These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_4379#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 768 fasta sequence [GGACTATCAATAAAATATAATAAAACTAATCCATATTATTTAATTTATCCACAACAATCACCAGCATTAGCCGGTGGTTTATTTGCTGTTTGGAAAGATGATTTCTTCCATTATGGTGGATATGATGAAGAAATGAATATATGGGGTGGTGAAAATATTGAATTATCACTTAGAACATGGATGTGTTATGGACAAATTGAAATTATTCCATGTAGTCGCGTTGGTCATATGTTTCGTAATAATCATCCATATACATTTCCTATGGGTAAAGAATTTACCATATTACGTAATCATAAACGTACTGTATTAGTTTGGTTTCAACATGATACTAATTTAACATTAGCTAAAGAATATCTATCTTATTTTTATACAGTATCACCAGAATCTAAAATAATACCAGCTGGAGATATAAGATCACGTAGAATTATTCCAAATTCATTAAATTGTCATACATTCACATGGTATTTGGATAATATTTATCCTTTACTTAAAAAAGAAGCCCAAAGCATTGTAATCAATGAAGATACTTATTATTTAACTGCATTTGACAACTTATAGACTACATTCAAAGTAACTGACAGTCTTGGATGGTGATTTGATTGTGGAGTTTCTAAGGATAAATAC-ATGAATACACCTCAGAAGAGCTAAATTC-AAAGTGAAGACGTTAATTATTGTTTT-AATAGTTTAGTTATC-ATAGATATCTTC-TTTTGAG-AAG-AATTTGA-TATCTACTC-TTTATATAATTG-ATAGAT-GATA-TCAAAT-AAGTGTATA] [+] EMBL CD082219 [GGACTATCAATAAAATATAATAAAACTAATCCATATTATTTAATTTATCCACAACAATCACCAGCATTAGCCGGTGGTTTATTTGCTGTTTGGAAAGATGATTTCTTCCATTATGGTGGATATGATGAAGAAATGAATATATGGGGTGGTGAAAATATTGAATTATCACTTAGAACATGGATGTGTTATGGACAAATTGAAATTATTCCATGTAGTCGCGTTGGTCATATGTTTCGTAATAATCATCCATATACATTTCCTATGGGTAAAGAATTTACCATATTACGTAATCATAAACGTACTGTATTAGTTTGGTTTCAACATGATACTAATTTAACATTAGCTAAAGAATATCTATCTTATTTTTATACAGTATCACCAGAATCTAAAATAATACCAGCTGGAGATATAAGATCACGTAGAATTATTCCAAATTCATTAAATTGTCATACATTCACATGGTATTTGGATAATATTTATCCTTTACTTAAAAAAGAAGCCCAAAGCATTGTAATCAATGAAGATACTTATTATTTAACTGCATTTGACAACTTATAGACTACATTCAAAGTAACTGACAGTCTTGGATGGTGATTTGATTGTGGAGTTTCTAAGGATAAATAC ATGAATACACCTCAGAAGAGCTAAATTC AAAGTGAAGACGTTAATTATTGTTTT AATAGTTTAGTTATC ATAGATATCTTC TTTTGAG AAG AATTTGA TATCTACTC TTTATATAATTG ATAGAT GATA TCAAAT AAGTG ] [+] EMBL CD118782 [ TCACCAGCATTAGCCGGTGGTTTATTTGCTGTTTGGAAAGATGATTTCTTCCATTATGGTGGATATGATGAAGAAATGAATATATGGGGTGGTGAAAATATTGAATTATCACTTAGAACATGGATGTGTTATGGACAAATTGAAATTATTCC ] [-] EMBL CD075830 [ CATGGATGTGTTATGGACAAATTGAAATTATTCCATGTAGTCGCGTTGGTCATATGTTTCGTAATAATCATCCATATACATTTCCTATGGGTAAAGAATTTACCATATTACGTAATCATAAACGTACTGTATTAGTTTGGTTTCAACATGATACTAATTTAACATTAGCTAAAGAATATCTATCTTATTTTTATACAGTATCACCAGAATTTAAAATAATACCAGCTGGAGATATAAGATCACGTAGAATTATTCCAAATTCATTAAATTGTCATACATTCACATGGTATTTGGATAATATTTATCCTTTACTTAAAAAAGAAGCCCAAAGCATTGTAATCAATGAAGATACTTATTATTTAACTGCATTTGACAACTTATAGACTACATTCAAAGTAACTGACAGTCTTGGATGGTGATTTGATTGTGGAGTTTTTAAGGAT AATACAATGAATACACCTCAGAAGAGCTAAATTCAAAAGTGAAGACGTTAATTATTGTTTTAAATAGTTTAGTTATCAATAGATATCTTCTTTTTGAGAAAGAAATTTGATTATCTACTCTTTTATATAATTGTATAGATAGATATTCAAATAAAGTGTATA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||