cluster # 3178

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 3178 cluster # 3178 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3178#0 length = 468 sequences # 2

consensusID : consensus_3178#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 468
fasta sequence

                              [ATTTGAAAGTAATTTTGAACGTGAATTGATATTAACTAAAGAGTGGTTACAATTACGTAAGCATTGAATAGGTGCTTTTCGCTAAATTAAGACGTCACAGAAGTGTG-CACCTACAATGTAACACCGTATGAGGTTAAAGGAAAGATCTATACACCTCATGGTAAACACAACATAGTTAAATCAAACTACAATGATCAAAACGGACAGTCAAAATAAATATCCAAACAACAACACTCATAAAATTTAAGGTCAACAAAACAAGCAATCAATTGTACATGAAGGAATTCTTATAAATCATTTCTGTCTGAAATTTGTTTTTTATGATATTGTCTAGAAAGGTAATAAACGCTACTGAATTAAACTATTCAACTCAGAGAATACAAATTCACCAGAAATATTTAACTCGCTTAATAAGAATTAAGTAGCTGTAGCACATTATTGTGATGAGAAAAATTTCTTCTCAATTGT]

[+] EMBL CD115794             [ATTTGAAAGTAATTTTGAACGTGAATTGATATTAACTAAAGAGTGGTTACAATTACGTAAGCATTGAATAGGTGCTTTTCGCTAAATTAAGACGTCACAGAAGTGTG CACCTACAATGTAACACCGTATGAGGTTAAAGGAAAGATCTATACACCTCATGGTAAACACAACATAGTTAAATCAAACTACAATGATCAAAACGGACAGTCAAAATAAATATCCAAACAACAACACTCATAAAATTTAAGGTCAACAAAACAAGCAATCAATTGTACATGAAGGAATTCTTATAAATCATTTCTGTCTGAAATTTGTTTTTTATGATATTGTCTAGAAAGGTAATAAACGCTACTGAATTAAACTATTCAACTCAGAGAATACAAATTCACCAGAAATATTTAACTCGCTTAATAAGAATTAAGTAGCTGTAGCACATTATTGTGATGAGAAAAATTTCTTCTCAATTGT]
[+] EMBL CD115729             [ATTTGAAAGTAATTCTGAACGTGAATTGATATTAACTAAAGAGTGGTTACAATTACGTAAGCATTGAATAGGTGCTTTTCGCTAAATTAAGACGTCACAGAAGTGTGTCTCCTACAATGTAACACCGTATGAGGTGAAAGGAAAGATCTATACATCTCATGGTAAACACAACATATTTAAATCAAACTACAATGATCAAAACGGACAGTCAAAATAAATATCCAAACAACAACACTCATAAAATTTAAGGTCAACAAAACAAGCAATCAATTGTACATGAAGAAATTCTTATAAATCATTTCTGTCTGAAATTTGCTTTTTATGATATTGCCTAGAAAGGTAATAAACGCTACTGAATTAAACTA                                                                                                        ]




>consensus_3178#0
ATTTGAAAGTAATTTTGAACGTGAATTGATATTAACTAAAGAGTGGTTACAATTACGTAA
GCATTGAATAGGTGCTTTTCGCTAAATTAAGACGTCACAGAAGTGTGCACCTACAATGTA
ACACCGTATGAGGTTAAAGGAAAGATCTATACACCTCATGGTAAACACAACATAGTTAAA
TCAAACTACAATGATCAAAACGGACAGTCAAAATAAATATCCAAACAACAACACTCATAA
AATTTAAGGTCAACAAAACAAGCAATCAATTGTACATGAAGGAATTCTTATAAATCATTT
CTGTCTGAAATTTGTTTTTTATGATATTGTCTAGAAAGGTAATAAACGCTACTGAATTAA
ACTATTCAACTCAGAGAATACAAATTCACCAGAAATATTTAACTCGCTTAATAAGAATTA
AGTAGCTGTAGCACATTATTGTGATGAGAAAAATTTCTTCTCAATTGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case