Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 4888 cluster # 4888       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4888#0 length = 398 sequences # 3  

consensusID : consensus_4888#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 398
fasta sequence
                              [CAACTCTTAGGTGTTGAATCCAGGATCCTAGGGCTGAAACTATATATATATTTTTTTGAAAATTGTGTTTCTCATTAAGCTATTTTTCCTCTTGACCTGTAACACTTTGTATTACTGATGAAAAACAGTTGTTGTGATAATCAATATTTCAGGTCACTACTTGATAAAGTAGAAATTTTTAAACTCCGGATTTTAATTTATGCTAGTATGTTGTCAAAACAGCTTTATTATGGAATTTATTTTACTGCCGAACCAATTTGTACAAACCATTTAATTACCTTGAATTCAATTTAAAACGGATTAAATTATCCCATTGTTGATATTTTTGATTGAAAGTTGATCAGTCTTGGTTGCACGTATATGAATTCTGTGCGAATTGCCTCGATATAACCAATATG]

[+] EMBL CD070031             [CAACTCTTAGGTGTTGAATCCAGGATCCTAGGGCTGAAACTATATATATATTTTTTTGAAAATTGTGTTTCTCATTAAGCTATTTTTCCTCTTGACCTGTAACACTTTGTATTACTGATGAAAAACAGTTGTTGTGATAATCAATATTTCAGGTCACTACTTGATAAAGTAGAAATTTTTAAACTCCGGATTTTAATTCATGCTAGTATGTTGTCAAAACAGCTTTATTATGGAATTTATTTTACTGCCGAACCAATTTGTACAAACCATTTAATTACCTTGAATTCAATTTAAAACGGATTAAATTATCCCATTGTTGATATTTTTGATTGAAAGTTGATCAGTCTTGGTTGCACGTATATNAATTCTGTGCGAATTGCCTCGATATAACCAATATG]
[+] EMBL CD070015             [CAACTCTTAGGTGTTGAATCCAGGATCCTAGGGCTGAAGCTATATATATATTTTTTTGAAAATTGTGTTTCTCATTAAGCTATTTTTCCTCTTGACCTGTAACACTTTGTATTACTGATGAAAAACAGTTGTTGTGATAATCAATATTTCAGGTCACTACTTGATAAAGTAGAAATTTTTAAACTCCGGATTTTAATTTATGCTAGTATGTTGTCAAAACAGCTTTATTATGGAATTTATATTACTGCCGAACCAATTTGTACAAACCATTTAATTACCTTGAATTCAATTTAAAACGGATTAAATTATCCCATTGTTGATATTTTTGATTGAAAGTTGATCAGTCTTGGTTGCACGTATATGAATTCTGTGCGAATTGCCTCGATATAACCAATATG]
[+] EMBL CD070029             [CAACTCTTAGGTGTTGAATCCAGGATCCTAGGGCTGAAACTATATATATA TTTTTTGAAAATTGTGTTTCTCATTAAGCTATTTTTCCTCTTGACCTGTAACACTTTGTATTACTGATGAAAAACAGTTGTTGTGATAATCAATATTTCAGGTCACTACTTGATAAAGTAGAAATTTTTAAACTCCGGATTTTAATTTATGCTAGTATGTTGTCAAAACAGCTTTATTATGGAATTTATTTTACTGCCGAACCAATTTGTACAAACCATTTAATTACCTTGAATTCAATTTAAAACGGATTAAATTATCCCATTGTTGATATTTTTGATTGAAAGTTGATCAGTCTTGGTTGCACGTATATGAATTCTGTGCGAATTGCCTCGATATAACCAATATG]


>consensus_4888#0 CAACTCTTAGGTGTTGAATCCAGGATCCTAGGGCTGAAACTATATATATATTTTTTTGAA AATTGTGTTTCTCATTAAGCTATTTTTCCTCTTGACCTGTAACACTTTGTATTACTGATG AAAAACAGTTGTTGTGATAATCAATATTTCAGGTCACTACTTGATAAAGTAGAAATTTTT AAACTCCGGATTTTAATTTATGCTAGTATGTTGTCAAAACAGCTTTATTATGGAATTTAT TTTACTGCCGAACCAATTTGTACAAACCATTTAATTACCTTGAATTCAATTTAAAACGGA TTAAATTATCCCATTGTTGATATTTTTGATTGAAAGTTGATCAGTCTTGGTTGCACGTAT ATGAATTCTGTGCGAATTGCCTCGATATAACCAATATG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)