cluster # 1174

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Schistosoma mansoni
cluster # 1174 cluster # 1174 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1174#0 length = 977 sequences # 2

consensusID : consensus_1174#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 977
fasta sequence

                              [CGAGCCAANAATTCGGCACGAGGATTATATCAAAGTGAAAGTATTTTATCTACATTGAAATTATATAGTGATCAATTTTTTACTGTCCAATTACAACAACCTATTACTATTCCACCGGGGGATAAAGTTTACGCTCTTGTTTCATTGGTTAATCCACAAAAAACAAGTAAATTAATATTGGAGAACTGTTGGGCAACTGCTACTCCCAATCGTAATTCAACACCAAGACGAAATTTAATTGTTAATAGATGTGCTGCATATGAAAATCTTACGGTTATTCCATCTTCAGCAACACAAGTCGGTTTCACATTTAATGCATTTTATTTAAATACTGCTGGATCAGTAGTTCCTATCAATTCAAATCTTTTTCTACATTGTGATATACGTGTATGTGATTTAAGAGAGATTAATGAAAATTGTCAACAGTATTGTCAATCATCAATAATATTTCCAACATTATCACCATTAACTACAATAAACACAACATCAACTGGCGTTCAACCAGTGAAAAGATATAGACGTGATTTAAATTTTATCAATCCAAAATTTCTTCAATCACATGGACACATTCATGTTGACAGTGGACAAATTATGACAGTGTAATAACAATAATAGTATTATTATTAATGATATAAATCATCATTATTCTAACTATGTACACAAACTTTTTCCCCATAGATCAATCACATTCAATTATCAATGGATAATTATTCAAATGTATTCAATCCAAATTAGTTATTAATTAAGAATTTTTGTATACGCTTTTGATATTGAAAAAGACAGTATTCTAAACAAAACAAAAAAGAATCAATATATTTTATCATAGATTGTCTGTCGTATTATCTCCATAGAGTAACTCAGTTTACATTGTTTAAACCATAAGTTTATTTATAGTTATCTGTTGTTTGTTCGTTCATTTGTTTACCTTTTCCCTTTTTGTTATAAATATTTAACCAGTTCATCTTAAATAAATTTAT]

[+] EMBL CD082537             [CGAGCCAANAATTCGGCACGAGGATTATATCAAAGTGAAAGTATTTTATCTACATTGAAATTATATAGTGATCAATTTTTTACTGTCCAATTACAACAACCTATTACTATTCCACCGGGGGATAAAGTTTACGCTCTTGTTTCATTGGTTAATCCACAAAAAACAAGTAAATTAATATTGGAGAACTGTTGGGCAACTGCTACTCCCAATCGTAATTCAACACCAAGACGAAATTTAATTGTTAATAGATGTGCTGCATATGAAAATCTTACGGTTATTCCATCTTCAGCAACACAAGTCGGTTTCACATTTAATGCATTTTATTTAAATACTGCTGGATCAGTAGTTCCTATCAATTCAAATCTTTTTCTACATTGTGATATACGTGTATGTGATTTAAGAGAGATTAATGAAAATTGTCAACAGTATTGTCAATCATCAATAATATTTCCAACATTATCACCATTAACTACAATAAACACAACATCAACTGGCGTTCAACCAGTGAAAAGATATAGACGTGATTTAAATTTTATCAATCCAAAATTTCTTCAATCACATGGACACATTCATGTTGACAGTGGACAAATTATGACAGTGTAATAACAATAATAGTATTATTATTAATGATATAAATCATCATTATTCTAACTATGTACACAAACTTTTTCCCCATAGATCAATCACATTCAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD076135             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTGCTGGATCAGTAGTTCCTATCAATTCAAATCTTTTTCTACATTGTGATATACGTGTATGTGATTTAAGAGAGATTAATGAAAATTGTCAACAGTATTGTCAATCATCAATAATATTTCCAACATTATCACCATTAACTACAATAAACACAACATCAACTGGCGTTCAACCAGTGAAAAGATATAGACGTGATTTAAATTTTATCAATCCAAAATTTCTTCAATCACATGGACACATTCATGTTGACAGTGGACAAATTATGACAGTGTAATAACAATAATAGTATTATTATTAATGATATAAATCATCATTATTCTAACTATGTACACAAACTTTTTCCCAATAGATCAATCACATTCAATTATCAATGGATAATTATTCAAATGTATTCAATCCAAATTAGTTATTAATTAAGAATTTTTGTATACGCTTTTGATATTGAAAAAGACAGTATTCTAAACAAAACAAAAAAGAATCAATATATTTTATCATAGATTGTCTGTCGTATTATCTCCATAGAGTAACTCAGTTTACATTGTTTAAACCATAAGTTTATTTATAGTTATCTGTTGTTTGTTCGTTCATTTGTTTACCTTTTCCCTTTTTGTTATAAATATTTAACCAGTTCATCTTAAATAAATTTAT]




>consensus_1174#0
CGAGCCAANAATTCGGCACGAGGATTATATCAAAGTGAAAGTATTTTATCTACATTGAAA
TTATATAGTGATCAATTTTTTACTGTCCAATTACAACAACCTATTACTATTCCACCGGGG
GATAAAGTTTACGCTCTTGTTTCATTGGTTAATCCACAAAAAACAAGTAAATTAATATTG
GAGAACTGTTGGGCAACTGCTACTCCCAATCGTAATTCAACACCAAGACGAAATTTAATT
GTTAATAGATGTGCTGCATATGAAAATCTTACGGTTATTCCATCTTCAGCAACACAAGTC
GGTTTCACATTTAATGCATTTTATTTAAATACTGCTGGATCAGTAGTTCCTATCAATTCA
AATCTTTTTCTACATTGTGATATACGTGTATGTGATTTAAGAGAGATTAATGAAAATTGT
CAACAGTATTGTCAATCATCAATAATATTTCCAACATTATCACCATTAACTACAATAAAC
ACAACATCAACTGGCGTTCAACCAGTGAAAAGATATAGACGTGATTTAAATTTTATCAAT
CCAAAATTTCTTCAATCACATGGACACATTCATGTTGACAGTGGACAAATTATGACAGTG
TAATAACAATAATAGTATTATTATTAATGATATAAATCATCATTATTCTAACTATGTACA
CAAACTTTTTCCCCATAGATCAATCACATTCAATTATCAATGGATAATTATTCAAATGTA
TTCAATCCAAATTAGTTATTAATTAAGAATTTTTGTATACGCTTTTGATATTGAAAAAGA
CAGTATTCTAAACAAAACAAAAAAGAATCAATATATTTTATCATAGATTGTCTGTCGTAT
TATCTCCATAGAGTAACTCAGTTTACATTGTTTAAACCATAAGTTTATTTATAGTTATCT
GTTGTTTGTTCGTTCATTTGTTTACCTTTTCCCTTTTTGTTATAAATATTTAACCAGTTC
ATCTTAAATAAATTTAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case