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Schistosoma mansoni
cluster # 1119 cluster # 1119       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1119#0 length = 730 sequences # 2  

consensusID : consensus_1119#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 730
fasta sequence
                              [AAAAAAAAACGTAAAAAATGTTTGACGAGGAAACAAAAGGCTGAAACTATTCCCTTAGTTCTCAATAAACAATATGGCTAAAGCTCGTAAAATACCCAATGCCACCAAAGAGGAACTCATGGTTTTAACCGTGAGTGAAATAATCTCACACCTTTTAAAGGCTATCGAGGAAAAACGTGATGTTGATTTAAATAAACTGAAATCAGTGATATCTAGTAAATATGGTTTAGCCTCACAACCACGACTGGTTGATTTAATCGCAGCTGTACCAACAGAACATAGACATGTGCTGTTGCCACATTTGAAAGCGAAACCAGTGAGATCAGCTAGTGGGATTGTAGTTATAGCAGTTATGTGTAAACCTCACCGATGTCCTCATATAGCTGTGACCGGGAATGTTTGCGTCTATTGTCCAGGTGGACCAGATTCTGATTTTGAATACTCCACACAGTCGTATACTGGATATGAGCCCACTTCAATGCGTGCTATTCGAGCTCGTTACAATCCTTTTATTCAAACACGGCATCGAATTGAACAACTTCAACAACTGGGACATACATGTGATAAAGTTGAATTTATTGTTATGGGGGGAACGTTTATGTGTCTTTCTGAAGACTATCGGGATTATTTCATTAGAAGTTTACATGATGCACTATCTGGTCATACAAGCCAAAACGTTGACGAAGCTGTGAGTTATTCTGAACGAAGTAAAACAAAATGTGTTGGAATC]

[+] EMBL CD181058             [AAAAAAAAACGTAAAAAATGTTTGACGAGGAAACAAAAGGCTGAAACTATTCCCTTAGTTCTCAATAAACAATATGGCTAAAGCTCGTAAAATACCCAATGCCACCAAAGAGGAACTCATGGTTTTAACCGTGAGTGAAATAATCTCACACCTTTTAAAGGCTATCGAGGAAAAACGTGATGTTGATTTAAATAAACTGAAATCAGTGATATCTAGTAAATATGGTTTAGCCTCACAACCACGACTGGTTGATTTAATCGCAGCTGTACCAACAGAACATAGACATGTGCTGTTGCCACATTTGAAAGCGAAACCAGTGAGATCAGCTAGTGGGATTGTAGTTATAGCAGTTATGTGTAAACCTCACCGATGTCCTCATATAGCTGTGACCGGGAATGTTTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD118962             [                                                                                                                                                                                                                                                         TGATTTAATCGCAGCTGTACCAACAGAACATAGACATGTGCTGTTGCCACATTTGAAAGCGAAACCAGTGAGATCAGCTAGTGGGATTGTAGTTATAGCAGTTATGTGTAAACCTCACCGATGTCCTCATATAGCTGTGACCGGGAATGTTTGCGTCTATTGTCCAGGTGGACCAGATTCTGATTTTGAATACTCCACACAGTCGTATACTGGATATGAGCCCACTTCAATGCGTGCTATTCGAGCTCGTTACAATCCTTTTATTCAAACACGGCATCGAATTGAACAACTTCAACAACTGGGACATACATGTGATAAAGTTGAATTTATTGTTATGGGGGGAACGTTTATGTGTCTTTCTGAAGACTATCGGGATTATTTCATTAGAAGTTTACATGATGCACTATCTGGTCATACAAGCCAAAACGTTGACGAAGCTGTGAGTTATTCTGAACGAAGTAAAACAAAATGTGTTGGAATC]


>consensus_1119#0 AAAAAAAAACGTAAAAAATGTTTGACGAGGAAACAAAAGGCTGAAACTATTCCCTTAGTT CTCAATAAACAATATGGCTAAAGCTCGTAAAATACCCAATGCCACCAAAGAGGAACTCAT GGTTTTAACCGTGAGTGAAATAATCTCACACCTTTTAAAGGCTATCGAGGAAAAACGTGA TGTTGATTTAAATAAACTGAAATCAGTGATATCTAGTAAATATGGTTTAGCCTCACAACC ACGACTGGTTGATTTAATCGCAGCTGTACCAACAGAACATAGACATGTGCTGTTGCCACA TTTGAAAGCGAAACCAGTGAGATCAGCTAGTGGGATTGTAGTTATAGCAGTTATGTGTAA ACCTCACCGATGTCCTCATATAGCTGTGACCGGGAATGTTTGCGTCTATTGTCCAGGTGG ACCAGATTCTGATTTTGAATACTCCACACAGTCGTATACTGGATATGAGCCCACTTCAAT GCGTGCTATTCGAGCTCGTTACAATCCTTTTATTCAAACACGGCATCGAATTGAACAACT TCAACAACTGGGACATACATGTGATAAAGTTGAATTTATTGTTATGGGGGGAACGTTTAT GTGTCTTTCTGAAGACTATCGGGATTATTTCATTAGAAGTTTACATGATGCACTATCTGG TCATACAAGCCAAAACGTTGACGAAGCTGTGAGTTATTCTGAACGAAGTAAAACAAAATG TGTTGGAATC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)