Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 2385 cluster # 2385       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2385#0 length = 627 sequences # 2  

consensusID : consensus_2385#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 627
fasta sequence
                              [TCCGGTGTGAAACAGATCAACTTAGTTAAACTATTATTAAGAGCTGTATGATAATAGGTGTTATAGTGTCGCAATATGAAAAAGATTGCAAACGTGATCTCATAAAAGATGATATATGCAGCATAGTAATTTTCCTTTTTTATATAGACAACATCAAACAATGTTCAAGATATTATTGAAGGACGAGTATAAAAACGTACAAAAGATACATTTGTACCTGTTGGAGGTGGTAAAATGCTTACATTTATGGATGACTTTAATATGCCTGCTAAAGATAGCTCTGGTTCTCAACCACCTCTTGAATTAATTCGTCAATGGTTAGAATATGGATTTTGGTATGACCGTACAAAACAAACTAGAAAGAAAATAAAAGGTATGCAAATTTTTGCAGCAATGGGTACACCGGGTGGTGGAAGAATGATATTATCTCAACGACTACAATCTCATTTTCATCAGATTGTTGTCACATTTCCAACGGTATGAATTTTGTTATGGAATTAAAAGTTAACATTGTGATTTTTTTGAAATTTGAAGATAGTTTTGTTTAAATTTTTATGCTGAAATTAGATGAGTATTTTGTTAAAAAGTTATTTCAAATTTGCTTTATACAACATTCAGTATTTAGAT]

[+] EMBL CD086324             [TCCGGTGTGAAACAGATCAACTTAGTTAAACTATTATTAAGAGCTGTATGATAATAGGTGTTATAGTGTCGCAATATGAAAAAGATTGCAAACGTGATCTCATAAAAGATGATATATGCAGCATAGTAATTTTCCTTTTTTATATAGACAACATCAAACAATGTTCAAGATATTATTGAAGGACGAGTATAAAAACGTACAAAAGATACATTTGTACCTGTTGGAGGTGGTAAAATGCTTACATTTATGGATGACTTTAATATGCCTGCTAAAGATAGCTCTGGTTCTCAACCACCTCTTGAATTAATTCGTCAATGGTTAGAATATGGATTTTGGTATGACCGTACAAAACAAACTAGAAAGAAAATAAAAGGTATGCAAATTTTTGCAGCAATGGGTACACCGGGTGGTGGAAGAATGATATTATCTCAACGACTACAATCTCATTTTCATCAGATTGTTGTCACATTTCCAACGGTATGAATTTTGTTATGGAATTAAAAGTTAACATTGTGATTTTTTTGAAATTTGAAGATAGTTTTGTTTAAATTTTTATGCTGAAATTAGATGAGTATTTTGTTAA                                            ]
[+] EMBL CD086314             [                 CAACTTAGTTAAACTAGTATTAAGAGCTGTATGATAATAGGTGTTATAGTGTCGCAATATGAAAAAGATTGCAAACGTGATCTCATAAAAGATGATATATGCAGTATAGTAATTTTCCTTTTTTATATAGACAACATCAAACAATGTTCAAGATATTATTGAAGGACGAGTAGAAAAACGTACAAAAGATACATTTGTACCTGTTGGAGGTGGTAAAATGCTTACATTTATGGATGACTTTAATATGCCTGCTAAAGATAGCTCTGGTTCTCAACCACCTCTTGAATTAATTCGTCAATGGTTAGAATATGGATTTTGGTATGACCGTACAAAACAAACTAGAAAGAAAATAAAAGGTATGCAAATTTTTGCAGCAATGGGTACACCGGGTGGTGGAAGAATGATATTATCTCAACGACTACAATCTCATTTTCATCAGATTGTTGTCACATTTCCAACGGTATGAATTTTGTTATGGAATTAAAAGTTAACATTGT ATTTTTTTGAAATTTGAAGATAGTTTTGTTTAAATTTTTATGCTGAAATTAGATGAGTATTTTGTTAAAAAGTTATTTCAAATTTGCTTTATACAACATTCAGTATTTAGAT]


>consensus_2385#0 TCCGGTGTGAAACAGATCAACTTAGTTAAACTATTATTAAGAGCTGTATGATAATAGGTG TTATAGTGTCGCAATATGAAAAAGATTGCAAACGTGATCTCATAAAAGATGATATATGCA GCATAGTAATTTTCCTTTTTTATATAGACAACATCAAACAATGTTCAAGATATTATTGAA GGACGAGTATAAAAACGTACAAAAGATACATTTGTACCTGTTGGAGGTGGTAAAATGCTT ACATTTATGGATGACTTTAATATGCCTGCTAAAGATAGCTCTGGTTCTCAACCACCTCTT GAATTAATTCGTCAATGGTTAGAATATGGATTTTGGTATGACCGTACAAAACAAACTAGA AAGAAAATAAAAGGTATGCAAATTTTTGCAGCAATGGGTACACCGGGTGGTGGAAGAATG ATATTATCTCAACGACTACAATCTCATTTTCATCAGATTGTTGTCACATTTCCAACGGTA TGAATTTTGTTATGGAATTAAAAGTTAACATTGTGATTTTTTTGAAATTTGAAGATAGTT TTGTTTAAATTTTTATGCTGAAATTAGATGAGTATTTTGTTAAAAAGTTATTTCAAATTT GCTTTATACAACATTCAGTATTTAGAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)