cluster # 4401

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Schistosoma mansoni
cluster # 4401 cluster # 4401 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4401#0 length = 799 sequences # 3

consensusID : consensus_4401#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 799
fasta sequence

                              [AACTATTATTATTACCACTTGCGAATGGTGGCATAAAATAGGGTCCAGGTGTAAATGAATGTGGATGAAGATGAGGAAGTAGATGATGGAATGGTGGTGGTACAAAATGAGGTGGTGGAGCTAAAGTTGTTGCAACAGGAATAGGAGTCATTGATGGGTGAAGAAAATGTTGTGGTCTATGACCAATATGTGGAATGCTTCCAAAATAGTAAATATTAAGATTTGGATGTTGTTGTAATTGCGGTATATGGGATTGTTGGGTACCCCCCATTGAAGAGTTAGAAGTAATTCCATGAATTGGAAGATTCGACGATAAATTAGTGGTACTTGTTGATACATGATTTGTTGAAATATTACTGGTTTAATTACAGTTATCAGATGACGTAATTGTTACTGTGTTAGATCGTGATTCA-GATGTATTTGTAGAAGATACTGTAGATGTAGTTTGTGATCTAGCTGATGGTGGGACTGATATGGATACTTGTATAGGATGTGAATTTTCTAAGTTTTCACATCCTACTGGTCTGTAATGAACACGTTGAAGGGAAAGTGGTGAACCCAATGGGCTAACAGCAGGCGTACTAGATTGACTATCTAATCCACTAGAGAATGATTTCTTTCGTAATTTTTGTACAGCTAAACCACGACGACCAGATAATGGGGAACCTTCACTTAGATTTCCAAGTGATAAACGTGATGAACCATTTAATGTTAATTTTAAACTATCTATTCTTTTACGAGGTGGATCAGGAGTACTACTCCTAGATCGAATTTCATCTGGATCATCTGAACTGGGATT]

[-] EMBL CD145688             [AACTATTATTATTACCACTTGCGAATGGTGGCATAAAATAGGGTCCAGGTGTAAATGAATGTGGATGAAGATGAGGAAGTAGATGATGGAATGGTGGTGGTACAAAATGAGGTGGTGGAGCTAAAGTTGTTGCAACAGGAATAGGAGTCATTGATGGGTGAAGAAAATGTTGTGGTCTATGACCAATATGTGGAATGCTTCCAAAATAGTAAATATTAAGATTTGGATGTTGTTGTAATTGCGGTATATGGGATTGTTGGGTACCCCCCATTGAAGAGTTAGAAGTAATTCCATGAATTGGAAGATTCGACGATAAATTAGTGGTACTTGTTGATACATGATTTGTTGAAATATTACTGGTTTAATTACAGTTATCAGATAACGTGAATGTGACTGTGTTAGATCGTGAGTCACGATGTGTTTGTAGAAGATACTGTAGATGTAGTGTGTGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD178511             [                                                                                                      CAAAATGAGGTGGTGGAGCTAAAGTTGTTGCAACAGGAATAGGAGTCATTGATGGGTGAAGAAAATGTTGTGGTCTATGACCAATATGTGGAATGCTTCCAAAATAGTAAATATTAAGATTTGGATGTTGTTGTAATTGCGGTATATGGGATTGTTGGGTACCACCAATTGAAGAGTTAGAAGTAATTCCATGAATTGGAAGATTCGACGATAAATTAGTGGTACTTGTTGATACATGATTTGTTGAAATATTACTGGTTAAATTACAGTTATCAGATGACGTAATTGTTACTGTGTTAGATCGTGATTCA GATGTATTTGTAGAAGATACTGTAGATGTAGTTTGTGATCTAGCTGATGGTGGGACTGATATGGATACTTGTATAGGATGTGAATTTTCTAAGTTTTCACATCCTACTGGTCTGTAATGAACACGTTGAAGGGAAAGTGGTGAACCCAATGGGCTAACAGCAGGCGTACTAGATTGACTATCTAATCCACTAGAGAATGATTTCTTTCGTAATTTTTGTACAGCTAAACCACGACGACCAGA                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD197735             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACAGTTATCAGATGACGTAATTGTTACTGTGTTAGATCGTGATTCA GATGTATTTGTAGAAGATACTGTAGATGTAGTTTGTGATCTAGCTGATGGTGGGACTGATATGGATACTTGTATAGGATGTGAATTTTCTAAGCTTTCACATCCTACTGGTCTGTAATGAACACGTTGAAGGGAAAGTGGTGAGCCTAATGGGCTAACAGCAGGCGTACTAGATTGACTATCTAATCCACTAGAGAATGATTTCTTTCGTAATTTTTGTACAGCTAAACCACGACGACCAGATAATGGGGAACCTTCACTTAGATTTCCAAGTGATAAACGTGATGAACCATTTAATGTTAATTTTAAACTATCTATTCTTTTACGAGGTGGATCAGGAGTACTACTCCTAGATCGAATTTCATCTGGATCATCTGAACTGGGATT]




>consensus_4401#0
AACTATTATTATTACCACTTGCGAATGGTGGCATAAAATAGGGTCCAGGTGTAAATGAAT
GTGGATGAAGATGAGGAAGTAGATGATGGAATGGTGGTGGTACAAAATGAGGTGGTGGAG
CTAAAGTTGTTGCAACAGGAATAGGAGTCATTGATGGGTGAAGAAAATGTTGTGGTCTAT
GACCAATATGTGGAATGCTTCCAAAATAGTAAATATTAAGATTTGGATGTTGTTGTAATT
GCGGTATATGGGATTGTTGGGTACCCCCCATTGAAGAGTTAGAAGTAATTCCATGAATTG
GAAGATTCGACGATAAATTAGTGGTACTTGTTGATACATGATTTGTTGAAATATTACTGG
TTTAATTACAGTTATCAGATGACGTAATTGTTACTGTGTTAGATCGTGATTCAGATGTAT
TTGTAGAAGATACTGTAGATGTAGTTTGTGATCTAGCTGATGGTGGGACTGATATGGATA
CTTGTATAGGATGTGAATTTTCTAAGTTTTCACATCCTACTGGTCTGTAATGAACACGTT
GAAGGGAAAGTGGTGAACCCAATGGGCTAACAGCAGGCGTACTAGATTGACTATCTAATC
CACTAGAGAATGATTTCTTTCGTAATTTTTGTACAGCTAAACCACGACGACCAGATAATG
GGGAACCTTCACTTAGATTTCCAAGTGATAAACGTGATGAACCATTTAATGTTAATTTTA
AACTATCTATTCTTTTACGAGGTGGATCAGGAGTACTACTCCTAGATCGAATTTCATCTG
GATCATCTGAACTGGGATT

clustalw multiple alignements is not computed in this case