cluster # 3714

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Schistosoma mansoni
cluster # 3714 cluster # 3714 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3714#0 length = 645 sequences # 2

consensusID : consensus_3714#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 645
fasta sequence

                              [GTTAACAAAAGATTGCAGAAGGAATTAATGGAGTTGTTAATGTCCAACGATAAAAGCGTGACGGCATTCCCAGATGGTGAAAATCTCACTCATTGGTTAGCATCTATACGTGGTCCTGATGGAACGGTATATGAAGGTCAGCAATACAAACTTTCACTCGAGTTTGGTCCTAACTATCCATACAGTCCTCCTAATGTGCGTTTTGTTTCTAAATGTTATCATCCTAATGTTGATACTCGTGGAGTAATATGCTTAGATATTCTGAAAGAAATGTGGTCTCCCTTACTGACTGTAGAAAATCTGCTGTTATCCATTCGAAGTTTATTAGCAGAACCCAATAATGATAGTCCTTTAAATGGCCAAGCAGCCCAACTCTGGTCTAATCCTTCTGCATTCCGTACTGAAATGATGAAATTTCAAGCATCATCGTCTAACAGCTAGTCTATGTAAATATTTCAGTGTCTGGCTATTGTGTACAGTCAAATTTTCTCCTTAATGGTCTGCAAACTTTTGTACTATCCAATCACTTTCCCTCTATTTTCAAGTTTCTGTATTCCACCCAAAATCCATGTATTTATCCAAACANCAGGCATACTCANAAGACTTGCGTATNAATATTATATACATACANAATAANATGGTTCA]

[+] EMBL CD078764             [GTTAACAAAAGATTGCAGAAGGAATTAATGGAGTTGTTAATGTCCAACGATAAAAGCGTGACGGCATTCCCAGATGGTGAAAATCTCACTCATTGGTTAGCATCTATACGTGGTCCTGATGGAACGGTATATGAAGGTCAGCAATACAAACTTTCACTCGAGTTTGGTCCTAACTATCCATACAGTCCTCCTAATGTGCGTTTTGTTTCTAAATGTTATCATCCTAATGTTGATACTCGTGGAGTAATATGCTTAGATATTCTGAAAGAAATGTGGTCTCCCTTACTGACTGTAGAAAATCTGCTGTTATCCATTCGAAGTTTATTAGCAGAACCCAATAATGATAGTCCTTTAAATGGCCAAGCAGCCCAACTCTGGTCTAATCCTTCTGCATTCCGTACTGAAATGATGAAATTTCAAGCATCATCGTCTAACAGCTAGTCTATGTAAATATTTCAGTGTCTGGCTATTGTGTACAGTCAAATTTTCTCCTTAATGGTCTGCAAACTTTTGTACTATCCAATCACTTTCCCTCTATTTTCAAGTTTCTGTATTCCACCCAAAATCCATGTATTTATCCAAACANCAGGCATACTCANAAGACTTGCGTATNAATATTATATACATACANAATAANATGGTTC ]
[-] EMBL CD073223             [                                                                                                                    TGATGGAACGGTATATGAAGGTCAGCAATACAAACTTTCACTCGAGTTTGGTCCTAACTATCCATACAGTCCTCCTAATGTGCGTTTTGTTTCTAAATGTTATCATCCTAATGTTGATACTCGTGGAGTAATATGCTTAGATATTTTGAAAGAAATGTGGTCTCCCTTACTGACTGTAGAAAATCTGCTGTTATCCATTCGAAGTTTATTAGCAGAACCCAATAATGATAGTCCTTTAAATGGCCAAGCAGCCCAACTCTGGTTTAATCCTTCTGCATTCCGTACTGAAATGATGAAATTTCAAGCATCATCGTTTAACAGCTAGTCTATGTAAATATTTCAGTGTCTGGCTATTGTGTACAGTCAAATTTTCTCCTTAATGGTCTGCAAACTTTTGTACTATCCAATCACTTTCCCTCTATTTTCAAGTTTCTGTATTCCACCCAAAATCCATGTATTTATCCAAACACAAGGCATACTCAAAAGACTTGCGTATAAATATTATATACATACAAAATAAAATGTTTta]




>consensus_3714#0
GTTAACAAAAGATTGCAGAAGGAATTAATGGAGTTGTTAATGTCCAACGATAAAAGCGTG
ACGGCATTCCCAGATGGTGAAAATCTCACTCATTGGTTAGCATCTATACGTGGTCCTGAT
GGAACGGTATATGAAGGTCAGCAATACAAACTTTCACTCGAGTTTGGTCCTAACTATCCA
TACAGTCCTCCTAATGTGCGTTTTGTTTCTAAATGTTATCATCCTAATGTTGATACTCGT
GGAGTAATATGCTTAGATATTCTGAAAGAAATGTGGTCTCCCTTACTGACTGTAGAAAAT
CTGCTGTTATCCATTCGAAGTTTATTAGCAGAACCCAATAATGATAGTCCTTTAAATGGC
CAAGCAGCCCAACTCTGGTCTAATCCTTCTGCATTCCGTACTGAAATGATGAAATTTCAA
GCATCATCGTCTAACAGCTAGTCTATGTAAATATTTCAGTGTCTGGCTATTGTGTACAGT
CAAATTTTCTCCTTAATGGTCTGCAAACTTTTGTACTATCCAATCACTTTCCCTCTATTT
TCAAGTTTCTGTATTCCACCCAAAATCCATGTATTTATCCAAACANCAGGCATACTCANA
AGACTTGCGTATNAATATTATATACATACANAATAANATGGTTCA

clustalw multiple alignements is not computed in this case