cluster # 4379

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Schistosoma mansoni
cluster # 4379 cluster # 4379 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4379#0 length = 768 sequences # 3

consensusID : consensus_4379#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 768
fasta sequence

                              [GGACTATCAATAAAATATAATAAAACTAATCCATATTATTTAATTTATCCACAACAATCACCAGCATTAGCCGGTGGTTTATTTGCTGTTTGGAAAGATGATTTCTTCCATTATGGTGGATATGATGAAGAAATGAATATATGGGGTGGTGAAAATATTGAATTATCACTTAGAACATGGATGTGTTATGGACAAATTGAAATTATTCCATGTAGTCGCGTTGGTCATATGTTTCGTAATAATCATCCATATACATTTCCTATGGGTAAAGAATTTACCATATTACGTAATCATAAACGTACTGTATTAGTTTGGTTTCAACATGATACTAATTTAACATTAGCTAAAGAATATCTATCTTATTTTTATACAGTATCACCAGAATCTAAAATAATACCAGCTGGAGATATAAGATCACGTAGAATTATTCCAAATTCATTAAATTGTCATACATTCACATGGTATTTGGATAATATTTATCCTTTACTTAAAAAAGAAGCCCAAAGCATTGTAATCAATGAAGATACTTATTATTTAACTGCATTTGACAACTTATAGACTACATTCAAAGTAACTGACAGTCTTGGATGGTGATTTGATTGTGGAGTTTCTAAGGATAAATAC-ATGAATACACCTCAGAAGAGCTAAATTC-AAAGTGAAGACGTTAATTATTGTTTT-AATAGTTTAGTTATC-ATAGATATCTTC-TTTTGAG-AAG-AATTTGA-TATCTACTC-TTTATATAATTG-ATAGAT-GATA-TCAAAT-AAGTGTATA]

[+] EMBL CD082219             [GGACTATCAATAAAATATAATAAAACTAATCCATATTATTTAATTTATCCACAACAATCACCAGCATTAGCCGGTGGTTTATTTGCTGTTTGGAAAGATGATTTCTTCCATTATGGTGGATATGATGAAGAAATGAATATATGGGGTGGTGAAAATATTGAATTATCACTTAGAACATGGATGTGTTATGGACAAATTGAAATTATTCCATGTAGTCGCGTTGGTCATATGTTTCGTAATAATCATCCATATACATTTCCTATGGGTAAAGAATTTACCATATTACGTAATCATAAACGTACTGTATTAGTTTGGTTTCAACATGATACTAATTTAACATTAGCTAAAGAATATCTATCTTATTTTTATACAGTATCACCAGAATCTAAAATAATACCAGCTGGAGATATAAGATCACGTAGAATTATTCCAAATTCATTAAATTGTCATACATTCACATGGTATTTGGATAATATTTATCCTTTACTTAAAAAAGAAGCCCAAAGCATTGTAATCAATGAAGATACTTATTATTTAACTGCATTTGACAACTTATAGACTACATTCAAAGTAACTGACAGTCTTGGATGGTGATTTGATTGTGGAGTTTCTAAGGATAAATAC ATGAATACACCTCAGAAGAGCTAAATTC AAAGTGAAGACGTTAATTATTGTTTT AATAGTTTAGTTATC ATAGATATCTTC TTTTGAG AAG AATTTGA TATCTACTC TTTATATAATTG ATAGAT GATA TCAAAT AAGTG    ]
[+] EMBL CD118782             [                                                         TCACCAGCATTAGCCGGTGGTTTATTTGCTGTTTGGAAAGATGATTTCTTCCATTATGGTGGATATGATGAAGAAATGAATATATGGGGTGGTGAAAATATTGAATTATCACTTAGAACATGGATGTGTTATGGACAAATTGAAATTATTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD075830             [                                                                                                                                                                               CATGGATGTGTTATGGACAAATTGAAATTATTCCATGTAGTCGCGTTGGTCATATGTTTCGTAATAATCATCCATATACATTTCCTATGGGTAAAGAATTTACCATATTACGTAATCATAAACGTACTGTATTAGTTTGGTTTCAACATGATACTAATTTAACATTAGCTAAAGAATATCTATCTTATTTTTATACAGTATCACCAGAATTTAAAATAATACCAGCTGGAGATATAAGATCACGTAGAATTATTCCAAATTCATTAAATTGTCATACATTCACATGGTATTTGGATAATATTTATCCTTTACTTAAAAAAGAAGCCCAAAGCATTGTAATCAATGAAGATACTTATTATTTAACTGCATTTGACAACTTATAGACTACATTCAAAGTAACTGACAGTCTTGGATGGTGATTTGATTGTGGAGTTTTTAAGGAT AATACAATGAATACACCTCAGAAGAGCTAAATTCAAAAGTGAAGACGTTAATTATTGTTTTAAATAGTTTAGTTATCAATAGATATCTTCTTTTTGAGAAAGAAATTTGATTATCTACTCTTTTATATAATTGTATAGATAGATATTCAAATAAAGTGTATA]




>consensus_4379#0
GGACTATCAATAAAATATAATAAAACTAATCCATATTATTTAATTTATCCACAACAATCA
CCAGCATTAGCCGGTGGTTTATTTGCTGTTTGGAAAGATGATTTCTTCCATTATGGTGGA
TATGATGAAGAAATGAATATATGGGGTGGTGAAAATATTGAATTATCACTTAGAACATGG
ATGTGTTATGGACAAATTGAAATTATTCCATGTAGTCGCGTTGGTCATATGTTTCGTAAT
AATCATCCATATACATTTCCTATGGGTAAAGAATTTACCATATTACGTAATCATAAACGT
ACTGTATTAGTTTGGTTTCAACATGATACTAATTTAACATTAGCTAAAGAATATCTATCT
TATTTTTATACAGTATCACCAGAATCTAAAATAATACCAGCTGGAGATATAAGATCACGT
AGAATTATTCCAAATTCATTAAATTGTCATACATTCACATGGTATTTGGATAATATTTAT
CCTTTACTTAAAAAAGAAGCCCAAAGCATTGTAATCAATGAAGATACTTATTATTTAACT
GCATTTGACAACTTATAGACTACATTCAAAGTAACTGACAGTCTTGGATGGTGATTTGAT
TGTGGAGTTTCTAAGGATAAATACATGAATACACCTCAGAAGAGCTAAATTCAAAGTGAA
GACGTTAATTATTGTTTTAATAGTTTAGTTATCATAGATATCTTCTTTTGAGAAGAATTT
GATATCTACTCTTTATATAATTGATAGATGATATCAAATAAGTGTATA

clustalw multiple alignements is not computed in this case