Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 3581 cluster # 3581       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3581#0 length = 756 sequences # 2  

consensusID : consensus_3581#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 756
fasta sequence
                              [CTTTGATTGGTCGCAGTACAGATTGTCTATTGAAGTTGCCTTAGTTTATATGCAGTTTGTAATGCTATTTCTTTTTTTCTACGTATATTTACTAGACACTTTTGATGAAGATGCAAGTGTAGCTACTTTTACGAAAGATGGTAGTGCTGTGATTAGTCTGCCGCTCTCTTAAATAGATTATATATACAACGTTTCATATCCCTTTGGTTTGTTACTTTTATTAATTAATCTGCGTGATTTGATTACACATATACTTTTGTTCGCACTATTTTTGCATTTGGTTTACTATTTGTTTTTGTCATGGTGGAGAAGATTTGTAGTTCAGGTGGATGAGCTAAGAGAACAAAACTCCATCAAAATTGTTTTTGTCGTCGAGAAAGGCTGATTTTGCACTTTCAGAATAATATTTAGGTGTTTGGTTCTGTTTAAAGCGGTCGTTGATTATCCTGAATGATAACTAAAGTTCTGCAATTAAACTACTTCAACCTGGACTTCAGTGCCTACGAAATTATCTCTGTCATCCCAAGTACATTAATTTAAAAGTTTACAAATATTACCAAATCATTTACAAATATACACTTTCGGAAAAAATCTTCTTTTTCTTGTAGTCTTGTCGTCTGGTATCCCGGATTAAATATCGTCCTCCTAATTGGTCTCGTAAACTACGTGTTTCTTGTTCATCTTAACAGATAGTGATATGTAAGCTTTGCCCATATATATTGTATTTTAATATATTGTTTCAATATACAATACTCT]

[+] EMBL CD078506             [CTTTGATTGGTCGCAGTACAGATTGTCTATTGAAGTTGCCTTAGTTTATATGCAGTTTGTAATGCTATTTCTTTTTTTCTACGTATATTTACTAGACACTTTTGATGAAGATGCAAGTGTAGCTACTTTTACGAAAGATGGTAGTGCTGTGATTAGTCTGCCGCTCTCTTAAATAGATTATATATACAACGTTTCATATCCCTTTGGTTTGTTACTTTTATTAATTAATCTGCGTGATTTGATTACACATATACTTTTGTTCGCACTATTTTTGCATTTGGTTTACTATTTGTTTTTGTCATGGTGGAGAAGATTTGTAGTTCAGGTGGATGAGCTAAGAGAACAAAACTCCATCAAAATTGTTTTTGTCGTCGAGAAAGGCTGATTTTGCACTTTCAGAATAATATTTAGGTGTTTGGTTCTGTTTAAAGCGGTCGTTGATTATCCTGAATGATAACTAAAGTTCTGCAATTAAACTACTTCAACCTGGACTTCAGTGCCTACGAAATTATCTCTGTCATCCCAAGTACATTAATTTAAAAGTTTACAAATATTACCAAATCATTTACAAATATACACTTTCG                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD072978             [                                                                                                                                                                                                                          TATTAATTAATCTGCGTGATTTGATTACACATATACTTTTGTTCGCACTATTTTTGCATTTGGTTTACTATTTGTTTTTGTCATGGTGGAGAAGATTTGTAGTTCAGGTGGATGAGCTAAGAGAACAAAACTCCATCAAAATTGTTTTTGTCGTCGAGAAAGGCTGATTTTGCACTTTCAGAATAATATTTAGGTGTTTGGTTCTGTTTAAAGCGGTCGTTGATTATCCTGAATGATAACTAAAGTTCTGCAATTAAACTACTTCAACCTGGACTTCAGTGCCTACGAAATTATCTCTGTCATCCCAAGTACATTAATTTAAAAGTTTACAAATATTACCAAATCATTTACAAATATACACTTTCGGAAAAAATCTTCTTTTTCTTGTAGTCTTGTCGTCTGGTATCCCGGATTAAATATCGTCCTCCTAATTGGTCTCGTAAACTACGTGTTTCTTGTTCATCTTAACAGATAGTGATATGTAAGCTTTGCCCATATATATTGTATTTTAATATATTGTTTCAATATACAATACTCT]


>consensus_3581#0 CTTTGATTGGTCGCAGTACAGATTGTCTATTGAAGTTGCCTTAGTTTATATGCAGTTTGT AATGCTATTTCTTTTTTTCTACGTATATTTACTAGACACTTTTGATGAAGATGCAAGTGT AGCTACTTTTACGAAAGATGGTAGTGCTGTGATTAGTCTGCCGCTCTCTTAAATAGATTA TATATACAACGTTTCATATCCCTTTGGTTTGTTACTTTTATTAATTAATCTGCGTGATTT GATTACACATATACTTTTGTTCGCACTATTTTTGCATTTGGTTTACTATTTGTTTTTGTC ATGGTGGAGAAGATTTGTAGTTCAGGTGGATGAGCTAAGAGAACAAAACTCCATCAAAAT TGTTTTTGTCGTCGAGAAAGGCTGATTTTGCACTTTCAGAATAATATTTAGGTGTTTGGT TCTGTTTAAAGCGGTCGTTGATTATCCTGAATGATAACTAAAGTTCTGCAATTAAACTAC TTCAACCTGGACTTCAGTGCCTACGAAATTATCTCTGTCATCCCAAGTACATTAATTTAA AAGTTTACAAATATTACCAAATCATTTACAAATATACACTTTCGGAAAAAATCTTCTTTT TCTTGTAGTCTTGTCGTCTGGTATCCCGGATTAAATATCGTCCTCCTAATTGGTCTCGTA AACTACGTGTTTCTTGTTCATCTTAACAGATAGTGATATGTAAGCTTTGCCCATATATAT TGTATTTTAATATATTGTTTCAATATACAATACTCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)