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Schistosoma mansoni
cluster # 3701 cluster # 3701       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3701#0 length = 715 sequences # 2  

consensusID : consensus_3701#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 715
fasta sequence
                              [TCGAAAGTTGATGGTCCAAAATTTGTAACGGTAATGCAGTTTAAAGAATACCGACTTCGTCTAACTTTCAACTTAATTGTTTTTAGATTTATTTCTATCTGGTTAGAACTAACAATGAATGGTTGATAAATATAAATTGACTAAAGACAAGTTATATGGTATGTAAAGTCCAAACATATGCATTTGATATTTTAAAAGTCTATTGAGATATTGAGCATGTACTACCATATATTACTAATAAATATATGTGGAAGCTCATAAACTTTAAGTTATACGAATTTATCCATCACTACTTAAAGTTATCAACCATGGACGACAAGCGAATGCCAAAATAAGAAAAATAAACATGCGGATAGGGAATCCTTGTGGTGTTTGTTGCTGTCAAGCCCGTATGGGTTATTCTAGCTTCCGGACAAATCAATTTATTCAATCGAATTTAGTCACATGTCGACATTGTTAATTATCCGCATTTCAGCATTGACTACTATCATGTAAACACATGTGTGTGCACTTCTTATTCTATTCATCACATATCTGTAATTTATCTTTGTTTGACTATAAATATCGATTCACTCTCGGNTAAATTGTGTTGGNTCACTCTGTTCTCCATCATGCGTCATTTCGNTTCGTCTCAATCTCTCCTCTTATCTTCTGNCTCTCTGNTCCCCTGATGNNCTG-TCTGATC-ACGATTGTGAG-AATATACGTATTTGAATTT]

[+] EMBL CD078739             [TCGAAAGTTGATGGTCCAAAATTTGTAACGGTAATGCAGTTTAAAGAATACCGACTTCGTCTAACTTTCAACTTAATTGTTTTTAGATTTATTTCTATCTGGTTAGAACTAACAATGAATGGTTGATAAATATAAATTGACTAAAGACAAGTTATATGGTATGTAAAGTCCAAACATATGCATTTGATATTTTAAAAGTCTATTGAGATATTGAGCATGTACTACCATATATTACTAATAAATATATGTGGAAGCTCATAAACTTTAAGTTATACGAATTTATCCATCACTACTTAAAGTTATCAACCATGGACGACAAGCGAATGCCAAAATAAGAAAAATAAACATGCGGATAGGGAATCCTTGTGGTGTTTGTTGCTGTCAAGCCCGTATGGGTTATTCTAGCTTCCGGACAAATCAATTTATTCAATCGAATTTAGTCACATGTCGACATTGTTAATTATCCGCATTTCAGCATTGACTACTATCATGTAAACACATGTGTGTGCACTTCTTATTCTATTCATCACATATCTGTAATTTATCTTTGTTTGACTATAAATATCGATTCACTCTCGGNTAAATTGTGTTGGNTCACTCTGTTCTCCATCATGCGTCATTTCGNTTCGTCTCAATCTCTCCTCTTATCTTCTGNCTCTCTGNTCCCCTGATGNNCTG TCTGATC ACGATTGTGAG AATATACGTATTTGAAT  ]
[-] EMBL CD073201             [                                                                                                                                                                                          ATA TTTAAAAGTCTATTGAGATATTGAGCATGTACTACCATATATTACTAATAAATATATGTGGAAGCTCATAAACTTTAAGTTATACGAATTTATCCATCACTACTTAAAGTTATCAACCATGGACGACAAGCGAATGCCAAAATAAGAAAAATAAACATGCGGATAGGGAATCCTTGTGGTGTTTGTTGCTGTCAAGCCCGTATGGGTTATTCTAGCTTCCGGACAAATCAATTTATTCAATCGAATTTAGTCACATGTCGACATTGTTAATTATCCGCATTTCAGCATTGACTACTATCATGTAAACACATGTGTGTGCACTTCTTATTCTATTCATCACATATCTGTAATTTATCTTTGTTTGACTATAAATATCGATTCACTCTCGGTTAAATTGTGTTGGTTCACTCTGTTCTCCATCATGCGTCATTTCGTTTCGTCTCAATCTCTCCTCTTATCTTCTGTCTCTCTGTTTCCCTGATTGTCTGTTCTGATCAACGATTGTGAGAAATATACGTATTTGAAATT]


>consensus_3701#0 TCGAAAGTTGATGGTCCAAAATTTGTAACGGTAATGCAGTTTAAAGAATACCGACTTCGT CTAACTTTCAACTTAATTGTTTTTAGATTTATTTCTATCTGGTTAGAACTAACAATGAAT GGTTGATAAATATAAATTGACTAAAGACAAGTTATATGGTATGTAAAGTCCAAACATATG CATTTGATATTTTAAAAGTCTATTGAGATATTGAGCATGTACTACCATATATTACTAATA AATATATGTGGAAGCTCATAAACTTTAAGTTATACGAATTTATCCATCACTACTTAAAGT TATCAACCATGGACGACAAGCGAATGCCAAAATAAGAAAAATAAACATGCGGATAGGGAA TCCTTGTGGTGTTTGTTGCTGTCAAGCCCGTATGGGTTATTCTAGCTTCCGGACAAATCA ATTTATTCAATCGAATTTAGTCACATGTCGACATTGTTAATTATCCGCATTTCAGCATTG ACTACTATCATGTAAACACATGTGTGTGCACTTCTTATTCTATTCATCACATATCTGTAA TTTATCTTTGTTTGACTATAAATATCGATTCACTCTCGGNTAAATTGTGTTGGNTCACTC TGTTCTCCATCATGCGTCATTTCGNTTCGTCTCAATCTCTCCTCTTATCTTCTGNCTCTC TGNTCCCCTGATGNNCTGTCTGATCACGATTGTGAGAATATACGTATTTGAATTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)