cluster # 1314

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Schistosoma mansoni
cluster # 1314 cluster # 1314 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1314#0 length = 1040 sequences # 2

consensusID : consensus_1314#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1040
fasta sequence

                              [GGCCAGAATTCGGCACGAGGACTATGTCATGATGAGTAGAAAGTACTTGTGTACTGTCATCTGGTATTCTGATGTACTGAAGGAAGGTTAAGGGGATGGAAAATTGATGTGAGATATTGACCAGTTGACAAATACAATGGTGAAGTAGGTGGGCTATTAAGAACACACACATCCATTCTTAAATAACTCACTACAATTTCACAGAATGCTTTTGCATTAATCATTTTCAGATGATCAAGTTAGCAAACTAAATAATAGAGAAAAATAGCATTAAGGTAAACGCTGACATAAACTATAATATTTTGTCCTAGTATGGGACTACTTGACAATGTACATCCACGATCTCACCCACGAGATTCGAACCCATAACTGTTCGATCCAATGCTTCCATGTTTCCTAGCCATAAAATGAATTCAATCATTAAATTACTAAAATCTCCATAATTCACCCTTCTAATTATAATATTTTGTGTTTAGTCCTAGCCGTCATTGAAATTGACAGTAACATACATAAGTTGAACTATGGTTATACACATGGGTTTAGATGATTGAAGTAAAAGCATGATACTGATCAATATGTACATTGATTTCAGGAATTGGCAATTGCAACTCAAGCAATTTTTTCAGGTGATAAACGATTCGGTTTTCGAGATGATCAATATTTTCTATTTGGATTAGTACTTGCAACAATAATTATTTGGATGAATATGATCATTTCAAGTGAAATCTCACTTATATGCAATGTATTTAATAAAACAAGCCAATGTATTTGAGAGGAACAAATGGATATGTAGTTGTCTATACACATTCATTGATGATTGTCCATGAGTGTTATCTTTTGTTATGTGAAACTGTTATTGGGATCACAAGATCATTCACATTTGATTTGCAATACTAAAAATTGTAACCAAAATTGCTTTCTTCCTATGTGATTCATCAAATGAATTTTCTCCTATACACCTGTAAGTGATGTTTCTATTGCTGCATATACGACGTTGAACTATTTCGATTTATTCTGTTTGTTCCATCATGAATATAAAG]

[+] EMBL CD082897             [GGCCAGAATTCGGCACGAGGACTATGTCATGATGAGTAGAAAGTACTTGTGTACTGTCATCTGGTATTCTGATGTACTGAAGGAAGGTTAAGGGGATGGAAAATTGATGTGAGATATTGACCAGTTGACAAATACAATGGTGAAGTAGGTGGGCTATTAAGAACACACACATCCATTCTTAAATAACTCACTACAATTTCACAGAATGCTTTTGCATTAATCATTTTCAGATGATCAAGTTAGCAAACTAAATAATAGAGAAAAATAGCATTAAGGTAAACGCTGACATAAACTATAATATTTTGTCCTAGTATGGGACTACTTGACAATGTACATCCACGATCTCACCCACGAGATTCGAACCCATAACTGTTCGATCCAATGCTTCCATGTTTCCTAGCCATAAAATGAATTCAATCATTAAATTACTAAAATCTCCATAATTCACCCTTCTAATTATAATATTTTGTGTTTAGTCCTAGCCGTCATTGAAATTGACAGTAACATACATAAGTTGAACTATGGTTATACACATGGGTTTAGATGATTGAAGTAAAAGCATGATACTGATCAATATGTACATTGATTTCAGGAATTGGCAATTGCAACTCAAGCAATTTTTTCAGGTGATAAACGATTCGGTTTTCGAGATGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD076481             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATA TTTGTGTTTAGTCCTAGCCGTCATTGAAATTGACAGTAACATACATAAGTTGAACTATGGTTATACACATGGGTTTAGATGATTGAAGTAAAAGCATGATACTGATCAATATGTACATTGATTTCAGGAATTGGCAATTGCAACTCAAGCAATTTTTTCAGGTGATAAACGATTCGGTTTTCGAGATGATCAATATTTTCTATTTGGATTAGTACTTGCAACAATAATTATTTGGATGAATATGATCATTTCAAGTGAAATCTCACTTATATGCAATGTATTTAATAAAACAAGCCAATGTATTTGAGAGGAACAAATGGATATGTAGTTGTCTATACACATTCATTGATGATTGTCCATGAGTGTTATCTTTTGTTATGTGAAACTGTTATTGGGATCACAAGATCATTCACATTTGATTTGCAATACTAAAAATTGTAACCAAAATTGCTTTCTTCCTATGTGATTCATCAAATGAATTTTCTCCTATACACCTGTAAGTGATGTTTCTATTGCTGCATATACGACGTTGAACTATTTCGATTTATTCTGTTTGTTCCATCATGAATATAAAG]




>consensus_1314#0
GGCCAGAATTCGGCACGAGGACTATGTCATGATGAGTAGAAAGTACTTGTGTACTGTCAT
CTGGTATTCTGATGTACTGAAGGAAGGTTAAGGGGATGGAAAATTGATGTGAGATATTGA
CCAGTTGACAAATACAATGGTGAAGTAGGTGGGCTATTAAGAACACACACATCCATTCTT
AAATAACTCACTACAATTTCACAGAATGCTTTTGCATTAATCATTTTCAGATGATCAAGT
TAGCAAACTAAATAATAGAGAAAAATAGCATTAAGGTAAACGCTGACATAAACTATAATA
TTTTGTCCTAGTATGGGACTACTTGACAATGTACATCCACGATCTCACCCACGAGATTCG
AACCCATAACTGTTCGATCCAATGCTTCCATGTTTCCTAGCCATAAAATGAATTCAATCA
TTAAATTACTAAAATCTCCATAATTCACCCTTCTAATTATAATATTTTGTGTTTAGTCCT
AGCCGTCATTGAAATTGACAGTAACATACATAAGTTGAACTATGGTTATACACATGGGTT
TAGATGATTGAAGTAAAAGCATGATACTGATCAATATGTACATTGATTTCAGGAATTGGC
AATTGCAACTCAAGCAATTTTTTCAGGTGATAAACGATTCGGTTTTCGAGATGATCAATA
TTTTCTATTTGGATTAGTACTTGCAACAATAATTATTTGGATGAATATGATCATTTCAAG
TGAAATCTCACTTATATGCAATGTATTTAATAAAACAAGCCAATGTATTTGAGAGGAACA
AATGGATATGTAGTTGTCTATACACATTCATTGATGATTGTCCATGAGTGTTATCTTTTG
TTATGTGAAACTGTTATTGGGATCACAAGATCATTCACATTTGATTTGCAATACTAAAAA
TTGTAACCAAAATTGCTTTCTTCCTATGTGATTCATCAAATGAATTTTCTCCTATACACC
TGTAAGTGATGTTTCTATTGCTGCATATACGACGTTGAACTATTTCGATTTATTCTGTTT
GTTCCATCATGAATATAAAG

clustalw multiple alignements is not computed in this case