cluster # 1519

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Schistosoma mansoni
cluster # 1519 cluster # 1519 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1519#0 length = 965 sequences # 2

consensusID : consensus_1519#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 965
fasta sequence

                              [AAGGTTCTAACCCATTATTATATACTTTATTAACCAATGATAAAGTTACTGGGATTACTTTATTCCGATTGAATCCGATGCATACAACTTTCGACCCTGGATCTGTTTTGTATCAAAAATCCATTCGTCTACCTTGTAATAAGAATACAATGCTAACACCGAATCAATTAGCTACATATTTAATGCCACATAGCATTAATGCTATGTTTGAGGTCATTTTATATCCTAACTTACCACATTTAGTCGGTGTTGATCAATCAGTGATTTCAGCGAAATTTCAACTTCCAATATCGTATGCTCGTAAACCTCAACCCTATATGGGTTTAATCAATTGGCAGGAACAATCAGCCGAAGATATAATTCGATATTGGCATGCATTTCAAGGCACTTGTGTAAATTTATATACGGAGCTTTGTTTATTGAACACTGTACAAGAAGAAAAGGAGAATAATTCTTTAGTTGCAAA-TTTCGTCTATCCGAATGTCCATTGTTGGTACCACATATTGGTCG-TGCTTCTAACAATAACAATGGCCAGAATAATGCTGAAGTTGCCGATATATACTGTCCAAACTATGGGTCCAAAATTATGGACTATCTCAACGAAGCTTCAATTCTTCTGCATCAACCATATCCATCGTCATTACCACCTGGAAGTATTGTATATGTACGTTCACACAAGATAGGAGACATCATTTAATACCATACGCTTGCATTGCTTGTAAGCCAAATAATTCTTCACCTATTATAAAACAGAGTAATTCTGTATCATGGTGAGCGGTTAAATGTTTTTTAGTGGAAGTGGCCTATTTCATCAACGAACACTCGACATTTAACAGCTATTGATTTATACAGTGGTTATTTTTAAAAATATATTCATTTGCTACCATCGGCATCATCGACACTGAAAAGTATCTGTAGAAAATGAGGAGCGAAATTCTCGCCACTTGGGTGCACGTTATTTTGGG]

[+] EMBL CD162769             [AAGGTTCTAACCCATTATTATATACTTTATTAACCAATGATAAAGTTACTGGGATTACTTTATTCCGATTGAATCCGATGCATACAACTTTCGACCCTGGATCTGTTTTGTATCAAAAATCCATTCGTCTACCTTGTAATAAGAATACAATGCTAACACCGAATCAATTAGCTACATATTTAATGCCACATAGCATTAATGCTATGTTTGAGGTCATTTTATATCCTAACTTACCACATTTAGTCGGTGTTGATCAATCAGTGATTTCAGCGAAATTTCAACTTCCAATATCGTATGCTCGTAAACCTCAACCCTATATGGGTTTAATCAATTGGCAGGAACAATCAGCCGAAGATATAATTCGATATTGGCATGCATTTCAAGGCACTTGTGTAAATTTATATACGGAGCTTTGTTTATTGAACACTGTACAAGAAGAAAAGGAGAATAATTCTTTAGTTGCAAA TTTCGTCTATCCGAATGTCCATTGTTGGTACCACATATTGGTCG TGCTTCTAACAATAACAATGGCCAGAATAATGCTGAAGTTGCCGATATATACTGTCCAAACTATGGGTCCAAAATTATGGACTATCTCAACGAAGCTTCAATTCTTCTGCATCAACCATATCCATCGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL AW146467             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GAATAATTCTTTAGTTGCAAATTTTCGTCTATCCGAATGTCCATTGTTGGTACCACATATTGGTCGCTGCTTCTAACAATAACAATGGCCAGAATAATGCTGAAGTTGCCGATATATACTGTCCAAACTATGGGTCCAAAATTATGGACTATCTCAACGAAGCTTCAATTCTTCTGCATCAACCATATCCATCGTCATTACCACCTGGAAGTATTGTATATGTACGTTCACACAAGATAGGAGACATCATTTAATACCATACGCTTGCATTGCTTGTAAGCCAAATAATTCTTCACCTATTATAAAACAGAGTAATTCTGTATCATGGTGAGCGGTTAAATGTTTTTTAGTGGAAGTGGCCTATTTCATCAACGAACACTCGACATTTAACAGCTATTGATTTATACAGTGGTTATTTTTAAAAATATATTCATTTGCTACCATCGGCATCATCGACACTGAAAAGTATCTGTAGAAAATGAGGAGCGAAATTCTCGCCACTTGGGTGCACGTTATTTTGGG]




>consensus_1519#0
AAGGTTCTAACCCATTATTATATACTTTATTAACCAATGATAAAGTTACTGGGATTACTT
TATTCCGATTGAATCCGATGCATACAACTTTCGACCCTGGATCTGTTTTGTATCAAAAAT
CCATTCGTCTACCTTGTAATAAGAATACAATGCTAACACCGAATCAATTAGCTACATATT
TAATGCCACATAGCATTAATGCTATGTTTGAGGTCATTTTATATCCTAACTTACCACATT
TAGTCGGTGTTGATCAATCAGTGATTTCAGCGAAATTTCAACTTCCAATATCGTATGCTC
GTAAACCTCAACCCTATATGGGTTTAATCAATTGGCAGGAACAATCAGCCGAAGATATAA
TTCGATATTGGCATGCATTTCAAGGCACTTGTGTAAATTTATATACGGAGCTTTGTTTAT
TGAACACTGTACAAGAAGAAAAGGAGAATAATTCTTTAGTTGCAAATTTCGTCTATCCGA
ATGTCCATTGTTGGTACCACATATTGGTCGTGCTTCTAACAATAACAATGGCCAGAATAA
TGCTGAAGTTGCCGATATATACTGTCCAAACTATGGGTCCAAAATTATGGACTATCTCAA
CGAAGCTTCAATTCTTCTGCATCAACCATATCCATCGTCATTACCACCTGGAAGTATTGT
ATATGTACGTTCACACAAGATAGGAGACATCATTTAATACCATACGCTTGCATTGCTTGT
AAGCCAAATAATTCTTCACCTATTATAAAACAGAGTAATTCTGTATCATGGTGAGCGGTT
AAATGTTTTTTAGTGGAAGTGGCCTATTTCATCAACGAACACTCGACATTTAACAGCTAT
TGATTTATACAGTGGTTATTTTTAAAAATATATTCATTTGCTACCATCGGCATCATCGAC
ACTGAAAAGTATCTGTAGAAAATGAGGAGCGAAATTCTCGCCACTTGGGTGCACGTTATT
TTGGG

clustalw multiple alignements is not computed in this case