Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 2232 cluster # 2232       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2232#0 length = 729 sequences # 2  

consensusID : consensus_2232#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 729
fasta sequence
                              [ACTTTTACTACCATTATTATTATTCAATCTGTTAGTAATCGAATCATTCAAAGAGAATAGTCGAGGAATACCAGAAGGAGATTTAATTTTATTCAATGTAATCTCTGCATCATTTAATGGATGATCTTTAGATGGGATAGATTGATTTTGTTGTTGTTGTTGTATATCTATTAAATTAGATGATGCTGTAGTAATTCCTTGATGTGTTGTTAATGAAGATTGTTGATTTGTAGTAGGAAATGATGAAAGTTGTCGTTTTGTTGTTGAATTTATATGTTGGTAATTTAATGTATGTTTCTTGTACAGGTGATTGTGTTAACATTGTAGTTACATTTAATTGAAATTGATTAGTTGAACACTATGGAGTTGTTTGAATAAAAAACACACAGAAGAAAAAATGTTTTTCTATTATTAAATGTCCAAGTCAATTATAACTTCAATGATTGTTTATATATTGTAATGGATTAATAATAAAATTAAAATATTCCAACAATCAAATGACAATGACGATGTTGATGGTGATGAGGAGGAGTAGGATAATGATGATGACGAGAATCAATCTGACATGATTATTTCCTATCAGTAATAATAATAATGGTAGTAAAAGTAATAACAATAATAATTCATCTCCAACTAATTCACCAACCAATTCATCCAATGGTAATGCTTGTAACACTAATAATAATACAATCAATTATACAACTACTAATACTAATCATANTCATAATT]

[-] EMBL CD084004             [ACTTTTACTACCATTATTATTATTCAATCTGTTAGTAATCGAATCATTCAAAGAGAATAGTCGAGGAATACCAGAAGGAGATTTAATTTTATTCAATGTAATCTCTGCATCATTTAATGGATGATCTTTAGATGGGATAGATTGATTTTGTTGTTGTTGTTGTATATCTATTAAATTAGATGATGCTGTAGTAATTCCTTGATGTGTTGTTAATGAAGATTGTTGATTTGTAGTAGGAAATGATGAAAGTTGTCGTTTTGTTGTTGAATTTATATGTTGGTAATTTAATGTATGTTTCTTGTACAGGTGATTGTGTTAACATTGTAGTTACATTTAATTGAAATTGATTAGTTGAACACTATGGAGTTGTTTGAATAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD152971             [                                                                                                                                                                        TATTAAATTAGACGATGCTGTAGTAATTCCTTGATGTGTTGTTAATGAAGATTGTTGATTTGTAGTAGGAAATGATGAAAGTTGTCGTTTTGTTGTTGAATTTATATGTTGGTAATTTAATG ATGTTTCTTGTACAGGTGATTGTGTTAACATTGTAGTTACATTTAATTGAAATTGATTAGTTGAACACTATGGAGTTGTTTGAATAAAAAACACACAGAAGAAAAAATGTTTTTCTATTATTAAATGTCCAAGTCAATTATAACTTCAATGATTGTTTATATATTGTAATGGATTAATAATAAAATTAAAATATTCCAACAATCAAATGACAATGACGATGTTGATGGTGATGAGGAGGAGTAGGATAATGATGATGACGAGAATCAATCTGACATGATTATTTCCTATCAGTAATAATAATAATGGTAGTAAAAGTAATAACAATAATAATTCATCTCCAACTAATTCACCAACCAATTCATCCAATGGTAATGCTTGTAACACTAATAATAATACAATCAATTATACAACTACTAATACTAATCATANTCATAATT]


>consensus_2232#0 ACTTTTACTACCATTATTATTATTCAATCTGTTAGTAATCGAATCATTCAAAGAGAATAG TCGAGGAATACCAGAAGGAGATTTAATTTTATTCAATGTAATCTCTGCATCATTTAATGG ATGATCTTTAGATGGGATAGATTGATTTTGTTGTTGTTGTTGTATATCTATTAAATTAGA TGATGCTGTAGTAATTCCTTGATGTGTTGTTAATGAAGATTGTTGATTTGTAGTAGGAAA TGATGAAAGTTGTCGTTTTGTTGTTGAATTTATATGTTGGTAATTTAATGTATGTTTCTT GTACAGGTGATTGTGTTAACATTGTAGTTACATTTAATTGAAATTGATTAGTTGAACACT ATGGAGTTGTTTGAATAAAAAACACACAGAAGAAAAAATGTTTTTCTATTATTAAATGTC CAAGTCAATTATAACTTCAATGATTGTTTATATATTGTAATGGATTAATAATAAAATTAA AATATTCCAACAATCAAATGACAATGACGATGTTGATGGTGATGAGGAGGAGTAGGATAA TGATGATGACGAGAATCAATCTGACATGATTATTTCCTATCAGTAATAATAATAATGGTA GTAAAAGTAATAACAATAATAATTCATCTCCAACTAATTCACCAACCAATTCATCCAATG GTAATGCTTGTAACACTAATAATAATACAATCAATTATACAACTACTAATACTAATCATA NTCATAATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)