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Schistosoma mansoni
cluster # 1285 cluster # 1285       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1285#0 length = 537 sequences # 2  

consensusID : consensus_1285#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 537
fasta sequence
                              [ACCTAGACAATGGAGTTGTGTTTATTGGCTCAACACTTGGGGACTCACAGCTAATTCGTTTAAATCCTGACCCAGATCCTGAGCGTAATAGCTATATAACTATTTTAGAAACATATACAAATATTGGACCGATAGTTGACATGGTCTTATTAGAAACAAAAGGTCAGAATCAGTTGATCACTTGCTCAGGAGCTTATAAAGAAGGAAGTCTACGTGTTATACGCAATGGAATTGGAATTCACGAACATGCTACTATTGATCAAGATCTAATTAAAGGTGCTTGGTGCTTCCCCATTGAATCGGATCGTTTCGATGATACAATTGTAGTATCTATGGTTGGTCAGACCCAACTTCTTCACCTTGCCGATGATGATATTACAGCTCTACACTTGGAAGGTTNTAAGACTGATGAACAAACTGTTTATTGTGCCACACTATCACCTGCTAATGATTCACCTAGGCCAGAATCTATGATGATTGACGAGAATAATAATACGTTAGATCCTTTACTGGTACAAGCAACAACAAGTGGCTTAC]

[+] EMBL AI977415             [ACCTAGACAATGGAGTTGTGTTTATTGGCTCAACACTTGGGGACTCACAGCTAATTCGTTTAAATCCTGACCCAGATCCTGAGCGTAATAGCTATATAACTATTTTAGAAACATATACAAATATTGGACCGATAGTTGACATGGTCTTATTAGAAACAAAAGGTCAGAATCAGTTGATCACTTGCTCAGGAGCTTATAAAGAAGGAAGTCTACGTGTTATACGCAATGGAATTGGAATTCACGAACATGCTACTATTGATCAAGATCTAATTAAAGGTGCTTGGTGCTTCCCCATTGAATCGGATCGTTTCGATGATACAATTGTAGTATCTATGGTTGGTCAGACCCAACTTCTTCACCTTGCCGATGATGATATTACAGCTCTACACTTGGAAGGTTNTAAGACTGATGAACAAACTGTTTATTGTGCCACACTATCACCTGCTAATGATTCACCTAGGCCAGAATCTATGATGATTGACGAGAATAATAATACGTTAGATCCTTTACTGGTACAAGCAACAACAAGTGGCTTAC]
[-] EMBL CD131107             [                                                                                                                                    TAGTTGACATGGTCTTATTAGAAACAAAAGGTCAGAGTCAGTTGATCACTTGCTCAGGAGCTTATAAAGAAGGAAGTCTACGTGTTATACGCAATGGAATTGGAATTCACGAACATGCTACTATTGATCAAGATCTAATTAAAGGTGCTTGGTGCTTCCCCATTGAATCGGATCGTTTCGATGATACAATTGTAGTATCTATGGTTGGTCAGACCCAACTTCTTCACCTTGCCGATGATGATATTACAGCTCTACACTTGGAAGGTTTTAAGACTGATGAACAAACTGTTTATTGTGCCACACTATCACCTGCTAAT                                                                                        ]


>consensus_1285#0 ACCTAGACAATGGAGTTGTGTTTATTGGCTCAACACTTGGGGACTCACAGCTAATTCGTT TAAATCCTGACCCAGATCCTGAGCGTAATAGCTATATAACTATTTTAGAAACATATACAA ATATTGGACCGATAGTTGACATGGTCTTATTAGAAACAAAAGGTCAGAATCAGTTGATCA CTTGCTCAGGAGCTTATAAAGAAGGAAGTCTACGTGTTATACGCAATGGAATTGGAATTC ACGAACATGCTACTATTGATCAAGATCTAATTAAAGGTGCTTGGTGCTTCCCCATTGAAT CGGATCGTTTCGATGATACAATTGTAGTATCTATGGTTGGTCAGACCCAACTTCTTCACC TTGCCGATGATGATATTACAGCTCTACACTTGGAAGGTTNTAAGACTGATGAACAAACTG TTTATTGTGCCACACTATCACCTGCTAATGATTCACCTAGGCCAGAATCTATGATGATTG ACGAGAATAATAATACGTTAGATCCTTTACTGGTACAAGCAACAACAAGTGGCTTAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)