cluster # 4383

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Schistosoma mansoni
cluster # 4383 cluster # 4383 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4383#0 length = 720 sequences # 3

consensusID : consensus_4383#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 720
fasta sequence

                              [AGGCCAGAATTTGGCACGAGGCGCAAGTTGAAATCTCGATGCAAGCAGTTAACGGGTCGGATTTTATGGGGTTGACAGCAATGTATCTGCGAAAAAAATCATGTTAATGGAGCAAAGACGTAACCGGAAAGCTTCAAAGAAAGAGGTTAAACTTGCTAAGAAGTTAGCAATCGTTGAGGGAAAGCTCATATGTTTTATTTGCAACAAGAATCGGAAAAGTTTAAACTGTGCCAGATCAGTTTGTCGCACATGTTGTCAAAATCAAAGTGAATCAAGTCTGAATTCATTAACAAACACTTTTTGTTCATTCCATCATCGTCAAATAAATAATGCTATATTAGATTAGTAAATTTTTCTTTTCACAAATTTGGACATGTTAACGATGGTCATAGCAATTGTGTGCATGTTCTTGAGATTCTGCTTCCATCCATCAATGTGGGTGAATGTCAGAAATATATAGACTTATTGAACAAACTTCAAGTTGAATGTTATGGGCTTTATTTTGACCTATAAACTATTATCATACAATTTACCATCCTTGAGTTATTCCTAGTCTATTAATGGCTGCCTCCCATATTCACATCCATGTTTAGCTGAATCATGTGCAAATGTTATTTCCTATTTTATTGATACGATGTGGTCAGTCTATTTGGTATATAAACTCAGTATGTTTGAAATATAATGATTCATACCCCAAAAAAAAAGTAAAAAAAANCATNT]

[+] EMBL CD079614             [AGGCCAGAATTTGGCACGAGGCGCAAGTTGAAATCTCGATGCAAGCAGTTAACGGGTCGGATTTTATGGGGTTGACAGCAATGTATCTGCGAAAAAAATCATGTTAATGGAGCAAAGACGTAACCGGAAAGCTTCAAAGAAAGAGGTTAAACTTGCTAAGAAGTTAGCAATCGTTGAGGGAAAGCTCATATGTTTTATTTGCAACAAGAATCGGAAAAGTTTAAACTGTGCCAGATCAGTTTGTCGCACATGTTGTCAAAATCAAAGTGAATCAAGTCTGAATTCATTAACAAACACTTTTTGTTCATTCCATCATCGTCAAATAAATAATGCTATATTAGATTAGTAAATTTTTCTTTTCACAAATTTGGACATGTTAACGATGGTCATAGCAATTGTGTGCATGTTCTTGAGATTCTGCTTCCATCCATCAATGTGGGTGAATGTCAGAAATATATAGACTTATTGAACAAACTTCAAGTTGAATGTTATGGGCTTTATTTTGACCTATAAACTATTATCATACAATTTACCATCCTTGAGTTATTCCTAGTCTATTAATGGCTGCCTCCCATATTCACATCCATGTTTAGCTGAATCATGTGCAAATGTTATTTCCTATTTTATTGATACGATGTGGTCAGTCTATTTGGTATATAAACTCAGTATGTTTGAAATATAATGA                                   ]
[-] EMBL CD073878             [                                                                    GGGTTGACAGCAATGTATCTGCGAAAAAAATCATGTTAATGGAGCAAAGACGTAACCGGAAAGCTTCAAAGAAAGAGGTTAAACTTGCTAAGAAGTTAGCAATCGTTGAGGGAAAGCTCATATGTTTTATTTGCAACAAGAATCGGAAAAGTTTAAACTGTGCCAGATCAGTTTGTCGCACATGTTGTCAAAATCAAAGTGAATCAAGTCTGAATTCATTAACAAACACTTTTTGTTCATTCCATCATCGTCAAATAAATAATGCTATATTAGATTAGTAAATTTTTCTTTTCACAAATTTGGACATGTTAACGATGGTCATAGCAATTGTGTGCATGTTCTTGAGATTCTGCTTCCATCCATCAATGTGGGTGAATGTCAGAAATATATAGACTTATTGAACAAACTTCAAGTTGAATGTTATGGGCTTTATTTTGACCTATAAACTATTATCATACAATTTACCATCCTTGAGTTATTCCTAGTCTATTAATGGCTGCCTCCCATATTCACATCCATGTTTAGCTGAATCATGTGCAAATGTTATTTCCTATTTTATTGATACGATGTGGTCAGTCTATTTGGTATATAAACTCAGTATGATTGAAATATAATGATTCATACCCCAAAAAAAAAGTAAAAAAAANCATNT]
[-] EMBL CD139871             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CATGTTAACGATGGTCATAGCAATTGTGTGCATGTTCTTGAGATTCTGCTTCCATCCATCAATGTGGGTGAATGTCAGAAATATATAGACTTATTGAACAAACTTCAAGTTGAATGTTATGGGCTTTATTTTGACCTATAAACTATTATCATACAATTTACCATCCTTGAGTTATTCCTAGTCTATTAATGGCTGCCTCCCATATTCACATCCATGTTTAGCTGAATCGTGTGCAAATGTTATTTC                                                                                                      ]




>consensus_4383#0
AGGCCAGAATTTGGCACGAGGCGCAAGTTGAAATCTCGATGCAAGCAGTTAACGGGTCGG
ATTTTATGGGGTTGACAGCAATGTATCTGCGAAAAAAATCATGTTAATGGAGCAAAGACG
TAACCGGAAAGCTTCAAAGAAAGAGGTTAAACTTGCTAAGAAGTTAGCAATCGTTGAGGG
AAAGCTCATATGTTTTATTTGCAACAAGAATCGGAAAAGTTTAAACTGTGCCAGATCAGT
TTGTCGCACATGTTGTCAAAATCAAAGTGAATCAAGTCTGAATTCATTAACAAACACTTT
TTGTTCATTCCATCATCGTCAAATAAATAATGCTATATTAGATTAGTAAATTTTTCTTTT
CACAAATTTGGACATGTTAACGATGGTCATAGCAATTGTGTGCATGTTCTTGAGATTCTG
CTTCCATCCATCAATGTGGGTGAATGTCAGAAATATATAGACTTATTGAACAAACTTCAA
GTTGAATGTTATGGGCTTTATTTTGACCTATAAACTATTATCATACAATTTACCATCCTT
GAGTTATTCCTAGTCTATTAATGGCTGCCTCCCATATTCACATCCATGTTTAGCTGAATC
ATGTGCAAATGTTATTTCCTATTTTATTGATACGATGTGGTCAGTCTATTTGGTATATAA
ACTCAGTATGTTTGAAATATAATGATTCATACCCCAAAAAAAAAGTAAAAAAAANCATNT

clustalw multiple alignements is not computed in this case