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Schistosoma mansoni
cluster # 4138 cluster # 4138       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4138#0 length = 881 sequences # 3  

consensusID : consensus_4138#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 881
fasta sequence
                              [GTAGAAGACAGAGTGAAACCGTAAGTATGAAGGAATATTGAAACTCAAGACCTAAAGTGAGTACATCTGAGACACGGTAGGTGACTATGAATCACGTAACGAGGTAATCGTTTACCGGCAGTAAGTAAAACTTAATTATTATAGTGGGTGAACTGATAGAATTGACTACTAATCACAAAAGCAATGGTGAAAAGGCATGTGGTAGCGATAGTAATAAAAATAATAATTTAAGACTAAGTTATATAAGAATAAGTTAAATTTAACTTATACAGCCAACATGGTGAAAATTAGTTGCAATCATTCTTCAGTGGTCAGATTTCTATGTAAGTTAAAATATTAATCATACCTTGAAACATTATCTGGCTTAGGCCCATAACTGGAAAACTGTAGGTAAATGCAGAAATCGCTAACAAAAGAAGACTGTAACAAGGGCTTATTACTCTCCTCAATAATGGAACTACTAAAGTTATTTTATCTCAGTAATCATCACAATTCTCGAAAAAAACGAGAGTAAATATTCTCTGGACAATTGTTAATTTTATCCCGATAGCAAAATCTATGTGGTTACTTTCAGTCAGTCAGTTACGAGCGACGTAGAACCTTATTCCAGCAGACATAAAACTGAACAGATCTGGGAGCAATAAATTGTTATGGCAAGTTTAAATAATTCTTGTTACGTAAGACAGTCCCTAAGACTACTTAATTTTCTTAATAGAATATTTAAAACAGATCTAGAGATTGACAAGGTTAATGACTGTCATCTACGTCTGAGATATGGTGATTAAACGCTGTAGAACTAAAAAGATTGTTTTGTGTAAGTGTGGCTCAGTAACGTTAGCAAGTAACCCTGTGAAGGGCAGTGACTTTTGTACTTGTTGTGA]

[+] EMBL CD196736             [GTAGAAGACAGAGTGAAACCGTAAGTATGAAGGAATATTGAAACTCAAGACCTAAAGTGAGTACATCTGAGACACGGTAGGTGACTATGAATCACGTAACGAGGTAATCGTTTACCGGCAGTAAGTAAAACTTAATTATTATAGTGGGTGAACTGATAGAATTGACTACTAATCACAAAAGCAATGGTGAAAAGGCATGTGGTAGCGATAGTAATAAAAATAATAATTTAAGACTAAGTTATATAAGAATAAGTTAAATTTAACTTATACAGCCAACATGGTGAAAATTAGTTGCAATCATTCTTCAGTGGTCAGATTTCTATGTAAGTTAAAATATTAATCATACCTTGAAACATTATCTGGCTTAGGCCCATAACTGGAAAACTGTAGGTAAATGCAGAAATCGCTAACAAAAGAAGACTGTAACAAGGGCTTATTACTCTCCTCAATAATGGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD196602             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TCGCTAACAAAAGAAGACTGTAACAAGGGCTTATTACTCTCCTCAATAATGGAACTACTAAAGTTATTTTATCTCAGTAATCATCACAATTCTCGAAAAAAACGAGAGTAAATATTCTCTGGACAATTGTTAATTTTATCCCGATAGCAAAATCTATGTGGTTACTTTCAGTCAGTCAGTTACGAGCGACGTAGAACCTTATTCCAGCAGACATAAAACTGAACAGATCTGGGAGCAATAAATTGTTATGGCAAGTTTAAATAATTCTTGTTACGTAAGACAGTCCCTAAGACTACTTAATTTTCTTAATAGAATATTTAAAACAGATCTAGAGATTGACAAGGTTAATGACTGTCATCTACGTCTGAGATATGGTGATTAAACGCTGTAGAACTAAAAAGATTGTTTTGTGTAAGTGTGGCTCAGTAACGTTAGCAAGTAACCCTGTGAA                           ]
[-] EMBL CD196783             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TAATGGAACTACTAAAGTTATTTTATCTCAGTAATCATCACAATTCTCGAAAAAAACGAGAGTAAATATTCTCTGGACAATTGTTAATTTTATCCCGATAGCAAAATCTATGTGGTTACTTTCAGTCAGTCAGTTACGAGCGACGTAGAACCTTATTCCAGCAGACATAAAACTGAACAGATCTGGGAGCAATAAATTGTTATGGCAAGTTTAAATAATTCTTGTTACGTAAGACAGTCCCTAAGACTACTTAATTTTCTTAATAGAATATTTAAAACAGATCTAGAGATTGACAAGGTTAATGACTGTCATCTACGTCTGAGATATGGTGATTAAACGCTGTAGAACTAAAAAGATTGTTTTGTGTAAGTGTGGCTCAGTAACGTTAGCAAGTAACCCTGTGAAGGGCAGTGACTTTTGTACTTGTTGTGA]


>consensus_4138#0 GTAGAAGACAGAGTGAAACCGTAAGTATGAAGGAATATTGAAACTCAAGACCTAAAGTGA GTACATCTGAGACACGGTAGGTGACTATGAATCACGTAACGAGGTAATCGTTTACCGGCA GTAAGTAAAACTTAATTATTATAGTGGGTGAACTGATAGAATTGACTACTAATCACAAAA GCAATGGTGAAAAGGCATGTGGTAGCGATAGTAATAAAAATAATAATTTAAGACTAAGTT ATATAAGAATAAGTTAAATTTAACTTATACAGCCAACATGGTGAAAATTAGTTGCAATCA TTCTTCAGTGGTCAGATTTCTATGTAAGTTAAAATATTAATCATACCTTGAAACATTATC TGGCTTAGGCCCATAACTGGAAAACTGTAGGTAAATGCAGAAATCGCTAACAAAAGAAGA CTGTAACAAGGGCTTATTACTCTCCTCAATAATGGAACTACTAAAGTTATTTTATCTCAG TAATCATCACAATTCTCGAAAAAAACGAGAGTAAATATTCTCTGGACAATTGTTAATTTT ATCCCGATAGCAAAATCTATGTGGTTACTTTCAGTCAGTCAGTTACGAGCGACGTAGAAC CTTATTCCAGCAGACATAAAACTGAACAGATCTGGGAGCAATAAATTGTTATGGCAAGTT TAAATAATTCTTGTTACGTAAGACAGTCCCTAAGACTACTTAATTTTCTTAATAGAATAT TTAAAACAGATCTAGAGATTGACAAGGTTAATGACTGTCATCTACGTCTGAGATATGGTG ATTAAACGCTGTAGAACTAAAAAGATTGTTTTGTGTAAGTGTGGCTCAGTAACGTTAGCA AGTAACCCTGTGAAGGGCAGTGACTTTTGTACTTGTTGTGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)