Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 3251 cluster # 3251       Sequences # 2       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3251#0 length = 513 sequences # 2  
consensusID : consensus_3251#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 513
fasta sequence 
                              [ACTGTGGGAAATCGTGCTCACTGTTACCTTCAGTTGAGTATATTTGTAGCTAAATTTAAAGAATATGTGAAACCTATGATTGATCATTGGGTCAATGTTCGTCTTGGACATTGGGATGATTCAATCAGATATCTGGCTGCTTGTGCTTTAGGCAAACTATACATAGCTGATCCTGATTACATGATGGAAATTGTCTTACCTCAGATCATCAATGGTTCAATTAATTCTACCCTACACAATCAACAGGGGTGTATATATGGAACAGGTGAATTGGTATGTTCGTCATCCAGTTGTGTTATAAATGAGGAAAATCTACTCAAGATTAAGGAAATTGTTCCAGCACTTAAAAGTGCCAACAAATTTCGTGGTCTAAGTGGTGAATTAATTCGAAAAGCAACTGCTCATTTTATTCAGAAGTGTGCAATGGCCAAATTACCGTTTCACGATGATCCAATAATTGAAGTTTGGCGTGAATTCTTGGACGATTGTGTTGGACACAAAAATCCTGAAGTA]

[+] EMBL CD117265             [ACTGTGGGAAATCGTGCTCACTGTTACCTTCAGTTGAGTATATTTGTAGCTAAATTTAAAGAATATGTGAAACCTATGATTGATCATTGGGTCAATGTTCGTCTTGGACATTGGGATGATTCAATCAGATATCTGGCTGCTTGTGCTTTAGGCAAACTATACATAGCTGATCCTGATTACATGATGGAAATTGTCTTACCTCAGATCATCAATGGTTCAATTAATTCTACCCTACACAATCAACAGGGGTGTATATATGGAACAGGTGAATTGGTATGTTCGTCATCCAGTTGTGTTATAAATGAGGAAAATCTACTCAAGATTAAGGAAATTGTTCCAGCACTTAAAAGTGCCAACAAATTTCGTGGTCTAAGTGGTGAATTAATTCGAAAAGCAACTGCTCATTTTATTCAGAAGTGTGCAATGGCCAAATTACCGTTTCACGATGATCCAATAATTGAAGTTTGGCGTGAATTCTTGGACGATTGTGTTGGACACAAAAATCCTGAAGT ]
[-] EMBL CD116939             [ CTGTGGGAAATCGTGCTCACTGTTACCTTCAGTTGAGTATATTTGTAGCTAAATTTAAAGAATATGTGAAACCTATGATTGATCATTTGGTCAATGTTCGTCTTGGACATTGGGATGATTCAATCAGATATCTGGCTGCTTGTGCTTTAGGCAAACTATACATAGCTGATCCTGATTACATGATGGAAATTGTCTTACCTCAGATCATCAATGGTTCAATTAATTCTACCCTACACAATCAACAGGGGTGTATATATGGAACAGGTGAATTGGTATGTTCGTCATCCAGTTGTGTTATAAATGAGGAAAATCTACTCAAGATTAAGGAAATTGTTCCAGCACTTAAAAGTGCCAACAAATTTCGTGGTCTAAGTGGTGAATTAATTCGAAAAGCAACTGCTCATTTTATTCAGAAGTGTGCAATGGCCAAATTACCGTTTCACGATGATCCAATAATTGAAGTTTGGCGTGAATTCTTGGACGATTGTGTTGGACACAAAAATCCTGAAGTA]




>consensus_3251#0
ACTGTGGGAAATCGTGCTCACTGTTACCTTCAGTTGAGTATATTTGTAGCTAAATTTAAA
GAATATGTGAAACCTATGATTGATCATTGGGTCAATGTTCGTCTTGGACATTGGGATGAT
TCAATCAGATATCTGGCTGCTTGTGCTTTAGGCAAACTATACATAGCTGATCCTGATTAC
ATGATGGAAATTGTCTTACCTCAGATCATCAATGGTTCAATTAATTCTACCCTACACAAT
CAACAGGGGTGTATATATGGAACAGGTGAATTGGTATGTTCGTCATCCAGTTGTGTTATA
AATGAGGAAAATCTACTCAAGATTAAGGAAATTGTTCCAGCACTTAAAAGTGCCAACAAA
TTTCGTGGTCTAAGTGGTGAATTAATTCGAAAAGCAACTGCTCATTTTATTCAGAAGTGT
GCAATGGCCAAATTACCGTTTCACGATGATCCAATAATTGAAGTTTGGCGTGAATTCTTG
GACGATTGTGTTGGACACAAAAATCCTGAAGTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)