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Schistosoma mansoni
cluster # 3032 cluster # 3032       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3032#0 length = 623 sequences # 2  

consensusID : consensus_3032#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 623
fasta sequence
                              [TCTTGTAATATTATTGTTTGATTTGAAGAGAAAATCTCATATCTCAGTCACATTTTGGTAAAACGCATCCTTCTTGTTGTTCGGGAATCGTTTTGCATTTTTTCATCTGTATACAACGCACCATAATTATTCTTGGATAAAACAGTCAAGTTAACTTTTTAACTTGAAAAAGCACGACTTAATGGACGATCTTCAAAAGGCTGTTATCCTTATGGCAACAAAATTGTCTGTACATAACTCAAAGCCACTATGTAATGCAGAAGTTGTCACTGTTCGTTGTCGTCATGTTGTGAAACACATTCCTAAACGGTATGTTATGGCATATATCTTATCATTAGCACAAAAGCAATGCTTAAATCTTGAGAAGGAAAGTTTTTCGTTTCTGAGCTATGTTCCAGAAGTATGGATAAACCTTGTGGATGTTATTAGATCTATAAATTCCGATAATTATGATTTTGGTTATATACAAACAATCGCTTTAGAATCATTGAAGAAAGCTATTAAGCTATGTCATGATACAATCGATAAAACATTATGTCA-ATATTATTATTCACGTGCTTCACTCAATTCAATTAATTTATTATTGGATACACATTCAATTGTGAATAGACGTAGACGTCAAG]

[+] EMBL CD154961             [TCTTGTAATATTATTGTTTGATTTGAAGAGAAAATCTCATATCTCAGTCACATTTTGGTAAAACGCATCCTTCTTGTTGTTCGGGAATCGTTTTGCATTTTTTCATCTGTATACAACGCACCATAATTATTCTTGGATAAAACAGTCAAGTTAACTTTTTAACTTGAAAAAGCACGACTTAATGGACGATCTTCAAAAGGCTGTTATCCTTATGGCAACAAAATTGTCTGTACATAACTCAAAGCCACTATGTAATGCAGAAGTTGTCACTGTTCGTTGTCGTCATGTTGTGAAACACATTCCTAAACGGTATGTTATGGCATATATCTTATCATTAGCACAAAAGCAATGCTTAAATCTTGAGAAGGAAAGTTTTTCGTTTCTGAGCTATGTTCCAGAAGTATGGATAAACCTTGTGGATGTTATTAGATCTATAAATTCCGATAATTATGATTTTGGTTATATACAAACAATCGCTTTAGAATCATTGAAGAAAGCTATTAAGCTATGTCATGATACAATCGATAAAACATTATGTCA ATATTATTATTCACGTGCTTCACTCAATTCAATTAATTTATTATTGGATACACATTCAATTGTGAATAGACGTAGACGTCAAG]
[-] EMBL CD068619             [                                                                                                                                                                                                                 TTATGGCAACAAAATTGTCTGTACATAACTCAAAGCCACTATGTAATGCAGAAGTTGTCACTGTTCGTTGTCGTCATGTTGTGAAACACATTCCTAAACGGTATGTTATGGCATATATCTTATCATTAGCACAAAAGCAATGCTTAAATCTTGAGAAGGAAAGTTTTTCGTTTCTGAGCTATGTTCCAGAAGTATGGATAAACCTTGTGGATGTTATTAGATCTATAAATTCCGATAATTATGATTTTGG TATATACAAAC ATCGCTTTAGAATCATTGAAGAAAGCTATTAAGCTATGTCATGATACAATCGATAAAACATTA GTCATATATatc                                                                            ]


>consensus_3032#0 TCTTGTAATATTATTGTTTGATTTGAAGAGAAAATCTCATATCTCAGTCACATTTTGGTA AAACGCATCCTTCTTGTTGTTCGGGAATCGTTTTGCATTTTTTCATCTGTATACAACGCA CCATAATTATTCTTGGATAAAACAGTCAAGTTAACTTTTTAACTTGAAAAAGCACGACTT AATGGACGATCTTCAAAAGGCTGTTATCCTTATGGCAACAAAATTGTCTGTACATAACTC AAAGCCACTATGTAATGCAGAAGTTGTCACTGTTCGTTGTCGTCATGTTGTGAAACACAT TCCTAAACGGTATGTTATGGCATATATCTTATCATTAGCACAAAAGCAATGCTTAAATCT TGAGAAGGAAAGTTTTTCGTTTCTGAGCTATGTTCCAGAAGTATGGATAAACCTTGTGGA TGTTATTAGATCTATAAATTCCGATAATTATGATTTTGGTTATATACAAACAATCGCTTT AGAATCATTGAAGAAAGCTATTAAGCTATGTCATGATACAATCGATAAAACATTATGTCA ATATTATTATTCACGTGCTTCACTCAATTCAATTAATTTATTATTGGATACACATTCAAT TGTGAATAGACGTAGACGTCAAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)