTGGAATTCCATCACTAGTGGGG-----------CTATAACGGGAGCTGCTCTGG 307
consensus_11155#4      ---------CTCGCGGCCAGNAATTCGG-----------TCCGAGGGGGAGCTGCTCTGG 40
consensus_11155#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11155#0      GTGTATCGTTGAATTACTAATTATATTTAAAAACCGTTGATTTCCAGAAACAAACTTGTA 479
consensus_11155#2      ATGTGATACATAAT--------------AAAAACCGT-GATTC----AGACAAACTGTNA 185
consensus_11155#1      CTGTTCGTCATGGTC------------CAACAGCTATGGTCGGTCAAGCATTTGTTGGTG 355
consensus_11155#4      CTGTTCGTCATGGTC------------CAACAGCTATGGTCGGTCAAGCATTTGTTGGTG 88
consensus_11155#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11155#0      AAGTTATACATGTGTAAAACGTCTTTTAGTTTCTTGAATTAATCAATGCCGATTAACTGT 539
consensus_11155#2      ATATCAT------GGTAAACGTCTTT-AGTTC--TGAAT-AATCAATGC-GATTACNTGT 234
consensus_11155#1      GCGTTATAT---TGGCAATTATCGAGGGACTT--GGAATCATGATAAATAGATTCGCT-C 409
consensus_11155#4      GCGTTATAT---TGGCAATTATCGAGGGACTT--GGAATCATGATAAATAGATTCGCT-C 142
consensus_11155#3      --------------------------------GAGCAATCGACAGCAGTAAACACTCCAC 28
                                                           ***            *        

consensus_11155#0      ATTTTGTTTCAGAAGCTCCGCCAGACTCTGTACCAAATCCACAAAACGATCAGTCACCAG 599
consensus_11155#2      ATTT-GTTTCAGAAGCTCCGCCAGACTCTGTANCCAATCCACANAACGATCAGTCANCAG 293
consensus_11155#1      CTATGCTGATGCAAGCTCCGCCAGACTCTGTACCAAATCCACAAAACGATCAGTCATCAG 469
consensus_11155#4      CTATGCTGATGCAAGCTCCGCCAGACTCTGTACCAAATCCACAAAACGATCAGTCATCAG 202
consensus_11155#3      CCCATATAGCGAACCCTCCACCCGTGATTGGTGCACGTG-ACGACTGTACCAATTGGCGC 87
                             *     *  **** ** *    **   *   *  **      * ** *   *  

consensus_11155#0      GTCCAG--GAAGCTCGCCTGGTAGTGGCGGGAGT--GGATTNTACGACTNTTTTGGTTCC 655
consensus_11155#2      GTCCAG--AAAGCTCGCCTGGTAGTGGCNGGAGT--GGATTT-ACGACTTTTTTGGTTCC 348
consensus_11155#1      GTCCAG--GAAGCTCGCCTGGTAGTGGCGGGAGT--GGATTTTACGACTTTTTTGGTTCC 525
consensus_11155#4      GTCCAG--GAAGCTCGCCTGGTAGTGGCGGGAGT--GGATTTTACGACTTTTTTGGGTCC 258
consensus_11155#3      CTTTAACTAAGKTTTTTTTTTBGGTGGTAAACCCCCSGAAAGGAAGGCCGTTTTAA--CC 145
                        *  *    *   *    *    ****          **    * * *  ****    **

consensus_11155#0      AGTTCCACACATTCGTCTTCGGAGGCAACTGCTACAGAGTCTGCT-AGTACTGTATCACC 714
consensus_11155#2      AGTTCCACACATTCGTCTTCGGAGGCAACTGCTACAGAGTCTGCT-AGTACAGTATCACC 407
consensus_11155#1      AGTTCCACACATTCGTCTTCGGAGGCAACTGCTACAGAGTCTGCT-AGTACAGTATCACC 584
consensus_11155#4      AGTTCCACACATTCGTCTTCGGAGGCAACTGCTACAGAGTCTGCT-AGTACAGTATCACC 317
consensus_11155#3      GAATWAGCCCCTCCTTGTTAAGAAA-AATTTTTWAAAAACCWMCTTAAHCCCGGCCCGTT 204
                          *   * * * * * **  **   ** *  *  * *  *  ** *   * *   *   

consensus_11155#0      GAA-ATCTGGATTTATATTTCAATAGATCTACCATTTTGTTGTATAATTCAATAGTAGAC 773
consensus_11155#2      GAA-ATCTGGATTTATATTTCAATAGATCTACCATTTTGTTGTATAATTCAATAGTAGAC 466
consensus_11155#1      GAA-ATCTGGATTTATATTTCAATAGATCTACCATTTTGTTGTATAATTCAATAGTAGAC 643
consensus_11155#4      GAA-ATCTGGATTTA--------------------------------------------- 331
consensus_11155#3      WAAGACMAGGGCCCCCCCCTTTTGGCTTYCAACAWTCCATTGGGTAACCCGAAGRCCTCC 264
                        ** *   **                                                  

consensus_11155#0      TTTGTTTACTGTCTTCCATTCATGCTTGTGTATATAAAAATAATCACGCTAGTGTACTAT 833
consensus_11155#2      TTTGTTTACTGTCTTCCATTCATGCTTGTGTATATAAAAATAATCACGCTAGTGTACTAT 526
consensus_11155#1      TTTGTTTACTGTCTTCCATTCATGCTTGTGTATATAAAAATAATCACGCTAGTGTACTAT 703
consensus_11155#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11155#3      GGAAWTTTCCGGTGAAATTCCAVGGGGGTBCCMAWWAAGG-------SCTGGTGTTTYCC 317
                                                                                   

consensus_11155#0      TCAATAATAACGACAACAATAGG--GATCCTCATAGTTTATCAGCATTCCCTTCTATATT 891
consensus_11155#2      TCAATAATAACAACAACAATAGG--GATCCTCATAGTTTATCAGCATTCCCTTCTATATT 584
consensus_11155#1      TCAATAATAACGACAACAATAGG--GATCCTCATAGTTTATCAGCATTCCCTTCTATATT 761
consensus_11155#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11155#3      CYKGTTGGTGGAAAAATTTTGKTTTAATCCCCGGCCTCCAACAAAWTTTCCC-----MAC 372
                                                                                   

consensus_11155#0      CATCTTGATTTTATTAGTAATGTTTTTCGCTTTTTAATTATTACTTCATATT-AGTTATG 950
consensus_11155#2      CATCTTGATTTTATTAGTAATGTTTTTCGCTTTTTAATTATTACTTCATATT-AGTTATG 643
consensus_11155#1      CATCTTGATTTTATTAGTAATGTTTTTCGCTTTTTAATTATTACTTCATATNTAGTTATG 821
consensus_11155#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11155#3      CAMCCAAACCWTTTAWCCGGAGDGCCCGGGAGAAAGCCWATTA------AAAAAGKTGTG 426
                                                                                   

consensus_11155#0      TAAAAA-GAAAGTTAACT-CTTATGACAG-TGTATACATAGATCTAC---TTCACTGTTG 1004
consensus_11155#2      TAAAAA-GAAAGTTAACT-CTTATGACAG-TGTATACATAGATCTAC---TTCACTGTTG 697
consensus_11155#1      TAAAANAGAAAGTTAACTTCTTATGACAGGTGTATACATAGTATTCTACTTTCACTGTTG 881
consensus_11155#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11155#3      TDAAAA-------AAGCCCCTTGGGGGGG-TTKGCCCYTAAAA----------------- 461
                                                                                   

consensus_11155#0      TTGA-AAGCATTTTCAGGTTGTTTGAATATTTCTATTATCAACTTCATCCTACTTGTGTC 1063
consensus_11155#2      TTGA-AAGCATTTTCAGGTTGTTTGAATATTTCTATTATCAACTTCATCCTACTTGTGTC 756
consensus_11155#1      TTNNGAAAGACATTTTCANNGGTTGTTTGNNAATATTTTCTATATATCAACTTTCATTCC 941
consensus_11155#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11155#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11155#0      AACTTTGCGTTGTCTGTAGACTAATCTGTTTTTATAAAGGTACATTGGTATTAGAATTTG 1123
consensus_11155#2      AACTTTGCGTTGTCTGTAGACTAATCTGTTTTTATAAAGGTACATTGGTATTAGAATTTG 816
consensus_11155#1      TACTTGTGNTTCAACTTTGCNGTTGTTCTGTAGACATAATTCTGTTTNTTATAAAGGTCA 1001
consensus_11155#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11155#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11155#0      TATCATGTTTACTGTTATTTCTTCACAAGTTG-GTTGATTGCTTCTGTTGTTTTGTCATT 1182
consensus_11155#2      TATCATGTTTACTGTTATTTCTTCACAAGTTG-GTTGATTGCTTCTGTTGTTTTGTCATT 875
consensus_11155#1      CATATGGTATATAGAAATTTGTATACATGTTGTACTGTTATCTTCTATCACCAAGTTGGT 1061
consensus_11155#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11155#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11155#0      TTTCCCCATCCTTGC-GTTCATGCACATTCTTTGAACTCTTACTTTATTCGTATTAACCT 1241
consensus_11155#2      TTTCCCCATCCTTGC-GTTCATGCACATTCTTTGAACTCTTACTTTATTCGTATTAACCT 934
consensus_11155#1      ATGATTGCTCTCTGTTGTGTTTGTACATTTTTCCGCCATGCCTTGCGTTCATCGCACATT 1121
consensus_11155#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11155#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11155#0      CGTTTTCGTCTCTCCTACAAGTTAGTCATCCATCTTTGAGCTTTCGCATATAATAGTAAA 1301
consensus_11155#2      CGTTTTCGTCTCTCCTACAAGTTAGTCATCCATCTTTGAGCTTTCGCATATAATAGTAAA 994
consensus_11155#1      CATTTGAACTCTCTACTTTAATTCGTATTAAC---------------------------- 1153
consensus_11155#4      ------------------------------------------------------------
consensus_11155#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11155#0      ATGTCAATATAACGATACTATCTCTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1356
consensus_11155#2      ATGTCAATATAACGATAC------------------------------------- 1012
consensus_11155#1      -------------------------------------------------------
consensus_11155#4      -------------------------------------------------------
consensus_11155#3      -------------------------------------------------------
                                                                              




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)