cluster # 1861

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Schistosoma mansoni
cluster # 1861 cluster # 1861 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1861#0 length = 694 sequences # 2

consensusID : consensus_1861#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 694
fasta sequence

                              [GAGGCCAGAATTCGGCACGAGGCTGCTCTCAATTTCCTGCATAATACACTTGGAGTTTCTCACAATAATATGGGTACTACCAGTATATTTATTGATTCGAATATGTATTGGAAGTTGTGCGGTTTCGAGTTTGCTCTGGAATTTAAGAATATGTCTGCTGATCATATACGAAAAATTGAAGTTTTAAAGGGACAACAAGACGCAAAAAAAACCTTCAAGAGTCACCCAAGTCCAAATTGACCATATCTCTTCAAAATTTTCAGAAGTTTGTCAATCCTTTAATTGTTCAGAAATTTATGGTTAACGAGAGACATACGCGTATTTTACTACTTCAGCATTTCACTGGCTATTTAAAAGTACTAACTGATAGTGATTTGTTAAATGTGATATTACCACAAATATGTCGTGGAGTTTTCGACAGTCATAATACGCTTTCAGTTTTAAGTTTACAAGCGTTAGGATGTCTTGCTAATCGTTTAAATTCTACTGTTGTTTTAAATCATTTACGTCTGATCGAAGAAAACTTGTGTAAATCTGGCAGTTTATCTAATAATTCAAATCATAGTACGAGCACTGAGGGAAATAATAGATTAGTTACTTATGTTTGGCCTCGTAATAATCTATTTTATGAAGCAGCACC-AAAATTAATAGGAATAATCGGGAAATTCCTTTATGTGAGAAGAAACANAACCAT]

[+] EMBL CD079370             [GAGGCCAGAATTCGGCACGAGGCTGCTCTCAATTTCCTGCATAATACACTTGGAGTTTCTCACAATAATATGGGTACTACCAGTATATTTATTGATTCGAATATGTATTGGAAGTTGTGCGGTTTCGAGTTTGCTCTGGAATTTAAGAATATGTCTGCTGATCATATACGAAAAATTGAAGTTTTAAAGGGACAACAAGACGCAAAAAAAACCTTCAAGAGTCACCCAAGTCCAAATTGACCATATCTCTTCAAAATTTTCAGAAGTTTGTCAATCCTTTAATTGTTCAGAAATTTATGGTTAACGAGAGACATACGCGTATTTTACTACTTCAGCATTTCACTGGCTATTTAAAAGTACTAACTGATAGTGATTTGTTAAATGTGATATTACCACAAATATGTCGTGGAGTTTTCGACAGTCATAATACGCTTTCAGTTTTAAGTTTACAAGCGTTAGGATGTCTTGCTAATCGTTTAAATTCTACTGTTGTTTTAAATCATTTACGTCTGATCGAAGAAAACTTGTGTAAATCTGGCAGTTTATCTAATAATTCAAATCATAGTACGAGCACTGAGGGAAATAATAGATTAGTTACTTATGTTTGGCCTCGTAATAATCTATTTTATGAAGCAGCACC AAAATTAATAGGAATA                                      ]
[+] EMBL CD079369             [                 gagGGCTGCTCTCAATTTCCTGCATAATACACTTGGAGTTTCT ACAATAATATGGGTACTACCAGTATATTTATTGATTCGAATATGTATTGGAAGTTGTGCGGTTTCGAGTTTGCTCTGGAATTTAAGAATATGTCTGCTGATCATATACGAAAAATTGAAGTTTTAAAGGGACAACAAGACGCAAAAAAAACCTTCAAGAGTCACCCAAGTCCAAATTGACCATATCTCTTCAAAATTTTCAGAAGTTTGTCAATCCTTTAATTGTTCAGAAATTTATGGTTAACGAGAGACATACGCGTATTTTACTACTTCAGCATTTCACTGGCTATTTAAAAGTACTAACTGATAGTGATTTGTTAAATGTGATATTACCACAAATATGTCGTGGAGTTTTCGACAGTCATAATACGCTTTCAGTTTTAAGTTTACAAGCGTTAGGATGTCTTGCTAATCGTTTAAATTCTACTGTTGTTTTAAATCATTTACGTCTGATCGAAGAAAACTTGTGTAAATCTGGCAGTTTATCTAATAATTCAAATCATAGTACGAGCACTGAGGGAAATAATAGATTAGTTACTTATGTTTGGCCTCGTAATAATCTATTTTATGAAGCAGCACCAAAAATTAATAGGAATAATCGGGAAATTCCTTTATGTGAGAAGAAACANAACCAT]




>consensus_1861#0
GAGGCCAGAATTCGGCACGAGGCTGCTCTCAATTTCCTGCATAATACACTTGGAGTTTCT
CACAATAATATGGGTACTACCAGTATATTTATTGATTCGAATATGTATTGGAAGTTGTGC
GGTTTCGAGTTTGCTCTGGAATTTAAGAATATGTCTGCTGATCATATACGAAAAATTGAA
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GTTTATCTAATAATTCAAATCATAGTACGAGCACTGAGGGAAATAATAGATTAGTTACTT
ATGTTTGGCCTCGTAATAATCTATTTTATGAAGCAGCACCAAAATTAATAGGAATAATCG
GGAAATTCCTTTATGTGAGAAGAAACANAACCAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case