cluster # 3742

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Schistosoma mansoni
cluster # 3742 cluster # 3742 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3742#0 length = 677 sequences # 2

consensusID : consensus_3742#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 677
fasta sequence

                              [CATTGTTATATTATACAAATAAATATACTACTTAATTCTTTAAACAGTTGTGATAACAGTAGTATTGATAGTAGTCCTAGTCTTAGTCCTAGTCGTAGTCGTAGTAGTGACAATAATTAGGAGTGCATATCTCGAAGGAACTTTAACCATATTGATGATCAATGTTTCCATGGATACTTGAACACATTTTTTTGCATTATCATTACCAGGAATTTAATTAATCAAAAAAGTAAAAAAAAAACAAACAAAAAGAAAAGAAGAATAGAAGGAAGAAGGAGGATTGTTTTAAAGAAGGTTATATACCTCAATTATACATAGATACATATTAATCAATGGGTGGTATTCATTCAAATAAAAGGATTAGTAAAACTGAATTAAAAAAACTATCAACTAAAACACATTTTACA-GAAGCCCAAATTAAAAAATGGTATAAAGGTTTTATTAAAGATTGTCCTTCAGG-TTTATTGAATCGTTCAACATTTCTTAGTATGTATACACAATTTTTTCCAGATGGTAAAGCAAGATTATTCTATGAACATTTAATTCGTACATTTGATCAANATGCTANTGGAAGTATTGATTTTAATGAATTTTTAACAGCTATTAGTATTNCTCAATCNGGGTAGTCCAGAAAGACAAACTTGAAATTAGCTTTNCAATTATNTGATATNGATAGA]

[+] EMBL AI977226             [CATTGTTATATTATACAAATAAATATACTACTTAATTCTTTAAACAGTTGTGATAACAGTAGTATTGATAGTAGTCCTAGTCTTAGTCCTAGTCGTAGTCGTAGTAGTGACAATAATTAGGAGTGCATATCTCGAAGGAACTTTAACCATATTGATGATCAATGTTTCCATGGATACTTGAACACATTTTTTTGCATTATCATTACCAGGAATTTAATTAATCAAAAAAGTAAAAAAAAAACAAACAAAAAGAAAAGAAGAATAGAAGGAAGAAGGAGGATTGTTTTAAAGAAGGTTATATACCTCAATTATACATAGATACATATTAATCAATGGGTGGTATTCATTCAAATAAAAGGATTAGTAAAACTGAATTAAAAAAACTATCAACTAAAACACATTTTACA GAAGCCCAAATTAAAAAATGGTATAAAGGTTTTATTAAAGATTGTCCTTCAGG TTTATTGAATCGTTCAACATTTCTTAGTATGTATACACAATTTTTTCCAGATGGTAAAGCAAGATTATTCTATGAACATTTAATTCG                                                                                                                                  ]
[+] EMBL AA559588             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATCAACTAAAACACNTTTTACAGGAAGCCCAAATTAAAAAATGGTAGAAAGGTTTTATTAAAGATTGTCCTTCAGGNTTTATTGAATCGTNCAACATTTCTTAGTNTGTATACACAATTTTNNCCAGATGGTAAAGCNAGATTATTCTATGAACATTTATTTCGTACATTTGATCAANATGCTANTGGAAGTATTGATTTTAATGAATTTTTAACAGCTATTAGTATTNCTCAATCNGGGTAGTCCAGAAAGACAAACTTGAAATTAGCTTTNCAATTATNTGATATNGATAGA]




>consensus_3742#0
CATTGTTATATTATACAAATAAATATACTACTTAATTCTTTAAACAGTTGTGATAACAGT
AGTATTGATAGTAGTCCTAGTCTTAGTCCTAGTCGTAGTCGTAGTAGTGACAATAATTAG
GAGTGCATATCTCGAAGGAACTTTAACCATATTGATGATCAATGTTTCCATGGATACTTG
AACACATTTTTTTGCATTATCATTACCAGGAATTTAATTAATCAAAAAAGTAAAAAAAAA
ACAAACAAAAAGAAAAGAAGAATAGAAGGAAGAAGGAGGATTGTTTTAAAGAAGGTTATA
TACCTCAATTATACATAGATACATATTAATCAATGGGTGGTATTCATTCAAATAAAAGGA
TTAGTAAAACTGAATTAAAAAAACTATCAACTAAAACACATTTTACAGAAGCCCAAATTA
AAAAATGGTATAAAGGTTTTATTAAAGATTGTCCTTCAGGTTTATTGAATCGTTCAACAT
TTCTTAGTATGTATACACAATTTTTTCCAGATGGTAAAGCAAGATTATTCTATGAACATT
TAATTCGTACATTTGATCAANATGCTANTGGAAGTATTGATTTTAATGAATTTTTAACAG
CTATTAGTATTNCTCAATCNGGGTAGTCCAGAAAGACAAACTTGAAATTAGCTTTNCAAT
TATNTGATATNGATAGA

clustalw multiple alignements is not computed in this case