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Schistosoma mansoni
cluster # 4282 cluster # 4282       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4282#0 length = 481 sequences # 3  

consensusID : consensus_4282#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 481
fasta sequence
                              [CCAGGAGGAAAATGAACTATAAAGGAAGGCGCAGCCAGGACAGAGTGTGTTAGAGAATGCTGGTTGGCGGCCTATGCTCCATTGGGAGTAACAGGCGTAAGTAAGTAAGTAATTAATAGCTGGTTAATCCAGATATTCGTGTTCTTCTAATAGAACAATGTCTGTACACACAGTCTTCTCTAAACATTGAGTAGCCTTTCTTAATGTCGATCAGGTAACTAAATGCATACCATGGAACCATTATTTGTAGTTTTCTTTGAAAATATTGCGATTTTGTCTCGTACATAATGTATGCTGTTTGTTAAATTCAATGTTTATTTACCGAAATTAAAAAGTTTATGTTATATGTATACATAGGCTTCGATATTCTATTTTCGTCCTGTGGTGTGCTCTGCAATCAGGGTTCTAAACTGTCTTCTCTGCTGGTCTTTAAGTGTCTGGCCCATCCCATGCTTTTTG-ACGTACTGAAACCCTCCTTCTG]

[+] EMBL CD086045             [CCAGGAGGAAAATGAACTATAAAGGAAGGCGCAGCCAGGACAGAGTGTGTTAGAGAATGCTGGTTGGCGGCCTATGCTCCATTGGGAGTAACAGGCGTAAGTAAGTAAGTAATTAATAGCTGGTTAATCCAGATATTCGTGTTCTTCTAATAGAACAATGTCTGTACACACAGTCTTCTCTAAACATTGTGTAGCCTTTCTTAATGTCGATCAGGTAACTAAATGCATACCATGGAACCATTATTTGTAGTTTTCTTTGAAAATATTGCGATTTTGTCTCGTACATAATGTATGCTGTTTGTTAAATTCAATGTTTATTTACCGAAATTAAAAAGTTTATGTTATATGTATACATAGGCTTCGATATTCTATTCTCGTCCTGTGGTGTGCTCTGCAATCAGGGTTCTAAACTGTCTTCTCTGCTGGTCTTTAAGTGTCTGGCCCATCCCATGCTTTTTG ACGTTCTGAAACCCTCCTTCTG]
[-] EMBL CD086115             [                   TAAAGGAAGGCGCAGCCAGGACAGAGTGTGTTAGAGAATGCTGGTTGGCGGCCTATGCTCCATTGGGAGTAACAGGCGTAAGTAAGTAAGTAATTAATAGCTGGTTAATCCAGATATTCGTGTTCTTCTAATAGAACAATGTCTGTACACACAGTCTTCTCTAAACATTGAGTAGCCTTTCTTAATGTCGATCAGGTAACTAAATGCATACCATGGAACCATTATTTGTAGTTTTCTTTGAAAATATTGCGATTTTGTCTCGTACATAATGTATGCTGTTTGTTAAATTCAATGTTTATTTACCGAAATTAAAAAGTTTATGTTATATGTATACATAGGCTTCGATATTCTATTTTCGTCCTGTGGTGTGCTCTGCAATCAGGGTTCTAAACTGTCTTCTGTGCTGGTCTTTAAGTGTCTGGCCCATCCCATGCTTTTTGAACGTA                 ]
[-] EMBL CD086056             [                   TAAAGGAAGGCGCAGCCAGGACAGAGTGTGTTAGAGAATGCTGGTTGGCGGCCTATGCTCCATTGGGAGTAACAGGCGTAAGTAAGTAAGTAATTAATAGCTGGTTAATCCAGATATTCGTGTTCTTCTAATAGAACAATGTCTGTACACACAGTCTTCTCTAAACATTGAGTAGCCTTTCTTAATGTCGATCAGGTAACTAAATGCATACCATGGAACCATTATTTGTAGTTTTCTTTGAAAATATTGCGATTTTGTCTCGTACATAATGTATGCTGTTTGTTAAATTCAATGTTTATTTACCGAAATTAAAAAGTTTATGTTATATGTATACATAGGCTTCGATATTCTATTTTCGTCCTGTGGTGTGCTCTGCAATCAGGGTTCTAAACTGTCTTCTCTGCTGGTCTTTAAGTGTCTGGCCCATCCCA GCTTTTTG ACGTA                 ]


>consensus_4282#0 CCAGGAGGAAAATGAACTATAAAGGAAGGCGCAGCCAGGACAGAGTGTGTTAGAGAATGC TGGTTGGCGGCCTATGCTCCATTGGGAGTAACAGGCGTAAGTAAGTAAGTAATTAATAGC TGGTTAATCCAGATATTCGTGTTCTTCTAATAGAACAATGTCTGTACACACAGTCTTCTC TAAACATTGAGTAGCCTTTCTTAATGTCGATCAGGTAACTAAATGCATACCATGGAACCA TTATTTGTAGTTTTCTTTGAAAATATTGCGATTTTGTCTCGTACATAATGTATGCTGTTT GTTAAATTCAATGTTTATTTACCGAAATTAAAAAGTTTATGTTATATGTATACATAGGCT TCGATATTCTATTTTCGTCCTGTGGTGTGCTCTGCAATCAGGGTTCTAAACTGTCTTCTC TGCTGGTCTTTAAGTGTCTGGCCCATCCCATGCTTTTTGACGTACTGAAACCCTCCTTCT G



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)