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Schistosoma mansoni
cluster # 220 cluster # 220       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_220#0 length = 1102 sequences # 2  

consensusID : consensus_220#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1102
fasta sequence
                              [TTTTTTTTTTTTTTTTGTTCTCGTAATGACTCTTTTTTTTTCAAATACATTTACAAGTGAATTAATAAATAAATAATTTGTATTTATTAAATGTAATGTATAAATAGGGTTATGTTATTACCATTATTATTATTATTATTATTATAACAGTTCACTTGTATAAACAGTTCATATTAGTTTAATATAAAGATCATTTTTCATGTTGTTTGCATTTGTATTTTATTCACCTATGTTTACCAATATCACTGTTCGTTTTCTTCATCTTCTCCGTCGTCTTCGCCATGTTGTGGTATAGTTTGTGGTTCTTCTGGATGTGGTGTTGGCTGTGGTTTGTACCTATTTCCATATTTTTTATACTTTCCTTTTCTCCTCTTTCCTTTCCTTCCTTTCGTTCCCTTGGTTCCTTTCGTTCCTTTCTTGGACGATTTTGTTTTGCCTAATACGCGTTTGTTTGACCGTTTGTATTTCTTAAATTTACAATATCTAGTAGGCTTATATTCGTTCTCTTCTGTTTCATCGGGTTTATTATCTTCGCCTTCCTCATTATTAACGTTTTCTCCTACGTTACCACTAGGTTGTTCGTTTGAATTAGAAGGTATAGGAGTAGGATGAGGAGGAGGAGGANAAAGGTTGTGGTGTCTGATAATCAGGTATATAATTTCCATATTGATCATATTTACTAGGATCTTTTGGTTNTTTAACATACGTTTCTTCACCTACTAATCCATAACCTTCTCCTTCATAATATCTTGGGTTATACCGATGTCCACTGAGAACTAACTCTCTCAATTCACTATCATATTTATCTAAANTCATCATATATCCGTGATAACGACTATGGTTATAGTGTGGCCGACATTANTCTCGTCGCATCAGCTCATGTGTGCTTCAGTTTTTCAGAGTGCTCGAGTGGGTCTGATCTATCAGAATTGNAGTGACGTACCTCTCAGTGATATGGCTGGGGATGTAGATGATTCTATTCTGATGATCACTGGACTATCTGNGAAGACTACTGGCGATTGCNGGGCATCTTNGNNTAATNATGCACGTCTGGATTCCATCACACGACAGACGCTAGATCTTGCTCCTGACTCTTACGAGA]

[+] EMBL AI395757             [TTTTTTTTTTTTTTTTGTTCTCGTAATGACTCTTTTTTTTTCAAATACATTTACAAGTGAATTAATAAATAAATAATTTGTATTTATTAAATGTAATGTATAAATAGGGTTATGTTATTACCATTATTATTATTATTATTATTATAACAGTTCACTTGTATAAACAGTTCATATTAGTTTAATATAAAGATCATTTTTCATGTTGTTTGCATTTGTATTTTATTCACCTATGTTTACCAATATCACTGTTCGTTTTCTTCATCTTCTCCGTCGTCTTCGCCATGTTGTGGTATAGTTTGTGGTTCTTCTGGATGTGGTGTTGGCTGTGGTTTGTACCTATTTCCATATTTTTTATACTTTCCTTTTCTCCTCTTTCCTTTCCTTCCTTTCGTTCCCTTGGTTCCTTTCGTTCCTTTCTTGGACGATTTTGTTTTGCCTAATACGCGTTTGTTTGACCGTTTGTATTTCTTAAATTTACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD074501             [                                                                        ATAATTTGTATTTATTAAATGTAATGTATAAATAGGGTTATGTTATTACCATTATTATTATTATTATTATTATAACAGTTCACTTGTATAAACAGTTCATATTAGTTTAATATAAAGATCATTTTTCATGTTGTTTGCATTTGTATTTTATTCACCTATGTTTACCAATATCACTGTTCGTTTTCTTCATCTTCTCCGTCGTCTTCGCCATGTTGTGGTATAGTTTGTGGTTCTTCTGGATGTGGTGTTGGTTGTGGTTTGTACCTATTTCCATATTTTTTATACTTTCCTTTTCCCCTCTTTCCTTTCGTTCCTTTCGTTCCTTTGGTTCCTTTCGTTCCTTTCTTGGATGATTTTGTTTTGCTTGATACGCGTTTGTTTGACGGTTTGTATTTCTTATATTTAACATATCTAGTAGGCTTATATTCGTTCTCTTCTGTTTCATCGGGTTTATTATCTTCGCCTTCCTCATTATTAACGTTTTCTCCTACGTTACCACTAGGTTGTTCGTTTGAATTAGAAGGTATAGGAGTAGGATGAGGAGGAGGAGGANAAAGGTTGTGGTGTCTGATAATCAGGTATATAATTTCCATATTGATCATATTTACTAGGATCTTTTGGTTNTTTAACATACGTTTCTTCACCTACTAATCCATAACCTTCTCCTTCATAATATCTTGGGTTATACCGATGTCCACTGAGAACTAACTCTCTCAATTCACTATCATATTTATCTAAANTCATCATATATCCGTGATAACGACTATGGTTATAGTGTGGCCGACATTANTCTCGTCGCATCAGCTCATGTGTGCTTCAGTTTTTCAGAGTGCTCGAGTGGGTCTGATCTATCAGAATTGNAGTGACGTACCTCTCAGTGATATGGCTGGGGATGTAGATGATTCTATTCTGATGATCACTGGACTATCTGNGAAGACTACTGGCGATTGCNGGGCATCTTNGNNTAATNATGCACGTCTGGATTCCATCACACGACAGACGCTAGATCTTGCTCCTGACTCTTACGAGA]


>consensus_220#0 TTTTTTTTTTTTTTTTGTTCTCGTAATGACTCTTTTTTTTTCAAATACATTTACAAGTGA ATTAATAAATAAATAATTTGTATTTATTAAATGTAATGTATAAATAGGGTTATGTTATTA CCATTATTATTATTATTATTATTATAACAGTTCACTTGTATAAACAGTTCATATTAGTTT AATATAAAGATCATTTTTCATGTTGTTTGCATTTGTATTTTATTCACCTATGTTTACCAA TATCACTGTTCGTTTTCTTCATCTTCTCCGTCGTCTTCGCCATGTTGTGGTATAGTTTGT GGTTCTTCTGGATGTGGTGTTGGCTGTGGTTTGTACCTATTTCCATATTTTTTATACTTT CCTTTTCTCCTCTTTCCTTTCCTTCCTTTCGTTCCCTTGGTTCCTTTCGTTCCTTTCTTG GACGATTTTGTTTTGCCTAATACGCGTTTGTTTGACCGTTTGTATTTCTTAAATTTACAA TATCTAGTAGGCTTATATTCGTTCTCTTCTGTTTCATCGGGTTTATTATCTTCGCCTTCC TCATTATTAACGTTTTCTCCTACGTTACCACTAGGTTGTTCGTTTGAATTAGAAGGTATA GGAGTAGGATGAGGAGGAGGAGGANAAAGGTTGTGGTGTCTGATAATCAGGTATATAATT TCCATATTGATCATATTTACTAGGATCTTTTGGTTNTTTAACATACGTTTCTTCACCTAC TAATCCATAACCTTCTCCTTCATAATATCTTGGGTTATACCGATGTCCACTGAGAACTAA CTCTCTCAATTCACTATCATATTTATCTAAANTCATCATATATCCGTGATAACGACTATG GTTATAGTGTGGCCGACATTANTCTCGTCGCATCAGCTCATGTGTGCTTCAGTTTTTCAG AGTGCTCGAGTGGGTCTGATCTATCAGAATTGNAGTGACGTACCTCTCAGTGATATGGCT GGGGATGTAGATGATTCTATTCTGATGATCACTGGACTATCTGNGAAGACTACTGGCGAT TGCNGGGCATCTTNGNNTAATNATGCACGTCTGGATTCCATCACACGACAGACGCTAGAT CTTGCTCCTGACTCTTACGAGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)