cluster # 3411

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Schistosoma mansoni
cluster # 3411 cluster # 3411 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3411#0 length = 551 sequences # 2

consensusID : consensus_3411#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 551
fasta sequence

                              [AGATCACTGAGCGGGCATCAGTTGACTAATTCACGATACTGCGCTTCTATCTTTCATTGTCATCAGTGAATAAATGTGTTACACTCGACACCGTTGGACCCCACTGGTCGCGGCTGCTCACTAGAACTCCGAGGATTTTCTCTTAAAGTTGGTCACTAATCAGCACATGATAATTCTCAGTATGTGGTTGTGGAGGTTGGTCGGTTCATGATTTCAATCTCCACAATCTCATACTAAAGATTAGATGTTTATTTTTCCAACAAATTATGCTGTAGTTTTTGTTCACTTCACTTTTAATGCTAAAATACTTCAAAAAAGAAAAAAATCTAAACATTTAGTGCAACTCGGTAAGGGTTAATGTATCCGACTCTGAATTAAGCTTACTGAATGAGGTCAAAATATACCAACCACTCATCAAGTGACCGAAGTAAGATTTCTAACTTAAGATTGTTTCAATGATTGAAAATCGAACAGAACAGTAAATATATTGTAAGTTATATGGTAAAAAACGTTTAATCAGATAGA-TTTTTTTCGACAGTTTGTATTNTATT]

[+] EMBL CD198189             [AGATCACTGAGCGGGCATCAGTTGACTAATTCACGATACTGCGCTTCTATCTTTCATTGTCATCAGTGAATAAATGTGTTACACTCGACACCGTTGGACCCCACTGGTCGCGGCTGCTCACTAGAACTCCGAGGATTTTCTCTTAAAGTTGGTCACTAATCAGCACATGATAATTCTCAGTATGTGGTTGTGGAGGTTGGTCGGTTCATGATTTCAATCTCCACAATCTCATACTAAAGATTAGATGTTTATTTTTCCAACAAATTATGCTGTAGTTTTTGTTCACTTCACTTTTAATGCTAAAATACTTCAAAAAAGAAAAAAATCTAAACATTTAGTGCAACTCGGTAAGGGTTAATGTATCCGACTCTGAATTAAGCTTACTGAATGAGGTCAAAATATACCAACCACTCATCAAGTGACCGAAGTAAGATTTCTAACTTAAGATTGTTTCAATGATTGAAAATCGAACAGAACAGTAAATATATTGTAAGTTATATGGTAAAAAACGTTTAATCAGATAGA TTTTTTTCGACAGTTTGTATTNTATT]
[+] EMBL CD198161             [AGATCACTGAGCGGGCATCAGTTGACTAATTCACGATACTGCGCTTCTATCTTTCATTGTCATCAGTGAATAAATGTGTTACACTCGACACCGTTGGACCCCACTGGTCGCGGCTGCTCACTAGAACTCCGAGGATTTTCTCTTAAAGTTGGTCACTAATCAGCACATGATAATTCTCAGTATGTGGTTGTGGAGGTTGGTCGGTTCATGATTTCAATCTCCACAATCTCATACTAAAGATTAGATGTTTATTTTTCCAACAAACTATGCTGTAGTTTTTGTTCACTTCACTTTTAATGCTAAAATACTTCAAAAAAGAAAAAAATCTAAACATTTAGTGCAACTCGGTAAGGGTTAATGTATCCGACTCTGAATTAAGCTTACTGAATGAGGTCAAAATATACCAACCACTCATCAAGTGACCGAAGTAAGATTTCTAACTTAAGATTGTTTCAATGATTGAAAATCGAACAGAACAGTAAATATATTGTAAGTTATATGGTAAAAAACGTTTAATCAGATAGATTTTTTTTCGACAGTT           ]




>consensus_3411#0
AGATCACTGAGCGGGCATCAGTTGACTAATTCACGATACTGCGCTTCTATCTTTCATTGT
CATCAGTGAATAAATGTGTTACACTCGACACCGTTGGACCCCACTGGTCGCGGCTGCTCA
CTAGAACTCCGAGGATTTTCTCTTAAAGTTGGTCACTAATCAGCACATGATAATTCTCAG
TATGTGGTTGTGGAGGTTGGTCGGTTCATGATTTCAATCTCCACAATCTCATACTAAAGA
TTAGATGTTTATTTTTCCAACAAATTATGCTGTAGTTTTTGTTCACTTCACTTTTAATGC
TAAAATACTTCAAAAAAGAAAAAAATCTAAACATTTAGTGCAACTCGGTAAGGGTTAATG
TATCCGACTCTGAATTAAGCTTACTGAATGAGGTCAAAATATACCAACCACTCATCAAGT
GACCGAAGTAAGATTTCTAACTTAAGATTGTTTCAATGATTGAAAATCGAACAGAACAGT
AAATATATTGTAAGTTATATGGTAAAAAACGTTTAATCAGATAGATTTTTTTCGACAGTT
TGTATTNTATT

clustalw multiple alignements is not computed in this case