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Schistosoma mansoni
cluster # 4117 cluster # 4117       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4117#0 length = 823 sequences # 3  

consensusID : consensus_4117#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 823
fasta sequence
                              [TACGGTGACTATTTTATTAAGAAAATATATGTAAAGTCAAATGATAAAAATTTCTACAGAAATAAAAAGTTAGGTAATTAGCCTGTTCAATTTATAAAAGATAATGTGTGCTTAAATACAACCACCGGTAAGTAGGTATTAAATGTTATAGATGATTGACATGAAAGAACAGTCATCAATTAATTCGATATAATAATATAAGTGACAAGATTAGTTTGTAGTATTCAATAACAGATTGGACAGAAAATGATAAGCAAAATAAAAAAAATGAC--TGTTAAATAATTGATCACATTACTGTAAAGAAAAATTCACGTCAATACGCATGAAATAAATAATACTTAACAGGATGTTTTAATAATAATAATAATAATAAAAATGTACACAAAAAGAATGTAGGTATATACAATTGATGGTTAAAATATCAGGGAACATTAAATGTACTGATTGTAACCACATCCGCTCTCCTTCATTTTTCTTCTTTTAAACATATACTTTGGCCAATGCATCAGATCCAGCACTAGCCATAAAATGTTGTGTTGGATGAAATGCAACTGCATTAATAGCTTCACCAAATTTTTTCCTATGACCTGTAATCTCTTGAATACATAATTTTGTATTGATATCCCATATTCGTATGGAACAGTCATGACTTGCTGAGAGTAATAATGTTCCTTTTGAATTTAAACTGAGTGTTGTTACTGAATCCAAATGAGCAGTCAATGAATGAACACATTTGCCACTTAACGAATCCCAAAATCGAATTTGACGATCATCATGAGCACTAATTATTAATGAGAGATGAGGATGAGAAATGACAGAATTT]

[+] EMBL CD075003             [TACGGTGACTATTTTATTAAGAAAATATATGTAAAGTCAAATGATAAAAATTTCTACAGAAATAAAAAGTTAGGTAATTAGCCTGTTCAATTTATAAAAGATAATGTGTGCTTAAATACAACCACCGGTAAGTAGGTATTAAATGTTATAGATGATTGACATGAAAGAACAGTCATCAATTAATTCGATATAATAATATAAGTGACAAGATTAGTTTGTAGTATTCAATAACAGATTGGACAGAAAATGATAAGCAAAATAAAAAAAATGAC  TGTTAAATAATTGATCACATTACTGTAAAGAAAAATTCACGTCAATACGCATGAAATAAATAATACTTAACAGGATGTTTTAATAATAATAATAATAATAAAAATGTACACAAAAAGAATGTAGGTATATACAATTGATGGTTAAAATATCAGGGAACATTAAATGTACTGATTGTAACCACATCCGCTCTCCTTCATTTTTCTTCTTTTAAACATATACTTTGGCCAATGCATCAGATCCAGCACTAGCCATAAAATGTTGTGTTGGATGAAATGCAACTGCATTAATAGCTTCACCAAATTTTTTCCTATGACCTGTAATCTCTTGAATACATAATTTTGTATTGATATCCCATATTCGTATGGAACAGTCATGACTTGCTGAGAGTAATAATGTTCCTTTTGAATTTAAACTGAGTGTTGTTACTGAATCCAAATGAGCAGTCAATGAATGAACACATTTGCCACTTAACGAATCCCAAAATCGAATTTGACGATCATCATGAGCACTAATTATTAATGAGAGATGAGGATGAGAAATGACAGAATTT]
[+] EMBL CD134363             [                                                                          gtacTAGCCTGTTCAATTTATAAAAGATAATGTGTGCCTAAATACAACCACCGGTAAGTAGGTATTAAATGTTACAGATGATTGACATGAAAGAACAGTCATCAATTAATTCGATATAATAATATAAGTGACAAGATTAGTTTGTAGTATTCAATAACAGATTGGACAGAAAATGATAAGCAAAATAAAAAAAATGACTGTGTTAAATGATTGGTCACATTACTGTAAAGAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD078418             [                                                                                                       ATGTGTGCTTAAATACAACCACCGGTAAGTAGGTATTAAATGTTATAGATGATTGACATGAAAGAACAGTCATCAATTAATTCGATATAATAATATAAGTGACAAGATTAGTTTGTAGTATTCAATAACAGATTGGACAGAAAATGATAAGCAAAATAAAAAAAATGAC  TGTTAAATAATTGATCACATTACTGTAAAGAAAAATTCACGTCAATACGCATGAAATAAATAATACTTAACAGGATGTTTTAATAATAATAATAATAATAAAAATGTACACAAAAAGAATGTAGGTATATACAATTGATGGTTAAAATATCAGGGAACATTAAATGTACTGATTGTAACCACATCCGCTCTCCTTCATTTTTCTTCTTTTAAACATATACTTTGGCCAATGCATCAGATCCAGCACTAGCCATAAAATGTTGTGTTGGATGAAATGCAACTGCATTAATAGCTTCACCAAATTTTTTCCTATGACCTGTAATCTCTTGAATACATAATTTTGTATTGATATCCCATATTCGTATGGAACAGTCATGACTTGCTGAGAGTAATAATGTTCCTTTTGAATTTAAACTGAGTGTTGTTACTGAATCCAAATGAGC                                                                                                             ]


>consensus_4117#0 TACGGTGACTATTTTATTAAGAAAATATATGTAAAGTCAAATGATAAAAATTTCTACAGA AATAAAAAGTTAGGTAATTAGCCTGTTCAATTTATAAAAGATAATGTGTGCTTAAATACA ACCACCGGTAAGTAGGTATTAAATGTTATAGATGATTGACATGAAAGAACAGTCATCAAT TAATTCGATATAATAATATAAGTGACAAGATTAGTTTGTAGTATTCAATAACAGATTGGA CAGAAAATGATAAGCAAAATAAAAAAAATGACTGTTAAATAATTGATCACATTACTGTAA AGAAAAATTCACGTCAATACGCATGAAATAAATAATACTTAACAGGATGTTTTAATAATA ATAATAATAATAAAAATGTACACAAAAAGAATGTAGGTATATACAATTGATGGTTAAAAT ATCAGGGAACATTAAATGTACTGATTGTAACCACATCCGCTCTCCTTCATTTTTCTTCTT TTAAACATATACTTTGGCCAATGCATCAGATCCAGCACTAGCCATAAAATGTTGTGTTGG ATGAAATGCAACTGCATTAATAGCTTCACCAAATTTTTTCCTATGACCTGTAATCTCTTG AATACATAATTTTGTATTGATATCCCATATTCGTATGGAACAGTCATGACTTGCTGAGAG TAATAATGTTCCTTTTGAATTTAAACTGAGTGTTGTTACTGAATCCAAATGAGCAGTCAA TGAATGAACACATTTGCCACTTAACGAATCCCAAAATCGAATTTGACGATCATCATGAGC ACTAATTATTAATGAGAGATGAGGATGAGAAATGACAGAATTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)