cluster # 1358

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Schistosoma mansoni
cluster # 1358 cluster # 1358 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1358#0 length = 729 sequences # 2

consensusID : consensus_1358#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 729
fasta sequence

                              [GTCCCAAAACAAAGTATACAATCATAATTGCAATCCCAGTAAGCATGACAACACAGCTAAATACAAATAAAAAACCAGAGCACATTGTAAAATCAAAACGTGTTTGCATTGCAAATAGAGTTATGCAGATGCATAGAGCAAATGTTAGCGCTACAGCAATTAAAGCTGCTTCAGCTCCGTAGAATGCACCAATTGAACCAGCCATATAGGATAAAGCTAATGTAAATACAGTTAAGCATATATAGTTCCCGGGAAATCTTCTACGTACACTTACAATACAGCCAAGTACCAAATACGTTACGAAAAATACTGCATAGGCTAAATAGTAGAACCAAGAGTTACGACGCACCCAATTCGTCACGGGTTTAACAAGACAAAAAACACATACGATTCCAAATGTGAATAATAATTGCACACTAAGTGTAAAATATACTTTACGAATAAATGCATGACGAATGGTNTTATCATTAAATTTTGATGCAGTGAATTGATTCTCCATGCGTCCACCTTCACCACCAGTGTTGTTATTATTAAAATGTGGGTTGTCATTATAATTTCCATATGGGTAACCATCTCCTCCTTGCCAATGTGAACCGATATTAGGTGGATAAAGAGGTGGGGGTTGAGTTGGATATGGACCTTGGTGTCCGTTTACGTGTGGTGGTGGTGGTCCATATGGATACGGTGGTTCGTTGTATGGTGGTTGGAACCGCGGATCGGCCATTTAAA]

[+] EMBL BG931688             [GTCCCAAAACAAAGTATACAATCATAATTGCAATCCCAGTAAGCATGACAACACAGCTAAATACAAATAAAAAACCAGAGCACATTGTAAAATCAAAACGTGTTTGCATTGCAAATAGAGTTATGCAGATGCATAGAGCAAATGTTAGCGCTACAGCAATTAAAGCTGCTTCAGCTCCGTAGAATGCACCAATTGAACCAGCCATATAGGATAAAGCTAATGTAAATACAGTTAAGCATATATAGTTCCCGGGAAATCTTCTACGTACACTTACAATACAGCCAAGTACCAAATACGTTACGAAAAATACTGCATAGGCTAAATAGTAGAACCAAGAGTTACGACGCACCCAATTCGTCACGGGTTTAACAAGACAAAAAACACATACGATTCCAAATGTGAATAATAATTGCACACTAAGTGTAAAATATACTTTACGAATAAATGCATGACGAATGGTNTTATCATTAAATTTTGATGCAGTGAATTGA                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL BF936334             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAATGTGAATAATAATTGCACACTAAGTGTAAAATATACTTTACGAATAAATGCATGACGAATTGTTTTATCATTAAATTTTGATGCAGTGAATTGATTCTCCATGCGTCCACCTTCACCACCAGTGTTGTTATTATTAAAATGTGGGTTGTCATTATAATTTCCATATGGGTAACCATCTCCTCCTTGCCAATGTGAACCGATATTAGGTGGATAAAGAGGTGGGGGTTGAGTTGGATATGGACCTTGGTGTCCGTTTACGTGTGGTGGTGGTGGTCCATATGGATACGGTGGTTCGTTGTATGGTGGTTGGAACCGCGGATCGGCCATTTAAA]




>consensus_1358#0
GTCCCAAAACAAAGTATACAATCATAATTGCAATCCCAGTAAGCATGACAACACAGCTAA
ATACAAATAAAAAACCAGAGCACATTGTAAAATCAAAACGTGTTTGCATTGCAAATAGAG
TTATGCAGATGCATAGAGCAAATGTTAGCGCTACAGCAATTAAAGCTGCTTCAGCTCCGT
AGAATGCACCAATTGAACCAGCCATATAGGATAAAGCTAATGTAAATACAGTTAAGCATA
TATAGTTCCCGGGAAATCTTCTACGTACACTTACAATACAGCCAAGTACCAAATACGTTA
CGAAAAATACTGCATAGGCTAAATAGTAGAACCAAGAGTTACGACGCACCCAATTCGTCA
CGGGTTTAACAAGACAAAAAACACATACGATTCCAAATGTGAATAATAATTGCACACTAA
GTGTAAAATATACTTTACGAATAAATGCATGACGAATGGTNTTATCATTAAATTTTGATG
CAGTGAATTGATTCTCCATGCGTCCACCTTCACCACCAGTGTTGTTATTATTAAAATGTG
GGTTGTCATTATAATTTCCATATGGGTAACCATCTCCTCCTTGCCAATGTGAACCGATAT
TAGGTGGATAAAGAGGTGGGGGTTGAGTTGGATATGGACCTTGGTGTCCGTTTACGTGTG
GTGGTGGTGGTCCATATGGATACGGTGGTTCGTTGTATGGTGGTTGGAACCGCGGATCGG
CCATTTAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case