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Schistosoma mansoni
cluster # 4475 cluster # 4475       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4475#0 length = 766 sequences # 3  

consensusID : consensus_4475#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 766
fasta sequence
                              [CAACCAAAATCAATGAACATTCTTGATTTCAATATTGAATCGATTAGTAATGAAGAAAATAAAATGATAACGGAAGAGGATAATCATTCTACTAATGAGACAAATGCTAATATTTCTCCAACTACGCCTCCTGGATGGGTAGACTTCTTTGATGATGATGATGATGATGATATTAATAATAATAACAATGATAATAACGATAGTAGCAATGATAATGATAAAAGTACCACTGACAGAAATATTATTGATGATAATAAGGCGATAGGTGTGTGGTAATTTGTATAATTTTCGAATGTGCAGACAGGTATGTGCATTAGTTTTTTGTTTAGACAGTGTTACGTGTAATGTTGCGTAACTTGTTTGATTTAGTTAAGTTGAGTAAATGACTGGAATGTGGCTTGTAGTACAAGTAGTAGTTGCGGATGGACACATTTCTTGGTTAATGAAATTAACTGTACATGATTACGTAGGTTTGATGTGAGTGAAGTATATATTTGTATTTGTATTTGTATTTGTATGTATATTTATATATCTATATATATGTAGCTAATGTGTGTGGATAAATTTGATATTATTGCGAGTGTTGTTTGACATTACATTACTAATTAGTACTACTGAGGATATAGTGAGAAAAACGTCTACACTGTAAGTGTTTTGTTTTGTTAATGTGACGTGATAATAAATTTGGTATACCTAAGTTGGTTGATGACAGATGTGTGATCCACATGTTAGTGGTGAGTATATTCTGGTTGGCACCTAATGAATG]

[+] EMBL CD088083             [CAACCAAAATCAATGAACATTCTTGATTTCAATATTGAATCGATTAGTAATGAAGAAAATAAAATGATAACGGAAGAGGATAATCATTCTACTAATGAGACAAATGCTAATATTTCTCCAACTACGCCTCCTGGATGGGTAGACTTCTTTGATGATGATGATGATGATGATATTAATAATAATAACAATGATAATAACGATAGTAGCAATGATAATGATAAAAGTACCACTGACAGAAATATTATTGATGATAATAAGGCGATAGGTGTGTGGTAATTTGTATAATTTTCGAATGTGCAGACAGGTATGTGCATTAGTTTTTTGTTTAGACAGTGTTACGTGTAATGTTGCGTAACTTGTTTGATTTAGTTAAGTTGAGTAAATGACTGGAATGTGGCTTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD089495             [                                                                                                                                                                                                     gtccacTAGCAATGATAATGATAAAAGTACCACTGACAGAAATATTATTGATGATAATAAGGCGATAGGTGTGTGGTAATTTGTATAATTTTCGAATGTGCAGACAGGTATGTGCATTAGTTTTTTGTTTAGACAGTGTTACGTGTAATGTTGCGTAACTTGTTTGATTTAGTTAAGTTGAGTAAATGACTGGAATGTGGCTTGTAGTACAAGTAGTAGTTGCGGATGGACACATTTCTTGGTTAATGAAATTAACTGTACATGATTACGTAGGTTTGATGTGAGTGAAGTATATATTTGTATTTGTATTTGTATTTGTATGTATATTTATATATCTATATATATGTAGCTAATGTGTGTGGATAAATTTGATATTATTGCGAGTGTTGTTTGACATTACA                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD089490             [                                                                                                                                                                                                                    TAATGATAAAAGTACCACTGACAGAAATATTATTGATGATAATAAGGCGATAGGTGTGTGGTAATTTGTATAATTTTCGAATGTGCAGACAGGTATGTGCATTAGTTTTTTGTTTAGACAGTGTTACGTGTAATGTTGCGTAACTTGTTTGATTTAGTTAAGTTGAGTAAATGACTGGAATGTGGCTTGTAGTACAAGTAGTAGTTGCGGATGGACACATTTCTTGGTTAATGAAATTAACTGTACATGATTAGGTANGTTTGATGTGAGTGAAGTATATATTTGTATTTGTATTTGTATTTGTATGTATATTTATATATCTATATATATGTAGCTAATGTGTGTGGATAAATTTGATATTATTGCGAGTGTTGTTTGACATTACATTACTAATTAGTACTACTGAGGATATAGTGAGAAAAACGTCTACACTGTAAGTGTTTTGTTTTGTTAATGTGACGTGATAATAAATTTGGTATACCTAAGTTGGTTGATGACAGATGTGTGATCCACATGTTAGTGGTGAGTATATTCTGGTTGGCACCTAATGAATG]


>consensus_4475#0 CAACCAAAATCAATGAACATTCTTGATTTCAATATTGAATCGATTAGTAATGAAGAAAAT AAAATGATAACGGAAGAGGATAATCATTCTACTAATGAGACAAATGCTAATATTTCTCCA ACTACGCCTCCTGGATGGGTAGACTTCTTTGATGATGATGATGATGATGATATTAATAAT AATAACAATGATAATAACGATAGTAGCAATGATAATGATAAAAGTACCACTGACAGAAAT ATTATTGATGATAATAAGGCGATAGGTGTGTGGTAATTTGTATAATTTTCGAATGTGCAG ACAGGTATGTGCATTAGTTTTTTGTTTAGACAGTGTTACGTGTAATGTTGCGTAACTTGT TTGATTTAGTTAAGTTGAGTAAATGACTGGAATGTGGCTTGTAGTACAAGTAGTAGTTGC GGATGGACACATTTCTTGGTTAATGAAATTAACTGTACATGATTACGTAGGTTTGATGTG AGTGAAGTATATATTTGTATTTGTATTTGTATTTGTATGTATATTTATATATCTATATAT ATGTAGCTAATGTGTGTGGATAAATTTGATATTATTGCGAGTGTTGTTTGACATTACATT ACTAATTAGTACTACTGAGGATATAGTGAGAAAAACGTCTACACTGTAAGTGTTTTGTTT TGTTAATGTGACGTGATAATAAATTTGGTATACCTAAGTTGGTTGATGACAGATGTGTGA TCCACATGTTAGTGGTGAGTATATTCTGGTTGGCACCTAATGAATG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)