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Schistosoma mansoni
cluster # 320 cluster # 320       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_320#0 length = 1095 sequences # 2  

consensusID : consensus_320#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1095
fasta sequence
                              [GATACCTGGACTGAACGAGTTATGTATATATTTTCAGATCACGCAACTTACTAACACTATACACCTTCAGTTTATAATTGAAGATCATTAAAATTGGTTAGTTAATTGTTAAATATAACATACAATTTATCCAATAAACATAAACCAATACCAACAAGAGACTGATCAATTGCAATCCTAAATAGCAATGGGAAGATACAAGTGAACAACACCATGTAAATTTAAACTTCACCCTATTGCACAAGAAAGTGGATATCAGGAATCAGTAGCTAAGTGGATAACGTGATGGCGTCTAAAGCGAAAGGTACTGGGTTCGAGTCCCAGTGTGAACATCAACAAGTCTGAGATGCAGGTACATCCATCTGACAAGTCCCAAATAGGACGAAACGCGCGTCAAACTGTATTCCACTGCTAGCCACTATCCATCTTTGTTTACAATGCTTGTGACTTCAGGCAACATCGAGGCAATACGCACAGTATGCACATATGCCAACAACAGACTGATCAATTGCAATCTCGACATGATGTTGAACGTAAAATTTTTAATTGTGCTCCAATTAAATTTAAACGTAAAATTGTATCTAAATTTTTAATTATATTCAAATTAGTACAATGATTATGATTTAATTTAGATGGTAGAAATGACATAACGTAATTTGATTGATAAATTTGATGGTATCGCTGATGGTTTATGATTGATTATTGATTTTGAAAAGGATTTCTTCTTTGAATGAGGACGTTTCACTTTGATAGGAAGGTCATCAGTGGAAGATAATCGTTTTCTTGGTAATAGATTAATATTATGACTGACATTAGAACCTGGACGCCAATATAAATCAGATTGATTACGTTGCTTTTCAATGACATGACGTCGTACAAATCCTCGGACGAATTCACTTACAACAGTTATTCCTTGGTTTGGATATTTCACGTCTATGCTTCTCGGATAGTTTCTTTTTTGTCATGATTCAACTAGAAAACAAAATGATAAGATGTAAGATTTTAGATATTATATATAAATCAAAGCTACTAAATATTGAAACTTTATACATACACACATATAAGAAACACATCGAACCGTACTCAAACACTCCT]

[+] EMBL CD074850             [GATACCTGGACTGAACGAGTTATGTATATATTTTCAGATCACGCAACTTACTAACACTATACACCTTCAGTTTATAATTGAAGATCATTAAAATTGGTTAGTTAATTGTTAAATATAACATACAATTTATCCAATAAACATAAACCAATACCAACAAGAGACTGATCAATTGCAATCCTAAATAGCAATGGGAAGATACAAGTGAACAACACCATGTAAATTTAAACTTCACCCTATTGCACAAGAAAGTGGATATCAGGAATCAGTAGCTAAGTGGATAACGTGATGGCGTCTAAAGCGAAAGGTACTGGGTTCGAGTCCCAGTGTGAACATCAACAAGTCTGAGATGCAGGTACATCCATCTGACAAGTCCCAAATAGGACGAAACGCGCGTCAAACTGTATTCCACTGCTAGCCACTATCCATCTTTGTTTACAATGCTTGTGACTTCAGGCAACATCGAGGCAATACGCACAGTATGCACATATGCCAACAACAGACTGATCAATTGCAATCTCGACATGATGTTGAACGTAAAATTTTTAATTGTGCTCCAATTAAATTTAAACGTAAAATTGTATCTAAATTTTTAATTATATTCAAATTAGTACAATGATTATGATTTAATTTAGATGGTAGAAATGACATAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD081023             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CACAGTATGCACATATGCCAACAACAGACTGATCNAATGCAATCTCGACATGATGTTGAACGTAAAATTNTTAATTGTGCTCCAATTAAATTTAAACGTAAAATTGTATCTAAATTTTTAATTATATTCAAATTAGTACAATGATTATGATTTAATTTAGATGGTAG AATTAAATAATGTAATTTGATTGATAAATTTGATGGTATCGCTGATGGTTTATGATTGATTATTGATTTTGAAAAGGATTTCTTCTTTGAATGAGGACGTTTCACTTTGATAGGAAGGTCATCAGTGGAAGATAATCGTTTTCTTGGTAATAGATTAATATTATGACTGACATTAGAACCTGGACGCCAATATAAATCAGATTGATTACGTTGCTTTTCAATGACATGACGTCGTACAAATCCTCGGACGAATTCACTTACAACAGTTATTCCTTGGTTTGGATATTTCACGTCTATGCTTCTCGGATAGTTTCTTTTTTGTCATGATTCAACTAGAAAACAAAATGATAAGATGTAAGATTTTAGATATTATATATAAATCAAAGCTACTAAATATTGAAACTTTATACATACACACATATAAGAAACACATCGAACCGTACTCAAACACTCCT]


>consensus_320#0 GATACCTGGACTGAACGAGTTATGTATATATTTTCAGATCACGCAACTTACTAACACTAT ACACCTTCAGTTTATAATTGAAGATCATTAAAATTGGTTAGTTAATTGTTAAATATAACA TACAATTTATCCAATAAACATAAACCAATACCAACAAGAGACTGATCAATTGCAATCCTA AATAGCAATGGGAAGATACAAGTGAACAACACCATGTAAATTTAAACTTCACCCTATTGC ACAAGAAAGTGGATATCAGGAATCAGTAGCTAAGTGGATAACGTGATGGCGTCTAAAGCG AAAGGTACTGGGTTCGAGTCCCAGTGTGAACATCAACAAGTCTGAGATGCAGGTACATCC ATCTGACAAGTCCCAAATAGGACGAAACGCGCGTCAAACTGTATTCCACTGCTAGCCACT ATCCATCTTTGTTTACAATGCTTGTGACTTCAGGCAACATCGAGGCAATACGCACAGTAT GCACATATGCCAACAACAGACTGATCAATTGCAATCTCGACATGATGTTGAACGTAAAAT TTTTAATTGTGCTCCAATTAAATTTAAACGTAAAATTGTATCTAAATTTTTAATTATATT CAAATTAGTACAATGATTATGATTTAATTTAGATGGTAGAAATGACATAACGTAATTTGA TTGATAAATTTGATGGTATCGCTGATGGTTTATGATTGATTATTGATTTTGAAAAGGATT TCTTCTTTGAATGAGGACGTTTCACTTTGATAGGAAGGTCATCAGTGGAAGATAATCGTT TTCTTGGTAATAGATTAATATTATGACTGACATTAGAACCTGGACGCCAATATAAATCAG ATTGATTACGTTGCTTTTCAATGACATGACGTCGTACAAATCCTCGGACGAATTCACTTA CAACAGTTATTCCTTGGTTTGGATATTTCACGTCTATGCTTCTCGGATAGTTTCTTTTTT GTCATGATTCAACTAGAAAACAAAATGATAAGATGTAAGATTTTAGATATTATATATAAA TCAAAGCTACTAAATATTGAAACTTTATACATACACACATATAAGAAACACATCGAACCG TACTCAAACACTCCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)