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Schistosoma mansoni
cluster # 3261 cluster # 3261       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3261#0 length = 545 sequences # 2  

consensusID : consensus_3261#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 545
fasta sequence
                              [AACAAAGATGGGAGTGATTTTATCTTACGGATAGATTGTGGCAGATTATTCCAGAGTTTGGAAAATTTACTAGTAAAGTAATTCATATAGGGAGATGATTTAGAATGGGTTTGTTTCACTAATGACAAAAAGTTACGGATGTTGTAATTAGAAGTTTCTGCATATTGAATTACTTCACTGAATGTAAAAGATAGTTTGTTAAGTATTTTGAAGAAAAATGACTATTCATTAAGTTGAACACCATCGTTTATTTACCTATTCATTTTGATCACATATTTTTATTGTGTCAGCATGTTTTTATTTATTGGGTAGAGGTAATGAATTATGAGGATGGTAATAATGTGATGTTAATGAATAAAGTTTCCGAATAATTTAGTAATCACATGGTGTGATTAAAATGTATGAATTAAAATACTTGGGAAGTAAATTTAAATTCGTGTCACTTCTCATGTTGGTTGGTATTTATGTGTTTATTTTAGACACGTAAATTCTGGTATATTTTGTCACTGAAAAGAGCATGTGGAATAATCATATTGTGGAAAAAT]

[+] EMBL CD069993             [AACAAAGATGGGAGTGATTTTATCTTACGGATAGATTGTGGCAGATTATTCCAGAGTTTGGAAAATTTACTAGTAAAGTAATTCATATAGGGAGATGATTTAGAATGGGTTTGTTTCACTAATGACAAAAAGTTACGGATGTTGTAATTAGAAGTTTCTGCATATTGAATTACTTCACTGAATGTAAAAGATAGTTTGTTAAGTATTTTGAAGAAAAATGACTATTCATTAAGTTGAACACCATCGTTTATTTACCTATTCATTTTGATCACATATTTTTATTGTGTCAGCATGTTTTTATTTATTGGGTAGAGGTAATGAATTATGAGGATGGTAATAATGTGATGTTAATGAATAAAGTTTCCGAATAATTTAGTAATCACATGGTGTGATTAAAATGTATGAATTAAAATACTTGGGAAGTAAATTTAAATTCGTGTCACTTCTCATGTTGGTTGGTATTTATGTGTTTATTTTAGACACGTAAATTCTGGTATATTTTGTCACTGAAAAGAGC                            ]
[-] EMBL CD069956             [                                           GATTATTCCAGAGTTTGGAAAATTTACTAGTAAAGTAATTCATATAGGGAGATGATTTAGAATGGGTTTGTTTCACTAATGACAAAAAGTTACGGATGTTGTAATTAGAAGTTTCTGCATATTGAATTACTTCACTGAATGTAAAAGATAGTTTGTTAAGTATTTTGAAGAAAAATGACTATTCATTAAGTTGAACACCATCGTTTATTTACCTATTCATTTTGATCACATATTTTTATTGTGTCAGCATGTTTTTATTTATTGGGTAGAAGTAATGAATTATGAGGATGGTAATAATGTGATGTTAATGAATAAAGTTTCCGAATAATTTAGTAATCACATGGTGTGATTAAAATGTATGAATTAAAATACTTGGGAAGTAAATTTAAATTTGTGTCACTTCTCATGTTGGTTGGTATTTATGTGTTTATTTTAGACACGTAAATTCTGGTATATTTTGTCACTGAAAAGAGCATGTGGAATAATCATATTGTGGAAAAAT]


>consensus_3261#0 AACAAAGATGGGAGTGATTTTATCTTACGGATAGATTGTGGCAGATTATTCCAGAGTTTG GAAAATTTACTAGTAAAGTAATTCATATAGGGAGATGATTTAGAATGGGTTTGTTTCACT AATGACAAAAAGTTACGGATGTTGTAATTAGAAGTTTCTGCATATTGAATTACTTCACTG AATGTAAAAGATAGTTTGTTAAGTATTTTGAAGAAAAATGACTATTCATTAAGTTGAACA CCATCGTTTATTTACCTATTCATTTTGATCACATATTTTTATTGTGTCAGCATGTTTTTA TTTATTGGGTAGAGGTAATGAATTATGAGGATGGTAATAATGTGATGTTAATGAATAAAG TTTCCGAATAATTTAGTAATCACATGGTGTGATTAAAATGTATGAATTAAAATACTTGGG AAGTAAATTTAAATTCGTGTCACTTCTCATGTTGGTTGGTATTTATGTGTTTATTTTAGA CACGTAAATTCTGGTATATTTTGTCACTGAAAAGAGCATGTGGAATAATCATATTGTGGA AAAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)