Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 3264 cluster # 3264       Sequences # 2       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3264#0 length = 399 sequences # 2  
consensusID : consensus_3264#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 399
fasta sequence 
                              [TAGGTATTCAAAGTGGAATGTACTAAGATTCAGTTTCAGTGAGAACATTAACACTAAGATTGAGGTATATTCAGCTGACAATCCCCAGATACGATGAAATTTACATCAAGGATTCTACTTTACTGATTATTTACCTAATATTATTTGATCATTTAAAAAGGTGTTTGATTAAAGCCTAATATCCAAAAAATGTCTGAATCGTTTCCTACTTTACGCGAAAGATTATTTTTAGGCTTAACATAGTCATATTTTAAATTACTGTCTAATTATTTTTAACATCAAAAATGTGTAATTCATGAATGCGCGTTTCTAACATGTGTCATCATTAAGTAAATAACTTTGAATTTATTCATGATGTGGGGGGATAGGTTAATGAAATGATAAGTTTCTACTGATATC]

[+] EMBL CD197128             [TAGGTATTCAAAGTGGAATGTACTAAGATTCAGTTTCAGTGAGAACATTAACACTAAGATTGAGGTATATTCAGCTGACAATCCCCAGATACGATGAAATTTACATCAAGGATTCTACTTTACTGATTATTTACCTAATATTATTTGATCATTTAAAAAGGTGTTTGATTAAAGCCTAATATCCAAAAAATGTCTGAATCGTTTCCTACTTTACGCGAAAGATTATTTTTAGGCTTAACATAGTCATATTTTAAATTACTGTCTAATTATTTTTAACATCAAAAATGTGTAATTCATGAATGCGCGTTTCTAACATGTGTCATCATTAAGTAAATAACTTTGAATTTATTCATGATGTGGGGGGATAGGTTAATGAAATGATAAGTTTCTACTGATAT ]
[-] EMBL CD196828             [ AGGTATTCAAAGTGGAATGTACTAAGATTCAGTTTCAGTGAGAACATTAACACTAAGATTGAGGTATATTCAGCTGACAATCCCCAGATACGATGAAATTTACATCAAGGATTCTACTTTACTGATTATTTACCTAATATTATTTGATCATTTAAAAAGGTGTTTGATTAAAGCCTAATATCCAAAAAATGTCTGAATCGTTTCCTACTTTACGCGAAAGATTATTTTTAGGCTTAACATAGTCATATTTTAAATTACTGTCTAATTATTTTTAACATCAAAAATGTGTAATTCATGAATGCGCGTTTCTAACATGCGTTATCATTAAGTAAATAACTTTGAATTTATTCATGATGTGGGGGGATAGGTTAATGAAATGATAAGTTTCTACTGATATC]




>consensus_3264#0
TAGGTATTCAAAGTGGAATGTACTAAGATTCAGTTTCAGTGAGAACATTAACACTAAGAT
TGAGGTATATTCAGCTGACAATCCCCAGATACGATGAAATTTACATCAAGGATTCTACTT
TACTGATTATTTACCTAATATTATTTGATCATTTAAAAAGGTGTTTGATTAAAGCCTAAT
ATCCAAAAAATGTCTGAATCGTTTCCTACTTTACGCGAAAGATTATTTTTAGGCTTAACA
TAGTCATATTTTAAATTACTGTCTAATTATTTTTAACATCAAAAATGTGTAATTCATGAA
TGCGCGTTTCTAACATGTGTCATCATTAAGTAAATAACTTTGAATTTATTCATGATGTGG
GGGGATAGGTTAATGAAATGATAAGTTTCTACTGATATC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)