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Schistosoma mansoni
cluster # 1183 cluster # 1183       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1183#0 length = 971 sequences # 2  

consensusID : consensus_1183#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 971
fasta sequence
                              [GCAGGCCANAATTCGGCACGAGGGNAGTTGAAAAAATAACAACAACATACTGTGTCACCAAAAGTACTTTTAAATTCTATATCTATAAAATATAGATTATAATGCATGTTTGTACAAGATTCCAATCATAGGTCTATTCATTTCTCTGAAAAATTCATCTTTTAAAATCGTCTTACATTATTCGAAATGCTATTTGCATAACGTATTGAAGATACAACCTAAAATTCATTTGTGATGGATTCTGATCAGTCTTGGTTGCCATATGTGGATCCTTCACTGATTGCCTCGATGCAGTAGGTATCTTTCAGTCCTTTATGGAATAAGTGACATTTGATTAGGGGGATGAAACGCGCGTCCTTGATTCCATTGTTAGACACATTCCATCTGTTCTGTGAATCTTAAATTTTAGGTATTTCATATTACCAAGTTTTAGAATTTAATCTAACTAAGTAATTCAAGTCTTTTTCTTCCAGTAATTGCTTGTATTTGTCATTTTACTATGCATATAGGATTTCACCAGAATAATATCTTGTTCAAAAGACTTTGTACCTGTTGGTTAGACCTTTGTTTTCGCAAGTTTCTTTNTATCATAATTAAAAATTACGACCTAATTTCTTTCATACTGGCAGATCGAAACGTTNTCTCTGCTAGGTTTTGGTAGTAAACCATAACGATAGAATGTGACCCAGTTACAAATTTGTGGAAAAAAATCTGTAGGCTTACAGTAATGTCATTAACTTTTGCTATCTTACTTGTATATATGCTAATTTTATATTGATTGTGAGGTTTTTGTGAGCCAGTTTATCGTAACCCTATGATGTATTTCTAATTTCTGTTTATGTTGTAGATGAATTTTACAAACTTCTTGCTCCATTAGGATGTCATAGTTGGATCGATCTTATTTTTACACGTTTCAAGAGATAATTACGTCTCTGTTGAGTATGTACAGCCTATTTCTAAAAAAGAAAATG]

[+] EMBL CD082557             [GCAGGCCANAATTCGGCACGAGGGNAGTTGAAAAAATAACAACAACATACTGTGTCACCAAAAGTACTTTTAAATTCTATATCTATAAAATATAGATTATAATGCATGTTTGTACAAGATTCCAATCATAGGTCTATTCATTTCTCTGAAAAATTCATCTTTTAAAATCGTCTTACATTATTCGAAATGCTATTTGCATAACGTATTGAAGATACAACCTAAAATTCATTTGTGATGGATTCTGATCAGTCTTGGTTGCCATATGTGGATCCTTCACTGATTGCCTCGATGCAGTAGGTATCTTTCAGTCCTTTATGGAATAAGTGACATTTGATTAGGGGGATGAAACGCGCGTCCTTGATTCCATTGTTAGACACATTCCATCTGTTCTGTGAATCTTAAATTTTAGGTATTTCATATTACCAAGTTTTAGAATTTAATCTAACTAAGTAATTCAAGTCTTTTTCTTCCAGTAATTGCTTGTATTTGTCATTTTACTATGCATATAGGATTTCACCAGAATAATATCTTGTTCAAAAGACTTTGTACCTGTTGGTTAGACCTTTGTTTTCGCAAGTTTCTTTNTATCATAATTAAAAATTACGACCTAATTTCTTTCATACTGGCAGATCGAAACGTTNTCTCTGCTAGGTTTTGGTAGTAAACCATAACGATAGAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD076155             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GGTATTTCATATTACCAAGTTTTAGAATTTAATCTAACTAAGTAATTCAAGTCTTTTTCTTCCAGTAATTGCTTGTATTTGTCATTTTACTATGCATATAGGATTTCACCAGAATAATATCTTGTTCAAAAGACTTTGTACCTGTTGGTTAGACCTTTGTTTTCGCAAGTTTCTTTTTATCATAATTAAAAATTACGACCTAATTTTTTTCATACTGGCAGATCGAAACGTTTTCTCTGCTAGGTTTTGGTAGTAAACCATAACGATAGAATGTGACCCAGTTACAAATTTGTGGAAAAAAATCTGTAGGCTTACAGTAATGTCATTAACTTTTGCTATCTTACTTGTATATATGCTAATTTTATATTGATTGTGAGGTTTTTGTGAGCCAGTTTATCGTAACCCTATGATGTATTTCTAATTTCTGTTTATGTTGTAGATGAATTTTACAAACTTCTTGCTCCATTAGGATGTCATAGTTGGATCGATCTTATTTTTACACGTTTCAAGAGATAATTACGTCTCTGTTGAGTATGTACAGCCTATTTCTAAAAAAGAAAATG]


>consensus_1183#0 GCAGGCCANAATTCGGCACGAGGGNAGTTGAAAAAATAACAACAACATACTGTGTCACCA AAAGTACTTTTAAATTCTATATCTATAAAATATAGATTATAATGCATGTTTGTACAAGAT TCCAATCATAGGTCTATTCATTTCTCTGAAAAATTCATCTTTTAAAATCGTCTTACATTA TTCGAAATGCTATTTGCATAACGTATTGAAGATACAACCTAAAATTCATTTGTGATGGAT TCTGATCAGTCTTGGTTGCCATATGTGGATCCTTCACTGATTGCCTCGATGCAGTAGGTA TCTTTCAGTCCTTTATGGAATAAGTGACATTTGATTAGGGGGATGAAACGCGCGTCCTTG ATTCCATTGTTAGACACATTCCATCTGTTCTGTGAATCTTAAATTTTAGGTATTTCATAT TACCAAGTTTTAGAATTTAATCTAACTAAGTAATTCAAGTCTTTTTCTTCCAGTAATTGC TTGTATTTGTCATTTTACTATGCATATAGGATTTCACCAGAATAATATCTTGTTCAAAAG ACTTTGTACCTGTTGGTTAGACCTTTGTTTTCGCAAGTTTCTTTNTATCATAATTAAAAA TTACGACCTAATTTCTTTCATACTGGCAGATCGAAACGTTNTCTCTGCTAGGTTTTGGTA GTAAACCATAACGATAGAATGTGACCCAGTTACAAATTTGTGGAAAAAAATCTGTAGGCT TACAGTAATGTCATTAACTTTTGCTATCTTACTTGTATATATGCTAATTTTATATTGATT GTGAGGTTTTTGTGAGCCAGTTTATCGTAACCCTATGATGTATTTCTAATTTCTGTTTAT GTTGTAGATGAATTTTACAAACTTCTTGCTCCATTAGGATGTCATAGTTGGATCGATCTT ATTTTTACACGTTTCAAGAGATAATTACGTCTCTGTTGAGTATGTACAGCCTATTTCTAA AAAAGAAAATG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)