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Schistosoma mansoni
cluster # 183 cluster # 183       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_183#0 length = 644 sequences # 2  

consensusID : consensus_183#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 644
fasta sequence
                              [TGTGTTCATAGATTAACCTCATGGGTGATTAATGGAATCGATATCAAGTACGTACATGTTTTATTCAGTGAGTCAGTCATTTTTGCTGTATGATGAGACGCAAACACTTTCTTGTCAATACCATGTGATTCAAGCACTCAACGAAAGCATCATTAAAGCTGGCATTGAAATGCATGCCACTTTAAACTGTTCCTCCAAGTTTAGTTGGTAAACTATTTGTATTGAAGTTCCAGTGAACTATGATTTTATTTACAAATCTGTAAACTATTCGACATTGATAAAACGACGTTACAAAGTACAAAAGTTTTACTCAACTATCTTGGTGAATACCTACTTTGTACTTATTGAATAGCGTTGAGGTGAACTTCCTTAAATTTGTGATCTGTATGAAAATAGCTTTACTTCACAAAATATATTAACATAAAACAGTGTATCGTAACTGCTGAAATTCACAGCAATTCTGAGTGTTAAGTGGTTTTCAATGGTTCTTCTGCTGATATAAATGAGTGAAGAAACTTTAACTTCTATATGATTTCAACAATTCGTTTTGAGTAAAACAAACTATCTTTAATACTTTTGTTATTAAAAGTGTTGTTAATTTGCAAACAATAAACGTTACGANTATAACACCGTAGTGTTAGTTA]

[+] EMBL CD123519             [TGTGTTCATAGATTAACCTCATGGGTGATTAATGGAATCGATATCAAGTACGTACATGTTTTATTCAGTGAGTCAGTCATTTTTGCTGTATGATGAGACGCAAACACTTTCTTGTCAATACCATGTGATTCAAGCACTCAACGAAAGCATCATTAAAGCTGGCATTGAAATGCATGCCACTTTAAACTGTTCCTCCAAGTTTAGTTGGTAAACTATTTGTATTGAAGTTCCAGTGAACTATGATTTTATTTACAAATCTGTAAACTATTCGACATTGATAAAACGACGTTACAAAGTACAAAAGTTTTACTCAACTATCTTGGTGAATACCTACTTTGTACTTATTGAATAGCGTTGAGGTGAACTTCCTTAAATTTGTGATCTGTATGAAAATAGCTTTACTTCACAAAATATATTAACATAAAACAGTGTATCGTAACTGCTGAAATTCACAGCAATTCTGAGTGTTAAGTGGTTTTCAATGGTTCTTCTGCTGATATAAATGAGTGAAGAAACTTTAACTTCTATATGATTTCAACAATTCGTTTTGAGTAAAACAAACTATCTTTAATACTTTTGTTATTAAAAGTGTTGTTAATTTGCAAACAATAAACGTTACGANTATAACACCGTAGTGTTAGTTA]
[+] EMBL CD123509             [TGTGTTCATAGATTAACCTCATGGGTGATTAATGGAATCGATATCAAGTACGTACATGTTCTATTCAGTGAGTCAGTCATTTTTGCTGTATGATGAGACGCAAACACTTTCTTGTCAATACCATGTGATTCAAGCACTCAACGAAAGCATCATTAAAGCTGGCATTGAAATGCATGCCACTTTAAACTGTTCCTCCAAGTTTAGTTGGTAAACTATTTGTATTGAAGTTCCAGTGAACTATGATTTTATTTACAAATCTGTAAACTATTCGACATTGATAAAACGACGTTACAAAGTACAAAAGTTTTACTCAACTATCTTGGTGAATACCTACTTTGTACTTATTGAATAGCGTTGAGGTGAACTTCCTTAAATTTGTGATCTGTATGAAAATAGCTTTACTTCACAAAATATATTAACATAAAACAGTGTATCGTAACTGCTGAAATTCACAGCAATTCTGAGTGTTAAGTGGTTTTCAATGGTTCTTCTGCTGATATAAATGAGTGAAGAAACTNTAACTTCTATATGATTTCAACAA                                                                                                       ]


>consensus_183#0 TGTGTTCATAGATTAACCTCATGGGTGATTAATGGAATCGATATCAAGTACGTACATGTT TTATTCAGTGAGTCAGTCATTTTTGCTGTATGATGAGACGCAAACACTTTCTTGTCAATA CCATGTGATTCAAGCACTCAACGAAAGCATCATTAAAGCTGGCATTGAAATGCATGCCAC TTTAAACTGTTCCTCCAAGTTTAGTTGGTAAACTATTTGTATTGAAGTTCCAGTGAACTA TGATTTTATTTACAAATCTGTAAACTATTCGACATTGATAAAACGACGTTACAAAGTACA AAAGTTTTACTCAACTATCTTGGTGAATACCTACTTTGTACTTATTGAATAGCGTTGAGG TGAACTTCCTTAAATTTGTGATCTGTATGAAAATAGCTTTACTTCACAAAATATATTAAC ATAAAACAGTGTATCGTAACTGCTGAAATTCACAGCAATTCTGAGTGTTAAGTGGTTTTC AATGGTTCTTCTGCTGATATAAATGAGTGAAGAAACTTTAACTTCTATATGATTTCAACA ATTCGTTTTGAGTAAAACAAACTATCTTTAATACTTTTGTTATTAAAAGTGTTGTTAATT TGCAAACAATAAACGTTACGANTATAACACCGTAGTGTTAGTTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)