cluster # 48

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 48 cluster # 48 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_48#0 length = 1137 sequences # 2

consensusID : consensus_48#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1137
fasta sequence

                              [GGAAAAATATCATTTAAATTCTATAAATTGGTCAATGAATTTACCTGAATATAAAAAACAAATATTATTAATTGAACATGGTTTATTATTAAATCGTGTAATTGTTTTAATTGAACATAATGAATTATGTCAATTATATGAATTAACATTAAATCATTTAATTGAGATTTATTTAAATAATAATAATAATGATAAAATGGAACAATTCAGTGTTTTAATTTATGCTAAAGAATTAAGTTTTTGGATTACTGGTTATATATATGGTTTAAATAAAAATAAAACTGTAAAACGTCTTCCTAAAGTTGAACAACTGGCTGAATTTATACAAATGAATTTAACTGGACAAGTTTTTGGATCAACAGCAGTTGAACTATTGAGTCTAATTATTCACAATGATGAAAGTACATATTCTTCAGTTCATGAGTTAGCTGTCAAACATGATCTAATTTTAATTCAAGATCCAGATCAAATTAAAATTCAATGTGAGAAGTTAATTAATGATTATCCTAAACTGGTCAGACAATATAAAAATGGTAATAAGAAAAGTTTAAAAAAGTTAGTGATGCATTTAATAACTAATTCAAAATGTTACAATAATTCCAATAAATTTAATCCTCCTACTGTTAACAAAATACTTGAACAACTTATTTTATCCTCCTCCTCCTCCTCATCATCATCATCAGCAGCGTCAACATCATCATCTGAATCATCTTCTTCATCAATCTCATCATCGANTAATACTGGGTCATTATCAAGTTCGGTTGGATTAGATCAGAAATGAAGGTATGAAAGTGTATAGGTGTATGTGGGCGGGGTGGGGTGGGGGAAACCATTTTGTATTTGTTACGAAGTTATAGAAGTATATCATTGAGAAGATTGTTAATTATACCCATATATATACATACAATACAATTTAGTTATGAAGTATTGTGTTCATCGGTTCGTTTACGTGTTTTCTTCTCTCAGAGGAACCAGAAACAAACTAATTTTTCTGTTATTCAAAGAAGAAATGTAAATGATACTTCTAATTATACTTCTTTTTTCTTTTCTTTTTTGTACATTAGTTTTTGCAATTATAAATGTATATTGATGTTTACATTCAGACATATAGTTGATATCATTGTCAAATAAATTTGT]

[+] EMBL CD079922             [GGAAAAATATCATTTAAATTCTATAAATTGGTCAATGAATTTACCTGAATATAAAAAACAAATATTATTAATTGAACATGGTTTATTATTAAATCGTGTAATTGTTTTAATTGAACATAATGAATTATGTCAATTATATGAATTAACATTAAATCATTTAATTGAGATTTATTTAAATAATAATAATAATGATAAAATGGAACAATTCAGTGTTTTAATTTATGCTAAAGAATTAAGTTTTTGGATTACTGGTTATATATATGGTTTAAATAAAAATAAAACTGTAAAACGTCTTCCTAAAGTTGAACAACTGGCTGAATTTATACAAATGAATTTAACTGGACAAGTTTTTGGATCAACAGCAGTTGAACTATTGAGTCTAATTATTCACAATGATGAAAGTACATATTCTTCAGTTCATGAGTTAGCTGTCAAACATGATCTAATTTTAATTCAAGATCCAGATCAAATTAAAATTCAATGTGAGAAGTTAATTAATGATTATCCTAAACTGGTCAGACAATATAAAAATGGTAATAAGAAAAGTTTAAAAAAGTTAGTGATGCATTTAATAACTAATTCAAAATGTTACAATAATTCCAATAAATTTAATCCTCCTACTGTTAACAAAATACTTGAACAACTTATTTTATCCTCCTCCTCCTCCTCATCATCATCATCAGCAGCGTCAACATCATCATCTGAATCATCTTCTTCATCAATCTCATCATCGANTAATACTGGGTCATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD074118             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AATATAAAAATGGTAATAAGAAAAGTTTAAAAAAGTTAGTGATGCATTTAATAACTAATTCAAAATGTTACAATAATTCCAATAAATTTAATCCTCCTACTGTTAACAAAATACTTGAACAACTTATTTTATCCTCCTCCTCCTCCTCATCATCATCATCAGCAGCGTCAACATCATCATTTGAATCATCTTCTTCATCAATCTCATCATCGATAAATACTGGTTCATTATCAAGTTCGGTTGGATTAGATCAGAAATGAAGGTATGAAAGTGTATAGGTGTATGTGGGCGGGGTGGGGTGGGGGAAACCATTTTGTATTTGTTACGAAGTTATAGAAGTATATCATTGAGAAGATTGTTAATTATACCCATATATATACATACAATACAATTTAGTTATGAAGTATTGTGTTCATCGGTTCGTTTACGTGTTTTCTTCTCTCAGAGGAACCAGAAACAAACTAATTTTTCTGTTATTCAAAGAAGAAATGTAAATGATACTTCTAATTATACTTCTTTTTTCTTTTCTTTTTTGTACATTAGTTTTTGCAATTATAAATGTATATTGATGTTTACATTCAGACATATAGTTGATATCATTGTCAAATAAATTTGT]




>consensus_48#0
GGAAAAATATCATTTAAATTCTATAAATTGGTCAATGAATTTACCTGAATATAAAAAACA
AATATTATTAATTGAACATGGTTTATTATTAAATCGTGTAATTGTTTTAATTGAACATAA
TGAATTATGTCAATTATATGAATTAACATTAAATCATTTAATTGAGATTTATTTAAATAA
TAATAATAATGATAAAATGGAACAATTCAGTGTTTTAATTTATGCTAAAGAATTAAGTTT
TTGGATTACTGGTTATATATATGGTTTAAATAAAAATAAAACTGTAAAACGTCTTCCTAA
AGTTGAACAACTGGCTGAATTTATACAAATGAATTTAACTGGACAAGTTTTTGGATCAAC
AGCAGTTGAACTATTGAGTCTAATTATTCACAATGATGAAAGTACATATTCTTCAGTTCA
TGAGTTAGCTGTCAAACATGATCTAATTTTAATTCAAGATCCAGATCAAATTAAAATTCA
ATGTGAGAAGTTAATTAATGATTATCCTAAACTGGTCAGACAATATAAAAATGGTAATAA
GAAAAGTTTAAAAAAGTTAGTGATGCATTTAATAACTAATTCAAAATGTTACAATAATTC
CAATAAATTTAATCCTCCTACTGTTAACAAAATACTTGAACAACTTATTTTATCCTCCTC
CTCCTCCTCATCATCATCATCAGCAGCGTCAACATCATCATCTGAATCATCTTCTTCATC
AATCTCATCATCGANTAATACTGGGTCATTATCAAGTTCGGTTGGATTAGATCAGAAATG
AAGGTATGAAAGTGTATAGGTGTATGTGGGCGGGGTGGGGTGGGGGAAACCATTTTGTAT
TTGTTACGAAGTTATAGAAGTATATCATTGAGAAGATTGTTAATTATACCCATATATATA
CATACAATACAATTTAGTTATGAAGTATTGTGTTCATCGGTTCGTTTACGTGTTTTCTTC
TCTCAGAGGAACCAGAAACAAACTAATTTTTCTGTTATTCAAAGAAGAAATGTAAATGAT
ACTTCTAATTATACTTCTTTTTTCTTTTCTTTTTTGTACATTAGTTTTTGCAATTATAAA
TGTATATTGATGTTTACATTCAGACATATAGTTGATATCATTGTCAAATAAATTTGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case