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Schistosoma mansoni
cluster # 4219 cluster # 4219       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4219#0 length = 999 sequences # 3  

consensusID : consensus_4219#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 999
fasta sequence
                              [TTTGATTCAAATAATTATGATTTAGTATTAGCTTGGTCTATGGCTGCAACTTCTTGTGCCATTACTACACTATCTATTGTATGGGTTCGTTATTGGCGTGCACAAACTAATTTAGCTAATAATTTAAAGTATATGCAGTATCTTTGTTGCCAAAGTTCTGGACTACAATCAATCAATATTTTGTTGAAATTGGCGCATGAACAAGAATTTAAAGCAGCTTTACTTACATATGCTTTGTTGTTAAGACCTACTGACAGTAATACTGCCTTAACTCCTGTACAGTTGGGTTTTCGCGCCGAATCTTGGATTGCTAGACACTTATCACCTCAATCTCATATTTCATTACCATCTTCAATTGGTTCACCAATCACAGGTGATTCTCCTGATTCACAATTTAGCGGTGGCTCTGGTCCACTATTCGATTTATCATTTGATGCAAATAGATCTTTACAAATACTACGACGTTTAGATCTGGTCCGTGGATCGGAATCATCACCAAATGCAGTTAGTCCCGATACAGCATCTGTAGATATTCCAAATGATGGTTTATCTAAATCAATTGGATTAGATCGTCTCTGGGTGACGGATCCATTGTTTAAAGAATCAGATTTAAATTTGTCGAAATCAAATGAATGTTAATTTTCATATAATCTTAATTGAATTTATGATTTATTGTTGTTGAAACGCATTAACTAATCTCTTTTCTAAAACATAAATATGTACTTGTCGAATGTCTTTTTTTCCCTATACAATAGCACACAACATATCTTATTTAGTTATAGTATAGGAAAGTTTCAGTTTCGTATTTTAAACTATTTTTAATATAGACTATAATGAATTTCATATTGCTCCCCGTTTTTTTGGAACACAAAAAGCAAAATATTTTTCTCTCTAATCATTACCTTTTATCATTTGTTCGTTAATGATTCGTCTTAATTTTACATGAAGCTAATGAACCGTANATTTGNTGTATATTACTCCTTGNCTGCNAACAAATTT]

[-] EMBL CD066438             [TTTGATTCAAATAATTATGATTTAGTATTAGCTTGGTCTATGGCTGCAACTTCTTGTGCCATTACTACACTATCTATTGTATGGGTTCGTTATTGGCGTGCACAAACTAATTTAGCTAATAATTTAAAGTATATGCAGTATCTTTGTTGCCAAAGTTCTGGACTACAATCAATCAATATTTTGTTGAAATTGGCGCATGAACAAGAATTTAAAGCAGCTTTACTTACATATGCTTTGTTGTTAAGACCTACTGACAGTAATACTGCCTTAACTCCTGTACAGTTGGGTTTTCGCGCCGAATCTTGGATTGCTAGACACTTATCACCTCAATCTCATATTTCATTACCATCTTCAATTGGTTCACCAATCAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD139311             [     TTCAAATAATTATGATTTAGTATTAGCTTGGTCTATGGCTGCAACTTCTTGTGCCATTACTACACTATCTATTGTATGGGTTCGTTATTGGCGTGCACAAACTAATTTAGCTAATAATTTAAAGTATATGCAGTATCTTTGTTGCCAAAGTTCTGGACTACAATCAATCAATATTTAGTTGAAATTGGCGCATGAACAAGAATTTAAAGCAGCTTTACTCACATATGCTTTGTTGTTAAGACCTACTGACAGTAATACTGCCTTAACTCCTGTACAGTTGGGTTTTCGCGCCGAATCTTGGATTGCTAAGCACTTATCACCTCAATCTCATATTTCATTACCATCTTCAATTGGTTCACCAATCACAGGTGATTCTCCTGATTCACAATTTAGCGGTGGCTCTGGTCCACTATTCGATTTATCATTTGATGCAAATAGATCTTTACAAATACTACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD079158             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGATTCACAATTTAGCGGTGGCTCTGGTCCACTATTCGACTTATCATTTGATGCAAATAGATCTTTACAAATACTACGACGTTTAGATCTGGTCCGTGGATCGGAATCATCACCAAATGCAGTTAGTCCCGATACAGCATCTGTAGATATTCCAAATGATGGTTTATCTAAATCAATTGGATTAGATCGTCTCTGGGTGACGGATCCATTGTTTAAAGAATCAGATTTAAATTTGTCGAAATCAAATGAATGTTAATTTTCATATAATCTTAATTGAATTTATGATTTATTGTTGTTGAAACGCATTAACTAATCTCTTTTCTAAAACATAAATATGTACTTGTCGAATGTCTTTTTTTCCCTATACAATAGCACACAACATATCTTATTTAGTTATAGTATAGGAAAGTTTCAGTTTCGTATTTTAAACTATTTTTAATATAGACTATAATGAATTTCATATTGCTCCCCGTTTTTTTGGAACACAAAAAGCAAAATATTTTTCTCTCTAATCATTACCTTTTATCATTTGTTCGTTAATGATTCGTCTTAATTTTACATGAAGCTAATGAACCGTANATTTGNTGTATATTACTCCTTGNCTGCNAACAAATTT]


>consensus_4219#0 TTTGATTCAAATAATTATGATTTAGTATTAGCTTGGTCTATGGCTGCAACTTCTTGTGCC ATTACTACACTATCTATTGTATGGGTTCGTTATTGGCGTGCACAAACTAATTTAGCTAAT AATTTAAAGTATATGCAGTATCTTTGTTGCCAAAGTTCTGGACTACAATCAATCAATATT TTGTTGAAATTGGCGCATGAACAAGAATTTAAAGCAGCTTTACTTACATATGCTTTGTTG TTAAGACCTACTGACAGTAATACTGCCTTAACTCCTGTACAGTTGGGTTTTCGCGCCGAA TCTTGGATTGCTAGACACTTATCACCTCAATCTCATATTTCATTACCATCTTCAATTGGT TCACCAATCACAGGTGATTCTCCTGATTCACAATTTAGCGGTGGCTCTGGTCCACTATTC GATTTATCATTTGATGCAAATAGATCTTTACAAATACTACGACGTTTAGATCTGGTCCGT GGATCGGAATCATCACCAAATGCAGTTAGTCCCGATACAGCATCTGTAGATATTCCAAAT GATGGTTTATCTAAATCAATTGGATTAGATCGTCTCTGGGTGACGGATCCATTGTTTAAA GAATCAGATTTAAATTTGTCGAAATCAAATGAATGTTAATTTTCATATAATCTTAATTGA ATTTATGATTTATTGTTGTTGAAACGCATTAACTAATCTCTTTTCTAAAACATAAATATG TACTTGTCGAATGTCTTTTTTTCCCTATACAATAGCACACAACATATCTTATTTAGTTAT AGTATAGGAAAGTTTCAGTTTCGTATTTTAAACTATTTTTAATATAGACTATAATGAATT TCATATTGCTCCCCGTTTTTTTGGAACACAAAAAGCAAAATATTTTTCTCTCTAATCATT ACCTTTTATCATTTGTTCGTTAATGATTCGTCTTAATTTTACATGAAGCTAATGAACCGT ANATTTGNTGTATATTACTCCTTGNCTGCNAACAAATTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)